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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000019919 (Gene tree)
Gene ID: 111224853
Gene Symbol: caprin2
Alias: c1qdc1|wu:fj80b02
Full Name: caprin-2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16910 bases
Position: chrBDQW01000138.1:20753028-20769937
Accession: 111224853
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000027534	Caprin-1_C	PF12287.8	4.5e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000028018	-	3814	XM_022749537	ENSSDUP00000027534	872 (aa)	XP_022605258	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	44.134	ENSSDUG00000021916	caprin1b	76	44.134

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000019919	caprin2	91	42.143	ENSG00000110888	CAPRIN2	96	52.713	Homo_sapiens
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	44.571	ENSG00000135387	CAPRIN1	84	43.636	Homo_sapiens
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	78.173	ENSAPOG00000019808	caprin2	100	74.264	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	44.693	ENSAPOG00000010508	caprin1b	75	44.693	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	43.344	ENSAMEG00000009118	CAPRIN2	79	43.344	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	44.134	ENSACIG00000017913	caprin1b	76	44.134	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000019919	caprin2	100	62.661	ENSACIG00000005589	caprin2	99	63.084	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000019919	caprin2	100	75.082	ENSAOCG00000013014	caprin2	100	74.973	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	44.134	ENSAOCG00000004574	caprin1b	73	44.134	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	44.134	ENSAPEG00000001227	caprin1b	73	44.134	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000019919	caprin2	92	46.587	ENSAPLG00000006703	CAPRIN2	75	46.325	Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000019919	caprin2	89	45.263	ENSACAG00000012953	CAPRIN2	73	45.263	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	45.565	ENSANAG00000035460	CAPRIN2	76	45.565	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000019919	caprin2	100	73.319	ENSACLG00000015175	-	100	73.644	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	44.693	ENSACLG00000007463	caprin1b	73	44.693	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	50.388	ENSAMXG00000007266	caprin2	90	50.166	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	44.689	ENSBTAG00000019373	CAPRIN2	81	43.590	Bos_taurus
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	45.391	ENSCJAG00000001080	CAPRIN2	74	45.391	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	43.531	ENSCAFG00000010713	CAPRIN2	84	43.531	Canis_familiaris
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	43.653	ENSCAFG00020018961	-	86	43.465	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	44.238	ENSCHIG00000026352	CAPRIN2	84	43.494	Capra_hircus
ENSSDUG00000019919	caprin2	67	53.951	ENSTSYG00000008590	CAPRIN2	60	53.951	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	43.750	ENSCAPG00000000035	CAPRIN1	78	43.750	Cavia_aperea
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	44.000	ENSCPOG00000015734	CAPRIN1	77	44.000	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000019919	caprin2	89	45.115	ENSCPOG00000006625	CAPRIN2	86	49.727	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	45.217	ENSCCAG00000027709	CAPRIN2	100	45.238	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	45.139	ENSCATG00000031463	CAPRIN2	100	45.604	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	44.571	ENSCATG00000038427	CAPRIN1	75	44.571	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000019919	caprin2	83	51.832	ENSCLAG00000001513	CAPRIN2	93	41.906	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	45.143	ENSCLAG00000015468	-	76	45.143	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	44.810	ENSCSAG00000007446	CAPRIN2	75	44.983	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000019919	caprin2	93	42.946	ENSCHOG00000008931	CAPRIN2	74	42.946	Choloepus_hoffmanni
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	44.175	ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	74	43.478	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	44.571	ENSCANG00000032583	CAPRIN1	84	43.636	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	43.223	ENSCANG00000035343	CAPRIN2	70	43.956	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000019919	caprin2	83	50.769	ENSCGRG00001002901	Caprin2	88	50.777	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000019919	caprin2	85	50.769	ENSCGRG00000001249	Caprin2	87	50.777	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	46.369	ENSCVAG00000021994	caprin1b	73	46.369	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	42.458	ENSDARG00000009346	caprin1a	76	42.458	Danio_rerio
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	51.429	ENSDARG00000020749	caprin2	91	51.086	Danio_rerio
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	41.762	ENSDORG00000012639	Caprin2	100	42.105	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000019919	caprin2	65	63.158	ENSETEG00000011498	-	73	52.922	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	43.931	ENSETEG00000009308	CAPRIN1	84	43.931	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	44.322	ENSEASG00005005997	CAPRIN2	82	43.223	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	44.322	ENSECAG00000000608	CAPRIN2	77	54.496	Equus_caballus
ENSSDUG00000019919	caprin2	57	43.931	ENSEEUG00000006638	CAPRIN1	79	43.931	Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	53.604	ENSELUG00000019776	caprin2	91	53.604	Esox_lucius
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	47.458	ENSELUG00000006003	caprin1b	74	47.458	Esox_lucius
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	42.905	ENSFCAG00000007004	CAPRIN2	79	41.892	Felis_catus
ENSSDUG00000019919	caprin2	92	45.151	ENSFALG00000009038	CAPRIN2	72	44.925	Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000019919	caprin2	68	51.842	ENSFDAG00000020134	CAPRIN2	75	44.840	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000019919	caprin2	100	66.304	ENSFHEG00000004435	caprin2	100	66.304	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	45.251	ENSFHEG00000009076	caprin1b	73	45.251	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000019919	caprin2	94	46.057	ENSGALG00000012947	CAPRIN2	75	46.215	Gallus_gallus
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	70.392	ENSGAFG00000020084	caprin2	91	70.392	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	42.222	ENSGACG00000015620	caprin1a	74	42.222	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	64.097	ENSGACG00000019233	caprin2	91	64.097	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	40.782	ENSGACG00000009867	caprin1b	73	40.782	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000019919	caprin2	89	47.323	ENSGAGG00000015057	CAPRIN2	66	47.323	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000019919	caprin2	67	53.951	ENSGGOG00000006182	CAPRIN2	59	53.951	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000019919	caprin2	57	44.304	ENSGGOG00000010997	CAPRIN1	82	44.304	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000019919	caprin2	100	75.054	ENSHBUG00000012107	-	100	75.380	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	44.693	ENSHBUG00000003821	caprin1b	76	44.693	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	41.447	ENSHGLG00000007117	CAPRIN2	93	41.581	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	46.733	ENSIPUG00000016517	caprin2	92	46.512	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000019919	caprin2	84	50.769	ENSSTOG00000004672	CAPRIN2	73	50.777	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000019919	caprin2	100	63.825	ENSKMAG00000011810	caprin2	100	63.934	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	43.575	ENSKMAG00000001524	caprin1b	73	43.575	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	44.693	ENSLBEG00000013179	caprin1b	51	32.964	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000019919	caprin2	100	74.320	ENSLBEG00000028194	caprin2	100	74.102	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	40.211	ENSLACG00000006297	CAPRIN2	94	40.632	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000019919	caprin2	70	67.660	ENSLOCG00000015099	caprin2	81	67.660	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	43.657	ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	83	43.657	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	44.571	ENSMFAG00000038273	CAPRIN1	84	43.636	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	45.061	ENSMFAG00000025167	CAPRIN2	71	45.061	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	43.223	ENSMMUG00000001359	CAPRIN2	99	45.234	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	43.636	ENSMMUG00000021643	CAPRIN1	84	43.636	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	44.571	ENSMNEG00000030485	CAPRIN1	84	43.636	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	45.061	ENSMNEG00000029750	CAPRIN2	100	45.521	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	43.223	ENSMLEG00000034760	CAPRIN2	70	43.956	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	44.571	ENSMLEG00000043851	CAPRIN1	84	43.636	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000019919	caprin2	100	78.486	ENSMAMG00000023305	caprin2	100	78.270	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000019919	caprin2	100	73.319	ENSMZEG00005008191	-	100	73.644	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	44.693	ENSMZEG00005005204	caprin1b	73	44.693	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	46.918	ENSMGAG00000013350	CAPRIN2	76	46.918	Meleagris_gallopavo
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	39.274	ENSMAUG00000008195	Caprin2	86	53.143	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	44.571	ENSMICG00000003617	CAPRIN1	79	43.636	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	43.012	ENSMICG00000010650	CAPRIN2	100	44.669	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000019919	caprin2	89	41.947	ENSMOCG00000001842	Caprin2	77	43.009	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	45.810	ENSMMOG00000012262	caprin1b	74	45.810	Mola_mola
ENSSDUG00000019919	caprin2	69	51.282	ENSMODG00000012642	-	66	51.282	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	43.429	ENSMALG00000008939	caprin1b	76	43.429	Monopterus_albus
ENSSDUG00000019919	caprin2	100	72.204	ENSMALG00000020970	caprin2	100	72.096	Monopterus_albus
ENSSDUG00000019919	caprin2	87	41.391	MGP_CAROLIEiJ_G0029073	Caprin2	86	48.718	Mus_caroli
ENSSDUG00000019919	caprin2	83	49.744	ENSMUSG00000030309	Caprin2	86	51.397	Mus_musculus
ENSSDUG00000019919	caprin2	91	42.734	MGP_PahariEiJ_G0022834	Caprin2	87	51.397	Mus_pahari
ENSSDUG00000019919	caprin2	83	49.744	MGP_SPRETEiJ_G0030128	Caprin2	86	51.397	Mus_spretus
ENSSDUG00000019919	caprin2	92	45.345	ENSMPUG00000011164	CAPRIN2	75	45.345	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000019919	caprin2	96	43.939	ENSMLUG00000008734	CAPRIN2	79	43.561	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	44.000	ENSMLUG00000016467	CAPRIN1	84	44.000	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	44.000	ENSNGAG00000006106	Caprin1	76	44.000	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	44.886	ENSNBRG00000013368	caprin1a	75	44.886	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000019919	caprin2	58	45.251	ENSNBRG00000002234	caprin1b	72	45.251	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000019919	caprin2	59	44.571	ENSNLEG00000017913	CAPRIN1	84	43.636	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000019919	caprin2	90	45.250	ENSNLEG00000005730	CAPRIN2	72	45.250	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000019919	caprin2	57	43.590	ENSMEUG00000012704	CAPRIN1	84	43.590	Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000019919	caprin2	73	50.829	ENSMEUG00000009176	CAPRIN2	60	50.829	Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000019919	caprin2	82	73.469	ENSOPRG00000011491	CAPRIN2	74	73.469	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000019919	caprin2	89	45.567	ENSODEG00000005454	CAPRIN2	76	45.648	Octodon_degus
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ENSSDUG00000019919	caprin2	58	45.714	ENSXMAG00000007287	caprin1b	73	45.714	Xiphophorus_maculatus