EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015000526 (Gene tree)
Gene ID: 108925173
Gene Symbol: ptrhd1
Alias: si:dkey-34f16.5
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2733 bases
Position: chrKV410841.1:497990-500722
Accession: 108925173
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015000653	PTH2	PF01981.16	9.2e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015000681	-	1973	XM_018736951	ENSSFOP00015000653	122 (aa)	XP_018592467	A0A1W4YLM0

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015000526's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015000526's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSG00000184924	PTRHD1	83	56.897	Homo_sapiens
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	73.554	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	96	73.554	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	56.034	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	73.554	ENSACIG00000002596	ptrhd1	96	73.554	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	73.554	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	96	73.554	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	73.554	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	96	73.554	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	75.207	ENSATEG00000019199	ptrhd1	96	75.207	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSANAG00000019089	PTRHD1	83	56.897	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	74.380	ENSACLG00000000814	ptrhd1	96	74.380	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	98	73.950	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	82	74.576	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	60.345	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	83	60.345	Bos_taurus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	93	46.018	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	43.548	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	56.034	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	55.172	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	83	55.172	Canis_familiaris
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	60.345	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	83	60.345	Capra_hircus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	83	56.897	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	55.738	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	87	55.738	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	83	56.897	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.391	ENSCATG00000033690	PTRHD1	83	57.391	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	55.738	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	84	55.738	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	83	56.897	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	45.217	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	84	45.217	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	57.377	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	87	57.377	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.391	ENSCING00000019647	-	97	57.391	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSCANG00000034444	PTRHD1	83	56.897	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	55	57.759	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	83	57.759	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	72.951	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	96	72.951	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	71.901	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	96	71.901	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	98	77.311	ENSDARG00000016122	ptrhd1	94	77.311	Danio_rerio
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	77	56.034	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	83	56.897	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	95	61.207	FBgn0038446	CG14903	97	61.207	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	96	46.154	ENSETEG00000009379	-	86	46.154	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	60.870	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	60.870	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	40.517	ENSEASG00005001302	-	82	40.517	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	40.517	ENSECAG00000005314	-	79	40.517	Equus_caballus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSECAG00000017730	PTRHD1	83	57.759	Equus_caballus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	83	56.897	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	96	82.051	ENSELUG00000003837	ptrhd1	93	82.051	Esox_lucius
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	53.448	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	83	53.448	Felis_catus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	83	57.759	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	71.074	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	96	71.074	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.391	ENSGALG00000016610	PTRHD1	86	55.372	Gallus_gallus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	69.421	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	96	69.421	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	75.207	ENSGACG00000006743	ptrhd1	95	75.207	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	58.197	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	96	58.197	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	92	56.034	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	74.380	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	96	74.380	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	60.345	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	83	60.345	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	59.483	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	83	59.483	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	58.621	ENSHGLG00100004341	-	85	58.621	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	98	75.630	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	94	75.630	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	95	77.586	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	97	77.586	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	83	57.759	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	84	57.759	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	92	75.893	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	75.893	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	76.033	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	96	76.033	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	89	69.444	ENSLACG00000018052	PTRHD1	96	66.942	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	98	79.832	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	93	79.832	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	100	56.349	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	90	56.349	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	83	56.034	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	83	56.034	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	83	56.034	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	55.652	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	83	55.652	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	73.554	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	96	73.554	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	74.380	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	96	74.380	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	83	56.897	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	58.621	ENSMICG00000001578	PTRHD1	83	58.621	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	56.034	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	75.207	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	96	75.207	Mola_mola
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	96	55.932	ENSMODG00000015895	PTRHD1	87	55.932	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	73.554	ENSMALG00000003471	ptrhd1	96	73.554	Monopterus_albus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	83	56.897	Mus_caroli
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	56.897	Mus_musculus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	83	56.897	Mus_spretus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	55.172	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	83	55.172	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	83	56.897	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	55.172	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	83	55.172	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	74.380	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	96	74.380	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	56.897	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	53	53.030	ENSMEUG00000010482	-	80	53.030	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	83	56.034	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	54.918	ENSODEG00000007805	PTRHD1	84	54.918	Octodon_degus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	74.380	ENSONIG00000015722	ptrhd1	89	74.380	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	83	56.897	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	95	76.068	ENSORLG00000028768	ptrhd1	99	76.068	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	95	76.068	ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	76.068	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	95	76.068	ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	76.068	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	95	75.000	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	91	75.000	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	98	52.500	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	86	52.500	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	60.345	ENSOARG00000018052	PTRHD1	83	60.345	Ovis_aries
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	83	56.897	Pan_paniscus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	53.448	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	83	53.448	Panthera_pardus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	53.448	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	83	53.448	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	83	56.897	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSPANG00000006781	PTRHD1	83	57.759	Papio_anubis
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	98	82.353	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	81	82.353	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	95	75.000	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	96	72.727	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	89	64.815	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	94	64.407	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	98	55.372	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	96	55.372	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	68.595	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	86	68.595	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	68.595	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	96	68.595	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	69.421	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	96	69.421	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	69.421	ENSPREG00000017624	ptrhd1	96	69.421	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	83	57.759	Pongo_abelii
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	100	56.349	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	90	56.349	Procavia_capensis
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	83	57.759	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	83	57.759	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	74.380	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	96	74.380	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	97	74.576	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	93	74.576	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	83	57.759	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	83	56.897	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.897	ENSRROG00000029627	PTRHD1	83	56.897	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	83	56.034	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	98	52.893	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	79	52.893	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	95	77.586	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	95	75.207	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	76.860	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	81	76.860	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	76.860	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	96	76.860	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	58.621	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	90	57.500	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	75.207	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	96	75.207	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	77	50.000	ENSSSCG00000040441	-	75	50.000	Sus_scrofa
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	60.345	ENSTGUG00000015169	-	85	60.345	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	71.074	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	96	71.074	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	74.380	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	96	74.380	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	56.034	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	83	56.034	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	55.172	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	83	55.172	Ursus_americanus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.759	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	83	57.759	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	91	63.964	ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	69.421	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	96	69.421	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	69.421	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	96	69.421	Xiphophorus_maculatus