EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000016033 (Gene tree)
Gene ID: 111234714
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 55937 bases
Position: chrBDQW01000450.1:472698-528634
Accession: 111234714
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000022144	MIF4G	PF02854.19	2.1e-27	1	1
ENSSDUP00000022112	MIF4G	PF02854.19	2.3e-27	1	1
ENSSDUP00000022075	MIF4G	PF02854.19	2.4e-27	1	1
ENSSDUP00000022043	MIF4G	PF02854.19	2.5e-27	1	1
ENSSDUP00000022030	MIF4G	PF02854.19	2.6e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000022551	-	4916	XM_022762879	ENSSDUP00000022144	644 (aa)	XP_022618600	-
ENSSDUT00000022519	-	4991	XM_022762878	ENSSDUP00000022112	669 (aa)	XP_022618599	-
ENSSDUT00000022482	-	5039	XM_022762876	ENSSDUP00000022075	685 (aa)	XP_022618597	-
ENSSDUT00000022437	-	5111	-	ENSSDUP00000022030	709 (aa)	-	-
ENSSDUT00000022450	-	5072	-	ENSSDUP00000022043	696 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSG00000134030	CTIF	99	67.500	Homo_sapiens
ENSSDUG00000016033	ctif	93	96.429	ENSAPOG00000020192	ctif	99	96.429	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000016033	ctif	77	57.734	ENSAMEG00000006759	CTIF	74	63.006	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000016033	ctif	100	86.906	ENSACIG00000017099	ctif	100	84.935	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000016033	ctif	100	87.445	ENSAOCG00000014275	ctif	100	87.299	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000016033	ctif	100	87.849	ENSAPEG00000016975	ctif	100	87.709	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000016033	ctif	100	86.938	ENSATEG00000016752	ctif	100	86.096	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000016033	ctif	99	61.216	ENSACAG00000018006	CTIF	55	66.384	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000016033	ctif	93	68.750	ENSANAG00000024925	CTIF	91	64.550	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000016033	ctif	100	83.939	ENSACLG00000005956	ctif	100	82.402	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000016033	ctif	99	66.141	ENSAMXG00000015964	ctif	100	66.381	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000016033	ctif	85	89.583	ENSBTAG00000018901	CTIF	89	89.583	Bos_taurus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	68.750	ENSCJAG00000004729	CTIF	91	64.550	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000016033	ctif	90	62.500	ENSCAFG00000019076	CTIF	91	66.250	Canis_familiaris
ENSSDUG00000016033	ctif	90	62.500	ENSCAFG00020026482	CTIF	91	66.250	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000016033	ctif	92	68.354	ENSCHIG00000014455	CTIF	73	68.354	Capra_hircus
ENSSDUG00000016033	ctif	90	52.683	ENSTSYG00000030461	CTIF	90	61.813	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000016033	ctif	93	65.060	ENSCAPG00000011865	CTIF	91	65.060	Cavia_aperea
ENSSDUG00000016033	ctif	93	65.060	ENSCPOG00000001049	CTIF	92	65.060	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSCCAG00000022758	CTIF	91	64.021	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSCATG00000038134	CTIF	89	67.500	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000016033	ctif	92	67.500	ENSCLAG00000008174	CTIF	92	64.211	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000016033	ctif	99	54.964	ENSCSAG00000018021	CTIF	92	64.345	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000016033	ctif	89	91.667	ENSCPBG00000025654	CTIF	89	91.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSCANG00000030916	CTIF	90	65.625	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000016033	ctif	92	70.000	ENSCGRG00001020158	Ctif	91	70.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000016033	ctif	92	70.513	ENSCGRG00000000052	Ctif	91	70.513	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000016033	ctif	100	78.243	ENSCSEG00000019857	ctif	100	80.082	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000016033	ctif	100	78.382	ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.801	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000016033	ctif	99	70.791	ENSDARG00000090617	ctif	90	75.073	Danio_rerio
ENSSDUG00000016033	ctif	64	58.280	ENSDNOG00000037310	CTIF	83	63.836	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000016033	ctif	92	67.500	ENSDORG00000003221	Ctif	91	67.500	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000016033	ctif	79	89.583	ENSEASG00005016094	CTIF	72	89.583	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000016033	ctif	83	65.079	ENSECAG00000020473	CTIF	91	65.079	Equus_caballus
ENSSDUG00000016033	ctif	73	63.467	ENSEEUG00000012451	CTIF	90	64.365	Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000016033	ctif	85	83.673	ENSELUG00000008733	ctif	100	65.604	Esox_lucius
ENSSDUG00000016033	ctif	85	89.583	ENSFCAG00000000664	CTIF	89	89.583	Felis_catus
ENSSDUG00000016033	ctif	90	65.000	ENSFALG00000008943	CTIF	88	66.193	Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000016033	ctif	92	67.500	ENSFDAG00000017379	CTIF	91	67.500	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000016033	ctif	100	80.444	ENSFHEG00000004334	ctif	100	79.473	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000016033	ctif	89	91.667	ENSGALG00000035912	-	89	91.667	Gallus_gallus
ENSSDUG00000016033	ctif	92	89.831	ENSGAFG00000011896	ctif	100	89.831	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000016033	ctif	63	54.920	ENSGAGG00000020663	CTIF	86	62.248	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSGGOG00000015204	CTIF	91	67.500	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000016033	ctif	100	84.078	ENSHBUG00000018092	ctif	100	82.542	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000016033	ctif	92	67.500	ENSHGLG00000005663	CTIF	91	67.500	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000016033	ctif	92	66.250	ENSHGLG00100006976	CTIF	91	66.250	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000016033	ctif	80	87.368	ENSHCOG00000011784	ctif	94	87.500	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000016033	ctif	99	67.622	ENSIPUG00000014050	ctif	88	72.619	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	66.250	ENSSTOG00000001967	CTIF	92	62.881	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000016033	ctif	92	68.750	ENSJJAG00000013706	Ctif	91	64.167	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000016033	ctif	100	79.712	ENSKMAG00000014651	ctif	100	79.281	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000016033	ctif	87	93.220	ENSLBEG00000018277	ctif	99	93.220	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000016033	ctif	99	66.861	ENSLOCG00000011697	ctif	100	60.114	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000016033	ctif	97	53.153	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	77.652	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSMFAG00000037903	CTIF	89	67.500	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSMMUG00000020898	CTIF	89	67.500	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSMNEG00000039395	CTIF	89	67.500	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSMLEG00000041132	CTIF	89	67.500	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000016033	ctif	100	85.754	ENSMAMG00000014741	ctif	100	85.196	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000016033	ctif	90	81.221	ENSMZEG00005019767	ctif	90	80.435	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000016033	ctif	75	91.667	ENSMGAG00000001378	CTIF	71	91.667	Meleagris_gallopavo
ENSSDUG00000016033	ctif	92	70.000	ENSMAUG00000000656	Ctif	91	64.286	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000016033	ctif	99	55.523	ENSMICG00000010167	CTIF	91	67.500	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000016033	ctif	99	56.259	ENSMOCG00000020507	Ctif	91	64.578	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000016033	ctif	100	84.127	ENSMMOG00000000831	ctif	100	82.955	Mola_mola
ENSSDUG00000016033	ctif	93	68.675	ENSMODG00000003464	CTIF	92	68.675	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000016033	ctif	69	89.744	ENSMALG00000020553	ctif	100	89.744	Monopterus_albus
ENSSDUG00000016033	ctif	92	67.500	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	91	67.500	Mus_caroli
ENSSDUG00000016033	ctif	92	68.750	ENSMUSG00000052928	Ctif	91	68.750	Mus_musculus
ENSSDUG00000016033	ctif	92	68.750	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	92	68.750	Mus_pahari
ENSSDUG00000016033	ctif	92	68.750	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	88	89.583	Mus_spretus
ENSSDUG00000016033	ctif	92	67.500	ENSMPUG00000000844	CTIF	91	67.500	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000016033	ctif	92	68.750	ENSMLUG00000003025	CTIF	91	68.750	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000016033	ctif	92	68.750	ENSNGAG00000011452	Ctif	91	68.750	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000016033	ctif	100	83.429	ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.857	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSNLEG00000011503	CTIF	91	67.500	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000016033	ctif	85	89.583	ENSMEUG00000000218	CTIF	82	89.583	Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000016033	ctif	92	67.500	ENSOPRG00000003558	CTIF	99	67.500	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000016033	ctif	92	66.667	ENSODEG00000018390	CTIF	92	66.667	Octodon_degus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	88.095	ENSONIG00000007750	ctif	98	88.095	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000016033	ctif	85	48.000	ENSOANG00000001337	CTIF	91	67.708	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	68.750	ENSOCUG00000024842	CTIF	91	68.750	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	90.476	ENSORLG00000005786	ctif	100	90.476	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000016033	ctif	94	89.286	ENSORLG00020005385	ctif	100	89.286	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000016033	ctif	94	90.476	ENSORLG00015011872	ctif	100	90.476	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000016033	ctif	100	80.668	ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.694	Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000016033	ctif	99	55.440	ENSOGAG00000013927	CTIF	91	68.750	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000016033	ctif	92	68.354	ENSOARG00000003754	CTIF	73	68.354	Ovis_aries
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSPPAG00000023554	CTIF	91	67.500	Pan_paniscus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	65.060	ENSPPRG00000002265	CTIF	91	65.079	Panthera_pardus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	65.060	ENSPTIG00000013761	CTIF	91	65.079	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSPTRG00000010009	CTIF	91	67.500	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSPANG00000017087	CTIF	89	67.500	Papio_anubis
ENSSDUG00000016033	ctif	73	67.102	ENSPKIG00000011234	ctif	91	71.387	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000016033	ctif	85	89.583	ENSPSIG00000006508	CTIF	88	89.583	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000016033	ctif	100	76.667	ENSPMGG00000022958	ctif	100	70.185	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.901	ENSPEMG00000022746	Ctif	91	67.901	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000016033	ctif	68	57.407	ENSPCIG00000026247	CTIF	81	70.956	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	89.157	ENSPFOG00000009243	ctif	100	89.157	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000016033	ctif	100	79.750	ENSPLAG00000019171	ctif	100	79.057	Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000016033	ctif	100	79.889	ENSPMEG00000020089	ctif	100	79.057	Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000016033	ctif	100	77.994	ENSPREG00000017326	ctif	100	77.159	Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000016033	ctif	76	59.480	ENSPPYG00000009147	CTIF	90	66.667	Pongo_abelii
ENSSDUG00000016033	ctif	99	53.333	ENSPCOG00000013391	CTIF	91	67.500	Propithecus_coquereli
ENSSDUG00000016033	ctif	92	67.073	ENSPVAG00000001965	CTIF	91	67.073	Pteropus_vampyrus
ENSSDUG00000016033	ctif	100	84.078	ENSPNYG00000007879	ctif	100	89.286	Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000016033	ctif	99	70.160	ENSPNAG00000029174	ctif	100	70.614	Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000016033	ctif	92	67.500	ENSRNOG00000018342	Ctif	91	67.500	Rattus_norvegicus
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSRBIG00000043937	CTIF	92	64.345	Rhinopithecus_bieti
ENSSDUG00000016033	ctif	93	67.500	ENSRROG00000006039	CTIF	92	64.345	Rhinopithecus_roxellana
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ENSSDUG00000016033	ctif	89	60.000	ENSXETG00000026836	ctif	72	70.611	Xenopus_tropicalis
ENSSDUG00000016033	ctif	64	69.595	ENSXCOG00000002477	ctif	95	74.014	Xiphophorus_couchianus
ENSSDUG00000016033	ctif	100	79.079	ENSXMAG00000004236	ctif	100	80.488	Xiphophorus_maculatus