EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000010864 (Gene tree)
Gene ID: 111235734
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19942 bases
Position: chrBDQW01000533.1:2237361-2257302
Accession: 111235734
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000014905	PAZ	PF02170.22	7.3e-29	1	1
ENSSDUP00000014905	Piwi	PF02171.17	1.6e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000015189	-	5657	XM_022764250	ENSSDUP00000014905	858 (aa)	XP_022619971	UPI000496687F

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSDUG00000010864	ago1	100	83.506	ENSSDUG00000010918	ago3a	100	83.506
ENSSDUG00000010864	ago1	100	82.609	ENSSDUG00000008069	-	100	84.197
ENSSDUG00000010864	ago1	99	80.682	ENSSDUG00000020781	ago4	100	83.712
ENSSDUG00000010864	ago1	98	82.598	ENSSDUG00000005726	ago2	99	81.090

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSG00000092847	AGO1	100	97.187	Homo_sapiens
ENSSDUG00000010864	ago1	100	100.000	ENSAPOG00000024299	ago1	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	96.154	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000010864	ago1	82	93.162	ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	100.000	ENSAOCG00000017727	ago1	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000010864	ago1	100	100.000	ENSAPEG00000004458	ago1	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000010864	ago1	100	100.000	ENSATEG00000008523	ago1	100	100.000	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000010864	ago1	99	89.559	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	89.559	Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000010864	ago1	91	97.059	ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.028	ENSANAG00000037711	AGO1	100	96.154	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.767	ENSACLG00000000890	ago1	100	99.767	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000010864	ago1	80	99.854	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.854	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.686	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.154	Bos_taurus
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.576	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	96.154	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	96.154	Canis_familiaris
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.667	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.222	ENSCHIG00000011848	-	100	95.365	Capra_hircus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	75.758	ENSTSYG00000032426	-	99	78.143	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.576	ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000010864	ago1	89	92.531	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	Cavia_aperea
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	96.154	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	95.804	ENSCATG00000031521	AGO1	100	97.187	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.576	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.154	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	96.154	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000010864	ago1	85	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSSDUG00000010864	ago1	100	96.037	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSCANG00000039798	AGO1	100	96.154	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.235	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	96.154	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.576	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	96.576	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000010864	ago1	99	97.914	ENSCSEG00000001051	ago1	100	97.914	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.650	ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	98.951	ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	Danio_rerio
ENSSDUG00000010864	ago1	91	97.187	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	97.187	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000010864	ago1	91	97.087	ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000010864	ago1	82	89.958	ENSETEG00000007626	AGO1	100	89.197	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.576	ENSEASG00005012086	AGO1	100	96.154	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSECAG00000024353	AGO1	100	96.154	Equus_caballus
ENSSDUG00000010864	ago1	92	88.818	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000010864	ago1	91	99.744	ENSELUG00000016803	ago1	100	99.744	Esox_lucius
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	96.154	Felis_catus
ENSSDUG00000010864	ago1	91	90.816	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000010864	ago1	100	96.154	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000010864	ago1	99	95.755	ENSFHEG00000017927	ago1	100	95.755	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000010864	ago1	87	86.649	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.649	Gadus_morhua
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.797	ENSGALG00000002249	AGO1	100	96.037	Gallus_gallus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.767	ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.767	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000010864	ago1	87	99.334	ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000010864	ago1	91	97.059	ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000010864	ago1	100	95.688	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	96.154	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.767	ENSHBUG00000010459	ago1	100	99.767	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.576	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	96.154	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.576	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	96.154	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000010864	ago1	99	100.000	ENSHCOG00000005708	ago1	100	100.000	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.417	ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.417	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	96.154	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	96.154	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	96.154	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.883	ENSKMAG00000019464	ago1	100	99.883	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.883	ENSLBEG00000007694	ago1	100	99.883	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000010864	ago1	99	90.824	ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000010864	ago1	100	94.755	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.235	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	96.154	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000010864	ago1	99	91.972	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	92.171	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000010864	ago1	100	92.308	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	97.187	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	96.154	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	100.000	ENSMAMG00000008381	ago1	100	100.000	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.767	ENSMZEG00005007996	ago1	100	99.767	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000010864	ago1	99	90.603	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.603	Meleagris_gallopavo
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	96.154	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.028	ENSMICG00000016147	AGO1	100	96.154	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.797	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	96.037	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000010864	ago1	78	99.701	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.701	Mola_mola
ENSSDUG00000010864	ago1	100	95.921	ENSMODG00000023335	AGO1	100	95.921	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000010864	ago1	99	99.882	ENSMALG00000011057	ago1	100	99.882	Monopterus_albus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	Mus_caroli
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	98.011	Mus_musculus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	98.011	Mus_pahari
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	98.011	Mus_spretus
ENSSDUG00000010864	ago1	84	97.772	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.772	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000010864	ago1	61	94.646	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	94.646	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	96.037	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	96.037	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000010864	ago1	91	99.872	ENSNBRG00000010867	ago1	100	99.872	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000010864	ago1	100	96.154	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.154	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000010864	ago1	84	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000010864	ago1	93	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000010864	ago1	100	94.919	ENSODEG00000005321	AGO1	100	96.154	Octodon_degus
ENSSDUG00000010864	ago1	99	99.765	ENSONIG00000016345	ago1	100	99.765	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	88.269	ENSOANG00000002080	AGO1	100	88.269	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.797	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	96.037	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.883	ENSORLG00000014965	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.883	ENSORLG00020018253	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.883	ENSORLG00015003287	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.883	ENSOMEG00000020528	ago1	100	99.883	Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.019	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	96.019	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.686	ENSOARG00000019591	AGO1	100	96.154	Ovis_aries
ENSSDUG00000010864	ago1	100	95.688	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	96.154	Pan_paniscus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	96.154	Panthera_pardus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.679	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	95.921	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000010864	ago1	100	95.688	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	96.154	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSPANG00000009060	AGO1	100	96.154	Papio_anubis
ENSSDUG00000010864	ago1	98	95.962	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000010864	ago1	80	98.547	ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000010864	ago1	100	95.921	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.767	ENSPFOG00000005867	ago1	100	99.767	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.767	ENSPLAG00000002824	ago1	100	99.767	Poecilia_latipinna
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