EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015001881 (Gene tree)
Gene ID: 108933781
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin-1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14600 bases
Position: chrKV411038.1:5414330-5428929
Accession: 108933781
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015002931	CRM1_C	PF08767.11	1.3e-133	1	1
ENSSFOP00015002931	Xpo1	PF08389.12	2.1e-41	1	1
ENSSFOP00015002931	IBN_N	PF03810.19	1.3e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015002976	XPO1-201	4803	XM_018751094	ENSSFOP00015002931	1071 (aa)	XP_018606610	A0A1W5A0P4

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
sfm03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	98.319	ENSSFOG00015011598	xpo1b	100	98.319

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.705	ENSG00000082898	XPO1	100	95.705	Homo_sapiens
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	91.915	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	91.915	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.292	ENSAPOG00000004984	-	100	97.292	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.455	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	96.455	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	98.191	ENSACIG00000010818	-	100	98.191	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	93.936	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	93.744	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	93.744	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.386	ENSAOCG00000010121	-	100	97.386	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015001881	XPO1	91	94.027	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	94.027	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.386	ENSAPEG00000007038	-	100	97.386	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.386	ENSATEG00000008816	-	100	97.386	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	93.744	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	93.744	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.639	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	96.639	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.452	ENSACAG00000002501	XPO1	100	96.452	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.705	ENSANAG00000020802	XPO1	100	95.705	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.386	ENSACLG00000015192	-	100	97.386	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	94.149	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	94.149	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.946	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	97.946	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	95.127	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	95.127	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.545	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	96.545	Bos_taurus
ENSSFOG00015001881	XPO1	99	52.218	WBGene00002078	xpo-1	99	52.218	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.705	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	95.705	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.545	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	96.545	Canis_familiaris
ENSSFOG00015001881	XPO1	93	96.787	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	96.787	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.545	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	96.545	Capra_hircus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.545	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	96.545	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015001881	XPO1	53	91.844	ENSCAPG00000006454	-	100	91.844	Cavia_aperea
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.051	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	95.051	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	77.273	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	77.458	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	93.948	ENSCATG00000032674	XPO1	100	96.277	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.265	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	96.265	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.705	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.705	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015001881	XPO1	83	97.536	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.536	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.545	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.545	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015001881	XPO1	99	81.437	ENSCING00000024562	-	99	81.437	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015001881	XPO1	99	80.299	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.299	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	91.597	ENSCANG00000028883	XPO1	100	95.567	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.518	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	95.518	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.518	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	95.518	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	96.915	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	96.915	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.106	ENSCVAG00000016788	-	100	97.106	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	92.624	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	92.624	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	94.958	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	96.594	Danio_rerio
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.759	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	97.759	Danio_rerio
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.639	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	96.639	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015001881	XPO1	92	93.729	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	93.729	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015001881	XPO1	99	71.040	FBgn0020497	emb	99	71.040	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015001881	XPO1	94	95.756	ENSETEG00000018045	XPO1	94	95.756	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015001881	XPO1	90	79.876	ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.545	ENSEASG00005007223	XPO1	100	96.545	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.545	ENSECAG00000024920	XPO1	100	96.545	Equus_caballus
ENSSFOG00015001881	XPO1	92	89.583	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	89.583	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015001881	XPO1	87	94.433	ENSELUG00000014306	-	99	94.433	Esox_lucius
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	96.596	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	96.596	Esox_lucius
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.545	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	96.545	Felis_catus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.452	ENSFALG00000010989	XPO1	100	96.452	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	94.771	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	94.771	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	92.997	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	92.997	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	94.398	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	94.398	Gadus_morhua
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	91.223	ENSGMOG00000019063	-	100	91.223	Gadus_morhua
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.639	ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.639	Gallus_gallus
ENSSFOG00015001881	XPO1	91	97.528	ENSGAFG00000003355	-	98	97.528	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	93.830	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.830	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	93.557	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	93.557	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.012	ENSGACG00000002743	-	100	97.012	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.452	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.452	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.705	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	95.705	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	93.838	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	93.838	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.479	ENSHBUG00000020037	-	100	97.479	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.172	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	96.172	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.172	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	96.172	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	97.128	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	97.128	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	98.039	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	98.039	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.145	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	95.145	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.359	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	96.359	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.265	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	96.265	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.732	ENSKMAG00000016218	-	100	96.732	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	92.904	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	92.904	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	91.525	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	91.525	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.386	ENSLBEG00000005740	-	100	97.386	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	75.531	ENSLACG00000018213	XPO1	100	75.531	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.666	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	97.666	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.172	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	96.172	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.705	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	95.705	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.705	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	95.705	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.705	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	95.705	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	93.953	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	93.953	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	93.651	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	93.651	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.199	ENSMAMG00000010568	-	100	97.199	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	93.838	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	93.838	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.386	ENSMZEG00005018158	-	98	97.734	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015001881	XPO1	68	96.970	ENSMGAG00000001496	-	100	96.970	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.518	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	95.518	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.545	ENSMICG00000027770	XPO1	100	96.545	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.798	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	95.798	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	94.149	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	94.149	Mola_mola
ENSSFOG00015001881	XPO1	87	98.079	ENSMMOG00000008001	-	99	98.079	Mola_mola
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.518	ENSMODG00000002831	XPO1	100	95.518	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	97.012	ENSMALG00000007085	-	100	97.012	Monopterus_albus
ENSSFOG00015001881	XPO1	88	93.624	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	93.624	Monopterus_albus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.705	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.705	Mus_caroli
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.705	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	95.705	Mus_musculus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.612	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.612	Mus_pahari
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.705	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	95.705	Mus_spretus
ENSSFOG00015001881	XPO1	100	96.545	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	96.545	Mustela_putorius_furo
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