EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000019070 (Gene tree)
Gene ID: 111223951
Gene Symbol: mars
Alias: id:ibd5106
Full Name: methionyl-tRNA synthetase
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 33002 bases
Position: chrBDQW01000121.1:2064364-2097365
Accession: 111223951
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000026300	tRNA-synt_1g	PF09334.11	3.1e-149	1	1
ENSSDUP00000026326	tRNA-synt_1g	PF09334.11	3.1e-149	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000026797	-	5281	-	ENSSDUP00000026326	920 (aa)	-	UPI000BBE31FF
ENSSDUT00000026771	-	3698	XM_022748265	ENSSDUP00000026300	920 (aa)	XP_022603986	UPI000BBE31FF

Gene Model

Click here to download ENSSDUG00000019070's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sdu00450	Selenocompound metabolism	KEGG
sdu00970	Aminoacyl-tRNA biosynthesis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSDUG00000019070's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.489	ENSG00000166986	MARS	100	63.272	Homo_sapiens
ENSSDUG00000019070	mars	100	90.652	ENSAPOG00000020238	mars	99	90.109	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.489	ENSAMEG00000004962	MARS	100	63.597	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000019070	mars	100	88.043	ENSACIG00000016271	mars	100	88.243	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000019070	mars	100	90.435	ENSAOCG00000011411	mars	99	89.891	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000019070	mars	100	90.000	ENSAPEG00000008610	mars	99	89.457	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000019070	mars	100	91.857	ENSATEG00000025019	mars	100	91.857	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000019070	mars	93	65.197	ENSAPLG00000014821	MARS	100	64.767	Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000019070	mars	99	60.917	ENSACAG00000006698	MARS	99	60.699	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.164	ENSANAG00000027589	MARS	100	62.514	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000019070	mars	100	88.478	ENSACLG00000018937	mars	100	88.043	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000019070	mars	100	76.052	ENSAMXG00000017335	mars	100	70.366	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000019070	mars	99	62.907	ENSBTAG00000018405	MARS	100	62.581	Bos_taurus
ENSSDUG00000019070	mars	72	54.925	WBGene00003415	mars-1	85	59.107	Caenorhabditis_elegans
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.839	ENSCJAG00000007249	MARS	100	62.297	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.514	ENSCAFG00000000229	MARS	100	62.514	Canis_familiaris
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.514	ENSCAFG00020023661	MARS	100	62.514	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.839	ENSCHIG00000027023	MARS	100	62.622	Capra_hircus
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.297	ENSTSYG00000005193	MARS	100	62.297	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000019070	mars	82	61.155	ENSCAPG00000014448	MARS	99	61.155	Cavia_aperea
ENSSDUG00000019070	mars	99	62.581	ENSCPOG00000012866	MARS	100	62.256	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.839	ENSCCAG00000032206	MARS	100	62.405	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000019070	mars	99	62.935	ENSCATG00000038907	MARS	100	62.609	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000019070	mars	97	63.647	ENSCLAG00000012164	MARS	99	63.423	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.002	ENSCSAG00000004852	MARS	100	61.787	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.148	ENSCPBG00000017136	MARS	99	61.781	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000019070	mars	74	60.146	ENSCING00000018550	-	99	59.568	Ciona_intestinalis
ENSSDUG00000019070	mars	62	64.550	ENSCSAVG00000006145	-	97	64.550	Ciona_savignyi
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.055	ENSCANG00000034583	MARS	100	62.839	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.947	ENSCGRG00001019238	Mars	100	62.405	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.947	ENSCGRG00000017321	Mars	100	62.405	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000019070	mars	99	86.601	ENSCSEG00000010816	mars	99	86.928	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000019070	mars	100	86.413	ENSCVAG00000009314	mars	99	86.413	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000019070	mars	100	73.319	ENSDARG00000034396	mars	97	72.935	Danio_rerio
ENSSDUG00000019070	mars	99	62.798	ENSDNOG00000017502	MARS	100	62.148	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.987	ENSDORG00000007127	Mars	100	62.662	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000019070	mars	98	49.402	FBgn0034401	MetRS	86	49.140	Drosophila_melanogaster
ENSSDUG00000019070	mars	60	67.631	ENSETEG00000007106	MARS	100	67.089	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000019070	mars	59	60.256	ENSEBUG00000010439	mars	87	60.256	Eptatretus_burgeri
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.164	ENSEASG00005007208	MARS	100	62.839	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.164	ENSECAG00000015175	MARS	100	62.839	Equus_caballus
ENSSDUG00000019070	mars	89	60.426	ENSEEUG00000015503	MARS	89	60.426	Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000019070	mars	100	78.548	ENSELUG00000010453	mars	100	77.849	Esox_lucius
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.597	ENSFCAG00000002083	MARS	100	63.055	Felis_catus
ENSSDUG00000019070	mars	100	61.105	ENSFDAG00000010217	MARS	100	60.997	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000019070	mars	100	86.630	ENSFHEG00000016374	mars	100	86.087	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000019070	mars	100	78.936	ENSGMOG00000007987	mars	100	78.936	Gadus_morhua
ENSSDUG00000019070	mars	92	61.983	ENSGALG00000039315	MARS	95	60.023	Gallus_gallus
ENSSDUG00000019070	mars	99	86.150	ENSGAFG00000013461	mars	100	83.064	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000019070	mars	100	89.022	ENSGACG00000006474	mars	100	88.587	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000019070	mars	96	65.650	ENSGAGG00000011640	MARS	97	65.311	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.380	ENSGGOG00000001982	MARS	100	63.164	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000019070	mars	91	89.365	ENSHBUG00000009575	mars	96	89.365	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000019070	mars	96	54.030	ENSHGLG00000019739	-	93	53.689	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.959	ENSHGLG00000013493	MARS	100	62.743	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000019070	mars	96	52.781	ENSHGLG00100004906	-	93	52.667	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.959	ENSHGLG00100006885	MARS	100	62.743	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000019070	mars	100	83.406	ENSHCOG00000001090	mars	100	83.279	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000019070	mars	90	74.607	ENSIPUG00000024410	mars	98	74.607	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000019070	mars	66	79.538	ENSIPUG00000024413	mars	98	79.538	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.121	ENSSTOG00000001128	MARS	100	62.229	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.771	ENSJJAG00000018827	Mars	100	62.338	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000019070	mars	100	88.043	ENSKMAG00000012408	mars	99	88.822	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000019070	mars	100	89.783	ENSLBEG00000013609	mars	100	89.022	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000019070	mars	100	65.330	ENSLACG00000018854	MARS	99	64.859	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000019070	mars	99	62.514	ENSLAFG00000013525	MARS	100	62.297	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.164	ENSMFAG00000010123	MARS	100	62.839	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.055	ENSMMUG00000011277	MARS	100	62.839	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.080	ENSMNEG00000044464	MARS	100	61.863	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000019070	mars	90	68.000	ENSMLEG00000034638	MARS	99	67.600	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000019070	mars	96	88.851	ENSMAMG00000010012	mars	97	88.851	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000019070	mars	100	88.370	ENSMZEG00005007092	mars	100	87.935	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000019070	mars	100	61.863	ENSMAUG00000011482	Mars	100	61.647	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000019070	mars	99	62.907	ENSMICG00000032056	MARS	100	62.690	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.055	ENSMOCG00000010941	Mars	100	62.514	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000019070	mars	99	84.004	ENSMMOG00000007461	mars	99	83.678	Mola_mola
ENSSDUG00000019070	mars	100	90.347	ENSMALG00000010005	mars	100	90.239	Monopterus_albus
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.164	MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	62.987	Mus_caroli
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.622	ENSMUSG00000040354	Mars	100	62.446	Mus_musculus
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.405	MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	62.189	Mus_pahari
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.839	MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	62.662	Mus_spretus
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.489	ENSMPUG00000001831	MARS	100	63.164	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.055	ENSMLUG00000001037	MARS	100	62.839	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.622	ENSNGAG00000018824	Mars	100	62.405	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000019070	mars	95	86.900	ENSNBRG00000004105	mars	100	86.900	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.272	ENSNLEG00000017297	MARS	100	63.055	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000019070	mars	89	63.107	ENSMEUG00000007195	MARS	100	63.126	Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000019070	mars	100	60.563	ENSOPRG00000006518	MARS	100	60.238	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.380	ENSODEG00000001752	MARS	100	63.164	Octodon_degus
ENSSDUG00000019070	mars	100	87.729	ENSONIG00000005090	mars	100	87.392	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000019070	mars	72	63.843	ENSOANG00000013318	MARS	100	63.843	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.622	ENSOCUG00000007373	MARS	100	62.189	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000019070	mars	100	84.783	ENSORLG00000005405	mars	100	84.565	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000019070	mars	100	85.109	ENSORLG00020017397	mars	100	84.891	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000019070	mars	100	84.565	ENSORLG00015012976	mars	100	84.348	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000019070	mars	100	85.543	ENSOMEG00000018411	mars	100	85.109	Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.527	ENSOGAG00000005226	MARS	100	62.311	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.839	ENSOARG00000006477	MARS	100	62.622	Ovis_aries
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.124	ENSPPAG00000025147	MARS	100	62.907	Pan_paniscus
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.380	ENSPPRG00000023243	MARS	100	62.947	Panthera_pardus
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.489	ENSPTIG00000006721	MARS	100	63.055	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.489	ENSPTRG00000005135	MARS	100	63.272	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.055	ENSPANG00000009140	MARS	100	62.730	Papio_anubis
ENSSDUG00000019070	mars	100	73.398	ENSPKIG00000002833	mars	100	73.073	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000019070	mars	82	48.148	ENSPSIG00000013607	MARS	99	41.278	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000019070	mars	99	84.188	ENSPMGG00000014847	mars	99	83.698	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.272	ENSPEMG00000000046	Mars	100	63.055	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000019070	mars	99	62.581	ENSPCIG00000023765	MARS	100	62.364	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000019070	mars	100	86.196	ENSPFOG00000006998	mars	100	86.087	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000019070	mars	100	86.413	ENSPLAG00000017870	mars	100	86.304	Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000019070	mars	100	86.196	ENSPMEG00000008197	mars	100	86.087	Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000019070	mars	100	86.630	ENSPREG00000008123	mars	100	85.652	Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.380	ENSPPYG00000004691	MARS	100	63.164	Pongo_abelii
ENSSDUG00000019070	mars	85	63.903	ENSPCAG00000016037	MARS	88	63.776	Procavia_capensis
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.839	ENSPCOG00000017598	MARS	100	62.622	Propithecus_coquereli
ENSSDUG00000019070	mars	80	60.152	ENSPVAG00000012112	MARS	80	60.303	Pteropus_vampyrus
ENSSDUG00000019070	mars	100	88.043	ENSPNYG00000013809	mars	100	87.609	Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000019070	mars	100	77.223	ENSPNAG00000017290	mars	100	77.007	Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.622	ENSRNOG00000025459	Mars	100	62.514	Rattus_norvegicus
ENSSDUG00000019070	mars	99	62.758	ENSRBIG00000044782	MARS	99	62.432	Rhinopithecus_bieti
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.409	ENSRROG00000042331	MARS	100	63.084	Rhinopithecus_roxellana
ENSSDUG00000019070	mars	63	52.137	YGR264C	MES1	76	52.137	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSDUG00000019070	mars	100	60.281	ENSSBOG00000022875	MARS	100	59.632	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSDUG00000019070	mars	99	63.449	ENSSHAG00000007182	MARS	100	62.907	Sarcophilus_harrisii
ENSSDUG00000019070	mars	100	73.073	ENSSFOG00015011038	mars	99	72.935	Scleropages_formosus
ENSSDUG00000019070	mars	100	91.413	ENSSMAG00000012409	mars	100	91.413	Scophthalmus_maximus
ENSSDUG00000019070	mars	90	99.637	ENSSLDG00000005561	mars	95	99.637	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000019070	mars	92	68.313	ENSSARG00000002477	MARS	92	68.107	Sorex_araneus
ENSSDUG00000019070	mars	85	68.421	ENSSPUG00000007756	MARS	99	66.667	Sphenodon_punctatus
ENSSDUG00000019070	mars	100	91.304	ENSSPAG00000022691	mars	100	90.761	Stegastes_partitus
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.095	ENSSSCG00000023318	MARS	95	62.771	Sus_scrofa
ENSSDUG00000019070	mars	100	83.587	ENSTRUG00000014774	mars	100	83.043	Takifugu_rubripes
ENSSDUG00000019070	mars	100	77.346	ENSTNIG00000007060	mars	100	77.346	Tetraodon_nigroviridis
ENSSDUG00000019070	mars	74	63.140	ENSTBEG00000000303	MARS	87	63.140	Tupaia_belangeri
ENSSDUG00000019070	mars	76	69.440	ENSTTRG00000013088	MARS	75	68.580	Tursiops_truncatus
ENSSDUG00000019070	mars	51	57.692	ENSUAMG00000019284	-	94	57.692	Ursus_americanus
ENSSDUG00000019070	mars	100	63.597	ENSUMAG00000019826	MARS	100	63.380	Ursus_maritimus
ENSSDUG00000019070	mars	64	73.856	ENSVPAG00000008665	MARS	66	73.856	Vicugna_pacos
ENSSDUG00000019070	mars	100	62.730	ENSVVUG00000017940	MARS	100	62.297	Vulpes_vulpes
ENSSDUG00000019070	mars	68	72.640	ENSXETG00000025174	mars	99	72.160	Xenopus_tropicalis
ENSSDUG00000019070	mars	100	84.891	ENSXCOG00000013878	mars	100	84.783	Xiphophorus_couchianus
ENSSDUG00000019070	mars	100	86.196	ENSXMAG00000017920	mars	100	86.087	Xiphophorus_maculatus