EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015002383 (Gene tree)
Gene ID: 108933807
Gene Symbol: papolg
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11750 bases
Position: chrKV411038.1:5525890-5537639
Accession: 108933807
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015003812	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.7e-27	1	2
ENSSFOP00015003812	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.7e-27	2	2
ENSSFOP00015003790	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.9e-27	1	2
ENSSFOP00015003790	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.9e-27	2	2
ENSSFOP00015003772	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.1e-27	1	2
ENSSFOP00015003772	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.1e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015003835	-	3805	XM_018751149	ENSSFOP00015003772	744 (aa)	XP_018606665	A0A1W5A0U9
ENSSFOT00015003876	-	2073	-	ENSSFOP00015003812	690 (aa)	-	-
ENSSFOT00015003853	-	3721	-	ENSSFOP00015003790	716 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015002383's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015002383's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.873	ENSSFOG00015011874	papolg	100	68.873
ENSSFOG00015002383	papolg	98	60.248	ENSSFOG00015004431	papola	96	72.089

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.512	ENSG00000115421	PAPOLG	100	84.188	Homo_sapiens
ENSSFOG00015002383	papolg	100	76.934	ENSAPOG00000004798	papolg	99	77.331	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015002383	papolg	98	69.396	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	69.973	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015002383	papolg	100	74.895	ENSACIG00000010546	papolg	99	75.070	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.762	ENSAOCG00000010254	papolg	89	76.222	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.762	ENSAPEG00000006944	papolg	89	76.222	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.199	ENSATEG00000009007	papolg	79	90.505	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015002383	papolg	98	65.182	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.182	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015002383	papolg	80	60.229	ENSACAG00000015048	-	100	60.229	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.401	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	70.401	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.514	ENSACLG00000015592	papolg	89	73.896	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.661	ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.661	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.449	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	70.449	Bos_taurus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.565	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.565	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.545	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	69.201	Canis_familiaris
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.295	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	69.986	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.449	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	71.049	Capra_hircus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.475	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	68.683	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015002383	papolg	55	77.953	ENSCAPG00000014901	-	100	77.953	Cavia_aperea
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.987	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.987	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.932	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	70.932	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015002383	papolg	91	78.541	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	78.788	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.804	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	69.804	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.293	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	69.293	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015002383	papolg	89	68.343	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	68.249	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015002383	papolg	71	64.503	ENSCING00000024664	-	92	64.503	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015002383	papolg	70	65.155	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.155	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.752	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	70.752	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015002383	papolg	98	70.501	ENSCGRG00001014951	Papolg	99	70.501	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015002383	papolg	98	70.501	ENSCGRG00000005552	-	99	70.501	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015002383	papolg	100	74.480	ENSCSEG00000000771	papolg	99	74.757	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015002383	papolg	100	71.166	ENSCVAG00000016602	papolg	90	88.515	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	76.096	ENSDARG00000012141	papolg	100	76.096	Danio_rerio
ENSSFOG00015002383	papolg	100	66.892	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	66.892	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015002383	papolg	62	83.217	ENSDORG00000016228	Papolg	100	83.217	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015002383	papolg	100	56.644	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	58.445	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015002383	papolg	71	69.697	ENSEBUG00000005042	-	87	69.697	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015002383	papolg	65	69.821	ENSEBUG00000004020	papolg	92	69.821	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.514	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	70.171	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.912	ENSECAG00000009859	PAPOLG	97	70.722	Equus_caballus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	64.238	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.238	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015002383	papolg	99	78.374	ENSELUG00000014497	papolg	86	79.020	Esox_lucius
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.565	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	69.565	Felis_catus
ENSSFOG00015002383	papolg	99	59.628	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	59.628	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.979	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	68.979	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015002383	papolg	66	65.900	ENSFHEG00000019080	papolg	90	68.000	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.631	ENSGMOG00000018772	papolg	94	85.432	Gadus_morhua
ENSSFOG00015002383	papolg	100	62.380	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	62.689	Gallus_gallus
ENSSFOG00015002383	papolg	79	87.729	ENSGAFG00000003263	papolg	89	72.644	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.844	ENSGACG00000002718	papolg	100	73.844	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.972	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	70.891	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.514	ENSHBUG00000004882	papolg	89	74.901	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015002383	papolg	98	70.390	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	70.296	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.749	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	69.749	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015002383	papolg	100	74.437	ENSHCOG00000006782	papolg	89	74.437	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.690	ENSIPUG00000021642	papolg	100	75.984	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.673	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	69.673	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015002383	papolg	62	83.450	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	83.450	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	74.339	ENSKMAG00000016439	papolg	97	73.492	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015002383	papolg	94	85.816	ENSLBEG00000023218	papolg	89	72.173	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015002383	papolg	99	65.119	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	65.119	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015002383	papolg	100	76.793	ENSLOCG00000016130	papolg	100	76.793	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.401	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	82.984	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.627	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	69.293	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.627	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	69.293	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015002383	papolg	100	62.109	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	62.857	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.195	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	70.972	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	76.136	ENSMAMG00000010667	papolg	99	76.596	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015002383	papolg	99	74.716	ENSMZEG00005018140	papolg	99	75.833	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015002383	papolg	98	62.366	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	98	62.366	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015002383	papolg	98	70.430	ENSMAUG00000009088	Papolg	98	70.430	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	71.271	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	71.271	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.066	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	70.066	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015002383	papolg	100	76.159	ENSMMOG00000008020	papolg	99	76.159	Mola_mola
ENSSFOG00015002383	papolg	98	70.187	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	70.187	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.099	ENSMALG00000007012	papolg	89	75.561	Monopterus_albus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.252	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	84.038	Mus_caroli
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.503	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	84.038	Mus_musculus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.947	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	69.947	Mus_pahari
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.213	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	84.038	Mus_spretus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.775	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	69.433	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015002383	papolg	98	70.201	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	70.201	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.612	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	70.612	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015002383	papolg	93	75.536	ENSNBRG00000011943	papolg	98	66.845	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015002383	papolg	62	83.217	ENSNLEG00000009507	-	100	83.217	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015002383	papolg	67	65.839	ENSMEUG00000013605	-	68	65.839	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.106	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	70.106	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015002383	papolg	61	81.579	ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	81.775	Octodon_degus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.477	ENSONIG00000002985	papolg	100	68.742	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015002383	papolg	98	71.524	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	71.524	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.407	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	69.407	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.184	ENSORLG00000001577	papolg	89	73.850	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.184	ENSORLG00020002482	papolg	89	73.850	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.052	ENSORLG00015008836	papolg	89	73.719	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.907	ENSOMEG00000001406	papolg	89	74.274	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015002383	papolg	58	60.860	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	61.229	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.449	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	70.449	Ovis_aries
ENSSFOG00015002383	papolg	100	71.031	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	71.111	Pan_paniscus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.565	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	69.565	Panthera_pardus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.433	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	69.433	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015002383	papolg	100	71.031	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	71.111	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015002383	papolg	100	65.359	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	66.013	Papio_anubis
ENSSFOG00015002383	papolg	92	83.763	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	82.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.995	ENSPKIG00000003313	papolg	100	75.995	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015002383	papolg	98	68.970	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.970	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015002383	papolg	98	71.390	ENSPEMG00000008960	-	99	71.390	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015002383	papolg	72	62.978	ENSPMAG00000004864	-	98	62.978	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015002383	papolg	99	52.926	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.121	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.856	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.856	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.997	ENSPFOG00000012909	papolg	98	73.936	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.866	ENSPLAG00000018445	papolg	89	73.168	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.526	ENSPMEG00000003961	papolg	89	73.856	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015002383	papolg	82	85.638	ENSPREG00000010358	papolg	89	73.012	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.293	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	69.293	Pongo_abelii
ENSSFOG00015002383	papolg	98	62.869	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	62.869	Procavia_capensis
ENSSFOG00015002383	papolg	100	65.527	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	65.527	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015002383	papolg	90	79.853	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	86	80.037	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.857	ENSPNYG00000006729	papolg	99	75.857	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015002383	papolg	100	76.658	ENSPNAG00000015521	papolg	100	76.658	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.721	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	69.721	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	65.395	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	65.395	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.990	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	71.071	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.986	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	70.678	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015002383	papolg	94	69.735	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.735	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015002383	papolg	97	85.088	ENSSMAG00000015598	papolg	95	70.375	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	76.781	ENSSDUG00000000912	papolg	99	77.443	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.848	ENSSLDG00000001217	papolg	99	71.330	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.699	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	69.607	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	76.136	ENSSPAG00000009004	papolg	99	76.705	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.897	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.897	Sus_scrofa
ENSSFOG00015002383	papolg	78	70.501	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	70.501	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015002383	papolg	100	74.270	ENSTRUG00000006410	papolg	99	74.270	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.774	ENSTNIG00000017106	papolg	100	69.774	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015002383	papolg	98	64.266	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	99	64.266	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015002383	papolg	100	64.812	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	65.459	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.793	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	70.483	Ursus_americanus
ENSSFOG00015002383	papolg	98	69.612	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	70.281	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015002383	papolg	98	67.339	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	68.011	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.517	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	69.302	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015002383	papolg	100	66.535	ENSXETG00000002208	papolg	100	66.535	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015002383	papolg	72	89.537	ENSXCOG00000006611	papolg	73	89.537	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015002383	papolg	76	87.149	ENSXMAG00000007383	papolg	95	87.149	Xiphophorus_maculatus