EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000017948 (Gene tree)
Gene ID: 111225688
Gene Symbol: nrde2
Alias: c14orf102
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8989 bases
Position: chrBDQW01000149.1:18627686-18636674
Accession: 111225688
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000024704	NRDE-2	PF08424.10	1.2e-100	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000025163	-	3852	XM_022750706	ENSSDUP00000024704	1208 (aa)	XP_022606427	UPI000BBE945F

Gene Model

Click here to download ENSSDUG00000017948's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSDUG00000017948's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.984	ENSG00000119720	NRDE2	100	66.829	Homo_sapiens
ENSSDUG00000017948	nrde2	100	80.608	ENSAPOG00000009202	nrde2	100	80.855	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.395	ENSAMEG00000001807	NRDE2	100	45.528	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000017948	nrde2	97	75.726	ENSACIG00000014783	nrde2	100	76.154	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000017948	nrde2	100	81.168	ENSAOCG00000015576	nrde2	99	81.414	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000017948	nrde2	100	80.592	ENSAPEG00000001711	nrde2	100	80.839	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000017948	nrde2	100	80.811	ENSATEG00000010247	nrde2	100	80.976	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000017948	nrde2	98	48.066	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	48.072	Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	44.814	ENSACAG00000014571	NRDE2	100	45.169	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	43.613	ENSANAG00000025313	NRDE2	100	44.516	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	76.442	ENSACLG00000025154	nrde2	100	76.853	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000017948	nrde2	86	76.190	ENSAMXG00000034642	nrde2	92	48.457	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.185	ENSBTAG00000005427	NRDE2	100	45.816	Bos_taurus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.010	ENSCJAG00000017711	NRDE2	100	47.087	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	43.555	ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.604	Canis_familiaris
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.810	ENSCAFG00020016346	NRDE2	100	45.786	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.953	ENSCHIG00000005876	NRDE2	100	45.654	Capra_hircus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.596	ENSTSYG00000000161	NRDE2	100	47.068	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000017948	nrde2	97	46.269	ENSCAPG00000012039	NRDE2	90	48.636	Cavia_aperea
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.405	ENSCPOG00000002428	NRDE2	100	45.898	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.714	ENSCCAG00000024917	NRDE2	100	46.564	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.045	ENSCLAG00000015185	NRDE2	100	44.984	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.148	ENSCSAG00000011451	NRDE2	100	45.455	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000017948	nrde2	74	45.192	ENSCHOG00000006165	NRDE2	75	45.455	Choloepus_hoffmanni
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.310	ENSCPBG00000008537	NRDE2	98	46.602	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.475	ENSCANG00000029067	NRDE2	100	46.796	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.759	ENSCGRG00001015658	Nrde2	100	45.234	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.041	ENSCGRG00000005062	Nrde2	100	45.381	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000017948	nrde2	96	71.245	ENSCSEG00000000089	nrde2	100	71.404	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	74.046	ENSCVAG00000023105	nrde2	100	74.752	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	55.601	ENSDARG00000074726	nrde2	100	55.153	Danio_rerio
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.721	ENSDNOG00000024057	NRDE2	100	44.830	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000017948	nrde2	79	46.514	ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.598	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000017948	nrde2	63	52.632	ENSETEG00000000198	NRDE2	63	52.632	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	40.080	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	40.048	Eptatretus_burgeri
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	47.088	ENSEASG00005020675	NRDE2	100	46.834	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	47.179	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	46.553	Equus_caballus
ENSSDUG00000017948	nrde2	64	59.398	ENSEEUG00000004026	-	69	59.398	Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	59.967	ENSELUG00000005973	nrde2	100	59.524	Esox_lucius
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.672	ENSFCAG00000011312	NRDE2	100	46.867	Felis_catus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.883	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	46.796	Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.864	ENSFDAG00000021350	NRDE2	100	45.337	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	73.377	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	73.706	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000017948	nrde2	64	72.314	ENSGMOG00000015815	nrde2	92	71.486	Gadus_morhua
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	47.126	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	47.476	Gallus_gallus
ENSSDUG00000017948	nrde2	92	72.491	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	76.483	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	76.500	ENSGACG00000012619	nrde2	100	76.708	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.330	ENSGAGG00000003252	NRDE2	100	45.587	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.902	ENSGGOG00000008835	NRDE2	100	45.499	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	76.030	ENSHBUG00000016736	nrde2	100	77.018	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.286	ENSHGLG00000006731	NRDE2	100	46.672	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000017948	nrde2	97	46.262	ENSHGLG00100017736	NRDE2	90	48.235	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000017948	nrde2	92	67.925	ENSHCOG00000009559	nrde2	97	68.268	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	50.000	ENSIPUG00000016129	nrde2	100	49.261	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.090	ENSSTOG00000001678	NRDE2	100	45.219	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.292	ENSJJAG00000000907	Nrde2	100	46.365	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	76.980	ENSKMAG00000008647	nrde2	100	77.063	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000017948	nrde2	95	76.038	ENSLBEG00000021428	nrde2	98	78.776	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000017948	nrde2	71	50.812	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.928	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	53.284	ENSLOCG00000009037	nrde2	100	52.742	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000017948	nrde2	97	45.050	ENSLAFG00000004966	NRDE2	91	46.968	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000017948	nrde2	79	48.750	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	67.317	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000017948	nrde2	100	81.638	ENSMAMG00000013452	nrde2	100	81.886	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	76.277	ENSMZEG00005008319	nrde2	100	76.689	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000017948	nrde2	86	47.970	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	48.384	Meleagris_gallopavo
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.878	ENSMAUG00000018578	Nrde2	100	45.352	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.417	ENSMICG00000016741	NRDE2	100	46.029	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	44.127	ENSMOCG00000014472	Nrde2	100	43.700	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000017948	nrde2	75	73.304	ENSMMOG00000004703	nrde2	93	73.304	Mola_mola
ENSSDUG00000017948	nrde2	94	43.261	ENSMODG00000002711	NRDE2	100	43.693	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000017948	nrde2	91	76.337	ENSMALG00000021869	nrde2	99	76.471	Monopterus_albus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.091	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.594	Mus_caroli
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.054	ENSMUSG00000021179	Nrde2	100	45.528	Mus_musculus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.640	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	45.682	Mus_pahari
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.192	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	90	62.712	Mus_spretus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.008	ENSMPUG00000008135	NRDE2	100	45.337	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.581	ENSMLUG00000007484	NRDE2	100	44.976	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.380	ENSNGAG00000002993	Nrde2	100	44.777	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000017948	nrde2	92	73.929	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	76.007	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	44.976	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	44.724	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000017948	nrde2	74	48.207	ENSMEUG00000011097	NRDE2	74	48.221	Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000017948	nrde2	58	60.000	ENSOPRG00000001375	-	60	62.376	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000017948	nrde2	91	46.510	ENSODEG00000012422	NRDE2	91	46.649	Octodon_degus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	75.287	ENSONIG00000019512	nrde2	100	75.369	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.399	ENSOCUG00000010083	NRDE2	99	45.985	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000017948	nrde2	96	69.291	ENSORLG00000017730	nrde2	99	69.896	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	71.841	ENSORLG00020015965	nrde2	100	72.254	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	72.254	ENSORLG00015012437	nrde2	100	72.832	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	72.780	ENSOMEG00000010890	nrde2	100	73.109	Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.776	ENSOGAG00000006624	NRDE2	100	45.992	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000017948	nrde2	97	44.073	ENSOARG00000003475	NRDE2	90	46.097	Ovis_aries
ENSSDUG00000017948	nrde2	97	46.012	ENSPPAG00000034133	NRDE2	96	49.579	Pan_paniscus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.391	ENSPPRG00000006422	NRDE2	100	46.710	Panthera_pardus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.391	ENSPTIG00000009989	NRDE2	100	46.710	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.984	ENSPTRG00000023399	NRDE2	100	45.580	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	50.452	ENSPKIG00000009331	nrde2	100	50.822	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.884	ENSPSIG00000005588	NRDE2	87	47.886	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000017948	nrde2	97	65.195	ENSPMGG00000024089	nrde2	100	65.025	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.884	ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	45.440	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000017948	nrde2	52	43.086	ENSPMAG00000003270	-	99	44.970	Petromyzon_marinus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.847	ENSPCIG00000018567	NRDE2	100	45.350	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	73.086	ENSPFOG00000013217	nrde2	99	73.086	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	75.144	ENSPLAG00000022350	nrde2	99	75.144	Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	75.144	ENSPMEG00000000778	nrde2	99	75.144	Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	75.453	ENSPREG00000009066	nrde2	99	75.453	Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000017948	nrde2	85	46.512	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	46.648	Pongo_abelii
ENSSDUG00000017948	nrde2	69	67.692	ENSPCAG00000016399	NRDE2	69	67.692	Procavia_capensis
ENSSDUG00000017948	nrde2	94	45.106	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	44.397	Propithecus_coquereli
ENSSDUG00000017948	nrde2	96	44.239	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	43.493	Pteropus_vampyrus
ENSSDUG00000017948	nrde2	98	74.538	ENSPNYG00000022833	nrde2	97	78.586	Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000017948	nrde2	92	54.675	ENSPNAG00000015807	nrde2	97	54.586	Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000017948	nrde2	90	45.714	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	44.831	Rattus_norvegicus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.775	ENSSBOG00000024346	NRDE2	100	45.979	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.068	ENSSHAG00000016736	NRDE2	97	45.272	Sarcophilus_harrisii
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	53.263	ENSSFOG00015011794	nrde2	100	53.181	Scleropages_formosus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	84.411	ENSSMAG00000011671	nrde2	99	84.685	Scophthalmus_maximus
ENSSDUG00000017948	nrde2	95	90.035	ENSSLDG00000023798	nrde2	100	90.035	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000017948	nrde2	92	47.364	ENSSPUG00000006348	NRDE2	97	48.022	Sphenodon_punctatus
ENSSDUG00000017948	nrde2	95	77.768	ENSSPAG00000000539	nrde2	100	78.030	Stegastes_partitus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.775	ENSSSCG00000002434	NRDE2	100	45.942	Sus_scrofa
ENSSDUG00000017948	nrde2	98	47.303	ENSTGUG00000012462	-	99	47.220	Taeniopygia_guttata
ENSSDUG00000017948	nrde2	79	71.083	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	71.083	Takifugu_rubripes
ENSSDUG00000017948	nrde2	86	51.092	ENSTBEG00000011834	NRDE2	83	52.262	Tupaia_belangeri
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.782	ENSTTRG00000013583	NRDE2	100	46.911	Tursiops_truncatus
ENSSDUG00000017948	nrde2	90	46.357	ENSUAMG00000004159	NRDE2	94	47.011	Ursus_americanus
ENSSDUG00000017948	nrde2	90	45.620	ENSUMAG00000006393	NRDE2	97	45.902	Ursus_maritimus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.924	ENSVVUG00000018202	NRDE2	100	45.615	Vulpes_vulpes
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	43.636	ENSXETG00000015708	nrde2	90	45.678	Xenopus_tropicalis
ENSSDUG00000017948	nrde2	94	71.454	ENSXCOG00000013298	nrde2	98	71.173	Xiphophorus_couchianus
ENSSDUG00000017948	nrde2	99	75.082	ENSXMAG00000009320	nrde2	100	75.000	Xiphophorus_maculatus