EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSDUG00000022938 (Gene tree)
Gene ID: 111219948
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Seriola_dumerili
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6275 bases
Position: chrBDQW01000068.1:11232016-11238290
Accession: 111219948
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSDUP00000031952	eRF1_2	PF03464.15	1.3e-31	1	1
ENSSDUP00000031943	eRF1_2	PF03464.15	1.4e-31	1	1
ENSSDUP00000031943	eRF1_3	PF03465.15	1.5e-25	1	1
ENSSDUP00000031952	eRF1_3	PF03465.15	3.9e-14	1	1
ENSSDUP00000031943	eRF1_1	PF03463.15	2e-52	1	1
ENSSDUP00000031952	eRF1_1	PF03463.15	2e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSDUT00000032493	-	1591	XM_022742817	ENSSDUP00000031943	385 (aa)	XP_022598538	UPI000BBEA7D3
ENSSDUT00000032502	-	1131	-	ENSSDUP00000031952	376 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSDUG00000022938's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sdu03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSDUG00000022938's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSG00000152684	PELO	100	80.519	Homo_sapiens
ENSSDUG00000022938	pelo	100	95.844	ENSAPOG00000023072	pelo	100	95.844	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000022938	pelo	66	95.547	ENSAPOG00000000616	pelo	90	95.547	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000022938	pelo	66	95.547	ENSAPOG00000023700	-	90	95.547	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.260	ENSAMEG00000007734	PELO	100	80.260	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSDUG00000022938	pelo	97	87.936	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.195	Amphilophus_citrinellus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	96.104	ENSAOCG00000023717	pelo	100	96.104	Amphiprion_ocellaris
ENSSDUG00000022938	pelo	100	96.104	ENSAPEG00000011235	pelo	100	96.104	Amphiprion_percula
ENSSDUG00000022938	pelo	100	95.065	ENSATEG00000019550	pelo	100	95.065	Anabas_testudineus
ENSSDUG00000022938	pelo	77	71.477	ENSAPLG00000013265	PELO	100	71.477	Anas_platyrhynchos
ENSSDUG00000022938	pelo	97	80.267	ENSACAG00000004352	PELO	100	79.740	Anolis_carolinensis
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.260	ENSANAG00000014096	PELO	100	80.260	Aotus_nancymaae
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	ENSACLG00000010305	pelo	100	91.688	Astatotilapia_calliptera
ENSSDUG00000022938	pelo	97	92.493	ENSAMXG00000020299	pelo	100	91.969	Astyanax_mexicanus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.260	ENSBTAG00000003268	PELO	99	80.260	Bos_taurus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	59.221	WBGene00011280	pelo-1	100	59.221	Caenorhabditis_elegans
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.519	Callithrix_jacchus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.519	Canis_lupus_dingo
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.000	ENSCHIG00000016410	PELO	99	80.000	Capra_hircus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.779	ENSTSYG00000005203	PELO	100	80.779	Carlito_syrichta
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.779	ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.779	Cavia_porcellus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSCCAG00000035600	PELO	100	80.519	Cebus_capucinus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSCATG00000011829	PELO	100	80.519	Cercocebus_atys
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.260	ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	Chinchilla_lanigera
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.519	Chlorocebus_sabaeus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSCHOG00000000523	PELO	100	80.519	Choloepus_hoffmanni
ENSSDUG00000022938	pelo	97	80.533	ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSSDUG00000022938	pelo	97	64.343	ENSCING00000001979	-	100	64.416	Ciona_intestinalis
ENSSDUG00000022938	pelo	100	65.714	ENSCSAVG00000006158	-	100	65.714	Ciona_savignyi
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSCANG00000023382	PELO	100	80.519	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSDUG00000022938	pelo	97	80.697	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.779	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSDUG00000022938	pelo	97	81.501	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.558	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSDUG00000022938	pelo	100	93.247	ENSCSEG00000008807	pelo	100	93.247	Cynoglossus_semilaevis
ENSSDUG00000022938	pelo	100	92.468	ENSCVAG00000016082	pelo	100	92.468	Cyprinodon_variegatus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	88.571	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.571	Danio_rerio
ENSSDUG00000022938	pelo	100	77.461	ENSDNOG00000036721	PELO	100	77.461	Dasypus_novemcinctus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	81.039	ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.039	Dipodomys_ordii
ENSSDUG00000022938	pelo	96	68.378	FBgn0011207	pelo	97	67.102	Drosophila_melanogaster
ENSSDUG00000022938	pelo	71	78.363	ENSEBUG00000004955	pelo	99	78.363	Eptatretus_burgeri
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.000	ENSEASG00005013348	PELO	100	80.000	Equus_asinus_asinus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	ENSELUG00000023229	pelo	100	91.688	Esox_lucius
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.260	ENSFCAG00000032341	PELO	100	80.260	Felis_catus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.519	Ficedula_albicollis
ENSSDUG00000022938	pelo	76	81.690	ENSFDAG00000002076	PELO	88	81.690	Fukomys_damarensis
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	ENSFHEG00000009769	pelo	100	91.826	Fundulus_heteroclitus
ENSSDUG00000022938	pelo	98	90.716	ENSGMOG00000005849	pelo	100	90.649	Gadus_morhua
ENSSDUG00000022938	pelo	100	90.909	ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.909	Gambusia_affinis
ENSSDUG00000022938	pelo	100	95.065	ENSGACG00000007245	pelo	100	95.065	Gasterosteus_aculeatus
ENSSDUG00000022938	pelo	97	80.533	ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.000	Gopherus_agassizii
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSGGOG00000012635	PELO	100	80.519	Gorilla_gorilla
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.688	Haplochromis_burtoni
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.779	ENSHGLG00000005932	PELO	100	80.779	Heterocephalus_glaber_female
ENSSDUG00000022938	pelo	100	78.701	ENSHGLG00100017627	PELO	100	78.701	Heterocephalus_glaber_male
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.429	ENSHCOG00000016782	pelo	100	91.429	Hippocampus_comes
ENSSDUG00000022938	pelo	100	89.351	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.351	Ictalurus_punctatus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.779	ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.779	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	78.701	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	78.701	Jaculus_jaculus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	92.727	ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	94.545	ENSLBEG00000022399	pelo	100	94.545	Labrus_bergylta
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.260	ENSLAFG00000020551	PELO	100	80.260	Loxodonta_africana
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSMFAG00000000651	PELO	100	80.519	Macaca_fascicularis
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSMMUG00000039101	PELO	100	80.519	Macaca_mulatta
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSMNEG00000035538	PELO	100	80.519	Macaca_nemestrina
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSMLEG00000039113	PELO	100	80.519	Mandrillus_leucophaeus
ENSSDUG00000022938	pelo	97	95.442	ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.805	Mastacembelus_armatus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	ENSMZEG00005014258	pelo	100	91.688	Maylandia_zebra
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.779	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	80.779	Mesocricetus_auratus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSMICG00000044040	PELO	100	80.519	Microcebus_murinus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	81.039	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	81.039	Microtus_ochrogaster
ENSSDUG00000022938	pelo	100	93.506	ENSMMOG00000001324	pelo	100	93.506	Mola_mola
ENSSDUG00000022938	pelo	100	93.506	ENSMALG00000008194	pelo	100	93.506	Monopterus_albus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.519	Mus_caroli
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	80.519	Mus_musculus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.779	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	80.779	Mus_pahari
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	80.519	Mus_spretus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.000	ENSMLUG00000024132	PELO	100	80.000	Myotis_lucifugus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	81.039	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.039	Nannospalax_galili
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.688	Neolamprologus_brichardi
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSNLEG00000035970	PELO	100	80.519	Nomascus_leucogenys
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.000	ENSMEUG00000005468	PELO	100	80.000	Notamacropus_eugenii
ENSSDUG00000022938	pelo	98	79.683	ENSOPRG00000018793	PELO	100	79.683	Ochotona_princeps
ENSSDUG00000022938	pelo	100	81.039	ENSODEG00000017579	PELO	100	81.039	Octodon_degus
ENSSDUG00000022938	pelo	96	92.722	ENSONIG00000011511	pelo	100	92.468	Oreochromis_niloticus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.519	Oryctolagus_cuniculus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.948	ENSORLG00000005827	pelo	100	91.948	Oryzias_latipes
ENSSDUG00000022938	pelo	100	92.208	ENSORLG00020016456	pelo	100	92.208	Oryzias_latipes_hni
ENSSDUG00000022938	pelo	100	92.208	ENSORLG00015014447	pelo	100	92.500	Oryzias_latipes_hsok
ENSSDUG00000022938	pelo	100	93.506	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.506	Oryzias_melastigma
ENSSDUG00000022938	pelo	100	81.039	ENSOGAG00000027940	PELO	100	81.039	Otolemur_garnettii
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.260	ENSOARG00000008324	PELO	99	80.260	Ovis_aries
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSPPAG00000038951	PELO	100	80.519	Pan_paniscus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.260	ENSPPRG00000018800	PELO	100	80.260	Panthera_pardus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.260	ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.260	Panthera_tigris_altaica
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.260	ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.260	Pan_troglodytes
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSPANG00000010902	PELO	100	80.519	Papio_anubis
ENSSDUG00000022938	pelo	100	89.610	ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.610	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSDUG00000022938	pelo	97	80.800	ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.260	Pelodiscus_sinensis
ENSSDUG00000022938	pelo	68	93.307	ENSPMGG00000014561	pelo	94	93.307	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	81.039	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	81.039	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSPCIG00000004880	PELO	100	80.519	Phascolarctos_cinereus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.688	Poecilia_formosa
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	ENSPLAG00000020787	pelo	100	91.688	Poecilia_latipinna
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.688	Poecilia_mexicana
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	ENSPREG00000023071	pelo	100	91.688	Poecilia_reticulata
ENSSDUG00000022938	pelo	97	80.697	ENSPPYG00000015451	PELO	96	80.519	Pongo_abelii
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSPCOG00000021178	PELO	100	80.519	Propithecus_coquereli
ENSSDUG00000022938	pelo	100	91.688	ENSPNYG00000017325	pelo	100	91.688	Pundamilia_nyererei
ENSSDUG00000022938	pelo	97	91.421	ENSPNAG00000012458	pelo	99	90.130	Pygocentrus_nattereri
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.779	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	80.779	Rattus_norvegicus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSRBIG00000007299	PELO	100	80.519	Rhinopithecus_bieti
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSRROG00000035507	PELO	100	80.519	Rhinopithecus_roxellana
ENSSDUG00000022938	pelo	97	33.247	YNL001W	-	99	33.247	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.779	ENSSBOG00000036140	PELO	100	80.779	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSDUG00000022938	pelo	63	78.689	ENSSHAG00000010770	PELO	100	78.689	Sarcophilus_harrisii
ENSSDUG00000022938	pelo	98	90.451	ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.390	Scleropages_formosus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	95.584	ENSSMAG00000017171	pelo	100	95.584	Scophthalmus_maximus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	96.543	ENSSLDG00000017884	pelo	100	96.543	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSDUG00000022938	pelo	97	81.600	ENSSPUG00000005545	PELO	100	81.039	Sphenodon_punctatus
ENSSDUG00000022938	pelo	98	96.021	ENSSPAG00000008501	pelo	100	95.844	Stegastes_partitus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	79.221	ENSSSCG00000016884	PELO	100	79.221	Sus_scrofa
ENSSDUG00000022938	pelo	100	81.039	ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.039	Taeniopygia_guttata
ENSSDUG00000022938	pelo	100	92.468	ENSTRUG00000005809	pelo	100	92.468	Takifugu_rubripes
ENSSDUG00000022938	pelo	100	92.987	ENSTNIG00000018937	pelo	100	92.987	Tetraodon_nigroviridis
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.260	ENSTTRG00000001857	PELO	100	80.260	Tursiops_truncatus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSUAMG00000002535	PELO	100	80.519	Ursus_americanus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSUMAG00000005809	PELO	100	80.519	Ursus_maritimus
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSVPAG00000001113	PELO	100	80.519	Vicugna_pacos
ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.519	ENSVVUG00000025499	PELO	100	80.519	Vulpes_vulpes
ENSSDUG00000022938	pelo	81	79.032	ENSXETG00000018368	pelo	100	77.301	Xenopus_tropicalis
ENSSDUG00000022938	pelo	100	92.208	ENSXMAG00000018474	pelo	100	92.208	Xiphophorus_maculatus