EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015000310 (Gene tree)
Gene ID: 108925179
Gene Symbol: srp9
Alias: zgc:56668
Full Name: signal recognition particle 9
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2078 bases
Position: chrKV410841.1:409488-411565
Accession: 108925179
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015000353	SRP9-21	PF05486.12	1.6e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015000380	-	1265	XM_018736959	ENSSFOP00015000353	86 (aa)	XP_018592475	A0A0P7TJF3

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015000310's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015000310's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSG00000143742	SRP9	100	79.070	Homo_sapiens
ENSSFOG00015000310	srp9	100	86.047	ENSAPOG00000006089	srp9	100	86.047	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSAMEG00000014744	SRP9	100	77.907	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015000310	srp9	100	63.953	ENSACIG00000022298	srp9	100	63.953	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	86.047	ENSAOCG00000014643	srp9	100	86.047	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015000310	srp9	100	86.047	ENSAPEG00000004398	srp9	100	86.047	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSATEG00000014339	srp9	100	88.372	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015000310	srp9	81	80.000	ENSAPLG00000015368	SRP9	100	80.000	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015000310	srp9	100	81.395	ENSACAG00000005788	SRP9	100	81.395	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSANAG00000022626	SRP9	100	79.070	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSACLG00000018392	srp9	100	88.372	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015000310	srp9	100	89.535	ENSAMXG00000010366	srp9	100	89.535	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSBTAG00000033322	SRP9	100	77.907	Bos_taurus
ENSSFOG00015000310	srp9	88	52.632	WBGene00013984	ZK512.4	100	52.632	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSCJAG00000040095	SRP9	100	79.070	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSCAFG00000016162	SRP9	100	77.907	Canis_familiaris
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSCAFG00020003285	SRP9	100	77.907	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSCHIG00000006407	SRP9	100	77.907	Capra_hircus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	76.744	ENSTSYG00000026832	SRP9	100	76.744	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSCPOG00000033454	SRP9	100	77.907	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSCCAG00000034464	SRP9	100	77.907	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSCATG00000041813	SRP9	100	79.070	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSCLAG00000001368	-	100	77.907	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015000310	srp9	99	69.412	ENSCLAG00000017687	-	99	69.412	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015000310	srp9	100	54.651	ENSCHOG00000012912	-	100	54.651	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015000310	srp9	58	72.000	ENSCHOG00000008435	-	100	72.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSCHOG00000006096	-	100	77.907	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015000310	srp9	100	81.395	ENSCPBG00000011999	SRP9	100	81.395	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSCANG00000030765	-	100	79.070	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSCANG00000012015	-	100	77.907	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	76.744	ENSCGRG00001008910	Srp9	100	76.744	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015000310	srp9	95	60.976	ENSCGRG00000009651	Srp9	95	60.976	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015000310	srp9	100	87.209	ENSCSEG00000018438	srp9	100	87.209	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015000310	srp9	100	87.209	ENSCVAG00000001083	srp9	100	87.209	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSDARG00000042851	srp9	100	88.372	Danio_rerio
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSDNOG00000013412	-	100	77.907	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015000310	srp9	90	38.961	FBgn0035827	Srp9	100	38.961	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015000310	srp9	100	70.930	ENSETEG00000012291	SRP9	100	70.930	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015000310	srp9	98	71.429	ENSEBUG00000009080	srp9	100	71.429	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSECAG00000033839	SRP9	100	77.907	Equus_caballus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	70.930	ENSEEUG00000001344	SRP9	100	70.930	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSELUG00000001506	srp9	100	88.372	Esox_lucius
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSFCAG00000010275	SRP9	62	77.907	Felis_catus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSFALG00000011689	SRP9	100	79.070	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015000310	srp9	100	81.395	ENSFDAG00000020469	SRP9	100	81.395	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015000310	srp9	100	87.209	ENSFHEG00000011666	srp9	100	87.209	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	87.209	ENSGMOG00000003565	srp9	100	87.209	Gadus_morhua
ENSSFOG00015000310	srp9	100	80.233	ENSGALG00000026009	SRP9	100	80.233	Gallus_gallus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	87.209	ENSGAFG00000009506	srp9	100	87.209	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015000310	srp9	100	86.047	ENSGACG00000004110	srp9	100	86.047	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	81.395	ENSGAGG00000017129	SRP9	100	81.395	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSGGOG00000011555	SRP9	100	79.070	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSHBUG00000021430	srp9	100	88.372	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015000310	srp9	93	80.000	ENSHGLG00000020925	-	100	80.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015000310	srp9	81	75.714	ENSHGLG00000019830	-	100	75.714	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015000310	srp9	100	75.581	ENSHGLG00000020168	-	100	75.581	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015000310	srp9	98	73.810	ENSHGLG00000006535	-	99	73.810	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSHGLG00000002329	SRP9	100	77.907	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015000310	srp9	100	75.581	ENSHGLG00100020800	-	100	75.581	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015000310	srp9	100	70.930	ENSHGLG00100011806	-	100	70.930	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015000310	srp9	95	78.049	ENSHGLG00100016521	-	100	78.049	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015000310	srp9	98	73.810	ENSHGLG00100009760	-	99	73.810	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015000310	srp9	100	80.233	ENSHGLG00100019986	-	100	80.233	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015000310	srp9	100	62.791	ENSHCOG00000006978	srp9	100	62.791	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSIPUG00000020674	srp9	100	88.372	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSSTOG00000026827	SRP9	100	77.907	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	76.744	ENSJJAG00000016583	Srp9	100	76.744	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	87.209	ENSKMAG00000014117	srp9	100	87.209	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSLBEG00000020620	srp9	100	88.372	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015000310	srp9	100	81.395	ENSLACG00000007546	SRP9	100	81.395	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015000310	srp9	100	91.860	ENSLOCG00000015903	srp9	100	91.860	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	76.744	ENSLAFG00000004081	SRP9	100	76.744	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSMFAG00000002641	SRP9	100	79.070	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSMMUG00000000134	SRP9	100	79.070	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSMNEG00000043512	SRP9	100	79.070	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSMLEG00000037309	SRP9	100	79.070	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSMAMG00000004755	srp9	100	88.372	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSMZEG00005015517	srp9	100	88.372	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015000310	srp9	100	80.233	ENSMGAG00000008061	SRP9	100	80.233	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015000310	srp9	100	76.744	ENSMAUG00000017552	Srp9	100	76.744	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	75.581	ENSMICG00000030104	-	100	75.581	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	75.581	ENSMOCG00000012590	Srp9	100	75.581	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015000310	srp9	100	85.057	ENSMMOG00000014838	srp9	100	85.057	Mola_mola
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSMODG00000025664	SRP9	100	79.070	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015000310	srp9	100	86.047	ENSMALG00000004262	srp9	100	86.047	Monopterus_albus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	MGP_CAROLIEiJ_G0014997	Srp9	100	77.907	Mus_caroli
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSMUSG00000026511	Srp9	100	77.907	Mus_musculus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	75.581	MGP_PahariEiJ_G0028229	Srp9	100	75.581	Mus_pahari
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	MGP_SPRETEiJ_G0015797	Srp9	100	77.907	Mus_spretus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	76.744	ENSMLUG00000014914	SRP9	100	76.744	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSNGAG00000019936	Srp9	100	79.070	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSNBRG00000010915	srp9	100	88.372	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSNLEG00000013740	SRP9	100	79.070	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSOPRG00000012133	SRP9	100	77.907	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015000310	srp9	100	69.318	ENSODEG00000010125	-	76	69.318	Octodon_degus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	73.256	ENSODEG00000015075	-	100	73.256	Octodon_degus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	87.209	ENSONIG00000011409	srp9	100	87.209	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSOANG00000001472	SRP9	100	79.070	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSOCUG00000010791	SRP9	100	77.907	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	84.884	ENSORLG00020003090	srp9	100	84.884	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015000310	srp9	100	84.884	ENSORLG00015001636	srp9	89	84.884	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015000310	srp9	100	86.047	ENSOMEG00000020548	srp9	100	86.047	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015000310	srp9	100	76.744	ENSOGAG00000031299	-	100	76.744	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015000310	srp9	100	76.744	ENSOGAG00000001752	-	100	76.744	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSPPAG00000042680	SRP9	100	79.070	Pan_paniscus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSPPRG00000011732	SRP9	100	77.907	Panthera_pardus
ENSSFOG00015000310	srp9	71	75.410	ENSPTIG00000014838	SRP9	71	75.410	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSPTRG00000002038	SRP9	100	79.070	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSPANG00000030164	SRP9	100	79.070	Papio_anubis
ENSSFOG00015000310	srp9	100	93.023	ENSPKIG00000015012	srp9	100	93.023	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015000310	srp9	100	81.395	ENSPSIG00000014842	SRP9	100	81.395	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015000310	srp9	100	63.953	ENSPMGG00000002318	srp9	100	63.953	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSPEMG00000022774	Srp9	100	77.907	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSPCIG00000017399	SRP9	100	79.070	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	87.209	ENSPREG00000020242	srp9	100	87.209	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015000310	srp9	97	79.518	ENSPPYG00000000174	SRP9	100	79.518	Pongo_abelii
ENSSFOG00015000310	srp9	100	76.744	ENSPCAG00000014886	SRP9	100	76.744	Procavia_capensis
ENSSFOG00015000310	srp9	71	73.770	ENSPCOG00000021743	-	98	73.770	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015000310	srp9	100	62.921	ENSPCOG00000012531	-	100	62.921	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSPVAG00000008142	SRP9	100	77.907	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSPNYG00000010536	srp9	100	88.372	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015000310	srp9	100	87.209	ENSPNAG00000008264	srp9	100	87.209	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSRNOG00000003211	Srp9	100	77.907	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSRBIG00000040480	SRP9	100	79.070	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSRROG00000028703	SRP9	100	79.070	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSSBOG00000034573	SRP9	100	79.070	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSSHAG00000013504	SRP9	100	79.070	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSSMAG00000001318	srp9	100	88.372	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSSDUG00000008772	srp9	100	88.372	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015000310	srp9	87	89.333	ENSSLDG00000019141	srp9	95	89.333	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015000310	srp9	100	59.302	ENSSPUG00000014436	SRP9	100	59.302	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSSPAG00000017244	srp9	100	88.372	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSSSCG00000031664	-	100	77.907	Sus_scrofa
ENSSFOG00015000310	srp9	100	79.070	ENSTGUG00000004123	SRP9	100	79.070	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSTRUG00000024107	srp9	100	88.372	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015000310	srp9	100	88.372	ENSTNIG00000007254	srp9	100	88.372	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015000310	srp9	100	76.744	ENSTBEG00000005634	SRP9	100	76.744	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015000310	srp9	71	75.410	ENSTTRG00000010081	SRP9	98	75.410	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSUAMG00000020489	SRP9	100	77.907	Ursus_americanus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSUMAG00000015908	SRP9	100	77.907	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015000310	srp9	71	75.410	ENSVPAG00000001698	SRP9	98	75.410	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015000310	srp9	100	77.907	ENSVVUG00000002065	SRP9	100	77.907	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015000310	srp9	100	86.047	ENSXCOG00000000662	srp9	100	86.047	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015000310	srp9	100	86.047	ENSXMAG00000029514	srp9	100	86.047	Xiphophorus_maculatus