EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000017513 (Gene tree)
Gene ID: 111239295
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 33736 bases
Position: chrBDQW01002262.1:67962-101697
Accession: 111239295
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000024194	RIX1	PF08167.12	7.2e-07	1	1
ENSSDUP00000024307	IBN_N	PF03810.19	7e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000024763	-	3123	-	ENSSDUP00000024307	1040 (aa)	-	-
ENSSDUT00000024649	-	3141	XM_022769139	ENSSDUP00000024194	1046 (aa)	XP_022624860	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.123	ENSG00000196497	IPO4	99	43.526	Homo_sapiens
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	78.657	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	78.657	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.435	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	42.251	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	78.716	ENSACIG00000004246	ipo4	100	78.440	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	81.227	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	81.685	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	81.502	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	81.777	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000017513	ipo4	92	85.913	ENSATEG00000017082	ipo4	99	85.813	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000017513	ipo4	84	43.436	ENSACAG00000003973	-	98	44.253	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.070	ENSANAG00000037973	IPO4	99	42.936	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	78.913	ENSACLG00000019742	ipo4	100	78.913	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	69.991	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	69.152	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.634	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.015	Bos_taurus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.721	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	43.761	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	43.762	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	43.790	Canis_familiaris
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	43.361	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	42.711	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	42.737	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	43.382	Capra_hircus
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	42.684	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	42.739	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.015	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	43.290	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.070	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	43.486	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.216	ENSCATG00000040395	IPO4	99	43.670	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.107	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	43.382	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000017513	ipo4	90	44.049	ENSCPBG00000025757	IPO4	97	41.511	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000017513	ipo4	92	36.141	ENSCING00000008639	-	99	35.172	Ciona_intestinalis
ENSSDUG00000017513	ipo4	92	35.693	ENSCSAVG00000011482	-	98	35.103	Ciona_savignyi
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.123	ENSCANG00000029513	IPO4	99	43.578	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.081	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	42.057	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.081	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	42.057	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	75.824	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	75.458	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	71.521	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	71.520	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	72.594	ENSDARG00000041493	ipo4	100	72.294	Danio_rerio
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.422	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	43.330	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	43.110	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	43.382	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000017513	ipo4	97	30.535	FBgn0042177	CG32164	85	32.334	Drosophila_melanogaster
ENSSDUG00000017513	ipo4	97	30.563	FBgn0042178	CG32165	85	32.161	Drosophila_melanogaster
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.346	ENSETEG00000018381	IPO4	99	42.491	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000017513	ipo4	90	44.995	ENSEASG00005011954	IPO4	96	44.848	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.698	ENSECAG00000009909	IPO4	99	43.658	Equus_caballus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	71.248	ENSELUG00000020628	ipo4	100	71.835	Esox_lucius
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.790	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	43.698	Felis_catus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	40.055	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	39.835	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000017513	ipo4	89	78.503	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	78.503	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	75.207	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	75.207	Gadus_morhua
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	76.670	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	76.670	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	78.952	ENSGACG00000002276	ipo4	99	78.952	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.216	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	43.578	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	79.650	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	79.650	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.238	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	43.382	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.962	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	43.107	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	76.449	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	76.087	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	70.772	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	70.772	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.974	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	44.301	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	42.937	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	42.844	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	77.727	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	77.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	80.900	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	81.084	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	48.477	ENSLACG00000001428	IPO4	100	48.656	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000017513	ipo4	80	61.250	ENSLOCG00000001149	ipo4	87	61.250	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.486	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	43.119	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.216	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	43.670	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.309	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	43.761	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.123	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	43.578	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.216	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	43.761	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	81.066	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	81.066	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	79.650	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	79.650	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.041	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	43.002	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	43.762	ENSMICG00000001719	IPO4	99	43.934	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	42.365	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	42.883	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	79.298	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	79.667	Mola_mola
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	41.713	ENSMODG00000003337	IPO4	97	41.414	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	80.847	ENSMALG00000001587	ipo4	100	81.031	Monopterus_albus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.188	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	43.350	Mus_caroli
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.004	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	43.227	Mus_musculus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.226	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	99	43.403	Mus_pahari
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.096	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	43.227	Mus_spretus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	44.158	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	44.301	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.818	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	42.923	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.462	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	43.382	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	82.445	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	82.445	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.434	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	43.578	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.474	ENSODEG00000002609	IPO4	99	43.750	Octodon_degus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	82.353	ENSONIG00000014574	ipo4	100	82.353	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.028	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	43.211	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	74.427	ENSORLG00000006457	ipo4	99	77.099	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	76.033	ENSORLG00020004286	ipo4	100	76.217	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	76.217	ENSORLG00015021856	ipo4	100	76.400	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	74.119	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	73.842	Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	42.644	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	42.962	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.096	ENSOARG00000019188	IPO4	99	42.608	Ovis_aries
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.216	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	43.251	Pan_paniscus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.882	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	43.790	Panthera_pardus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.790	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	43.698	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.123	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	43.578	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.309	ENSPANG00000026278	IPO4	99	43.761	Papio_anubis
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	66.267	ENSPKIG00000007683	-	99	64.695	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	64.286	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	64.625	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	76.682	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	76.777	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	41.621	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	41.529	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000017513	ipo4	95	43.075	ENSPCIG00000010718	IPO4	99	42.612	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	77.381	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	77.106	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	77.473	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	77.198	Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	77.381	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	77.106	Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	76.832	ENSPREG00000017605	ipo4	100	76.832	Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.030	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	43.303	Pongo_abelii
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	44.465	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	44.393	Procavia_capensis
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	43.017	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	43.054	Propithecus_coquereli
ENSSDUG00000017513	ipo4	98	43.296	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	43.514	Pteropus_vampyrus
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	80.681	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	80.681	Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000017513	ipo4	100	72.033	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	72.426	Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	42.318	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	42.226	Rattus_norvegicus
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.123	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	43.578	Rhinopithecus_bieti
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.216	ENSRROG00000011492	IPO4	99	43.670	Rhinopithecus_roxellana
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	44.148	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	43.797	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSDUG00000017513	ipo4	99	43.080	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	43.092	Sarcophilus_harrisii
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