EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015001054 (Gene tree)
Gene ID: 108922478
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase-like
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 45109 bases
Position: chrKV410815.1:90163-135271
Accession: 108922478
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015001561	Wyosine_form	PF08608.12	3.2e-27	1	1
ENSSFOP00015001549	Wyosine_form	PF08608.12	3.7e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSSFOT00015001585	-	3881	XM_018732641	ENSSFOP00015001549	737 (aa)	XP_018588157	A0A1W4Y9D8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	69.851	ENSG00000198874	TYW1	99	68.587	Homo_sapiens
ENSSFOG00015001054	tyw1	94	64.557	ENSG00000277149	TYW1B	99	60.523	Homo_sapiens
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	71.701	ENSAPOG00000014391	tyw1	96	72.954	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015001054	tyw1	96	71.667	ENSACIG00000007325	tyw1	99	69.643	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	71.049	ENSAOCG00000016792	tyw1	96	73.130	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	71.880	ENSAPEG00000015939	tyw1	99	73.684	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015001054	tyw1	86	72.987	ENSATEG00000006856	tyw1	90	72.350	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	69.254	ENSANAG00000037051	-	99	68.038	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	71.598	ENSACLG00000018688	tyw1	99	70.267	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015001054	tyw1	97	76.309	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	77.273	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	69.449	ENSBTAG00000008446	TYW1	99	68.646	Bos_taurus
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	69.656	ENSCJAG00000004295	-	99	68.169	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	70.000	ENSCAFG00000010867	-	99	68.611	Canis_familiaris
ENSSFOG00015001054	tyw1	87	79.268	ENSCAFG00020005367	-	96	66.314	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	69.851	ENSCHIG00000019510	-	99	68.785	Capra_hircus
ENSSFOG00015001054	tyw1	88	67.590	ENSTSYG00000008236	-	99	66.971	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015001054	tyw1	93	63.929	ENSCAPG00000013569	-	100	65.361	Cavia_aperea
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	65.468	ENSCPOG00000011182	-	99	65.854	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	68.135	ENSCCAG00000026643	-	99	67.901	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	69.104	ENSCATG00000043677	-	99	68.038	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	65.936	ENSCLAG00000006321	-	99	66.164	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015001054	tyw1	88	72.140	ENSCSAG00000018274	-	99	72.878	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015001054	tyw1	55	85.043	ENSCHOG00000003801	-	56	85.043	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	71.061	ENSCPBG00000014896	-	99	75.646	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015001054	tyw1	86	59.194	ENSCING00000004125	-	97	61.485	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015001054	tyw1	94	55.840	ENSCSAVG00000005712	-	100	56.942	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	69.104	ENSCANG00000033209	-	99	67.901	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015001054	tyw1	68	80.000	ENSCGRG00001003679	Tyw1	90	77.629	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	73.105	ENSCSEG00000005810	tyw1	97	70.620	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015001054	tyw1	91	67.841	ENSCVAG00000001054	tyw1	96	68.768	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015001054	tyw1	100	73.467	ENSDARG00000062987	tyw1	99	73.733	Danio_rerio
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	68.713	ENSDNOG00000024165	-	99	67.764	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015001054	tyw1	96	60.769	ENSDORG00000014772	Tyw1	97	61.077	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015001054	tyw1	64	71.759	ENSEBUG00000004494	tyw1	92	71.759	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	68.235	ENSEASG00005008818	-	98	68.384	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	67.428	ENSECAG00000023164	-	98	63.445	Equus_caballus
ENSSFOG00015001054	tyw1	59	82.653	ENSEEUG00000005950	-	61	82.653	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	71.199	ENSELUG00000008449	tyw1	99	71.818	Esox_lucius
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	68.593	ENSFCAG00000014262	-	99	67.956	Felis_catus
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	65.460	ENSFALG00000013810	-	99	66.201	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	66.667	ENSFDAG00000013270	-	99	67.490	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015001054	tyw1	88	69.805	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	72.964	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	67.656	ENSGALG00000001110	-	98	68.465	Gallus_gallus
ENSSFOG00015001054	tyw1	96	71.861	ENSGACG00000012692	tyw1	99	70.492	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	70.651	ENSGAGG00000022393	-	98	70.028	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015001054	tyw1	87	61.538	ENSGGOG00000001473	TYW1	99	60.061	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	71.450	ENSHBUG00000002640	tyw1	99	70.133	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015001054	tyw1	93	68.821	ENSHGLG00000012093	-	100	69.586	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	66.812	ENSHGLG00100011743	TYW1	99	67.260	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015001054	tyw1	95	69.537	ENSHCOG00000019949	tyw1	98	64.575	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015001054	tyw1	100	72.872	ENSIPUG00000016330	tyw1	99	74.933	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	68.101	ENSSTOG00000004067	-	93	66.712	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015001054	tyw1	97	68.976	ENSJJAG00000022959	Tyw1	99	68.232	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015001054	tyw1	97	72.632	ENSKMAG00000018599	tyw1	99	69.774	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015001054	tyw1	100	62.779	ENSLACG00000018917	tyw1	100	63.827	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	72.953	ENSLOCG00000004035	tyw1	99	70.899	Lepisosteus_oculatus
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ENSSFOG00015001054	tyw1	98	69.254	ENSMNEG00000041992	-	99	73.063	Macaca_nemestrina
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ENSSFOG00015001054	tyw1	99	71.659	ENSORLG00000001393	tyw1	99	70.464	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	71.659	ENSORLG00020019361	tyw1	99	70.323	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	71.659	ENSORLG00015008095	tyw1	97	71.020	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015001054	tyw1	100	68.175	ENSOGAG00000016555	-	96	69.132	Otolemur_garnettii
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ENSSFOG00015001054	tyw1	99	68.630	ENSPTIG00000019545	-	99	68.011	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	62.878	ENSPTRG00000023076	TYW1B	98	63.488	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	69.254	ENSPANG00000019053	-	99	67.984	Papio_anubis
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	75.780	ENSPKIG00000006545	tyw1	98	76.575	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	68.268	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	70.213	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	69.310	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	70.222	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015001054	tyw1	98	72.131	ENSPFOG00000015855	tyw1	98	71.923	Poecilia_formosa
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ENSSFOG00015001054	tyw1	98	71.598	ENSPNYG00000022381	tyw1	99	70.267	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015001054	tyw1	97	74.699	ENSPNAG00000009001	tyw1	99	74.793	Pygocentrus_nattereri
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ENSSFOG00015001054	tyw1	96	72.973	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	75.826	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	68.593	ENSUMAG00000015343	-	99	69.863	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015001054	tyw1	99	68.648	ENSVVUG00000016457	-	99	68.428	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015001054	tyw1	97	71.795	ENSXETG00000010094	tyw1	98	70.360	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015001054	tyw1	100	69.746	ENSXMAG00000013125	tyw1	98	73.272	Xiphophorus_maculatus