EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000017275 (Gene tree)
Gene ID: 111225790
Gene Symbol: gemin2
Alias: sip1|wu:fc52a05|zgc:110274
Full Name: gem nuclear organelle associated protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4595 bases
Position: chrBDQW01000149.1:18429447-18434041
Accession: 111225790
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000023785	SIP1	PF04938.12	3.7e-77	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000024228	-	1316	XM_022750818	ENSSDUP00000023785	263 (aa)	XP_022606539	UPI000BBF3627

Gene Model

Click here to download ENSSDUG00000017275's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sdu03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSDUG00000017275's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSG00000092208	GEMIN2	94	64.885	Homo_sapiens
ENSSDUG00000017275	gemin2	50	91.791	ENSAPOG00000012870	gemin2	82	91.791	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.259	ENSAMEG00000003856	GEMIN2	95	64.259	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000017275	gemin2	97	85.659	ENSACIG00000014430	gemin2	95	85.659	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	90.189	ENSAOCG00000012349	gemin2	100	90.189	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	90.114	ENSAPEG00000002529	gemin2	100	90.438	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	86.792	ENSATEG00000009574	gemin2	100	86.792	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000017275	gemin2	87	65.066	ENSAPLG00000012052	GEMIN2	99	65.066	Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	62.595	ENSACAG00000015872	GEMIN2	98	62.595	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	49.446	ENSANAG00000026213	GEMIN2	96	49.446	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000017275	gemin2	95	81.746	ENSACLG00000024473	gemin2	99	81.746	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000017275	gemin2	98	71.042	ENSAMXG00000033969	gemin2	99	71.042	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.122	ENSBTAG00000020930	GEMIN2	94	64.122	Bos_taurus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.122	ENSCJAG00000016248	GEMIN2	94	64.122	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSCAFG00000013859	GEMIN2	97	64.885	Canis_familiaris
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSCAFG00020022243	GEMIN2	97	64.885	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSCHIG00000009881	GEMIN2	97	64.885	Capra_hircus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	62.452	ENSTSYG00000032612	-	99	62.452	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSTSYG00000003528	-	94	64.885	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	57.471	ENSCPOG00000011338	GEMIN2	97	57.471	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSCCAG00000035944	GEMIN2	94	64.885	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	49.615	ENSCCAG00000030361	-	89	49.615	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	46.947	ENSCATG00000031373	-	91	46.947	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSCATG00000042473	GEMIN2	97	64.885	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000017275	gemin2	95	63.600	ENSCLAG00000008967	GEMIN2	98	63.600	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000017275	gemin2	98	47.126	ENSCSAG00000016872	-	92	47.126	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	52.091	ENSCHOG00000011644	GEMIN2	94	52.091	Choloepus_hoffmanni
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	65.019	ENSCPBG00000026207	GEMIN2	99	65.019	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000017275	gemin2	88	34.286	ENSCING00000012240	-	85	34.643	Ciona_intestinalis
ENSSDUG00000017275	gemin2	89	35.125	ENSCSAVG00000009875	-	85	35.125	Ciona_savignyi
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSCANG00000035266	GEMIN2	94	64.885	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	46.947	ENSCANG00000033060	-	88	46.947	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.504	ENSCGRG00001017720	Gemin2	97	64.504	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.504	ENSCGRG00000007060	Gemin2	97	64.504	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	80.000	ENSCSEG00000016057	gemin2	100	80.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000017275	gemin2	95	83.071	ENSCVAG00000003125	gemin2	100	83.071	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	70.992	ENSDARG00000015638	gemin2	99	70.992	Danio_rerio
ENSSDUG00000017275	gemin2	74	61.026	ENSDNOG00000018278	GEMIN2	89	61.026	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.122	ENSDORG00000003814	Gemin2	97	64.122	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	63.498	ENSETEG00000006463	GEMIN2	94	63.498	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000017275	gemin2	81	39.535	ENSEBUG00000002198	gemin2	77	40.969	Eptatretus_burgeri
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	65.267	ENSEASG00005007617	GEMIN2	94	65.267	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000017275	gemin2	95	64.542	ENSECAG00000007554	GEMIN2	84	64.542	Equus_caballus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	59.542	ENSEEUG00000008438	GEMIN2	94	59.542	Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	77.099	ENSELUG00000005266	gemin2	99	77.099	Esox_lucius
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.504	ENSFCAG00000029921	GEMIN2	94	64.504	Felis_catus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	65.267	ENSFALG00000006169	GEMIN2	94	65.267	Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	62.977	ENSFDAG00000001562	GEMIN2	97	62.977	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	81.203	ENSFHEG00000020705	gemin2	100	81.203	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000017275	gemin2	88	75.000	ENSGMOG00000009379	gemin2	99	75.000	Gadus_morhua
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	66.038	ENSGALG00000010154	GEMIN2	99	66.038	Gallus_gallus
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	78.358	ENSGAFG00000019641	gemin2	100	78.358	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	87.072	ENSGACG00000012444	gemin2	99	87.072	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000017275	gemin2	88	63.793	ENSGAGG00000003982	GEMIN2	97	63.793	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	46.183	ENSGGOG00000043428	-	78	46.183	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	55.725	ENSGGOG00000016691	GEMIN2	93	55.725	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	87.218	ENSHBUG00000016285	gemin2	100	87.218	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	63.359	ENSHGLG00000004890	GEMIN2	97	63.359	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	63.359	ENSHGLG00100009949	GEMIN2	97	63.359	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	80.755	ENSHCOG00000012786	gemin2	100	80.755	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000017275	gemin2	96	70.588	ENSIPUG00000012821	gemin2	99	70.588	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSSTOG00000006357	GEMIN2	97	64.885	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.504	ENSJJAG00000022975	Gemin2	97	64.504	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	86.090	ENSKMAG00000007880	gemin2	100	86.090	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000017275	gemin2	95	74.104	ENSLBEG00000022377	gemin2	100	74.104	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	66.160	ENSLACG00000004723	GEMIN2	99	66.160	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	68.561	ENSLOCG00000009221	gemin2	99	68.561	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSLAFG00000010321	GEMIN2	97	64.885	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	46.360	ENSMFAG00000003283	-	90	46.360	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSMFAG00000014362	GEMIN2	94	64.885	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSMMUG00000021028	GEMIN2	97	64.885	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	48.077	ENSMMUG00000001073	-	87	48.077	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSMNEG00000033286	GEMIN2	97	64.885	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	47.510	ENSMNEG00000033555	-	89	47.510	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSMLEG00000035575	GEMIN2	95	64.885	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	46.816	ENSMLEG00000008946	-	89	46.816	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000017275	gemin2	96	84.646	ENSMAMG00000012985	gemin2	99	84.646	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	87.218	ENSMZEG00005007915	gemin2	100	87.218	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000017275	gemin2	87	66.379	ENSMGAG00000012566	GEMIN2	99	66.379	Meleagris_gallopavo
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.122	ENSMAUG00000017447	Gemin2	97	64.122	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	50.382	ENSMICG00000043979	-	97	50.382	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.122	ENSMICG00000004811	-	92	64.122	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.122	ENSMOCG00000023031	Gemin2	97	64.122	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000017275	gemin2	95	86.905	ENSMMOG00000004604	gemin2	100	79.767	Mola_mola
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	66.160	ENSMODG00000011946	GEMIN2	99	66.160	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	86.792	ENSMALG00000021507	gemin2	100	86.792	Monopterus_albus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.504	MGP_CAROLIEiJ_G0017777	Gemin2	97	64.504	Mus_caroli
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.504	ENSMUSG00000060121	Gemin2	97	64.504	Mus_musculus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.504	MGP_PahariEiJ_G0029533	Gemin2	97	64.504	Mus_pahari
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.122	MGP_SPRETEiJ_G0018622	Gemin2	97	64.122	Mus_spretus
ENSSDUG00000017275	gemin2	98	65.251	ENSMPUG00000016240	GEMIN2	96	65.251	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000017275	gemin2	97	62.745	ENSMLUG00000002619	GEMIN2	97	62.745	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	63.740	ENSNGAG00000001053	Gemin2	97	63.740	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSNLEG00000004013	GEMIN2	96	64.885	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000017275	gemin2	95	61.600	ENSMEUG00000011734	-	92	61.600	Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	58.868	ENSOPRG00000007714	GEMIN2	94	58.868	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	63.359	ENSODEG00000000272	GEMIN2	97	63.359	Octodon_degus
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	86.842	ENSONIG00000019495	gemin2	100	86.842	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000017275	gemin2	98	63.707	ENSOANG00000014013	-	95	63.707	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	62.214	ENSOCUG00000000673	GEMIN2	93	62.214	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	76.628	ENSORLG00000017666	gemin2	99	76.628	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	80.989	ENSORLG00020016613	gemin2	99	80.989	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	81.369	ENSORLG00015013224	gemin2	99	81.369	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	83.525	ENSOMEG00000011576	gemin2	99	83.525	Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.122	ENSOGAG00000007906	GEMIN2	94	64.122	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.639	ENSOARG00000008466	GEMIN2	94	64.639	Ovis_aries
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	47.126	ENSPPAG00000033797	-	82	50.000	Pan_paniscus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	59.353	ENSPPAG00000043467	GEMIN2	94	59.353	Pan_paniscus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.504	ENSPPRG00000009485	GEMIN2	94	64.504	Panthera_pardus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.504	ENSPTIG00000018115	GEMIN2	97	64.504	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	47.126	ENSPTRG00000045455	-	78	47.126	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSPTRG00000006291	GEMIN2	94	64.885	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	47.566	ENSPANG00000034146	-	89	47.566	Papio_anubis
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	53.232	ENSPANG00000011343	-	95	53.232	Papio_anubis
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	73.946	ENSPKIG00000010339	gemin2	99	73.946	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	63.498	ENSPSIG00000013560	GEMIN2	88	63.498	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000017275	gemin2	98	78.846	ENSPMGG00000008763	gemin2	100	78.846	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.122	ENSPEMG00000008079	Gemin2	97	64.122	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000017275	gemin2	85	49.187	ENSPMAG00000009804	gemin2	91	49.793	Petromyzon_marinus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	66.540	ENSPCIG00000025754	GEMIN2	79	66.540	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	84.644	ENSPFOG00000014660	gemin2	100	84.644	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	84.586	ENSPLAG00000020265	gemin2	100	84.586	Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	84.211	ENSPMEG00000011134	gemin2	100	84.211	Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	79.401	ENSPREG00000007692	gemin2	100	79.401	Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSPPYG00000005764	GEMIN2	94	64.885	Pongo_abelii
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	56.705	ENSPCAG00000005387	GEMIN2	93	56.705	Procavia_capensis
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	60.305	ENSPCOG00000016964	GEMIN2	93	60.305	Propithecus_coquereli
ENSSDUG00000017275	gemin2	95	64.000	ENSPVAG00000002586	GEMIN2	95	64.000	Pteropus_vampyrus
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	87.218	ENSPNYG00000022626	gemin2	100	87.218	Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	72.075	ENSPNAG00000017346	gemin2	99	72.075	Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	63.740	ENSRNOG00000004360	Gemin2	97	63.740	Rattus_norvegicus
ENSSDUG00000017275	gemin2	95	44.000	ENSRBIG00000038026	-	76	53.279	Rhinopithecus_bieti
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSRBIG00000034601	GEMIN2	97	64.885	Rhinopithecus_bieti
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSRROG00000042627	GEMIN2	94	64.885	Rhinopithecus_roxellana
ENSSDUG00000017275	gemin2	95	64.683	ENSSBOG00000022280	GEMIN2	97	64.683	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSDUG00000017275	gemin2	59	60.645	ENSSHAG00000000156	-	95	60.645	Sarcophilus_harrisii
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	74.046	ENSSFOG00015012315	gemin2	99	74.046	Scleropages_formosus
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	87.547	ENSSMAG00000011151	gemin2	100	87.547	Scophthalmus_maximus
ENSSDUG00000017275	gemin2	96	98.419	ENSSLDG00000023429	gemin2	98	98.419	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000017275	gemin2	94	63.052	ENSSARG00000010294	GEMIN2	93	63.052	Sorex_araneus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	57.795	ENSSPUG00000017222	GEMIN2	99	57.795	Sphenodon_punctatus
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	90.566	ENSSPAG00000001354	gemin2	100	90.566	Stegastes_partitus
ENSSDUG00000017275	gemin2	98	65.000	ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	65.000	Sus_scrofa
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	65.267	ENSTGUG00000012039	GEMIN2	99	65.267	Taeniopygia_guttata
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	80.000	ENSTRUG00000021760	gemin2	98	80.000	Takifugu_rubripes
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	83.396	ENSTNIG00000016875	gemin2	100	83.396	Tetraodon_nigroviridis
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	65.267	ENSTBEG00000002654	GEMIN2	94	65.267	Tupaia_belangeri
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	54.962	ENSTTRG00000017126	GEMIN2	94	54.962	Tursiops_truncatus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	63.740	ENSUAMG00000021811	GEMIN2	97	63.740	Ursus_americanus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.122	ENSUMAG00000008366	GEMIN2	97	64.122	Ursus_maritimus
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSVPAG00000006856	GEMIN2	94	64.885	Vicugna_pacos
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSVVUG00000020954	GEMIN2	94	64.885	Vulpes_vulpes
ENSSDUG00000017275	gemin2	99	64.885	ENSXETG00000000298	gemin2	96	64.885	Xenopus_tropicalis
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	79.401	ENSXCOG00000014021	gemin2	100	79.401	Xiphophorus_couchianus
ENSSDUG00000017275	gemin2	100	79.323	ENSXMAG00000009532	gemin2	100	79.323	Xiphophorus_maculatus