EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000022535 (Gene tree)
Gene ID: 111237576
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: ras-related protein Rab-1A
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4451 bases
Position: chrBDQW01001001.1:538191-542641
Accession: 111237576
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000031346	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-05	1	1
ENSSDUP00000031351	MMR_HSR1	PF01926.23	2.8e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000031882	RAB1A-201	2103	XM_022766723	ENSSDUP00000031346	202 (aa)	XP_022622444	UPI00022B3980
ENSSDUT00000031887	RAB1A-202	645	-	ENSSDUP00000031351	214 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSDUG00000022535	RAB1A	80	39.157	ENSSDUG00000007575	rab9b	82	39.157
ENSSDUG00000022535	RAB1A	96	37.755	ENSSDUG00000021882	rab6ba	93	37.755
ENSSDUG00000022535	RAB1A	96	34.328	ENSSDUG00000010675	si:ch73-116o1.2	91	34.328
ENSSDUG00000022535	RAB1A	60	30.952	ENSSDUG00000017586	-	61	30.952
ENSSDUG00000022535	RAB1A	89	56.906	ENSSDUG00000006307	-	91	56.906
ENSSDUG00000022535	RAB1A	96	43.299	ENSSDUG00000009835	rab5aa	89	43.299
ENSSDUG00000022535	RAB1A	99	47.826	ENSSDUG00000006278	rab11al	96	47.826
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ENSSDUG00000022535	RAB1A	78	38.509	ENSSDUG00000019738	si:dkey-13a21.4	79	38.509
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ENSSDUG00000022535	RAB1A	98	33.333	ENSSDUG00000006543	RAB29	99	33.333
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ENSSDUG00000022535	RAB1A	96	47.423	ENSSDUG00000013724	rab2a	99	45.714
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ENSSDUG00000022535	RAB1A	93	45.714	ENSSDUG00000002934	-	96	45.714
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ENSSDUG00000022535	RAB1A	80	48.148	ENSSDUG00000004633	RAB15	76	48.148
ENSSDUG00000022535	RAB1A	81	30.952	ENSSDUG00000014082	si:cabz01085950.1	82	30.952
ENSSDUG00000022535	RAB1A	79	61.250	ENSSDUG00000005719	si:dkey-16l2.16	78	59.756
ENSSDUG00000022535	RAB1A	83	52.976	ENSSDUG00000002965	rab11ba	78	52.663
ENSSDUG00000022535	RAB1A	85	36.158	ENSSDUG00000019086	hrasb	93	36.158
ENSSDUG00000022535	RAB1A	79	49.375	ENSSDUG00000006260	rab25b	82	49.375
ENSSDUG00000022535	RAB1A	78	38.037	ENSSDUG00000010942	rab34a	61	38.037
ENSSDUG00000022535	RAB1A	86	30.208	ENSSDUG00000015078	rasl11a	75	30.208
ENSSDUG00000022535	RAB1A	90	32.973	ENSSDUG00000023508	rab23	86	31.707
ENSSDUG00000022535	RAB1A	64	30.435	ENSSDUG00000012868	arl4cb	67	30.435
ENSSDUG00000022535	RAB1A	98	44.118	ENSSDUG00000009735	rab25a	96	45.146
ENSSDUG00000022535	RAB1A	61	30.952	ENSSDUG00000011151	-	62	30.952
ENSSDUG00000022535	RAB1A	96	32.143	ENSSDUG00000006618	RAB17	86	32.487
ENSSDUG00000022535	RAB1A	97	45.128	ENSSDUG00000013050	-	90	45.128
ENSSDUG00000022535	RAB1A	97	46.154	ENSSDUG00000004551	rab14	90	46.154
ENSSDUG00000022535	RAB1A	58	30.081	ENSSDUG00000017356	-	63	30.081
ENSSDUG00000022535	RAB1A	58	33.333	ENSSDUG00000000586	arl4aa	59	33.333
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	92.574	ENSSDUG00000004698	rab1ba	100	92.574
ENSSDUG00000022535	RAB1A	82	51.205	ENSSDUG00000013325	rab30	84	49.412
ENSSDUG00000022535	RAB1A	62	30.935	ENSSDUG00000021055	arl8ba	61	30.935
ENSSDUG00000022535	RAB1A	81	37.576	ENSSDUG00000017779	kras	95	35.912
ENSSDUG00000022535	RAB1A	99	49.029	ENSSDUG00000002580	rab11a	96	49.029
ENSSDUG00000022535	RAB1A	82	50.299	ENSSDUG00000003823	rab18a	95	45.918
ENSSDUG00000022535	RAB1A	71	30.263	ENSSDUG00000013976	arl3	78	30.263
ENSSDUG00000022535	RAB1A	96	33.163	ENSSDUG00000014765	rabl2	86	33.163
ENSSDUG00000022535	RAB1A	55	37.500	ENSSDUG00000014258	RAP2B	88	37.903
ENSSDUG00000022535	RAB1A	96	37.879	ENSSDUG00000009251	rab6bb	93	37.879
ENSSDUG00000022535	RAB1A	63	34.328	ENSSDUG00000020599	-	69	34.328
ENSSDUG00000022535	RAB1A	84	45.614	ENSSDUG00000014091	-	80	45.614
ENSSDUG00000022535	RAB1A	89	40.796	ENSSDUG00000001791	rab33ba	83	40.796
ENSSDUG00000022535	RAB1A	99	46.411	ENSSDUG00000013558	rab11bb	96	46.411
ENSSDUG00000022535	RAB1A	87	42.135	ENSSDUG00000011851	rab42a	82	42.135
ENSSDUG00000022535	RAB1A	61	34.127	ENSSDUG00000010935	arl4d	61	34.127
ENSSDUG00000022535	RAB1A	75	32.237	ENSSDUG00000023163	rras2	81	32.927
ENSSDUG00000022535	RAB1A	77	40.252	ENSSDUG00000005037	-	75	40.252
ENSSDUG00000022535	RAB1A	96	46.154	ENSSDUG00000005960	rab18b	98	45.274
ENSSDUG00000022535	RAB1A	96	40.201	ENSSDUG00000013968	rab33a	84	40.201
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ENSSDUG00000022535	RAB1A	98	75.635	ENSSDUG00000004445	zgc:171927	92	75.635
ENSSDUG00000022535	RAB1A	79	39.877	ENSSDUG00000008011	-	79	39.877
ENSSDUG00000022535	RAB1A	96	45.408	ENSSDUG00000023008	rab5c	89	45.408
ENSSDUG00000022535	RAB1A	84	45.304	ENSSDUG00000008151	zgc:101559	77	45.304
ENSSDUG00000022535	RAB1A	84	33.714	ENSSDUG00000009122	rheb	94	33.714
ENSSDUG00000022535	RAB1A	71	30.345	ENSSDUG00000004762	-	73	30.612
ENSSDUG00000022535	RAB1A	79	30.303	ENSSDUG00000003036	dnajc27	60	30.303

Orthologs

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ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSG00000138069	RAB1A	98	100.000	Homo_sapiens
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	99.505	ENSAPOG00000008143	-	100	99.505	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSAMEG00000001127	RAB1A	99	96.040	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	99.505	ENSAOCG00000020606	-	100	99.505	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	99.505	ENSAPEG00000022488	-	100	99.505	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSANAG00000020929	RAB1A	99	96.040	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	100.000	ENSACLG00000003326	-	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	93.069	ENSAMXG00000034850	-	100	93.069	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	95.960	Bos_taurus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	95.455	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSCAFG00000003187	RAB1A	99	96.040	Canis_familiaris
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSCAFG00020026971	RAB1A	99	96.040	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000022535	RAB1A	98	95.939	ENSCHIG00000014060	RAB1A	100	93.171	Capra_hircus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	94.554	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	95.939	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSCPOG00000015437	RAB1A	99	96.040	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	96.040	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSCATG00000030853	RAB1A	99	96.040	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	96.040	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.535	ENSCPBG00000013243	RAB1A	99	96.535	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	93.564	ENSCANG00000035916	RAB1A	99	93.564	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSCGRG00001012691	-	99	96.040	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSCGRG00000008456	-	99	96.040	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSDNOG00000018236	RAB1A	99	96.040	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSDORG00000028628	-	99	96.040	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	85.222	FBgn0285937	Rab1	99	85.222	Drosophila_melanogaster
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	96.040	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSEASG00005007298	RAB1A	99	96.040	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSECAG00000009926	RAB1A	99	96.040	Equus_caballus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	96.040	Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.078	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	96.078	Esox_lucius
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSFCAG00000002536	RAB1A	99	96.040	Felis_catus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	94.554	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	94.554	Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSFDAG00000019505	-	99	96.040	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	98.515	ENSFHEG00000014414	-	100	98.515	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.535	ENSGALG00000031582	RAB1A	99	96.535	Gallus_gallus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	98.020	ENSGAFG00000000918	-	100	98.020	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.535	ENSGAGG00000006802	RAB1A	99	96.535	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	95.455	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSHGLG00000013585	RAB1A	99	96.040	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	94.554	ENSHGLG00100007994	RAB1A	99	94.554	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	ENSSTOG00000020693	-	99	96.040	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	98	95.939	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	95.939	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	98	98.985	ENSKMAG00000014038	-	93	98.985	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	98.515	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	98.515	Labrus_bergylta
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