EuRBPDB

Description
Ensembl ID
ENSSDUG00000014563 (Gene tree)
Gene ID
111223899
Gene Symbol
cdc5l
Alias
zgc:55853
Full Name
cell division cycle 5 like
Gene Type
protein_coding
Species
Seriola_dumerili
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
11861 bases
Position
chrBDQW01000120.1:2285162-2297022
Accession
111223899
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein ID
Domain
Pfam ID
E-value
Domain number
Total number
ENSSDUP00000020109Myb_CefPF11831.83e-8011
ENSSDUP00000020079Myb_CefPF11831.83e-8011
Transcripts
Transcript ID
Name
Length
RefSeq ID
Protein ID
Length
RefSeq ID
UniportKB ID
ENSSDUT00000020433-4794-ENSSDUP00000020079820 (aa)--
ENSSDUT00000020462-2439XM_022748197ENSSDUP00000020109812 (aa)XP_022603918UPI000BBEBCB0
Gene Model
Pathways
Pathway ID
Pathway Name
Source
sdu03040SpliceosomeKEGG
Protein-Protein Interaction (PPI)
Orthologs
Ensembl ID
Gene Symbol
Coverage
Identiy
Ortholog
Gene Symbol
Coverage
Identiy
Species
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSG00000096401CDC5L9977.132Homo_sapiens
ENSSDUG00000014563cdc5l10096.675ENSAPOG00000009828cdc5l10096.675Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.284ENSAMEG00000011685CDC5L9977.284Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000014563cdc5l10096.552ENSAOCG00000000762cdc5l10096.552Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000014563cdc5l10096.429ENSAPEG00000014728cdc5l10096.429Amphiprion_percula
ENSSDUG00000014563cdc5l10095.443ENSATEG00000016760cdc5l10095.443Anabas_testudineus
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.638ENSAPLG00000015586CDC5L9977.009Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.667ENSACAG00000012874CDC5L9976.667Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.695ENSANAG00000028499CDC5L9976.695Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000014563cdc5l10091.010ENSACLG00000027113cdc5l10091.010Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000014563cdc5l9778.184ENSAMXG00000000894cdc5l10077.932Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSBTAG00000020012CDC5L9977.379Bos_taurus
ENSSDUG00000014563cdc5l9845.900WBGene00008386cdc-5L9745.900Caenorhabditis_elegans
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.819ENSCJAG00000012210CDC5L9976.819Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSCAFG00000001996CDC5L9977.379Canis_familiaris
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSCAFG00020012353CDC5L9977.379Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSCHIG00000022031CDC5L9977.379Capra_hircus
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.885ENSTSYG00000013155CDC5L9976.885Carlito_syrichta
ENSSDUG00000014563cdc5l9765.360ENSCAPG00000016503CDC5L9965.613Cavia_aperea
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSCPOG00000000961CDC5L9977.379Cavia_porcellus
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.819ENSCCAG00000032324CDC5L9976.819Cebus_capucinus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSCATG00000038925CDC5L9977.132Cercocebus_atys
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSCLAG00000014884CDC5L9977.379Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSCSAG00000012464CDC5L9977.132Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000014563cdc5l7797.436ENSCHOG00000001728CDC5L7897.436Choloepus_hoffmanni
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSCPBG00000016346CDC5L9977.379Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000014563cdc5l9862.531ENSCING00000007995-9962.159Ciona_intestinalis
ENSSDUG00000014563cdc5l9861.768ENSCSAVG00000010518-9961.146Ciona_savignyi
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSCANG00000032340CDC5L9977.132Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000014563cdc5l9962.840ENSCGRG00001007741-9962.840Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000014563cdc5l8685.075ENSCGRG00001021667-9085.075Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000014563cdc5l9081.350ENSCGRG00001019419-9981.350Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000014563cdc5l9776.322ENSCGRG00000006762-9976.322Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000014563cdc5l9990.271ENSCSEG00000017309cdc5l9990.271Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000014563cdc5l8399.315ENSCVAG00000014810cdc5l9099.315Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000014563cdc5l9981.211ENSDARG00000043797cdc5l9981.211Danio_rerio
ENSSDUG00000014563cdc5l9973.309ENSDNOG00000044224CDC5L9873.063Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.312ENSDORG00000009131-9977.312Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000014563cdc5l9962.195FBgn0265574Cdc59762.195Drosophila_melanogaster
ENSSDUG00000014563cdc5l8582.264ENSETEG00000013241CDC5L8682.264Echinops_telfairi
ENSSDUG00000014563cdc5l8167.066ENSEBUG00000016336cdc5l9967.115Eptatretus_burgeri
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSEASG00005003742CDC5L9977.379Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSECAG00000010081CDC5L9977.379Equus_caballus
ENSSDUG00000014563cdc5l8764.124ENSEEUG00000007288CDC5L8764.124Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000014563cdc5l9984.321ENSELUG00000013492cdc5l9984.321Esox_lucius
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSFCAG00000009570CDC5L9977.379Felis_catus
ENSSDUG00000014563cdc5l9978.863ENSFALG00000012688CDC5L9978.863Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.638ENSFDAG00000018610CDC5L9976.638Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000014563cdc5l9992.725ENSFHEG00000013091cdc5l9992.725Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000014563cdc5l10089.066ENSGMOG00000000407cdc5l10089.066Gadus_morhua
ENSSDUG00000014563cdc5l9978.492ENSGALG00000016704CDC5L9078.492Gallus_gallus
ENSSDUG00000014563cdc5l6593.951ENSGAFG00000003610cdc5l9493.951Gambusia_affinis
ENSSDUG00000014563cdc5l10092.734ENSGACG00000011733cdc5l10092.734Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.256ENSGAGG00000005724CDC5L9977.256Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSGGOG00000006784CDC5L9977.132Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000014563cdc5l80100.000ENSHBUG00000017304cdc5l10095.902Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.009ENSHGLG00000011993CDC5L9977.009Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.009ENSHGLG00100005766CDC5L9977.009Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000014563cdc5l10085.714ENSHCOG00000020596cdc5l10085.714Hippocampus_comes
ENSSDUG00000014563cdc5l9979.803ENSIPUG00000004377cdc5l9979.803Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.638ENSSTOG00000016173CDC5L9976.638Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.503ENSJJAG00000012361-9977.503Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000014563cdc5l10095.197ENSKMAG00000007868cdc5l10095.197Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000014563cdc5l10092.365ENSLBEG00000019437cdc5l10092.365Labrus_bergylta
ENSSDUG00000014563cdc5l9978.863ENSLACG00000008060CDC5L9978.863Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000014563cdc5l9979.803ENSLOCG00000015811cdc5l9979.803Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSLAFG00000012689CDC5L9977.132Loxodonta_africana
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSMFAG00000000812CDC5L9977.132Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSMMUG00000014389CDC5L9885.996Macaca_mulatta
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSMNEG00000036577CDC5L9977.132Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSMLEG00000030582CDC5L9977.132Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000014563cdc5l10095.443ENSMAMG00000022399cdc5l10095.443Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000014563cdc5l10094.704ENSMZEG00005027301cdc5l10094.704Maylandia_zebra
ENSSDUG00000014563cdc5l9978.202ENSMGAG00000014263CDC5L9978.202Meleagris_gallopavo
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.256ENSMAUG00000013120-9977.256Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.009ENSMICG00000006933CDC5L9977.009Microcebus_murinus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.503ENSMOCG00000022910-9977.503Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000014563cdc5l9383.333ENSMMOG00000006817cdc5l9983.333Mola_mola
ENSSDUG00000014563cdc5l9970.632ENSMODG00000003716-9970.632Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000014563cdc5l9970.508ENSMODG00000003702-9970.508Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000014563cdc5l9978.025ENSMODG00000018923-9978.025Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000014563cdc5l10094.704ENSMALG00000021999cdc5l10094.704Monopterus_albus
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.885MGP_CAROLIEiJ_G0021641-9976.885Mus_caroli
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.143ENSMUSG00000112027Gm90459976.143Mus_musculus
ENSSDUG00000014563cdc5l9975.773ENSMUSG00000112781Gm90469975.773Mus_musculus
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.020ENSMUSG00000112252Gm328029976.020Mus_musculus
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.020ENSMUSG00000112216Gm327179976.020Mus_musculus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.256ENSMUSG00000023932Cdc5l9977.256Mus_musculus
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.020ENSMUSG00000112419Gm90449976.020Mus_musculus
ENSSDUG00000014563cdc5l9975.896ENSMUSG00000112495Gm90489975.896Mus_musculus
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.020ENSMUSG00000112814Gm90409976.020Mus_musculus
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.143ENSMUSG00000112919Gm90499976.143Mus_musculus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.256MGP_PahariEiJ_G0020633-9977.256Mus_pahari
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.256MGP_SPRETEiJ_G0022553-9977.256Mus_spretus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSMPUG00000012546CDC5L9977.379Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.407ENSMLUG00000012803CDC5L9977.407Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSNGAG00000015764-9977.132Nannospalax_galili
ENSSDUG00000014563cdc5l9194.904ENSNBRG00000009082cdc5l9594.904Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000014563cdc5l9076.230ENSNLEG00000003627CDC5L9578.138Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000014563cdc5l8766.573ENSMEUG00000015564-10066.573Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000014563cdc5l7092.466ENSMEUG00000012298-7092.466Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000014563cdc5l8763.404ENSOPRG00000007745CDC5L8763.404Ochotona_princeps
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.503ENSODEG00000017235CDC5L9977.503Octodon_degus
ENSSDUG00000014563cdc5l10094.458ENSONIG00000001420cdc5l10094.458Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.256ENSOANG00000008262CDC5L9977.256Ornithorhynchus_anatinus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.009ENSOCUG00000017240CDC5L9977.009Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000014563cdc5l10091.256ENSORLG00000018576cdc5l10091.256Oryzias_latipes
ENSSDUG00000014563cdc5l10091.995ENSOMEG00000015638cdc5l10091.995Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.037ENSOGAG00000008211CDC5L9977.037Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSOARG00000010205CDC5L9977.379Ovis_aries
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSPPAG00000031456CDC5L9977.132Pan_paniscus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSPPRG00000014475CDC5L9977.379Panthera_pardus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.256ENSPTIG00000006547CDC5L9977.256Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSPTRG00000018224CDC5L9977.132Pan_troglodytes
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSPANG00000018654CDC5L9977.132Papio_anubis
ENSSDUG00000014563cdc5l9980.542ENSPKIG00000015398cdc5l9980.542Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.256ENSPSIG00000013123CDC5L9977.256Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000014563cdc5l9965.389ENSPEMG00000007860-9965.389Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000014563cdc5l9974.605ENSPMAG00000005250cdc5l9974.605Petromyzon_marinus
ENSSDUG00000014563cdc5l9978.245ENSPCIG00000024040-9978.245Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000014563cdc5l10092.611ENSPFOG00000013630cdc5l10092.611Poecilia_formosa
ENSSDUG00000014563cdc5l10092.734ENSPLAG00000001970cdc5l10092.734Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000014563cdc5l10092.980ENSPMEG00000001452cdc5l10092.980Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000014563cdc5l10092.980ENSPREG00000004453cdc5l10092.980Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSPPYG00000016661CDC5L9981.172Pongo_abelii
ENSSDUG00000014563cdc5l8768.644ENSPCAG00000011444CDC5L10068.644Procavia_capensis
ENSSDUG00000014563cdc5l8773.054ENSPCOG00000024619CDC5L9473.054Propithecus_coquereli
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.256ENSPVAG00000004579CDC5L9977.256Pteropus_vampyrus
ENSSDUG00000014563cdc5l9981.088ENSPNAG00000006467cdc5l9981.088Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSRNOG00000019975Cdc5l9977.379Rattus_norvegicus
ENSSDUG00000014563cdc5l9971.852ENSRBIG00000037455CDC5L9971.852Rhinopithecus_bieti
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.132ENSRROG00000029176CDC5L9977.132Rhinopithecus_roxellana
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.819ENSSBOG00000031265CDC5L9976.819Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSDUG00000014563cdc5l9978.052ENSSHAG00000017642-9978.052Sarcophilus_harrisii
ENSSDUG00000014563cdc5l9980.296ENSSFOG00015015844cdc5l9980.296Scleropages_formosus
ENSSDUG00000014563cdc5l10095.320ENSSMAG00000001917cdc5l10095.320Scophthalmus_maximus
ENSSDUG00000014563cdc5l100100.000ENSSLDG00000017777cdc5l100100.000Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000014563cdc5l8578.499ENSSARG00000012371CDC5L8778.499Sorex_araneus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.627ENSSPUG00000006685CDC5L9977.627Sphenodon_punctatus
ENSSDUG00000014563cdc5l10095.936ENSSPAG00000023162cdc5l10095.936Stegastes_partitus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.503ENSSSCG00000001708CDC5L9977.503Sus_scrofa
ENSSDUG00000014563cdc5l9978.229ENSTGUG00000013251CDC5L9978.229Taeniopygia_guttata
ENSSDUG00000014563cdc5l10091.544ENSTRUG00000006648cdc5l10091.544Takifugu_rubripes
ENSSDUG00000014563cdc5l9989.163ENSTNIG00000009853cdc5l10089.163Tetraodon_nigroviridis
ENSSDUG00000014563cdc5l6884.842ENSTBEG00000017422CDC5L7784.842Tupaia_belangeri
ENSSDUG00000014563cdc5l9976.885ENSTTRG00000006940CDC5L9976.885Tursiops_truncatus
ENSSDUG00000014563cdc5l6769.510ENSUAMG00000028303CDC5L9770.074Ursus_americanus
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSUMAG00000005223CDC5L9977.379Ursus_maritimus
ENSSDUG00000014563cdc5l9776.952ENSVPAG00000008981CDC5L9976.952Vicugna_pacos
ENSSDUG00000014563cdc5l9977.379ENSVVUG00000029242CDC5L9977.379Vulpes_vulpes
ENSSDUG00000014563cdc5l9969.939ENSXETG00000007885cdc5l9970.208Xenopus_tropicalis
ENSSDUG00000014563cdc5l10092.611ENSXCOG00000014117cdc5l10092.611Xiphophorus_couchianus
ENSSDUG00000014563cdc5l10092.734ENSXMAG00000006816cdc5l10092.734Xiphophorus_maculatus