EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000020781 (Gene tree)
Gene ID: 111223032
Gene Symbol: ago4
Alias: Ago4|eif2c4|fd14f04|wu:fd14f04
Full Name: protein argonaute-4-like
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23662 bases
Position: chrBDQW01000110.1:12177734-12201395
Accession: 111223032
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000028885	PAZ	PF02170.22	1.8e-28	1	1
ENSSDUP00000028855	PAZ	PF02170.22	2.4e-28	1	1
ENSSDUP00000028885	Piwi	PF02171.17	8.9e-106	1	1
ENSSDUP00000028855	Piwi	PF02171.17	3e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000029348	-	7096	-	ENSSDUP00000028855	948 (aa)	-	-
ENSSDUT00000029378	-	2379	XM_022746997	ENSSDUP00000028885	792 (aa)	XP_022602718	-

Gene Model

Click here to download ENSSDUG00000020781's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSDUG00000020781's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSDUG00000020781	ago4	100	81.439	ENSSDUG00000005726	ago2	99	77.104
ENSSDUG00000020781	ago4	100	81.445	ENSSDUG00000010918	ago3a	100	78.635
ENSSDUG00000020781	ago4	100	80.649	ENSSDUG00000008069	-	100	80.649
ENSSDUG00000020781	ago4	100	83.712	ENSSDUG00000010864	ago1	99	80.682

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSG00000134698	AGO4	100	95.357	Homo_sapiens
ENSSDUG00000020781	ago4	95	97.919	ENSAPOG00000023867	ago4	99	98.937	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	94.892	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000020781	ago4	100	99.370	ENSACIG00000014548	ago4	100	99.370	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	95.202	ENSAPEG00000022426	ago4	100	95.202	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.103	ENSATEG00000006717	ago4	100	98.894	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	95.502	Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.348	ENSACAG00000017275	AGO4	99	94.011	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.977	ENSANAG00000031428	AGO4	100	95.243	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.012	ENSACLG00000005181	ago4	100	98.867	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.640	ENSAMXG00000010318	ago4	100	98.528	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.474	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	94.659	Bos_taurus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	95.357	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	97.103	Canis_familiaris
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.229	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	95.470	Capra_hircus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSTSYG00000014007	AGO4	99	95.533	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000020781	ago4	93	95.756	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	91.304	Cavia_aperea
ENSSDUG00000020781	ago4	100	95.088	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	92.971	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	95.357	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSCATG00000043421	AGO4	100	97.674	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.977	ENSCLAG00000012097	AGO4	99	95.304	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	95.357	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000020781	ago4	79	97.872	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	98.113	Choloepus_hoffmanni
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	95.325	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSCANG00000016914	AGO4	100	95.325	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.599	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	94.790	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.599	ENSCGRG00000013335	Ago4	99	94.960	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000020781	ago4	100	92.965	ENSCSEG00000010696	ago4	100	92.965	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000020781	ago4	100	99.118	ENSDARG00000100854	ago4	100	97.508	Danio_rerio
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	95.243	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSDORG00000008933	Ago4	100	95.357	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000020781	ago4	65	97.044	ENSETEG00000018390	AGO4	83	97.044	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSEASG00005012079	AGO4	100	95.357	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSECAG00000024686	AGO4	100	95.357	Equus_caballus
ENSSDUG00000020781	ago4	78	93.981	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	94.386	Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.516	ENSELUG00000023873	ago4	100	98.083	Esox_lucius
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	95.243	Felis_catus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSFDAG00000021483	AGO4	99	95.533	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000020781	ago4	100	89.295	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.201	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.866	ENSGMOG00000009544	ago4	99	96.815	Gadus_morhua
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSGALG00000039713	AGO4	100	97.103	Gallus_gallus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.764	ENSGAFG00000017239	ago4	100	98.641	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000020781	ago4	100	99.244	ENSGACG00000002683	ago4	99	97.386	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.103	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000020781	ago4	100	93.459	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	92.193	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.012	ENSHBUG00000001525	ago4	100	98.867	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	95.357	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	95.517	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.888	ENSHCOG00000003725	ago4	100	98.754	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.764	ENSIPUG00000015600	ago4	100	98.528	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	95.351	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.888	ENSKMAG00000018602	ago4	100	98.754	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.164	ENSLBEG00000010670	ago4	100	99.207	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.607	ENSLACG00000016888	AGO4	100	95.470	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.516	ENSLOCG00000000584	ago4	100	98.075	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.478	ENSLAFG00000010394	AGO4	99	96.478	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	95.357	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.981	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	96.825	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	96.825	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSMLEG00000039490	AGO4	99	95.418	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.888	ENSMAMG00000003874	ago4	100	98.867	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.012	ENSMZEG00005026346	ago4	100	98.867	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.725	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	94.983	Meleagris_gallopavo
ENSSDUG00000020781	ago4	81	97.122	ENSMAUG00000021743	Ago4	92	97.122	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.855	ENSMICG00000033507	AGO4	99	95.195	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.599	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	94.904	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.859	ENSMMOG00000013473	ago4	100	97.859	Mola_mola
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.229	ENSMODG00000017888	AGO4	100	95.470	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.475	ENSMALG00000011797	ago4	99	95.667	Monopterus_albus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.222	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	94.564	Mus_caroli
ENSSDUG00000020781	ago4	100	95.970	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	94.337	Mus_musculus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	95.718	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.111	Mus_pahari
ENSSDUG00000020781	ago4	100	95.970	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	94.337	Mus_spretus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	97.103	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.599	ENSMLUG00000017102	AGO4	99	93.827	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSNGAG00000020544	Ago4	99	95.533	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.012	ENSNBRG00000013492	ago4	100	98.867	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSNLEG00000011125	AGO4	99	95.418	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000020781	ago4	90	96.604	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	96.605	Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000020781	ago4	100	89.421	ENSOPRG00000012309	AGO4	99	88.431	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.977	ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.977	Octodon_degus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.615	ENSONIG00000013603	ago4	100	98.867	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.229	ENSOANG00000002082	AGO4	100	97.229	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.977	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	95.243	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.012	ENSORLG00000009865	ago4	99	96.832	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.012	ENSORLG00020016978	ago4	99	96.832	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.012	ENSORLG00015008800	ago4	99	96.832	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.012	ENSOMEG00000006399	ago4	100	98.981	Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000020781	ago4	100	90.050	ENSOGAG00000027107	-	100	86.976	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.096	ENSOGAG00000004233	-	99	96.096	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.725	ENSOARG00000019568	AGO4	99	93.933	Ovis_aries
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSPPAG00000031752	AGO4	99	95.418	Pan_paniscus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	95.243	Panthera_pardus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSPTIG00000020262	AGO4	99	95.418	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	95.357	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSPANG00000007232	AGO4	100	97.103	Papio_anubis
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.391	ENSPKIG00000022598	ago4	100	98.301	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	95.325	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000020781	ago4	100	99.244	ENSPMGG00000023325	ago4	100	99.244	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	85.678	ENSPEMG00000022651	-	97	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.229	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	95.470	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.888	ENSPFOG00000001935	ago4	100	98.754	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000020781	ago4	100	99.244	ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.508	Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.888	ENSPMEG00000005049	ago4	100	98.754	Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.888	ENSPREG00000010315	ago4	100	98.754	Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSPPYG00000001552	AGO4	99	95.418	Pongo_abelii
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.855	ENSPCOG00000015935	AGO4	99	95.309	Propithecus_coquereli
ENSSDUG00000020781	ago4	87	96.970	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	96.970	Pteropus_vampyrus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.012	ENSPNYG00000002089	ago4	100	98.867	Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000020781	ago4	100	98.741	ENSPNAG00000005191	ago4	100	96.716	Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000020781	ago4	75	96.147	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	96.147	Rattus_norvegicus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	95.849	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	96.825	Rhinopithecus_bieti
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSRROG00000035783	AGO4	100	97.103	Rhinopithecus_roxellana
ENSSDUG00000020781	ago4	96	96.838	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	96.830	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.229	ENSSHAG00000017320	AGO4	99	94.790	Sarcophilus_harrisii
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.640	ENSSFOG00015022028	ago4	100	98.414	Scleropages_formosus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.888	ENSSMAG00000000808	ago4	99	97.059	Scophthalmus_maximus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	99.370	ENSSLDG00000021841	ago4	100	99.370	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000020781	ago4	78	97.257	ENSSARG00000011504	AGO4	79	97.455	Sorex_araneus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	96.977	ENSSPUG00000000889	AGO4	100	95.130	Sphenodon_punctatus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	92.172	ENSTGUG00000001631	AGO4	99	89.605	Taeniopygia_guttata
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.764	ENSTRUG00000008052	ago4	100	98.641	Takifugu_rubripes
ENSSDUG00000020781	ago4	100	99.244	ENSTNIG00000006331	ago4	99	97.491	Tetraodon_nigroviridis
ENSSDUG00000020781	ago4	75	100.000	ENSTBEG00000016478	AGO4	77	97.143	Tupaia_belangeri
ENSSDUG00000020781	ago4	100	93.199	ENSTTRG00000015086	AGO4	99	91.867	Tursiops_truncatus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSUAMG00000027156	-	100	97.103	Ursus_americanus
ENSSDUG00000020781	ago4	100	95.214	ENSUMAG00000006297	AGO4	99	92.036	Ursus_maritimus
ENSSDUG00000020781	ago4	96	96.311	ENSVPAG00000006662	AGO4	100	96.311	Vicugna_pacos
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	ENSVVUG00000000465	-	100	97.103	Vulpes_vulpes
ENSSDUG00000020781	ago4	100	83.375	ENSXETG00000009664	ago4	100	81.828	Xenopus_tropicalis
ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.888	ENSXMAG00000016657	ago4	100	98.754	Xiphophorus_maculatus