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Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000008036 (Gene tree)
Gene ID: 111219934
Gene Symbol: aco2
Alias: cb1017|wu:fa10e03|wu:fb69g04|wu:fc20c11
Full Name: aconitate hydratase%2C mitochondrial-like
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9491 bases
Position: chrBDQW01000068.1:15740738-15750228
Accession: 111219934
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000011025	Aconitase	PF00330.20	4e-149	1	1
ENSSDUP00000011044	Aconitase	PF00330.20	6.1e-136	1	1
ENSSDUP00000011044	Aconitase_C	PF00694.19	4.2e-44	1	1
ENSSDUP00000011025	Aconitase_C	PF00694.19	5.5e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000011227	-	4548	XM_022742793	ENSSDUP00000011025	782 (aa)	XP_022598514	UPI000BBF1820
ENSSDUT00000011246	-	1947	-	ENSSDUP00000011044	648 (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sdu00020	Citrate cycle (TCA cycle)	KEGG
sdu00630	Glyoxylate and dicarboxylate metabolism	KEGG
sdu01100	Metabolic pathways	KEGG
sdu01200	Carbon metabolism	KEGG
sdu01210	2-Oxocarboxylic acid metabolism	KEGG
sdu01230	Biosynthesis of amino acids	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSDUG00000008036	aco2	99	88.906	ENSSDUG00000014898	ACO2	100	87.964

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.655	ENSG00000100412	ACO2	100	79.540	Homo_sapiens
ENSSDUG00000008036	aco2	100	95.141	ENSAPOG00000017786	aco2	100	95.141	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	88.438	ENSAPOG00000011484	ACO2	100	87.324	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	77.447	ENSAMEG00000015641	ACO2	100	77.447	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000008036	aco2	100	93.519	ENSACIG00000021636	aco2	100	93.519	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	95.988	ENSAOCG00000020887	aco2	100	95.988	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000008036	aco2	99	88.438	ENSAOCG00000019100	ACO2	100	87.580	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000008036	aco2	100	95.780	ENSAPEG00000020171	aco2	100	95.780	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000008036	aco2	99	88.438	ENSAPEG00000012427	ACO2	100	87.580	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000008036	aco2	100	94.290	ENSATEG00000006397	aco2	100	94.290	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	94.136	ENSATEG00000007473	aco2	100	94.136	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	88.438	ENSATEG00000008001	ACO2	100	87.708	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.499	ENSAPLG00000005198	ACO2	99	79.794	Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.469	ENSACAG00000004677	-	99	80.026	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.312	ENSANAG00000029281	ACO2	99	79.641	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000008036	aco2	100	92.711	ENSACLG00000019179	aco2	100	92.711	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000008036	aco2	86	84.433	ENSAMXG00000015485	ACO2	98	84.433	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	89.386	ENSAMXG00000008808	aco2	100	89.386	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	81.094	ENSBTAG00000006429	ACO2	99	80.154	Bos_taurus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	74.961	WBGene00000041	aco-2	99	76.211	Caenorhabditis_elegans
ENSSDUG00000008036	aco2	98	81.319	ENSCJAG00000005004	ACO2	99	81.417	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.563	ENSCAFG00000001075	ACO2	99	80.563	Canis_familiaris
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.563	ENSCAFG00020001976	ACO2	99	80.563	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000008036	aco2	99	81.094	ENSCHIG00000007877	ACO2	99	80.282	Capra_hircus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	81.377	ENSTSYG00000001084	ACO2	99	81.377	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000008036	aco2	99	81.435	ENSCAPG00000017225	ACO2	99	80.754	Cavia_aperea
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.563	ENSCPOG00000012642	ACO2	100	80.563	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	81.094	ENSCCAG00000028378	ACO2	98	81.933	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	53.197	ENSCATG00000000038	-	100	53.197	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.811	ENSCATG00000030437	ACO2	100	79.795	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000008036	aco2	93	64.500	ENSCATG00000026864	-	100	64.500	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.307	ENSCLAG00000016998	ACO2	100	80.307	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000008036	aco2	100	79.668	ENSCSAG00000005807	ACO2	100	79.668	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000008036	aco2	70	77.957	ENSCHOG00000003549	ACO2	81	77.957	Choloepus_hoffmanni
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.307	ENSCPBG00000020545	ACO2	99	80.307	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000008036	aco2	64	78.502	ENSCING00000008967	-	99	78.502	Ciona_intestinalis
ENSSDUG00000008036	aco2	99	78.404	ENSCSAVG00000007584	-	99	79.736	Ciona_savignyi
ENSSDUG00000008036	aco2	99	77.744	ENSCANG00000018904	ACO2	94	79.518	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.307	ENSCGRG00001023335	Aco2	100	80.307	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000008036	aco2	87	88.202	ENSCGRG00001009672	-	93	79.937	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000008036	aco2	87	88.202	ENSCGRG00000002318	-	93	80.251	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.307	ENSCGRG00000005122	Aco2	100	80.307	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000008036	aco2	99	88.281	ENSCSEG00000006701	ACO2	100	87.324	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000008036	aco2	100	88.606	ENSCSEG00000020501	aco2	100	88.606	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000008036	aco2	98	87.273	ENSCVAG00000006081	aco2	99	87.273	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	88.594	ENSCVAG00000010923	ACO2	100	88.204	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	90.000	ENSDARG00000007294	aco2	99	89.501	Danio_rerio
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.751	ENSDNOG00000018156	ACO2	98	73.117	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	81.591	ENSDORG00000002209	Aco2	99	80.959	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000008036	aco2	99	74.531	FBgn0010100	Acon	97	74.050	Drosophila_melanogaster
ENSSDUG00000008036	aco2	99	72.613	FBgn0037862	CG4706	97	70.980	Drosophila_melanogaster
ENSSDUG00000008036	aco2	81	81.792	ENSETEG00000010742	ACO2	81	81.792	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000008036	aco2	83	84.810	ENSEBUG00000009201	aco2	96	84.810	Eptatretus_burgeri
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.563	ENSEASG00005001546	ACO2	98	80.563	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.435	ENSECAG00000023762	ACO2	98	80.435	Equus_caballus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	78.193	ENSEEUG00000010201	ACO2	93	80.083	Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	87.635	ENSELUG00000007787	ACO2	100	87.635	Esox_lucius
ENSSDUG00000008036	aco2	99	88.456	ENSELUG00000019769	aco2	100	88.107	Esox_lucius
ENSSDUG00000008036	aco2	99	77.727	ENSFCAG00000018526	ACO2	100	77.528	Felis_catus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.343	ENSFALG00000011957	ACO2	99	81.258	Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.781	ENSFDAG00000010448	ACO2	99	80.026	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000008036	aco2	100	93.223	ENSFHEG00000012709	aco2	100	93.223	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	87.656	ENSFHEG00000020556	ACO2	100	87.534	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	77.977	ENSGMOG00000001946	-	100	77.977	Gadus_morhua
ENSSDUG00000008036	aco2	99	89.872	ENSGMOG00000013297	aco2	100	89.872	Gadus_morhua
ENSSDUG00000008036	aco2	100	79.795	ENSGALG00000011950	ACO2	99	79.795	Gallus_gallus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	93.364	ENSGAFG00000008252	aco2	100	93.364	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000008036	aco2	99	87.500	ENSGAFG00000010889	ACO2	100	85.915	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000008036	aco2	99	91.293	ENSGACG00000004686	aco2	99	91.293	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.563	ENSGAGG00000017500	ACO2	99	80.563	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000008036	aco2	88	69.133	ENSGGOG00000037860	-	99	67.581	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.499	ENSGGOG00000001107	ACO2	100	79.412	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000008036	aco2	100	92.711	ENSHBUG00000004106	aco2	100	92.711	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000008036	aco2	99	81.123	ENSHGLG00000015463	Aco2	100	80.051	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000008036	aco2	100	79.668	ENSHGLG00100010294	ACO2	100	79.668	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000008036	aco2	100	94.373	ENSHCOG00000010190	aco2	100	94.373	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000008036	aco2	99	88.438	ENSHCOG00000006890	ACO2	100	88.253	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000008036	aco2	99	90.726	ENSIPUG00000001101	aco2	100	90.726	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.179	ENSSTOG00000016210	ACO2	100	80.179	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000008036	aco2	89	75.967	ENSJJAG00000014029	Aco2	99	75.967	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000008036	aco2	55	94.009	ENSKMAG00000021995	aco2	90	94.009	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	88.281	ENSKMAG00000014823	ACO2	100	87.196	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	93.210	ENSLBEG00000002060	aco2	100	93.210	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000008036	aco2	92	75.581	ENSLACG00000011854	ACO2	100	76.535	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000008036	aco2	89	75.321	ENSLOCG00000011607	aco2	98	75.321	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.312	ENSLAFG00000006030	ACO2	100	79.641	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000008036	aco2	100	63.374	ENSMFAG00000041445	-	100	63.374	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.811	ENSMFAG00000043571	ACO2	100	79.795	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.811	ENSMMUG00000001454	ACO2	100	79.795	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000008036	aco2	100	79.668	ENSMNEG00000044522	ACO2	100	79.668	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.811	ENSMLEG00000031603	ACO2	100	79.795	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	62.883	ENSMLEG00000042289	-	100	62.883	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	93.673	ENSMAMG00000003762	aco2	100	93.673	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	89.219	ENSMAMG00000007378	ACO2	100	89.276	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	92.711	ENSMZEG00005019194	aco2	100	92.711	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.499	ENSMGAG00000012110	ACO2	99	79.794	Meleagris_gallopavo
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.179	ENSMAUG00000007598	Aco2	100	80.179	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	72.976	ENSMICG00000013529	ACO2	100	72.976	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.818	ENSMOCG00000008387	Aco2	100	80.818	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000008036	aco2	99	89.062	ENSMMOG00000002702	ACO2	100	88.092	Mola_mola
ENSSDUG00000008036	aco2	100	93.210	ENSMMOG00000003639	aco2	100	93.210	Mola_mola
ENSSDUG00000008036	aco2	99	80.469	ENSMODG00000016560	ACO2	99	80.026	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000008036	aco2	99	88.281	ENSMALG00000013359	ACO2	100	87.708	Monopterus_albus
ENSSDUG00000008036	aco2	99	94.053	ENSMALG00000008744	aco2	100	93.826	Monopterus_albus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.691	ENSMUSG00000022477	Aco2	100	88.144	Mus_musculus
ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.691	MGP_PahariEiJ_G0020064	Aco2	100	80.691	Mus_pahari
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ENSSDUG00000008036	aco2	100	80.179	ENSMPUG00000016396	ACO2	99	80.179	Mustela_putorius_furo
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