EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000013457 (Gene tree)
Gene ID: 111229261
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC111229261
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11968 bases
Position: chrBDQW01000017.1:900824-912791
Accession: 111229261
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000018444	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000018811	-	1230	-	ENSSDUP00000018476	409 (aa)	-	-
ENSSDUT00000018778	-	2826	XM_022755518	ENSSDUP00000018444	448 (aa)	XP_022611239	UPI000BBF16F5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.101	ENSSDUG00000016411	si:ch211-11k18.4	98	59.101

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.326	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	98	59.326	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	57.848	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	57.848	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.551	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	98	59.551	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.326	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	98	59.326	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.551	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	98	59.551	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	58.520	ENSACAG00000028632	-	98	58.613	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	58.837	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	98	58.837	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.465	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.465	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	80.717	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	99	80.717	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	82	58.649	ENSCING00000020807	-	98	58.649	Ciona_intestinalis
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	98	54.773	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.227	Ciona_savignyi
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	88.839	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	85.849	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	58.876	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	98	59.775	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	88.839	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	88.839	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.775	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	98	59.775	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	98	82.609	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	82.609	Danio_rerio
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	60.225	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	97	75.393	Danio_rerio
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	80	56.354	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	97	56.354	Eptatretus_burgeri
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	80.674	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	80.674	Esox_lucius
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.732	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	98	59.732	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	88	55.556	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	98	55.556	Gadus_morhua
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.326	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	98	59.326	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	89.509	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	84	63.395	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	98	61.461	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	58	94.186	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.186	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.060	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	98	59.060	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.101	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.101	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	84.009	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	84.009	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	95	59.112	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	98	59.112	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	78.027	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	78.027	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	84	57.937	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	57.937	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.326	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	98	59.326	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	89.286	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.286	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	60.579	ENSLACG00000004899	-	99	60.579	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	69.144	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.144	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	61.348	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.573	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	95	60.047	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	98	60.047	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	58.613	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	98	58.613	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	57.942	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	98	57.942	Mola_mola
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	98	88.838	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	88.838	Monopterus_albus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	59.551	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	98	59.551	Monopterus_albus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	95	59.346	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	97	59.346	Neolamprologus_brichardi
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ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	100	84.152	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	84.152	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	60.538	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	98	60.538	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	60.538	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	98	60.538	Oryzias_latipes_hni
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ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	60.538	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	98	60.538	Oryzias_latipes_hsok
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