EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015008281 (Gene tree)
Gene ID: 108933919
Gene Symbol: pusl1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8503 bases
Position: chrKV411047.1:427233-435735
Accession: 108933919
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015012850	PseudoU_synth_1	PF01416.20	3e-33	1	2
ENSSFOP00015012850	PseudoU_synth_1	PF01416.20	3e-33	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015013012	-	909	XM_018751337	ENSSFOP00015012850	302 (aa)	XP_018606853	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	48.780	ENSG00000169972	PUSL1	97	46.341	Homo_sapiens
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	62.230	ENSAPOG00000016290	pusl1	93	62.230	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	47.887	ENSAMEG00000013752	PUSL1	92	47.887	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	60.727	ENSACIG00000015240	pusl1	100	60.727	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	60.932	ENSAOCG00000019419	pusl1	83	60.932	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015008281	pusl1	96	58.703	ENSAPEG00000005452	pusl1	92	61.151	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	63.082	ENSATEG00000024154	pusl1	93	63.082	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	53.546	ENSAPLG00000004946	PUSL1	94	53.546	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015008281	pusl1	85	55.642	ENSACAG00000014111	PUSL1	97	55.642	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	49.306	ENSANAG00000037456	PUSL1	94	49.306	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015008281	pusl1	96	62.457	ENSACLG00000008675	pusl1	97	62.457	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	66.547	ENSAMXG00000044007	pusl1	95	65.649	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	52.518	ENSBTAG00000007619	PUSL1	95	52.518	Bos_taurus
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	48.611	ENSCJAG00000010972	PUSL1	94	48.611	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	45.862	ENSCAFG00000019291	PUSL1	93	45.862	Canis_familiaris
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	47.241	ENSCAFG00020011568	PUSL1	92	47.241	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	51.773	ENSCHIG00000012615	PUSL1	98	51.773	Capra_hircus
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	50.177	ENSCPOG00000005149	PUSL1	90	50.177	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	48.611	ENSCCAG00000027475	PUSL1	94	48.611	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	49.129	ENSCATG00000018260	PUSL1	94	49.129	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	49.821	ENSCLAG00000005232	PUSL1	90	49.821	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	49.306	ENSCSAG00000000680	PUSL1	94	49.306	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	54.965	ENSCPBG00000022621	PUSL1	97	54.965	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	48.780	ENSCANG00000034373	PUSL1	94	48.780	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015008281	pusl1	94	46.316	ENSCGRG00001012429	Pusl1	97	46.316	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015008281	pusl1	94	46.316	ENSCGRG00000006466	Pusl1	97	46.316	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	64.516	ENSCSEG00000005159	pusl1	93	64.516	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015008281	pusl1	81	55.918	ENSCVAG00000012923	pusl1	93	55.918	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015008281	pusl1	94	66.901	ENSDARG00000074565	pusl1	99	66.901	Danio_rerio
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	32.673	FBgn0083976	CG34140	99	32.673	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	50.355	ENSECAG00000006248	PUSL1	92	50.355	Equus_caballus
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	46.996	ENSEEUG00000000837	PUSL1	95	46.996	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	64.643	ENSELUG00000015945	pusl1	95	64.643	Esox_lucius
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	50.000	ENSFCAG00000007617	PUSL1	92	50.000	Felis_catus
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	65.108	ENSFHEG00000006370	pusl1	92	65.108	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	64.029	ENSGMOG00000019388	pusl1	98	64.029	Gadus_morhua
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	54.965	ENSGALG00000001714	PUSL1	97	54.965	Gallus_gallus
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	63.441	ENSGAFG00000007546	pusl1	94	63.441	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	60.432	ENSGACG00000007848	pusl1	91	60.432	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	55.319	ENSGAGG00000004730	PUSL1	97	55.319	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015008281	pusl1	82	48.400	ENSGGOG00000005364	PUSL1	96	48.400	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015008281	pusl1	96	61.856	ENSHBUG00000001264	pusl1	96	61.856	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015008281	pusl1	97	45.608	ENSHGLG00000017570	PUSL1	96	45.608	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	46.127	ENSHGLG00100007641	PUSL1	93	46.127	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	61.871	ENSHCOG00000010077	pusl1	100	61.594	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	68.705	ENSIPUG00000023921	pusl1	95	68.705	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	49.643	ENSSTOG00000001783	PUSL1	87	49.643	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015008281	pusl1	96	49.655	ENSJJAG00000020471	Pusl1	94	51.071	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015008281	pusl1	89	58.608	ENSKMAG00000005154	pusl1	92	58.608	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015008281	pusl1	90	63.736	ENSLBEG00000013469	pusl1	93	63.736	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015008281	pusl1	64	61.658	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	61.658	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	62.857	ENSLOCG00000002210	pusl1	96	62.766	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015008281	pusl1	87	49.242	ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	49.242	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	48.780	ENSMFAG00000046288	PUSL1	94	48.780	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	44.251	ENSMMUG00000016279	PUSL1	93	44.251	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015008281	pusl1	94	49.650	ENSMNEG00000037989	PUSL1	94	49.650	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	63.669	ENSMAMG00000016538	pusl1	91	63.669	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015008281	pusl1	96	62.457	ENSMZEG00005026990	pusl1	97	62.457	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015008281	pusl1	94	55.124	ENSMGAG00000003037	PUSL1	96	55.124	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	47.163	ENSMAUG00000019924	Pusl1	96	47.163	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	47.687	ENSMICG00000014171	PUSL1	95	47.687	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015008281	pusl1	94	48.772	ENSMOCG00000005602	Pusl1	97	48.772	Microtus_ochrogaster
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ENSSFOG00015008281	pusl1	94	49.123	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	97	49.123	Mus_caroli
ENSSFOG00015008281	pusl1	94	48.421	ENSMUSG00000051557	Pusl1	97	48.421	Mus_musculus
ENSSFOG00015008281	pusl1	94	49.474	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	97	49.474	Mus_pahari
ENSSFOG00015008281	pusl1	94	49.123	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	97	49.123	Mus_spretus
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	49.485	ENSMPUG00000014313	PUSL1	94	49.485	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	50.530	ENSNGAG00000004647	Pusl1	84	50.530	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015008281	pusl1	81	62.249	ENSNBRG00000014762	pusl1	90	62.249	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015008281	pusl1	85	49.805	ENSNLEG00000000051	PUSL1	93	49.805	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015008281	pusl1	90	43.382	ENSMEUG00000005176	-	98	43.382	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	53.901	ENSMEUG00000011649	-	98	53.901	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015008281	pusl1	98	46.667	ENSODEG00000008247	PUSL1	95	46.667	Octodon_degus
ENSSFOG00015008281	pusl1	96	62.116	ENSONIG00000019361	pusl1	96	62.116	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	61.458	ENSORLG00000016228	pusl1	97	61.458	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	60.764	ENSORLG00020013710	pusl1	97	60.764	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	63.669	ENSORLG00015008715	pusl1	98	63.669	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	62.816	ENSOMEG00000018897	pusl1	95	62.816	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	49.643	ENSOGAG00000031692	PUSL1	96	49.643	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015008281	pusl1	88	50.187	ENSOARG00000004905	PUSL1	99	50.187	Ovis_aries
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	48.780	ENSPPAG00000029283	PUSL1	94	48.780	Pan_paniscus
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	50.000	ENSPPRG00000023329	PUSL1	92	50.000	Panthera_pardus
ENSSFOG00015008281	pusl1	87	48.872	ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	48.872	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	48.432	ENSPTRG00000000021	PUSL1	94	48.432	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015008281	pusl1	95	48.780	ENSPANG00000000591	PUSL1	94	48.780	Papio_anubis
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	73.022	ENSPKIG00000002447	pusl1	96	73.022	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015008281	pusl1	86	58.077	ENSPSIG00000002781	PUSL1	96	58.077	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015008281	pusl1	96	53.952	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	57.914	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015008281	pusl1	94	49.123	ENSPEMG00000013541	Pusl1	97	49.123	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	52.857	ENSPCIG00000007816	-	64	52.857	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	63.669	ENSPFOG00000015448	pusl1	92	63.636	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	63.669	ENSPLAG00000004348	pusl1	93	63.669	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	63.669	ENSPMEG00000000931	pusl1	93	63.669	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	64.029	ENSPREG00000002324	pusl1	93	64.029	Poecilia_reticulata
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ENSSFOG00015008281	pusl1	62	48.404	ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	48.404	Procavia_capensis
ENSSFOG00015008281	pusl1	69	52.703	ENSPVAG00000001016	PUSL1	69	52.703	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015008281	pusl1	78	63.598	ENSPNYG00000006588	pusl1	99	63.598	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015008281	pusl1	93	70.318	ENSPNAG00000024441	pusl1	97	70.318	Pygocentrus_nattereri
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ENSSFOG00015008281	pusl1	95	48.432	ENSRROG00000030704	PUSL1	94	48.432	Rhinopithecus_roxellana
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ENSSFOG00015008281	pusl1	58	48.864	ENSSARG00000005323	-	92	48.864	Sorex_araneus
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ENSSFOG00015008281	pusl1	94	49.650	ENSSSCG00000003338	PUSL1	93	49.650	Sus_scrofa
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ENSSFOG00015008281	pusl1	91	64.388	ENSTRUG00000010102	pusl1	93	64.388	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015008281	pusl1	60	62.088	ENSTNIG00000005789	pusl1	81	62.088	Tetraodon_nigroviridis
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ENSSFOG00015008281	pusl1	98	47.841	ENSVVUG00000004320	PUSL1	94	41.515	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015008281	pusl1	76	57.205	ENSXETG00000011145	pusl1	100	57.205	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015008281	pusl1	92	60.432	ENSXCOG00000017748	pusl1	97	60.432	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015008281	pusl1	91	64.029	ENSXMAG00000018846	pusl1	93	64.029	Xiphophorus_maculatus