EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015007284 (Gene tree)
Gene ID: 108938909
Gene Symbol: trit1
Alias: si:ch211-194e15.1
Full Name: tRNA isopentenyltransferase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33652 bases
Position: chrKV411182.1:590130-623781
Accession: 108938909
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015011305	zf-met	PF12874.7	0.00045	1	1
ENSSFOP00015011281	zf-met	PF12874.7	0.00048	1	1
ENSSFOP00015011281	IPPT	PF01715.17	6.2e-67	1	1
ENSSFOP00015011305	IPPT	PF01715.17	7.2e-59	1	1
ENSSFOP00015011305	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	3.4e-07	1	1
ENSSFOP00015011281	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	3.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015011430	-	2283	XM_018759902	ENSSFOP00015011281	504 (aa)	XP_018615418	-
ENSSFOT00015011454	-	2205	XM_018759903	ENSSFOP00015011305	478 (aa)	XP_018615419	-

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015007284's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm01100	Metabolic pathways	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015007284's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.728	ENSG00000043514	TRIT1	99	58.929	Homo_sapiens
ENSSFOG00015007284	trit1	83	70.163	ENSAPOG00000020918	trit1	93	70.163	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015007284	trit1	81	61.220	ENSAMEG00000004342	TRIT1	92	60.140	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015007284	trit1	79	70.175	ENSACIG00000017409	trit1	96	66.740	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015007284	trit1	92	65.336	ENSAOCG00000009850	trit1	95	65.336	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015007284	trit1	92	65.336	ENSAPEG00000001481	trit1	95	65.336	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015007284	trit1	92	63.655	ENSATEG00000005426	trit1	96	63.655	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015007284	trit1	70	50.139	ENSAPLG00000011421	TRIT1	99	50.139	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015007284	trit1	89	55.850	ENSACAG00000002280	TRIT1	85	59.427	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.235	ENSANAG00000030732	TRIT1	90	58.790	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015007284	trit1	87	66.370	ENSACLG00000004920	trit1	94	66.370	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015007284	trit1	91	65.890	ENSAMXG00000010959	trit1	96	69.266	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015007284	trit1	90	58.643	ENSBTAG00000013832	TRIT1	99	57.537	Bos_taurus
ENSSFOG00015007284	trit1	77	33.911	WBGene00001740	gro-1	96	34.279	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.728	ENSCJAG00000002620	TRIT1	90	62.112	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.084	ENSCAFG00000003048	TRIT1	87	61.084	Canis_familiaris
ENSSFOG00015007284	trit1	80	59.189	ENSCAFG00020003875	TRIT1	90	61.585	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.520	ENSCHIG00000013259	TRIT1	92	59.491	Capra_hircus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	62.129	ENSTSYG00000004363	TRIT1	87	62.129	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015007284	trit1	63	56.646	ENSCAPG00000017001	TRIT1	82	56.646	Cavia_aperea
ENSSFOG00015007284	trit1	80	59.653	ENSCPOG00000012820	TRIT1	87	59.653	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	60.988	ENSCCAG00000031271	TRIT1	89	62.420	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015007284	trit1	79	59.424	ENSCATG00000034344	TRIT1	90	62.461	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015007284	trit1	80	60.891	ENSCLAG00000009828	TRIT1	87	60.891	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015007284	trit1	73	59.946	ENSCSAG00000001137	TRIT1	91	59.946	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.634	ENSCHOG00000000435	TRIT1	92	59.629	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015007284	trit1	80	44.578	ENSCSAVG00000002050	-	91	44.578	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.975	ENSCANG00000043008	TRIT1	90	63.091	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	60.988	ENSCGRG00001001894	Trit1	87	60.988	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015007284	trit1	74	59.626	ENSCGRG00000007059	Trit1	83	59.189	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015007284	trit1	80	66.106	ENSCSEG00000009574	trit1	98	63.090	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015007284	trit1	84	68.298	ENSDARG00000032876	trit1	99	69.419	Danio_rerio
ENSSFOG00015007284	trit1	79	61.017	ENSDNOG00000001994	TRIT1	93	51.927	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	55.062	ENSDORG00000012449	Trit1	94	53.380	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015007284	trit1	80	39.450	FBgn0043799	CG31381	98	38.235	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015007284	trit1	78	61.596	ENSETEG00000008733	TRIT1	94	61.596	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015007284	trit1	81	54.106	ENSEBUG00000012845	trit1	92	54.106	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015007284	trit1	80	60.533	ENSECAG00000010597	TRIT1	80	60.533	Equus_caballus
ENSSFOG00015007284	trit1	65	56.845	ENSEEUG00000009269	TRIT1	71	56.845	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015007284	trit1	83	62.353	ENSELUG00000017278	trit1	88	62.353	Esox_lucius
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.481	ENSFCAG00000006029	TRIT1	87	61.481	Felis_catus
ENSSFOG00015007284	trit1	74	59.893	ENSFALG00000000532	TRIT1	94	59.893	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015007284	trit1	80	58.654	ENSFDAG00000003098	TRIT1	92	58.654	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015007284	trit1	65	61.329	ENSFHEG00000022274	trit1	99	61.329	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015007284	trit1	83	68.618	ENSGMOG00000006522	trit1	99	68.618	Gadus_morhua
ENSSFOG00015007284	trit1	89	56.608	ENSGALG00000003851	TRIT1	98	56.608	Gallus_gallus
ENSSFOG00015007284	trit1	66	67.353	ENSGAFG00000018636	trit1	96	68.391	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015007284	trit1	83	66.047	ENSGACG00000008493	trit1	99	66.047	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015007284	trit1	79	58.025	ENSGAGG00000000522	TRIT1	99	58.025	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.728	ENSGGOG00000010070	TRIT1	90	62.658	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015007284	trit1	87	66.147	ENSHBUG00000018999	trit1	94	66.147	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015007284	trit1	82	58.531	ENSHGLG00000010308	-	97	56.473	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015007284	trit1	80	55.087	ENSHGLG00000009564	-	87	55.087	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015007284	trit1	72	44.687	ENSHGLG00100018159	-	94	44.687	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015007284	trit1	82	58.531	ENSHGLG00100015382	-	92	58.531	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015007284	trit1	79	68.215	ENSHCOG00000006755	trit1	84	67.582	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015007284	trit1	88	67.245	ENSIPUG00000021822	trit1	96	67.245	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015007284	trit1	81	59.756	ENSSTOG00000006446	TRIT1	93	56.291	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015007284	trit1	81	55.097	ENSJJAG00000000300	-	93	53.303	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015007284	trit1	81	55.854	ENSJJAG00000000316	-	91	55.854	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015007284	trit1	91	63.539	ENSKMAG00000021788	trit1	89	67.840	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015007284	trit1	89	67.105	ENSLBEG00000024262	trit1	94	67.105	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015007284	trit1	89	60.738	ENSLACG00000013861	TRIT1	94	60.738	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015007284	trit1	84	66.820	ENSLOCG00000002057	trit1	91	66.820	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	60.988	ENSLAFG00000016876	TRIT1	87	60.988	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.481	ENSMFAG00000001316	TRIT1	90	62.461	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.481	ENSMMUG00000016220	TRIT1	90	62.461	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.481	ENSMNEG00000023137	TRIT1	90	62.461	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.235	ENSMLEG00000035296	TRIT1	90	62.461	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	69.830	ENSMAMG00000005868	trit1	98	63.843	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015007284	trit1	87	66.147	ENSMZEG00005011506	trit1	94	66.147	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015007284	trit1	73	57.754	ENSMGAG00000005516	TRIT1	99	57.754	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015007284	trit1	80	60.988	ENSMAUG00000000399	Trit1	87	60.988	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015007284	trit1	81	61.071	ENSMICG00000016294	TRIT1	88	61.071	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.728	ENSMOCG00000008173	Trit1	87	61.728	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015007284	trit1	76	65.296	ENSMMOG00000021140	trit1	90	65.296	Mola_mola
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.463	ENSMODG00000017650	TRIT1	95	59.447	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015007284	trit1	91	61.966	ENSMALG00000017843	trit1	97	61.966	Monopterus_albus
ENSSFOG00015007284	trit1	81	61.463	MGP_CAROLIEiJ_G0026428	Trit1	88	61.463	Mus_caroli
ENSSFOG00015007284	trit1	81	61.707	ENSMUSG00000028653	Trit1	88	61.707	Mus_musculus
ENSSFOG00015007284	trit1	81	62.010	MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	87	62.010	Mus_pahari
ENSSFOG00015007284	trit1	81	61.463	MGP_SPRETEiJ_G0027408	Trit1	88	61.463	Mus_spretus
ENSSFOG00015007284	trit1	81	61.707	ENSMPUG00000014291	TRIT1	93	59.677	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015007284	trit1	80	59.753	ENSMLUG00000000334	TRIT1	92	57.809	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.728	ENSNLEG00000012038	TRIT1	90	62.776	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015007284	trit1	80	56.296	ENSMEUG00000005217	TRIT1	87	56.296	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015007284	trit1	57	53.179	ENSOPRG00000003205	-	65	52.991	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015007284	trit1	80	59.559	ENSODEG00000006117	TRIT1	87	59.559	Octodon_degus
ENSSFOG00015007284	trit1	89	64.642	ENSONIG00000015407	trit1	92	66.968	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015007284	trit1	73	60.647	ENSOANG00000002779	TRIT1	94	60.647	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015007284	trit1	81	62.683	ENSOCUG00000002054	TRIT1	88	62.683	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015007284	trit1	90	63.755	ENSORLG00000005802	trit1	99	63.755	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015007284	trit1	90	64.706	ENSORLG00020005519	trit1	99	64.706	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015007284	trit1	90	64.488	ENSORLG00015018715	trit1	99	64.488	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015007284	trit1	84	67.371	ENSOMEG00000006569	trit1	92	67.371	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.084	ENSOGAG00000009571	TRIT1	87	61.084	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015007284	trit1	88	58.705	ENSOARG00000020140	TRIT1	92	60.465	Ovis_aries
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.728	ENSPPAG00000023930	TRIT1	90	62.776	Pan_paniscus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.235	ENSPPRG00000009680	TRIT1	91	58.974	Panthera_pardus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.235	ENSPTIG00000021134	TRIT1	91	58.974	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.728	ENSPTRG00000000579	TRIT1	90	62.776	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.235	ENSPANG00000018125	TRIT1	90	62.145	Papio_anubis
ENSSFOG00015007284	trit1	75	74.406	ENSPKIG00000024527	trit1	98	74.211	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015007284	trit1	71	43.454	ENSPSIG00000017073	TRIT1	99	43.454	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015007284	trit1	71	68.611	ENSPMGG00000018445	trit1	92	68.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.235	ENSPEMG00000022418	Trit1	87	61.235	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015007284	trit1	73	57.592	ENSPMAG00000008892	trit1	96	57.592	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	62.379	ENSPCIG00000020666	TRIT1	98	61.919	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015007284	trit1	90	65.443	ENSPFOG00000014626	trit1	96	65.443	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015007284	trit1	66	67.761	ENSPLAG00000011669	trit1	97	68.580	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015007284	trit1	56	68.401	ENSPMEG00000023788	trit1	98	68.401	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015007284	trit1	65	70.091	ENSPREG00000018182	trit1	94	70.091	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015007284	trit1	80	62.222	ENSPPYG00000001499	TRIT1	87	62.222	Pongo_abelii
ENSSFOG00015007284	trit1	64	51.393	ENSPCAG00000014680	TRIT1	89	51.393	Procavia_capensis
ENSSFOG00015007284	trit1	80	62.222	ENSPCOG00000014150	TRIT1	86	62.222	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015007284	trit1	80	54.815	ENSPVAG00000003344	TRIT1	91	53.147	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015007284	trit1	63	67.961	ENSPNYG00000001003	trit1	100	67.961	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015007284	trit1	84	70.824	ENSPNAG00000009466	trit1	94	69.919	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015007284	trit1	81	60.142	ENSRNOG00000014274	Trit1	92	59.184	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.728	ENSRBIG00000043179	TRIT1	90	62.776	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.728	ENSRROG00000042670	TRIT1	90	62.776	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015007284	trit1	79	33.012	YOR274W	-	92	33.012	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSFOG00015007284	trit1	80	60.988	ENSSBOG00000024417	TRIT1	90	62.857	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015007284	trit1	75	58.854	ENSSHAG00000018363	TRIT1	91	58.854	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015007284	trit1	87	64.080	ENSSMAG00000020730	trit1	98	62.876	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015007284	trit1	87	67.188	ENSSDUG00000001683	trit1	92	67.188	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015007284	trit1	80	68.281	ENSSLDG00000008379	trit1	92	66.292	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.017	ENSSARG00000004540	TRIT1	92	59.217	Sorex_araneus
ENSSFOG00015007284	trit1	79	56.892	ENSSPUG00000003472	TRIT1	82	56.892	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015007284	trit1	79	69.927	ENSSPAG00000020745	trit1	91	69.927	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015007284	trit1	74	57.181	ENSTGUG00000001242	TRIT1	100	57.181	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015007284	trit1	88	66.000	ENSTRUG00000013936	trit1	95	66.900	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015007284	trit1	86	67.347	ENSTNIG00000009240	trit1	94	68.545	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015007284	trit1	64	74.699	ENSTBEG00000001317	TRIT1	68	74.699	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015007284	trit1	80	61.975	ENSTTRG00000005064	TRIT1	91	59.907	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015007284	trit1	51	61.694	ENSUAMG00000000522	-	98	60.150	Ursus_americanus
ENSSFOG00015007284	trit1	81	61.707	ENSUMAG00000017299	TRIT1	84	59.318	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015007284	trit1	80	57.037	ENSVPAG00000003008	TRIT1	86	57.037	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015007284	trit1	82	56.398	ENSXETG00000010952	trit1	92	56.398	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015007284	trit1	65	68.373	ENSXMAG00000016302	trit1	91	68.373	Xiphophorus_maculatus