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Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000008186 (Gene tree)
Gene ID: 111237725
Gene Symbol: GZF1
Alias: ZBTB23|ZNF336|dJ322G13.2
Full Name: GDNF inducible zinc finger protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6095 bases
Position: chrBDQW01000025.1:7885376-7891470
Accession: 111237725
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000011203	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-36	1	7
ENSSDUP00000011203	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-36	2	7
ENSSDUP00000011203	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-36	3	7
ENSSDUP00000011203	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-36	4	7
ENSSDUP00000011203	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-36	5	7
ENSSDUP00000011203	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-36	6	7
ENSSDUP00000011203	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-36	7	7
ENSSDUP00000011203	zf-met	PF12874.7	1.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000011412	GZF1-201	3500	XM_022766932	ENSSDUP00000011203	839 (aa)	XP_022622653	UPI000BBF0699

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSDUG00000008186	GZF1	71	46.154	ENSSDUG00000007770	zbtb24	76	38.667
ENSSDUG00000008186	GZF1	69	43.373	ENSSDUG00000015767	zbtb37	96	43.373
ENSSDUG00000008186	GZF1	50	34.934	ENSSDUG00000020397	prdm5	81	37.073
ENSSDUG00000008186	GZF1	70	43.147	ENSSDUG00000022170	zbtb49	97	43.147
ENSSDUG00000008186	GZF1	62	41.071	ENSSDUG00000009223	zbtb41	86	41.071
ENSSDUG00000008186	GZF1	70	30.247	ENSSDUG00000002796	znf131	75	30.247
ENSSDUG00000008186	GZF1	57	36.614	ENSSDUG00000016704	zbtb47b	57	36.614

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.970	ENSG00000125812	GZF1	100	45.833	Homo_sapiens
ENSSDUG00000008186	GZF1	71	77.066	ENSAPOG00000012930	GZF1	93	75.717	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000008186	GZF1	78	43.548	ENSAMEG00000009853	GZF1	93	43.421	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000008186	GZF1	97	73.807	ENSACIG00000004753	-	99	74.296	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000008186	GZF1	69	77.759	ENSAOCG00000024275	GZF1	92	76.897	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000008186	GZF1	100	78.118	ENSAPEG00000017195	GZF1	100	79.176	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000008186	GZF1	83	69.958	ENSATEG00000018374	GZF1	88	82.273	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000008186	GZF1	83	43.793	ENSANAG00000028240	GZF1	99	43.639	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000008186	GZF1	97	73.445	ENSACLG00000025866	GZF1	99	73.445	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000008186	GZF1	71	49.259	ENSAMXG00000017178	GZF1	82	48.430	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	47.546	ENSCAFG00000005142	GZF1	88	47.328	Canis_familiaris
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.832	ENSTSYG00000028054	GZF1	88	46.832	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.544	ENSCAPG00000002173	GZF1	88	46.697	Cavia_aperea
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.544	ENSCPOG00000010790	GZF1	88	46.697	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.880	ENSCCAG00000035601	GZF1	88	47.032	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.386	ENSCATG00000039279	GZF1	88	47.519	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.224	ENSCLAG00000014714	GZF1	88	46.224	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.456	ENSCSAG00000011054	GZF1	88	47.068	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000008186	GZF1	72	49.062	ENSCPBG00000023418	-	53	44.920	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000008186	GZF1	83	46.016	ENSCPBG00000023415	GZF1	99	45.344	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.445	ENSCANG00000041260	GZF1	88	47.368	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000008186	GZF1	82	44.272	ENSCGRG00001003944	Gzf1	97	44.272	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000008186	GZF1	82	44.272	ENSCGRG00000012721	Gzf1	97	44.272	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	67.434	ENSCSEG00000002270	GZF1	99	67.434	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	60.282	ENSCVAG00000013068	-	99	62.915	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	45.740	ENSDORG00000011855	Gzf1	88	47.648	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000008186	GZF1	73	52.347	ENSELUG00000013581	GZF1	81	61.736	Esox_lucius
ENSSDUG00000008186	GZF1	79	46.579	ENSFCAG00000006484	GZF1	99	45.192	Felis_catus
ENSSDUG00000008186	GZF1	81	44.292	ENSFDAG00000019468	GZF1	99	44.138	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000008186	GZF1	96	61.029	ENSFHEG00000020498	GZF1	99	61.707	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000008186	GZF1	72	65.850	ENSGMOG00000011017	GZF1	100	65.359	Gadus_morhua
ENSSDUG00000008186	GZF1	83	45.516	ENSGALG00000053640	GZF1	99	44.548	Gallus_gallus
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	65.799	ENSGAFG00000008725	GZF1	99	65.917	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000008186	GZF1	72	75.286	ENSGACG00000012415	GZF1	99	86.735	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.177	ENSGGOG00000023248	GZF1	88	47.669	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000008186	GZF1	97	74.636	ENSHBUG00000016502	-	99	74.636	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	45.902	ENSHGLG00000008891	GZF1	88	45.577	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	45.902	ENSHGLG00100015117	GZF1	88	45.577	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	52.096	ENSHCOG00000004326	GZF1	99	52.216	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	49.150	ENSSTOG00000009820	GZF1	88	49.304	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.847	ENSJJAG00000008172	Gzf1	88	47.297	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000008186	GZF1	80	74.194	ENSKMAG00000001453	-	98	76.531	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	70.379	ENSLBEG00000025803	-	99	71.564	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000008186	GZF1	79	46.210	ENSLAFG00000002458	GZF1	100	45.685	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.386	ENSMFAG00000042408	GZF1	88	47.519	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.386	ENSMMUG00000022387	GZF1	88	47.519	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.456	ENSMNEG00000033117	GZF1	88	47.519	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.456	ENSMLEG00000036831	GZF1	88	47.519	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	73.969	ENSMAMG00000011931	-	99	75.147	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000008186	GZF1	97	74.217	ENSMZEG00005010711	-	99	74.217	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000008186	GZF1	72	45.696	ENSMAUG00000019656	Gzf1	99	46.741	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000008186	GZF1	78	46.334	ENSMICG00000046070	GZF1	88	47.840	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000008186	GZF1	72	47.227	ENSMOCG00000017816	Gzf1	97	44.460	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	68.427	ENSMMOG00000004395	-	99	68.310	Mola_mola
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.914	ENSMODG00000006238	GZF1	100	64.231	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	47.130	MGP_CAROLIEiJ_G0024409	Gzf1	88	47.496	Mus_caroli
ENSSDUG00000008186	GZF1	81	44.708	ENSMUSG00000027439	Gzf1	96	45.049	Mus_musculus
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.942	MGP_PahariEiJ_G0025852	Gzf1	88	46.837	Mus_pahari
ENSSDUG00000008186	GZF1	81	44.568	MGP_SPRETEiJ_G0025327	Gzf1	96	45.125	Mus_spretus
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	48.250	ENSMPUG00000001160	GZF1	78	49.304	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	44.512	ENSMLUG00000002194	GZF1	90	45.967	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	47.612	ENSNGAG00000024012	Gzf1	88	48.308	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000008186	GZF1	71	65.127	ENSNBRG00000019987	GZF1	97	70.401	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.697	ENSNLEG00000011565	GZF1	88	47.519	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000008186	GZF1	82	44.875	ENSOPRG00000004697	GZF1	99	44.262	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000008186	GZF1	81	34.735	ENSODEG00000013020	GZF1	87	43.538	Octodon_degus
ENSSDUG00000008186	GZF1	72	76.759	ENSONIG00000000989	GZF1	100	76.923	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000008186	GZF1	72	46.986	ENSOCUG00000025214	GZF1	86	46.687	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000008186	GZF1	98	61.859	ENSORLG00000010006	-	99	62.813	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000008186	GZF1	98	62.275	ENSORLG00020001395	-	99	62.843	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000008186	GZF1	98	60.859	ENSORLG00015015364	GZF1	99	62.500	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	48.382	ENSOGAG00000028389	GZF1	88	48.382	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	47.032	ENSPPAG00000028487	GZF1	88	46.617	Pan_paniscus
ENSSDUG00000008186	GZF1	79	46.579	ENSPPRG00000010040	GZF1	99	45.192	Panthera_pardus
ENSSDUG00000008186	GZF1	79	46.579	ENSPTIG00000019328	GZF1	99	45.192	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.880	ENSPTRG00000013320	GZF1	88	46.767	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.606	ENSPANG00000017419	GZF1	88	47.669	Papio_anubis
ENSSDUG00000008186	GZF1	90	48.067	ENSPKIG00000003781	GZF1	93	47.809	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000008186	GZF1	72	49.375	ENSPSIG00000014208	-	60	43.062	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000008186	GZF1	83	46.238	ENSPSIG00000014455	GZF1	99	45.614	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000008186	GZF1	83	59.044	ENSPMGG00000003778	-	96	47.893	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000008186	GZF1	72	46.368	ENSPEMG00000011285	Gzf1	87	46.213	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000008186	GZF1	83	44.874	ENSPCIG00000013803	GZF1	99	44.195	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	65.677	ENSPFOG00000002393	GZF1	100	68.404	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	60.976	ENSPLAG00000005232	GZF1	94	69.839	Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	61.382	ENSPMEG00000020017	-	99	61.382	Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	58.872	ENSPREG00000016398	GZF1	99	58.167	Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000008186	GZF1	52	66.139	ENSPPYG00000010766	GZF1	70	66.139	Pongo_abelii
ENSSDUG00000008186	GZF1	68	47.723	ENSPCAG00000007544	GZF1	99	47.723	Procavia_capensis
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	47.597	ENSPCOG00000024180	GZF1	88	47.597	Propithecus_coquereli
ENSSDUG00000008186	GZF1	83	44.719	ENSPVAG00000014056	GZF1	99	45.179	Pteropus_vampyrus
ENSSDUG00000008186	GZF1	59	77.811	ENSPNYG00000000788	-	87	77.811	Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000008186	GZF1	81	45.125	ENSRNOG00000004735	Gzf1	96	46.025	Rattus_norvegicus
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	47.958	ENSRBIG00000028715	GZF1	88	48.411	Rhinopithecus_bieti
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	47.289	ENSRROG00000030533	GZF1	88	47.970	Rhinopithecus_roxellana
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	46.870	ENSSBOG00000018893	GZF1	88	46.870	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSDUG00000008186	GZF1	83	43.717	ENSSHAG00000009367	GZF1	99	42.632	Sarcophilus_harrisii
ENSSDUG00000008186	GZF1	94	44.717	ENSSFOG00015008631	gzf1	95	44.205	Scleropages_formosus
ENSSDUG00000008186	GZF1	100	97.497	ENSSLDG00000002382	GZF1	100	97.497	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000008186	GZF1	52	67.881	ENSSARG00000010285	GZF1	59	67.881	Sorex_araneus
ENSSDUG00000008186	GZF1	75	38.427	ENSSPUG00000004147	GZF1	88	44.781	Sphenodon_punctatus
ENSSDUG00000008186	GZF1	100	77.656	ENSSPAG00000011759	GZF1	100	76.557	Stegastes_partitus
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	63.967	ENSTRUG00000006128	-	99	63.967	Takifugu_rubripes
ENSSDUG00000008186	GZF1	72	66.938	ENSTNIG00000010722	GZF1	100	66.938	Tetraodon_nigroviridis
ENSSDUG00000008186	GZF1	73	48.580	ENSTTRG00000011345	GZF1	87	48.738	Tursiops_truncatus
ENSSDUG00000008186	GZF1	79	46.491	ENSUMAG00000004065	GZF1	93	46.413	Ursus_maritimus
ENSSDUG00000008186	GZF1	74	47.239	ENSVVUG00000012086	GZF1	88	47.231	Vulpes_vulpes
ENSSDUG00000008186	GZF1	83	41.826	ENSXETG00000004510	gzf1	99	41.473	Xenopus_tropicalis
ENSSDUG00000008186	GZF1	99	66.152	ENSXMAG00000023249	GZF1	100	66.311	Xiphophorus_maculatus