EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015006191 (Gene tree)
Gene ID: 108920416
Gene Symbol: mtrf1
Alias: zgc:113104
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8826 bases
Position: chrKV411293.1:2188218-2197043
Accession: 108920416
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015009517	RF-1	PF00472.20	2.5e-38	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015009647	-	6422	XM_018729156	ENSSFOP00015009517	441 (aa)	XP_018584672	A0A1W4XZ84

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015006191	mtrf1	84	43.817	ENSSFOG00015004475	mtrf1l	97	42.744

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	56.693	ENSG00000120662	MTRF1	85	56.693	Homo_sapiens
ENSSFOG00015006191	mtrf1	78	63.610	ENSAPOG00000010181	mtrf1	85	63.610	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	90	55.416	ENSAMEG00000008696	MTRF1	88	55.416	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015006191	mtrf1	53	69.658	ENSACIG00000001495	mtrf1	94	69.658	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	62.341	ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	62.341	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	62.087	ENSAPEG00000014844	mtrf1	88	62.087	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015006191	mtrf1	80	62.745	ENSATEG00000017403	mtrf1	85	62.745	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	85	56.233	ENSAPLG00000009317	MTRF1	87	56.233	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	57.216	ENSACAG00000000897	MTRF1	87	57.216	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015006191	mtrf1	79	55.908	ENSANAG00000025310	-	97	55.429	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	51.948	ENSANAG00000023063	-	85	51.948	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015006191	mtrf1	98	57.370	ENSACLG00000023945	mtrf1	97	57.370	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015006191	mtrf1	52	70.996	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	70.996	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	56.250	ENSBTAG00000012260	MTRF1	84	58.028	Bos_taurus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	98	51.481	ENSCJAG00000017739	MTRF1	97	64.497	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	56.443	ENSCAFG00000004795	MTRF1	87	56.443	Canis_familiaris
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	56.443	ENSCAFG00020018178	MTRF1	87	56.443	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	56.072	ENSCHIG00000011810	MTRF1	86	56.072	Capra_hircus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	95	53.791	ENSTSYG00000006976	MTRF1	93	53.791	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	56.510	ENSCAPG00000013163	MTRF1	88	56.510	Cavia_aperea
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	56.250	ENSCPOG00000005264	MTRF1	86	56.250	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	57.292	ENSCCAG00000035116	MTRF1	86	57.292	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	57.218	ENSCATG00000009909	MTRF1	85	57.218	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015006191	mtrf1	89	55.867	ENSCLAG00000000582	MTRF1	87	55.867	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	56.955	ENSCSAG00000017835	MTRF1	85	56.955	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	83	54.098	ENSCHOG00000011915	-	88	54.098	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	55.614	ENSCPBG00000007969	MTRF1	85	55.614	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	56.168	ENSCANG00000040353	MTRF1	85	56.168	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	57.106	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	87	57.106	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	57.106	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	87	57.106	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015006191	mtrf1	97	57.044	ENSCSEG00000005667	mtrf1	95	57.044	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015006191	mtrf1	99	57.111	ENSCVAG00000021729	mtrf1	98	57.111	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	52	58.442	ENSDARG00000033579	mtrf1	98	58.442	Danio_rerio
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	54.922	ENSDNOG00000034196	MTRF1	98	60.984	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	57.552	ENSDORG00000016429	Mtrf1	86	57.552	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015006191	mtrf1	90	54.912	ENSETEG00000014811	MTRF1	88	54.912	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015006191	mtrf1	51	54.626	ENSEBUG00000000778	mtrf1	93	54.626	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	57.031	ENSEASG00005015715	MTRF1	86	57.031	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	56.771	ENSECAG00000014389	MTRF1	83	56.771	Equus_caballus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	44.301	ENSEEUG00000004450	-	86	44.819	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	65.000	ENSELUG00000006544	mtrf1	87	65.000	Esox_lucius
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	56.510	ENSFCAG00000031635	MTRF1	86	56.510	Felis_catus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	55.556	ENSFALG00000008036	MTRF1	95	55.556	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	57.403	ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	57.403	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	59.690	ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	59.690	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	85	59.367	ENSGMOG00000008608	mtrf1	98	59.367	Gadus_morhua
ENSSFOG00015006191	mtrf1	85	55.968	ENSGALG00000016951	MTRF1	82	55.968	Gallus_gallus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	98	56.164	ENSGAFG00000007093	mtrf1	97	56.164	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015006191	mtrf1	85	63.325	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	63.325	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	70	58.387	ENSGAGG00000025696	MTRF1	98	58.387	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	56.955	ENSGGOG00000002529	MTRF1	85	56.955	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	54.688	ENSHGLG00000003210	MTRF1	86	54.688	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	54.688	ENSHGLG00100011843	MTRF1	86	54.688	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	61.198	ENSHCOG00000009449	mtrf1	87	61.198	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	56.771	ENSSTOG00000021682	MTRF1	86	56.771	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	57.632	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	85	57.632	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	98	59.268	ENSKMAG00000003231	mtrf1	96	59.268	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	52	72.294	ENSLBEG00000027169	-	93	72.294	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015006191	mtrf1	52	72.294	ENSLBEG00000023151	mtrf1	93	72.294	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	61.942	ENSLACG00000010582	MTRF1	85	61.942	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	62.857	ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	62.857	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	44.675	ENSLAFG00000030499	-	84	44.675	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	56.771	ENSLAFG00000022177	-	86	56.771	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	57.218	ENSMFAG00000037972	MTRF1	85	57.218	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	57.218	ENSMNEG00000035487	MTRF1	85	57.218	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	57.218	ENSMLEG00000033582	MTRF1	85	57.218	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	99	57.666	ENSMAMG00000022048	mtrf1	97	57.666	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	98	57.370	ENSMZEG00005017922	mtrf1	97	57.370	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	55.440	ENSMGAG00000014971	MTRF1	92	55.440	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	56.848	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	86	56.848	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	56.771	ENSMICG00000033131	MTRF1	86	56.771	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	57.106	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	86	57.106	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015006191	mtrf1	52	62.882	ENSMMOG00000013394	mtrf1	94	62.882	Mola_mola
ENSSFOG00015006191	mtrf1	89	53.807	ENSMODG00000014772	MTRF1	87	53.807	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015006191	mtrf1	98	58.661	ENSMALG00000013274	mtrf1	98	58.661	Monopterus_albus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	90	55.779	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	87	55.779	Mus_caroli
ENSSFOG00015006191	mtrf1	90	56.784	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	87	56.784	Mus_musculus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	90	56.030	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	88	56.030	Mus_pahari
ENSSFOG00015006191	mtrf1	90	56.030	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	87	56.030	Mus_spretus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	57.218	ENSMPUG00000001874	MTRF1	85	57.218	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	55.729	ENSMLUG00000017237	MTRF1	86	55.729	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	55.990	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	86	55.990	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015006191	mtrf1	54	70.042	ENSNBRG00000004634	mtrf1	100	70.042	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	56.693	ENSNLEG00000001236	MTRF1	85	56.693	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015006191	mtrf1	89	53.046	ENSMEUG00000001846	MTRF1	87	53.046	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015006191	mtrf1	63	30.797	ENSOPRG00000006450	-	83	30.797	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	56.771	ENSODEG00000005782	MTRF1	86	56.771	Octodon_degus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	62.821	ENSONIG00000012476	mtrf1	100	62.821	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	69	53.571	ENSOANG00000003383	-	98	53.571	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	55.729	ENSOCUG00000025207	MTRF1	86	55.729	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	62.916	ENSORLG00000003225	mtrf1	88	62.916	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	62.016	ENSORLG00020021048	mtrf1	87	62.016	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015006191	mtrf1	98	58.295	ENSORLG00015020957	mtrf1	96	58.295	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	63.566	ENSOMEG00000002022	mtrf1	88	63.566	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015006191	mtrf1	74	48.923	ENSOGAG00000026411	-	99	48.923	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015006191	mtrf1	80	57.746	ENSOGAG00000009719	-	79	57.746	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	55.814	ENSOARG00000006994	MTRF1	86	55.814	Ovis_aries
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	56.693	ENSPPAG00000000050	MTRF1	85	56.693	Pan_paniscus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	57.292	ENSPPRG00000009511	MTRF1	86	57.292	Panthera_pardus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	56.919	ENSPTIG00000006673	MTRF1	85	56.919	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	56.693	ENSPTRG00000005815	MTRF1	85	56.693	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015006191	mtrf1	86	57.218	ENSPANG00000010809	MTRF1	85	57.218	Papio_anubis
ENSSFOG00015006191	mtrf1	98	65.747	ENSPKIG00000015711	mtrf1	99	65.747	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	53.525	ENSPSIG00000004773	MTRF1	85	53.525	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015006191	mtrf1	53	72.222	ENSPMGG00000006724	mtrf1	95	72.222	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	90	55.890	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	87	55.890	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015006191	mtrf1	77	51.445	ENSPMAG00000009849	mtrf1	99	51.734	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	93	52.415	ENSPCIG00000012940	MTRF1	92	52.415	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015006191	mtrf1	97	55.684	ENSPFOG00000000254	mtrf1	97	55.684	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015006191	mtrf1	97	55.916	ENSPLAG00000014280	mtrf1	97	55.916	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015006191	mtrf1	97	56.148	ENSPMEG00000023245	mtrf1	97	56.148	Poecilia_mexicana
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ENSSFOG00015006191	mtrf1	52	64.935	ENSXCOG00000020386	mtrf1	95	64.935	Xiphophorus_couchianus
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