EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015001293 (Gene tree)
Gene ID: 108933702
Gene Symbol: rab1ab
Alias: fb53a02|rab1a|si:zc101n13.3|wu:fb53a02
Full Name: ras-related protein Rab-1A-like
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10205 bases
Position: chrKV411038.1:4847964-4858168
Accession: 108933702
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015001957	MMR_HSR1	PF01926.23	1.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015001997	-	5329	XM_018750912	ENSSFOP00015001957	202 (aa)	XP_018606428	A0A1W4ZZS5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015001293	rab1ab	89	36.979	ENSSFOG00015016156	rab36	75	36.979
ENSSFOG00015001293	rab1ab	58	31.092	ENSSFOG00015007064	arl4cb	59	31.092
ENSSFOG00015001293	rab1ab	89	44.199	ENSSFOG00015018421	rab39b	85	44.199
ENSSFOG00015001293	rab1ab	58	31.933	ENSSFOG00015018615	ARL4C	60	31.933
ENSSFOG00015001293	rab1ab	81	38.415	ENSSFOG00015023903	KRAS	95	36.464
ENSSFOG00015001293	rab1ab	77	40.252	ENSSFOG00015000053	rab9a	73	40.252
ENSSFOG00015001293	rab1ab	76	31.013	ENSSFOG00015020074	DNAJC27	58	31.013
ENSSFOG00015001293	rab1ab	84	32.759	ENSSFOG00015023790	rheb	94	32.759
ENSSFOG00015001293	rab1ab	84	37.647	ENSSFOG00015009244	rab39bb	76	37.647
ENSSFOG00015001293	rab1ab	87	40.782	ENSSFOG00015016000	-	83	40.782
ENSSFOG00015001293	rab1ab	79	39.877	ENSSFOG00015021180	RAB7A	79	39.877
ENSSFOG00015001293	rab1ab	59	34.711	ENSSFOG00015014423	rras2	68	34.711
ENSSFOG00015001293	rab1ab	78	39.877	ENSSFOG00015004325	rab34a	62	39.877
ENSSFOG00015001293	rab1ab	96	44.615	ENSSFOG00015009988	-	89	44.615
ENSSFOG00015001293	rab1ab	96	39.286	ENSSFOG00015002077	rab6a	93	39.286
ENSSFOG00015001293	rab1ab	98	52.284	ENSSFOG00015021754	rab13	97	52.284
ENSSFOG00015001293	rab1ab	97	45.641	ENSSFOG00015012785	rab14	90	45.641
ENSSFOG00015001293	rab1ab	83	36.842	ENSSFOG00015009566	si:dkey-13a21.4	83	36.842
ENSSFOG00015001293	rab1ab	85	37.288	ENSSFOG00015003051	hrasb	93	37.288
ENSSFOG00015001293	rab1ab	92	48.649	ENSSFOG00015015034	rab2a	99	44.762
ENSSFOG00015001293	rab1ab	80	39.521	ENSSFOG00015010492	rab9b	82	39.521
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	94.554	ENSSFOG00015020836	rab1ba	100	94.554
ENSSFOG00015001293	rab1ab	88	46.629	ENSSFOG00015008657	rab25a	84	46.629
ENSSFOG00015001293	rab1ab	80	63.975	ENSSFOG00015021448	-	77	63.975
ENSSFOG00015001293	rab1ab	82	36.905	ENSSFOG00015020319	mras	87	36.905
ENSSFOG00015001293	rab1ab	84	45.143	ENSSFOG00015020112	rab33b	81	44.633
ENSSFOG00015001293	rab1ab	96	42.051	ENSSFOG00015003628	-	92	42.051
ENSSFOG00015001293	rab1ab	95	41.709	ENSSFOG00015024034	rab33ba	95	41.709
ENSSFOG00015001293	rab1ab	98	45.455	ENSSFOG00015000865	-	99	45.455
ENSSFOG00015001293	rab1ab	58	32.203	ENSSFOG00015021537	arl8a	61	32.203
ENSSFOG00015001293	rab1ab	63	32.090	ENSSFOG00015007701	-	69	32.090
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	99.505	ENSSFOG00015011140	-	99	99.505
ENSSFOG00015001293	rab1ab	90	42.781	ENSSFOG00015006175	zgc:101559	80	42.781
ENSSFOG00015001293	rab1ab	79	39.877	ENSSFOG00015020012	rab7a	79	39.877
ENSSFOG00015001293	rab1ab	83	30.000	ENSSFOG00015019261	rasl11a	71	30.000
ENSSFOG00015001293	rab1ab	99	38.785	ENSSFOG00015006245	-	96	38.785
ENSSFOG00015001293	rab1ab	97	81.122	ENSSFOG00015005464	zgc:171927	92	81.122
ENSSFOG00015001293	rab1ab	76	35.948	ENSSFOG00015012604	rab23	81	35.329
ENSSFOG00015001293	rab1ab	99	48.325	ENSSFOG00015024042	rab11a	97	48.325
ENSSFOG00015001293	rab1ab	96	35.096	ENSSFOG00015005188	rab34	79	35.096
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	54.950	ENSSFOG00015006076	rab35	100	54.950
ENSSFOG00015001293	rab1ab	82	49.091	ENSSFOG00015017296	rab15	78	49.091
ENSSFOG00015001293	rab1ab	86	33.714	ENSSFOG00015014992	rhebl1	92	33.714
ENSSFOG00015001293	rab1ab	68	30.216	ENSSFOG00015014993	-	68	30.216
ENSSFOG00015001293	rab1ab	85	40.341	ENSSFOG00015012088	rab42	79	40.341
ENSSFOG00015001293	rab1ab	96	38.889	ENSSFOG00015004941	rab41	91	39.303
ENSSFOG00015001293	rab1ab	76	36.129	ENSSFOG00015020738	rabl2	67	36.129
ENSSFOG00015001293	rab1ab	87	42.135	ENSSFOG00015020732	rab42a	84	42.135
ENSSFOG00015001293	rab1ab	89	45.263	ENSSFOG00015015336	rab4a	89	45.263
ENSSFOG00015001293	rab1ab	97	45.641	ENSSFOG00015011318	-	90	45.641
ENSSFOG00015001293	rab1ab	96	37.436	ENSSFOG00015019202	RAB6B	94	37.436
ENSSFOG00015001293	rab1ab	81	38.182	ENSSFOG00015006846	-	95	36.313
ENSSFOG00015001293	rab1ab	58	31.356	ENSSFOG00015019411	arl8ba	61	31.356
ENSSFOG00015001293	rab1ab	99	46.411	ENSSFOG00015009042	rab11bb	96	46.411
ENSSFOG00015001293	rab1ab	96	43.814	ENSSFOG00015021115	-	89	43.814
ENSSFOG00015001293	rab1ab	96	44.845	ENSSFOG00015014517	rab5a	89	44.845
ENSSFOG00015001293	rab1ab	96	37.755	ENSSFOG00015011268	RAB41	92	37.755
ENSSFOG00015001293	rab1ab	81	46.429	ENSSFOG00015004253	rab33a	75	46.429
ENSSFOG00015001293	rab1ab	99	48.077	ENSSFOG00015008618	rab11al	96	48.077
ENSSFOG00015001293	rab1ab	82	50.898	ENSSFOG00015017444	rab18a	78	46.154
ENSSFOG00015001293	rab1ab	85	36.723	ENSSFOG00015011157	-	93	36.723
ENSSFOG00015001293	rab1ab	58	31.356	ENSSFOG00015020131	arl8bb	65	31.356
ENSSFOG00015001293	rab1ab	99	53.922	ENSSFOG00015006414	-	97	53.922
ENSSFOG00015001293	rab1ab	99	35.122	ENSSFOG00015011771	-	99	35.122
ENSSFOG00015001293	rab1ab	97	35.678	ENSSFOG00015003259	rab9a	92	35.678
ENSSFOG00015001293	rab1ab	96	36.364	ENSSFOG00015005076	zgc:100918	96	36.364
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ENSSFOG00015001293	rab1ab	79	30.303	ENSSFOG00015017512	dnajc27	61	30.303

Orthologs

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ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSG00000174903	RAB1B	100	93.069	Homo_sapiens
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	94.554	ENSAPOG00000012767	rab1ba	100	94.554	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	95.567	ENSAPOG00000007746	rab1ab	100	95.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSAMEG00000017135	RAB1B	100	93.069	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015001293	rab1ab	99	94.000	ENSACIG00000019049	rab1ab	99	92.574	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	91.667	ENSACIG00000014625	-	100	91.667	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	95.567	ENSAOCG00000006385	rab1ab	100	95.567	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	94.554	ENSAOCG00000003965	rab1ba	100	94.554	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	95.567	ENSAPEG00000001358	rab1ab	100	95.567	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	94.554	ENSAPEG00000012105	rab1ba	100	94.554	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	94.554	ENSATEG00000002479	rab1ba	100	94.554	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	95.050	ENSATEG00000015844	-	100	95.050	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	95.567	ENSATEG00000008052	rab1ab	100	95.567	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	67	97.778	ENSACAG00000009125	RAB1B	96	97.778	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSANAG00000022585	RAB1B	100	93.069	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	95.567	ENSACLG00000007644	rab1ab	100	95.567	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	94.554	ENSACLG00000013668	rab1ba	100	94.554	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015001293	rab1ab	99	92.965	ENSAMXG00000003547	rab1ba	89	92.965	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	98.515	ENSAMXG00000032564	rab1ab	100	98.515	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	98	90.909	ENSBTAG00000046485	RAB1B	67	90.909	Bos_taurus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSCJAG00000001599	-	100	93.069	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	92.079	ENSCJAG00000047933	-	100	92.079	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSCAFG00000012855	RAB1B	99	93.069	Canis_familiaris
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSCAFG00020015406	-	100	93.069	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	92.574	ENSCHIG00000015549	RAB1B	100	92.574	Capra_hircus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	98	92.893	ENSTSYG00000025638	RAB1B	99	91.176	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015001293	rab1ab	98	92.893	ENSCAPG00000015495	RAB1B	98	92.893	Cavia_aperea
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSCPOG00000014868	RAB1B	100	93.069	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSCCAG00000021540	RAB1B	100	93.069	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSCATG00000002342	RAB1B	100	93.069	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSCLAG00000015776	RAB1B	100	93.069	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015001293	rab1ab	69	98.571	ENSCSAG00000014775	-	97	98.571	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	98	92.893	ENSCSAG00000008145	RAB1B	88	92.893	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.564	ENSCPBG00000022446	RAB1B	100	93.564	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	88.614	ENSCING00000023081	-	99	88.614	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	88.614	ENSCSAVG00000009147	-	99	88.614	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSCANG00000042299	RAB1B	100	93.069	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSCGRG00001014956	Rab1b	100	93.069	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.069	ENSCGRG00000015564	Rab1b	100	93.069	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	93.564	ENSCSEG00000018732	rab1ba	100	93.564	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015001293	rab1ab	100	94.554	ENSCSEG00000020977	-	99	94.554	Cynoglossus_semilaevis
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