EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000022675 (Gene tree)
Gene ID: 111217541
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14778 bases
Position: chrBDQW01000044.1:5110743-5125520
Accession: 111217541
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000031558	GTP_EFTU	PF00009.27	7e-44	1	1
ENSSDUP00000031572	GTP_EFTU	PF00009.27	1.6e-43	1	1
ENSSDUP00000031572	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8.9e-13	1	1
ENSSDUP00000031558	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	9.9e-13	1	1
ENSSDUP00000031572	EFG_IV	PF03764.18	9.3e-25	1	1
ENSSDUP00000031558	EFG_IV	PF03764.18	1e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000032116	-	2775	-	ENSSDUP00000031572	924 (aa)	-	-
ENSSDUT00000032102	-	4675	XM_022739454	ENSSDUP00000031558	971 (aa)	XP_022595175	UPI000BBE99DD

Gene Model

Click here to download ENSSDUG00000022675's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sdu03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSDUG00000022675's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSDUG00000022675	eftud2	85	39.448	ENSSDUG00000005084	-	98	37.110
ENSSDUG00000022675	eftud2	86	37.543	ENSSDUG00000015383	eef2b	99	37.313
ENSSDUG00000022675	eftud2	84	36.994	ENSSDUG00000013271	efl1	87	36.994
ENSSDUG00000022675	eftud2	57	31.852	ENSSDUG00000021273	gfm2	71	33.824

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.588	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	99.588	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	92.284	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	95.469	ENSACIG00000009096	eftud2	100	95.469	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000022675	eftud2	88	92.824	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	92.824	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.588	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	99.588	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.176	ENSATEG00000000457	eftud2	100	99.176	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000022675	eftud2	99	88.774	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.980	Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.461	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.872	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.387	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.279	ENSACLG00000001296	eftud2	100	99.279	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	94.780	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.780	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	92.284	Bos_taurus
ENSSDUG00000022675	eftud2	99	70.764	WBGene00001166	eftu-2	99	70.455	Caenorhabditis_elegans
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.387	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	92.284	Canis_familiaris
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.284	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.284	Capra_hircus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.387	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	92.284	Cavia_aperea
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.284	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	92.387	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.387	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.078	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.387	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000022675	eftud2	91	81.194	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.194	Choloepus_hoffmanni
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.181	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	78.645	ENSCING00000009372	-	100	78.439	Ciona_intestinalis
ENSSDUG00000022675	eftud2	99	78.049	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	92.387	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.872	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.975	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.872	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.975	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.352	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	98.352	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.146	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	98.146	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	94.553	ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.553	Danio_rerio
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.872	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	92.078	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.078	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	74.719	FBgn0039566	CG4849	100	74.667	Drosophila_melanogaster
ENSSDUG00000022675	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSSDUG00000022675	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	Eptatretus_burgeri
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	92.284	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	92.181	Equus_caballus
ENSSDUG00000022675	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	94.542	ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.130	Esox_lucius
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.181	Felis_catus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.872	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.975	Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.284	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	97.940	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	97.940	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	96.708	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	96.708	Gadus_morhua
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.770	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.804	Gallus_gallus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	97.837	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	97.837	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.146	ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.146	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	92.387	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.176	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	99.176	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	92.078	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.078	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	97.531	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.531	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	94.645	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.645	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000022675	eftud2	91	93.243	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.038	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000022675	eftud2	95	93.913	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.913	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.043	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	98.043	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000022675	eftud2	95	98.488	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.647	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	93.306	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.306	Latimeria_chalumnae
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	94.645	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	94.336	Lepisosteus_oculatus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.770	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.872	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	92.387	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	92.387	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	92.387	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.661	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	98.661	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.279	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	99.279	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.581	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.786	Meleagris_gallopavo
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	92.078	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	92.387	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000022675	eftud2	92	75.506	ENSMOCG00000017653	-	90	75.618	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	ENSMOCG00000009039	-	100	92.078	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000022675	eftud2	88	99.176	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	99.176	Mola_mola
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.387	Monodelphis_domestica
ENSSDUG00000022675	eftud2	88	97.294	ENSMALG00000014501	eftud2	100	97.294	Monopterus_albus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	92.181	Mus_caroli
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	92.181	Mus_musculus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.181	Mus_pahari
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	92.181	Mus_spretus
ENSSDUG00000022675	eftud2	97	91.631	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.843	Mustela_putorius_furo
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	92.284	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.872	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.975	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.176	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	99.176	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000022675	eftud2	97	90.117	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.329	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	88.477	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.683	Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000022675	eftud2	96	91.511	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.362	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.872	ENSODEG00000018041	-	100	91.358	Octodon_degus
ENSSDUG00000022675	eftud2	93	76.184	ENSODEG00000003385	-	100	76.293	Octodon_degus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.279	ENSONIG00000000912	eftud2	100	99.279	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.284	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	97.734	ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.734	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	97.837	ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.837	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	97.734	ENSORLG00015002611	eftud2	100	98.475	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	90.535	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.741	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	92.284	Ovis_aries
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	92.387	Pan_paniscus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	92.284	Panthera_pardus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	92.284	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.387	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	92.387	Papio_anubis
ENSSDUG00000022675	eftud2	93	90.077	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.298	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	89.289	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	89.289	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	92.181	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	92.387	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.043	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	98.043	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.043	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	98.043	Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.043	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	98.043	Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	90.947	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.152	Pongo_abelii
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	88.169	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.374	Procavia_capensis
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.387	Propithecus_coquereli
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	87.963	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.169	Pteropus_vampyrus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.176	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	99.176	Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	95.160	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	95.160	Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.173	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	92.173	Rattus_norvegicus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	92.284	Rhinopithecus_bieti
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.284	Rhinopithecus_roxellana
ENSSDUG00000022675	eftud2	97	33.863	YKL173W	SNU114	91	34.431	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.387	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSDUG00000022675	eftud2	95	93.913	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.913	Sarcophilus_harrisii
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	96.189	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	96.189	Scleropages_formosus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.249	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	98.249	Scophthalmus_maximus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.897	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	99.897	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	83.951	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.156	Sorex_araneus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.770	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.975	Sphenodon_punctatus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	99.588	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	99.588	Stegastes_partitus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.078	Sus_scrofa
ENSSDUG00000022675	eftud2	83	92.786	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.786	Taeniopygia_guttata
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	96.807	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.807	Takifugu_rubripes
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.103	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	92.103	Tetraodon_nigroviridis
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	86.831	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	87.037	Tupaia_belangeri
ENSSDUG00000022675	eftud2	91	90.011	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.011	Tursiops_truncatus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	90.947	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.152	Ursus_americanus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	92.284	Ursus_maritimus
ENSSDUG00000022675	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.078	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	92.284	Vulpes_vulpes
ENSSDUG00000022675	eftud2	96	92.834	ENSXETG00000003394	eftud2	98	93.471	Xenopus_tropicalis
ENSSDUG00000022675	eftud2	81	98.469	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.469	Xiphophorus_couchianus
ENSSDUG00000022675	eftud2	100	97.837	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.837	Xiphophorus_maculatus