EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015002026 (Gene tree)
Gene ID: 108938789
Gene Symbol: srp72
Alias: wu:fi03d11
Full Name: signal recognition particle 72
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7140 bases
Position: chrKV411175.1:3722219-3729358
Accession: 108938789
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015003162	SRP72	PF08492.12	8.9e-22	1	1
ENSSFOP00015003197	SRP72	PF08492.12	1.5e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015003249	-	1926	-	ENSSFOP00015003197	641 (aa)	-	-
ENSSFOT00015003212	-	2633	XM_018759705	ENSSFOP00015003162	665 (aa)	XP_018615221	A0A1W5AQV1

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015002026's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015002026's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.802	ENSG00000174780	SRP72	99	78.861	Homo_sapiens
ENSSFOG00015002026	srp72	91	82.915	ENSAPOG00000019438	srp72	99	72.331	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015002026	srp72	96	79.005	ENSAMEG00000008469	SRP72	99	79.310	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.712	ENSACIG00000000488	srp72	100	82.712	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.635	ENSAOCG00000011256	srp72	100	83.084	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.084	ENSAPEG00000001512	srp72	100	83.084	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015002026	srp72	93	84.740	ENSATEG00000006781	srp72	99	84.740	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015002026	srp72	96	79.503	ENSAPLG00000008751	SRP72	98	79.545	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.207	ENSACAG00000002381	SRP72	98	77.844	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015002026	srp72	95	79.114	ENSANAG00000020836	-	94	79.114	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.259	ENSACLG00000014617	srp72	100	83.259	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015002026	srp72	98	84.462	ENSAMXG00000004011	srp72	100	83.910	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.034	ENSBTAG00000010593	SRP72	99	78.561	Bos_taurus
ENSSFOG00015002026	srp72	95	30.781	WBGene00017245	srpa-72	96	31.669	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.187	ENSCJAG00000017998	SRP72	99	78.261	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.955	ENSCAFG00000002244	SRP72	99	79.610	Canis_familiaris
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.955	ENSCAFG00020027338	SRP72	99	78.673	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015002026	srp72	97	76.227	ENSCHIG00000021465	SRP72	99	76.796	Capra_hircus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	79.134	ENSTSYG00000010571	-	100	78.287	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015002026	srp72	77	71.204	ENSCAPG00000016668	SRP72	100	72.458	Cavia_aperea
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.495	ENSCPOG00000000218	SRP72	99	78.561	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	76.615	ENSCCAG00000030830	-	99	76.727	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015002026	srp72	95	78.956	ENSCCAG00000030683	-	100	73.305	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.495	ENSCATG00000008072	SRP72	99	78.561	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015002026	srp72	98	62.423	ENSCATG00000045359	-	95	62.308	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015002026	srp72	97	77.880	ENSCLAG00000003571	SRP72	99	78.111	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015002026	srp72	97	74.808	ENSCSAG00000005079	SRP72	99	74.963	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015002026	srp72	87	80.702	ENSCHOG00000013240	SRP72	89	80.702	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015002026	srp72	96	79.316	ENSCPBG00000015015	SRP72	99	79.341	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015002026	srp72	96	43.288	ENSCING00000002417	-	95	43.288	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015002026	srp72	96	42.576	ENSCSAVG00000011288	-	95	42.727	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.495	ENSCANG00000041709	SRP72	99	78.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015002026	srp72	99	53.012	ENSCANG00000037920	-	97	54.824	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.187	ENSCGRG00001013548	Srp72	99	78.561	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015002026	srp72	92	78.155	ENSCGRG00000003013	Srp72	100	77.847	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015002026	srp72	98	83.333	ENSCSEG00000003616	srp72	100	83.109	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015002026	srp72	92	83.443	ENSCVAG00000001520	srp72	100	83.443	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015002026	srp72	85	83.713	ENSDARG00000014139	srp72	100	83.361	Danio_rerio
ENSSFOG00015002026	srp72	97	75.191	ENSDNOG00000039012	SRP72	83	75.336	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.915	ENSDORG00000000171	Srp72	99	78.861	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015002026	srp72	95	41.342	FBgn0038810	Srp72	96	41.589	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015002026	srp72	96	79.938	ENSETEG00000005191	SRP72	99	79.760	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015002026	srp72	75	61.240	ENSEBUG00000003696	srp72	98	61.240	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.955	ENSEASG00005017747	SRP72	99	79.010	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.802	ENSECAG00000006920	SRP72	99	78.861	Equus_caballus
ENSSFOG00015002026	srp72	98	81.750	ENSELUG00000022415	srp72	98	81.791	Esox_lucius
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.825	ENSFCAG00000027600	SRP72	99	79.010	Felis_catus
ENSSFOG00015002026	srp72	96	81.026	ENSFALG00000006713	SRP72	99	80.510	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.034	ENSFDAG00000002014	-	99	78.111	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015002026	srp72	97	49.065	ENSFDAG00000009793	-	94	47.745	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.090	ENSFHEG00000017652	srp72	92	82.537	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015002026	srp72	98	78.834	ENSGMOG00000005986	srp72	99	78.711	Gadus_morhua
ENSSFOG00015002026	srp72	96	80.967	ENSGALG00000011403	SRP72	99	80.480	Gallus_gallus
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.284	ENSGAFG00000017762	srp72	100	83.284	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015002026	srp72	100	80.746	ENSGACG00000016749	srp72	99	81.045	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015002026	srp72	87	78.351	ENSGAGG00000024611	SRP72	99	78.992	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.495	ENSGGOG00000013234	-	99	78.561	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.259	ENSHBUG00000020723	srp72	100	83.259	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.495	ENSHGLG00000009791	SRP72	99	78.561	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015002026	srp72	52	61.561	ENSHGLG00000003496	-	95	62.275	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015002026	srp72	90	69.657	ENSHGLG00000010633	-	99	70.509	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015002026	srp72	97	72.965	ENSHGLG00000005029	-	99	72.714	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015002026	srp72	97	60.587	ENSHGLG00000018597	-	99	61.295	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015002026	srp72	85	72.889	ENSHGLG00000003950	-	99	72.889	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.495	ENSHGLG00100009021	SRP72	99	78.561	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015002026	srp72	97	72.965	ENSHGLG00100011236	-	99	72.714	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015002026	srp72	99	59.639	ENSHGLG00100009346	-	99	59.337	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015002026	srp72	85	72.444	ENSHGLG00100017133	-	99	72.444	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.583	ENSHCOG00000013760	srp72	100	82.583	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015002026	srp72	100	84.361	ENSIPUG00000000210	srp72	100	84.361	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.802	ENSSTOG00000007305	SRP72	99	78.861	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015002026	srp72	96	79.160	ENSJJAG00000018324	Srp72	97	79.058	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015002026	srp72	100	81.642	ENSKMAG00000003776	srp72	100	81.642	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015002026	srp72	98	86.043	ENSLOCG00000002628	srp72	97	86.043	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.955	ENSLAFG00000018307	SRP72	99	79.010	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015002026	srp72	98	63.190	ENSMFAG00000037164	-	96	63.566	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.495	ENSMFAG00000031065	SRP72	99	78.561	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015002026	srp72	94	56.916	ENSMMUG00000021262	-	95	56.619	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015002026	srp72	98	78.440	ENSMMUG00000016368	SRP72	99	78.283	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.495	ENSMNEG00000038065	-	99	78.561	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015002026	srp72	95	77.690	ENSMLEG00000030140	-	94	77.057	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.960	ENSMAMG00000014989	srp72	88	82.960	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.259	ENSMZEG00005003325	srp72	100	83.259	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015002026	srp72	93	76.537	ENSMGAG00000008567	SRP72	100	78.158	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015002026	srp72	96	78.227	ENSMAUG00000001237	Srp72	99	78.261	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015002026	srp72	95	79.114	ENSMICG00000008507	-	94	79.114	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.034	ENSMOCG00000020309	Srp72	99	78.411	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.063	ENSMMOG00000002627	srp72	100	82.063	Mola_mola
ENSSFOG00015002026	srp72	96	75.078	ENSMODG00000020697	SRP72	99	75.412	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.212	ENSMALG00000003747	srp72	100	82.810	Monopterus_albus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	77.573	MGP_CAROLIEiJ_G0027323	Srp72	99	77.961	Mus_caroli
ENSSFOG00015002026	srp72	97	77.573	ENSMUSG00000036323	Srp72	99	77.961	Mus_musculus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.053	MGP_PahariEiJ_G0017103	Srp72	99	78.261	Mus_pahari
ENSSFOG00015002026	srp72	97	77.573	MGP_SPRETEiJ_G0028317	Srp72	99	77.961	Mus_spretus
ENSSFOG00015002026	srp72	96	79.005	ENSMPUG00000004828	SRP72	99	79.310	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015002026	srp72	96	78.261	ENSMLUG00000007344	SRP72	99	78.593	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015002026	srp72	98	78.931	ENSNGAG00000012595	Srp72	100	79.545	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015002026	srp72	100	79.970	ENSNBRG00000014492	srp72	100	79.970	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015002026	srp72	97	73.886	ENSNLEG00000008806	-	97	77.251	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015002026	srp72	88	76.763	ENSMEUG00000005164	SRP72	89	76.578	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015002026	srp72	96	78.072	ENSOPRG00000012521	SRP72	97	77.642	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015002026	srp72	96	76.398	ENSODEG00000012214	SRP72	99	76.347	Octodon_degus
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.408	ENSONIG00000001446	srp72	99	83.408	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	62.636	ENSOANG00000008562	SRP72	96	62.462	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.187	ENSOCUG00000012226	SRP72	97	78.101	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.309	ENSORLG00000020418	srp72	99	82.309	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.159	ENSORLG00020009138	srp72	97	82.159	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015002026	srp72	100	81.859	ENSORLG00015018251	srp72	99	81.859	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015002026	srp72	98	82.083	ENSOMEG00000022008	srp72	99	82.282	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.955	ENSOGAG00000003578	SRP72	99	79.160	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015002026	srp72	97	77.880	ENSOARG00000004329	SRP72	99	78.411	Ovis_aries
ENSSFOG00015002026	srp72	99	55.690	ENSPPAG00000011428	-	95	56.575	Pan_paniscus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.802	ENSPPAG00000042265	SRP72	99	78.861	Pan_paniscus
ENSSFOG00015002026	srp72	81	62.687	ENSPPAG00000032490	-	91	61.852	Pan_paniscus
ENSSFOG00015002026	srp72	96	79.005	ENSPPRG00000015991	SRP72	99	79.040	Panthera_pardus
ENSSFOG00015002026	srp72	96	79.005	ENSPTIG00000018786	SRP72	99	79.040	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015002026	srp72	99	57.663	ENSPTRG00000048100	-	95	58.525	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.802	ENSPTRG00000048466	-	99	78.861	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015002026	srp72	81	62.500	ENSPTRG00000043609	-	95	59.788	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.495	ENSPANG00000005495	SRP72	99	78.561	Papio_anubis
ENSSFOG00015002026	srp72	94	63.133	ENSPANG00000030230	-	97	63.680	Papio_anubis
ENSSFOG00015002026	srp72	94	78.914	ENSPSIG00000003003	SRP72	99	79.435	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015002026	srp72	96	78.072	ENSPEMG00000012828	-	99	78.111	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.173	ENSPCIG00000000732	SRP72	99	78.111	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.985	ENSPFOG00000003480	srp72	100	82.985	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.134	ENSPLAG00000020122	srp72	100	83.134	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.537	ENSPMEG00000019988	srp72	100	82.537	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.134	ENSPREG00000006218	srp72	100	83.134	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015002026	srp72	57	64.136	ENSPPYG00000009152	-	96	63.446	Pongo_abelii
ENSSFOG00015002026	srp72	98	78.626	ENSPPYG00000014752	-	78	78.689	Pongo_abelii
ENSSFOG00015002026	srp72	97	76.805	ENSPVAG00000005590	SRP72	99	77.511	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.408	ENSPNYG00000001916	srp72	100	83.408	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015002026	srp72	100	85.113	ENSPNAG00000022424	srp72	100	85.113	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015002026	srp72	99	76.162	ENSRNOG00000002100	LOC108348180	99	76.762	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015002026	srp72	99	61.446	ENSRBIG00000029328	-	98	62.478	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015002026	srp72	97	73.118	ENSRBIG00000042069	SRP72	99	77.273	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.495	ENSRROG00000035704	SRP72	99	78.561	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015002026	srp72	93	77.814	ENSSHAG00000000614	SRP72	99	75.410	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015002026	srp72	100	80.506	ENSSMAG00000007639	srp72	98	80.974	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.857	ENSSDUG00000007345	srp72	98	84.006	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.857	ENSSLDG00000021819	srp72	99	83.208	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015002026	srp72	74	75.263	ENSSARG00000005804	SRP72	76	75.505	Sorex_araneus
ENSSFOG00015002026	srp72	96	79.128	ENSSPUG00000009740	SRP72	99	78.861	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015002026	srp72	100	83.558	ENSSPAG00000011565	srp72	100	83.857	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015002026	srp72	99	76.169	ENSSSCG00000008900	SRP72	99	76.162	Sus_scrofa
ENSSFOG00015002026	srp72	96	81.026	ENSTGUG00000004767	SRP72	99	80.240	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015002026	srp72	98	81.902	ENSTRUG00000009831	srp72	98	81.902	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.063	ENSTNIG00000013073	srp72	99	82.063	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015002026	srp72	88	70.175	ENSTBEG00000007394	SRP72	90	70.175	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015002026	srp72	92	77.994	ENSTTRG00000010945	SRP72	100	78.549	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015002026	srp72	57	78.215	ENSUAMG00000001701	SRP72	100	78.421	Ursus_americanus
ENSSFOG00015002026	srp72	96	79.005	ENSUMAG00000008151	SRP72	99	79.310	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015002026	srp72	97	77.266	ENSVPAG00000000458	SRP72	99	77.811	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015002026	srp72	97	78.802	ENSVVUG00000006020	SRP72	99	79.460	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015002026	srp72	95	73.940	ENSXETG00000010205	srp72	100	73.940	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015002026	srp72	100	82.836	ENSXMAG00000018000	srp72	99	82.511	Xiphophorus_maculatus