EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015002587 (Gene tree)
Gene ID: 108923506
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 30202 bases
Position: chrKV410825.1:2199045-2229246
Accession: 108923506
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015004023	Xpo1	PF08389.12	2.3e-22	1	1
ENSSFOP00015004055	Xpo1	PF08389.12	3.3e-22	1	1
ENSSFOP00015004023	IBN_N	PF03810.19	5.6e-10	1	1
ENSSFOP00015004055	IBN_N	PF03810.19	6e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015004086	-	5142	XM_018734280	ENSSFOP00015004023	959 (aa)	XP_018589796	A0A1W4YND6
ENSSFOT00015004119	-	2829	-	ENSSFOP00015004055	942 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	80.729	ENSSFOG00015014185	-	100	80.729

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.682	ENSG00000117408	IPO13	99	82.440	Homo_sapiens
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	70.124	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	70.124	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	90.739	ENSAPOG00000003308	ipo13	100	90.739	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.471	ENSAMEG00000001123	IPO13	99	82.229	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015002587	ipo13	96	87.378	ENSACIG00000008146	ipo13	100	87.378	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015002587	ipo13	98	70.495	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	70.495	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	90.739	ENSAOCG00000004943	ipo13	100	90.739	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	68.983	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	99	68.983	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	69.087	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	99	69.087	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	90.843	ENSAPEG00000011282	ipo13	100	90.843	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015002587	ipo13	97	68.220	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	68.220	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	90.739	ENSATEG00000018367	ipo13	100	90.739	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	81.742	ENSAPLG00000001349	IPO13	99	81.742	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	81.618	ENSACAG00000014300	IPO13	99	81.618	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.471	ENSANAG00000034183	IPO13	99	82.229	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015002587	ipo13	96	90.889	ENSACLG00000011458	ipo13	100	90.889	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	70.324	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	70.324	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	63.627	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	63.627	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	91.988	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	91.988	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.154	ENSBTAG00000018887	IPO13	99	81.914	Bos_taurus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.577	ENSCJAG00000007453	IPO13	99	82.334	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.471	ENSCAFG00000004875	IPO13	99	82.229	Canis_familiaris
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.471	ENSCAFG00020017359	IPO13	99	82.229	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.154	ENSCHIG00000008341	IPO13	99	81.914	Capra_hircus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.577	ENSTSYG00000035980	IPO13	99	82.334	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015002587	ipo13	87	81.489	ENSCAPG00000001972	IPO13	96	82.822	Cavia_aperea
ENSSFOG00015002587	ipo13	98	82.177	ENSCPOG00000012445	IPO13	98	81.934	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.577	ENSCCAG00000022035	IPO13	99	82.334	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.682	ENSCATG00000041276	IPO13	99	82.440	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.365	ENSCLAG00000002914	IPO13	99	82.124	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.682	ENSCSAG00000001190	IPO13	99	82.440	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015002587	ipo13	95	82.205	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	82.205	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	37.122	ENSCING00000001863	-	99	37.122	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015002587	ipo13	98	35.782	ENSCSAVG00000001368	-	99	35.879	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.682	ENSCANG00000009091	IPO13	99	82.440	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	81.521	ENSCGRG00001021177	Ipo13	99	81.283	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	81.521	ENSCGRG00000012411	Ipo13	99	81.283	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	61.929	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	99	61.929	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	87.721	ENSCSEG00000007713	ipo13	100	87.721	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	90.114	ENSCVAG00000013039	ipo13	100	90.114	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015002587	ipo13	96	66.202	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	99	66.202	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	66.526	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	66.526	Danio_rerio
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	90.536	ENSDARG00000060618	ipo13	99	90.536	Danio_rerio
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.682	ENSDNOG00000016583	IPO13	99	82.440	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.471	ENSDORG00000005471	Ipo13	99	82.229	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	69.634	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	68.973	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.577	ENSEASG00005001738	IPO13	99	82.334	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.577	ENSECAG00000015508	IPO13	99	82.334	Equus_caballus
ENSSFOG00015002587	ipo13	67	86.472	ENSEEUG00000011681	IPO13	81	86.472	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	90.114	ENSELUG00000001498	ipo13	100	90.219	Esox_lucius
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	66.632	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	99	66.632	Esox_lucius
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.577	ENSFCAG00000006488	IPO13	99	82.334	Felis_catus
ENSSFOG00015002587	ipo13	95	82.314	ENSFALG00000005368	IPO13	100	82.314	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.260	ENSFDAG00000015599	IPO13	99	82.019	Fukomys_damarensis
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ENSSFOG00015002587	ipo13	99	67.942	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	99	67.942	Fundulus_heteroclitus
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ENSSFOG00015002587	ipo13	100	89.397	ENSGMOG00000015856	ipo13	99	89.397	Gadus_morhua
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.613	ENSGALG00000010087	IPO13	99	82.613	Gallus_gallus
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	89.802	ENSGAFG00000006361	ipo13	100	89.802	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	67.708	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	99	67.708	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	88.773	ENSGACG00000014562	ipo13	99	88.773	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015002587	ipo13	98	69.853	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	98	69.853	Gasterosteus_aculeatus
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ENSSFOG00015002587	ipo13	99	69.175	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	98	69.175	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.049	ENSHGLG00000001822	IPO13	99	81.809	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.049	ENSHGLG00100015830	IPO13	99	81.809	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015002587	ipo13	97	63.859	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	63.859	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	86.694	ENSHCOG00000018408	ipo13	98	89.540	Hippocampus_comes
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ENSSFOG00015002587	ipo13	100	90.312	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	90.312	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.577	ENSSTOG00000003611	IPO13	99	82.334	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.682	ENSJJAG00000018591	Ipo13	99	82.440	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015002587	ipo13	98	69.497	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	98	69.497	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	89.822	ENSKMAG00000007869	ipo13	99	89.822	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015002587	ipo13	100	88.854	ENSLBEG00000007442	ipo13	99	88.854	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015002587	ipo13	98	68.421	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	99	68.421	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015002587	ipo13	98	78.155	ENSLACG00000016657	IPO13	98	78.155	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015002587	ipo13	82	30.263	ENSLACG00000002351	TNPO3	87	32.812	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015002587	ipo13	99	85.057	ENSLOCG00000010620	ipo13	99	85.057	Lepisosteus_oculatus
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ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.682	ENSMMUG00000015142	IPO13	99	82.440	Macaca_mulatta
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ENSSFOG00015002587	ipo13	99	82.682	ENSMLEG00000044330	IPO13	99	82.440	Mandrillus_leucophaeus
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ENSSFOG00015002587	ipo13	99	70.293	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	70.293	Mastacembelus_armatus
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