EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000022608 (Gene tree)
Gene ID: 111234006
Gene Symbol: mtrf1
Alias: zgc:113104
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5854 bases
Position: chrBDQW01000019.1:1215015-1220868
Accession: 111234006
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000031437	RF-1	PF00472.20	1.5e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000031980	-	4701	XM_022761905	ENSSDUP00000031437	511 (aa)	XP_022617626	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSDUG00000022608	mtrf1	73	43.617	ENSSDUG00000019392	mtrf1l	84	43.617

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.252	ENSG00000120662	MTRF1	87	57.252	Homo_sapiens
ENSSDUG00000022608	mtrf1	78	83.709	ENSAPOG00000010181	mtrf1	97	83.709	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	74	59.103	ENSAMEG00000008696	MTRF1	85	59.103	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	82.927	ENSAOCG00000002832	mtrf1	100	82.927	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	82.483	ENSAPEG00000014844	mtrf1	100	82.483	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000022608	mtrf1	79	79.703	ENSATEG00000017403	mtrf1	97	79.703	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	54.712	ENSAPLG00000009317	MTRF1	88	54.712	Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000022608	mtrf1	77	55.639	ENSACAG00000000897	MTRF1	89	55.639	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	53.197	ENSANAG00000023063	-	86	53.197	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000022608	mtrf1	67	57.941	ENSANAG00000025310	-	93	57.941	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	82.667	ENSACLG00000023945	mtrf1	100	82.667	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.923	ENSBTAG00000012260	MTRF1	87	56.923	Bos_taurus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.410	ENSCJAG00000017739	MTRF1	100	63.793	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	74	58.947	ENSCAFG00000004795	MTRF1	85	58.947	Canis_familiaris
ENSSDUG00000022608	mtrf1	74	58.947	ENSCAFG00020018178	MTRF1	85	58.947	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	57.922	ENSCHIG00000011810	MTRF1	86	57.922	Capra_hircus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.436	ENSTSYG00000006976	MTRF1	87	57.436	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.252	ENSCAPG00000013163	MTRF1	90	57.252	Cavia_aperea
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.997	ENSCPOG00000005264	MTRF1	87	56.997	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.179	ENSCCAG00000035116	MTRF1	87	57.179	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.398	ENSCATG00000009909	MTRF1	87	57.398	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.489	ENSCLAG00000000582	MTRF1	87	56.489	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.143	ENSCSAG00000017835	MTRF1	87	57.143	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	69	55.524	ENSCHOG00000011915	-	86	55.524	Choloepus_hoffmanni
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	56.806	ENSCPBG00000007969	MTRF1	85	56.806	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.743	ENSCANG00000040353	MTRF1	87	56.743	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.667	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	88	56.667	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.667	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	88	56.667	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000022608	mtrf1	86	73.363	ENSCSEG00000005667	mtrf1	97	73.363	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	70.000	ENSCVAG00000021729	mtrf1	100	70.000	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	55.357	ENSDNOG00000034196	MTRF1	98	61.967	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	58.247	ENSDORG00000016429	Mtrf1	86	58.247	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	57.292	ENSETEG00000014811	MTRF1	86	57.292	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.584	ENSEASG00005015715	MTRF1	87	57.584	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.584	ENSECAG00000014389	MTRF1	84	57.584	Equus_caballus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	78	44.417	ENSEEUG00000004450	-	90	44.417	Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	87	64.653	ENSELUG00000006544	mtrf1	99	64.653	Esox_lucius
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	58.355	ENSFCAG00000031635	MTRF1	87	58.355	Felis_catus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	55.013	ENSFALG00000008036	MTRF1	96	55.013	Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.545	ENSFDAG00000017881	MTRF1	87	57.545	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000022608	mtrf1	85	73.455	ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	73.455	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	74	66.138	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	66.138	Gadus_morhua
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	55.759	ENSGALG00000016951	MTRF1	84	55.759	Gallus_gallus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	87	75.000	ENSGAFG00000007093	mtrf1	99	75.000	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000022608	mtrf1	74	80.739	ENSGACG00000013728	mtrf1	99	80.739	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	62	60.443	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	60.443	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.252	ENSGGOG00000002529	MTRF1	87	57.252	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.186	ENSHGLG00000003210	MTRF1	87	56.186	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.186	ENSHGLG00100011843	MTRF1	87	56.186	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000022608	mtrf1	86	69.545	ENSHCOG00000009449	mtrf1	99	69.545	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.506	ENSSTOG00000021682	MTRF1	87	57.506	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.732	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	87	57.732	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	75.166	ENSKMAG00000003231	mtrf1	99	75.166	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	60.363	ENSLACG00000010582	MTRF1	86	60.363	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000022608	mtrf1	74	62.698	ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	62.698	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	45.128	ENSLAFG00000030499	-	86	45.128	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.436	ENSLAFG00000022177	-	87	57.436	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.143	ENSMFAG00000037972	MTRF1	87	57.143	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.398	ENSMNEG00000035487	MTRF1	87	57.398	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.398	ENSMLEG00000033582	MTRF1	87	57.398	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	80.444	ENSMAMG00000022048	mtrf1	100	80.444	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	82.667	ENSMZEG00005017922	mtrf1	100	82.667	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	55.759	ENSMGAG00000014971	MTRF1	91	55.759	Meleagris_gallopavo
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.692	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	87	57.692	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.436	ENSMICG00000033131	MTRF1	87	57.436	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	85	53.563	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	93	53.563	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	55.469	ENSMODG00000014772	MTRF1	86	55.469	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000022608	mtrf1	86	82.232	ENSMALG00000013274	mtrf1	99	82.232	Monopterus_albus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	73	59.524	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	83	59.524	Mus_caroli
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.949	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	87	57.949	Mus_musculus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	86	53.167	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	95	53.167	Mus_pahari
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.436	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	87	57.436	Mus_spretus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	74	59.416	ENSMPUG00000001874	MTRF1	84	59.416	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.179	ENSMLUG00000017237	MTRF1	87	57.179	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	77	57.868	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	87	57.868	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.252	ENSNLEG00000001236	MTRF1	87	57.252	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	53.806	ENSMEUG00000001846	MTRF1	85	53.806	Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000022608	mtrf1	54	37.591	ENSOPRG00000006450	-	83	37.591	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.154	ENSODEG00000005782	MTRF1	87	56.154	Octodon_degus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	85.714	ENSONIG00000012476	mtrf1	99	85.714	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	60	57.742	ENSOANG00000003383	-	98	57.742	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	58.205	ENSOCUG00000025207	MTRF1	87	58.205	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	71.681	ENSORLG00000003225	mtrf1	100	71.681	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	71.903	ENSORLG00020021048	mtrf1	100	71.903	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	71.681	ENSORLG00015020957	mtrf1	100	71.681	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	71.333	ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	71.333	Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	55.980	ENSOGAG00000009719	-	87	55.980	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000022608	mtrf1	64	52.121	ENSOGAG00000026411	-	99	52.121	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	57.922	ENSOARG00000006994	MTRF1	86	57.922	Ovis_aries
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.252	ENSPPAG00000000050	MTRF1	87	57.252	Pan_paniscus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	59.383	ENSPPRG00000009511	MTRF1	87	59.383	Panthera_pardus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	59.278	ENSPTIG00000006673	MTRF1	87	59.278	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.252	ENSPTRG00000005815	MTRF1	87	57.252	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.398	ENSPANG00000010809	MTRF1	87	57.398	Papio_anubis
ENSSDUG00000022608	mtrf1	77	58.929	ENSPKIG00000015711	mtrf1	91	58.929	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000022608	mtrf1	75	56.283	ENSPSIG00000004773	MTRF1	85	56.283	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.106	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	86	57.106	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000022608	mtrf1	66	51.734	ENSPMAG00000009849	mtrf1	99	52.023	Petromyzon_marinus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.186	ENSPCIG00000012940	MTRF1	87	56.186	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	73.614	ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	73.614	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	73.836	ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	73.836	Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000022608	mtrf1	85	74.713	ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	74.713	Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.234	ENSPPYG00000005313	MTRF1	87	56.234	Pongo_abelii
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.923	ENSPCOG00000018133	MTRF1	87	56.923	Propithecus_coquereli
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.266	ENSPVAG00000008573	MTRF1	87	56.266	Pteropus_vampyrus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	74	65.079	ENSPNAG00000010682	mtrf1	86	65.079	Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000022608	mtrf1	74	58.311	ENSRNOG00000047106	Mtrf1	93	71.681	Rattus_norvegicus
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.743	ENSRBIG00000007069	MTRF1	87	56.743	Rhinopithecus_bieti
ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	56.743	ENSRROG00000035345	MTRF1	87	56.743	Rhinopithecus_roxellana
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ENSSDUG00000022608	mtrf1	69	56.620	ENSSHAG00000018109	MTRF1	87	56.620	Sarcophilus_harrisii
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