EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015008769 (Gene tree)
Gene ID: 108919958
Gene Symbol: zc3h12b
Alias: si:dkey-286f3.6
Full Name: probable ribonuclease ZC3H12B
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13334 bases
Position: chrKV411281.1:436900-450233
Accession: 108919958
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015013601	RNase_Zc3h12a	PF11977.8	8.7e-66	1	1
ENSSFOP00015013586	RNase_Zc3h12a	PF11977.8	9.9e-66	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015013770	-	3306	XM_018728388	ENSSFOP00015013601	836 (aa)	XP_018583904	A0A1W4XWH5
ENSSFOT00015013754	-	2778	-	ENSSFOP00015013586	925 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015008769's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015008769's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	79.810	ENSSFOG00015012866	ZC3H12B	99	79.318

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.494	ENSG00000102053	ZC3H12B	99	69.022	Homo_sapiens
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	78.749	ENSAPOG00000001738	zc3h12b	99	78.867	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	75	74.525	ENSAMEG00000006955	ZC3H12B	99	74.525	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	87	44.144	ENSACIG00000005689	-	73	69.198	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.500	ENSACIG00000009787	zc3h12b	99	77.619	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	78.512	ENSAOCG00000010094	zc3h12b	99	78.512	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	78.276	ENSAPEG00000007479	zc3h12b	99	78.512	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	78.173	ENSATEG00000011175	zc3h12b	99	78.292	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	71.783	ENSACAG00000013582	ZC3H12B	99	71.971	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.847	ENSANAG00000010296	ZC3H12B	99	69.376	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.751	ENSACLG00000007669	zc3h12b	99	77.870	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	52	58.730	ENSAMXG00000005320	-	91	47.152	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	95	43.196	ENSAMXG00000038308	-	86	45.032	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	93	73.850	ENSAMXG00000011328	zc3h12b	93	68.349	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.258	ENSBTAG00000002206	ZC3H12B	91	73.393	Bos_taurus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.729	ENSCJAG00000001427	ZC3H12B	99	69.376	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.316	ENSCAFG00000031307	ZC3H12B	99	67.609	Canis_familiaris
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.316	ENSCAFG00020017995	ZC3H12B	99	67.609	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	70	74.061	ENSCHIG00000011723	ZC3H12B	97	74.061	Capra_hircus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.847	ENSTSYG00000011302	ZC3H12B	91	74.036	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	73	69.544	ENSCAPG00000000650	ZC3H12B	100	69.544	Cavia_aperea
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.847	ENSCCAG00000030171	ZC3H12B	99	69.376	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.847	ENSCATG00000044845	ZC3H12B	99	69.376	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.658	ENSCLAG00000003600	ZC3H12B	91	73.522	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	75.030	ENSCPBG00000006983	ZC3H12B	99	76.338	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.729	ENSCANG00000006746	ZC3H12B	99	69.258	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.477	ENSCGRG00001018643	Zc3h12b	99	67.769	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.477	ENSCGRG00000015623	Zc3h12b	99	67.769	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	94	80.485	ENSCSEG00000013686	zc3h12b	94	80.485	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.817	ENSCVAG00000010473	zc3h12b	99	77.203	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	94	74.574	ENSDARG00000062463	zc3h12b	97	74.574	Danio_rerio
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	66.470	ENSDNOG00000038439	ZC3H12B	90	70.490	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	70.554	ENSDORG00000024832	Zc3h12b	92	73.764	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	81	66.815	ENSETEG00000012095	ZC3H12B	87	66.815	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	65.882	ENSEASG00005006995	ZC3H12B	91	69.666	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.882	ENSECAG00000020993	ZC3H12B	91	74.036	Equus_caballus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.856	ENSELUG00000010689	zc3h12b	93	75.805	Esox_lucius
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.787	ENSFCAG00000032299	ZC3H12B	91	72.622	Felis_catus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.949	ENSFDAG00000014258	ZC3H12B	91	73.196	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	56	76.014	ENSFHEG00000014717	-	82	69.436	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.960	ENSFHEG00000002391	zc3h12b	99	76.761	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	74.793	ENSGALG00000039391	ZC3H12B	99	75.000	Gallus_gallus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.130	ENSGAFG00000006871	zc3h12b	99	75.701	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	57	73.290	ENSGAFG00000004701	-	57	73.290	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	86	79.741	ENSGACG00000020334	zc3h12b	93	80.172	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	75.476	ENSGAGG00000005569	ZC3H12B	99	75.476	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.611	ENSGGOG00000024638	ZC3H12B	99	69.140	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.633	ENSHBUG00000000645	zc3h12b	99	77.751	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.949	ENSHGLG00000003107	ZC3H12B	91	72.938	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.949	ENSHGLG00100010721	ZC3H12B	91	72.938	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	98	77.284	ENSHCOG00000008487	zc3h12b	94	79.670	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	93	73.659	ENSIPUG00000016745	zc3h12b	83	74.119	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	53	60.440	ENSIPUG00000014830	-	88	47.782	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	70.401	ENSSTOG00000020962	ZC3H12B	91	74.107	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	67.414	ENSJJAG00000015755	Zc3h12b	91	71.778	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	76.422	ENSKMAG00000004921	zc3h12b	99	76.422	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	76.842	ENSLBEG00000006448	zc3h12b	99	77.568	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	76.667	ENSLACG00000014526	ZC3H12B	99	76.667	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	98	52.230	ENSLOCG00000010717	-	96	50.438	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	82.692	ENSLOCG00000014631	zc3h12b	94	79.889	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.000	ENSLAFG00000014891	ZC3H12B	92	71.447	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.611	ENSMFAG00000042237	ZC3H12B	99	69.140	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.729	ENSMMUG00000012261	ZC3H12B	99	69.258	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.729	ENSMNEG00000043003	ZC3H12B	99	69.258	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.847	ENSMLEG00000042630	ZC3H12B	99	69.376	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	78.292	ENSMAMG00000011770	zc3h12b	99	78.292	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.751	ENSMZEG00005007548	zc3h12b	99	77.870	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	75.266	ENSMGAG00000000759	ZC3H12B	99	75.534	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.750	ENSMAUG00000017800	Zc3h12b	92	71.701	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.494	ENSMICG00000010697	ZC3H12B	99	68.787	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.632	ENSMOCG00000000094	Zc3h12b	92	71.827	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	76.631	ENSMMOG00000008734	zc3h12b	99	76.631	Mola_mola
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	98	70.883	ENSMODG00000005206	ZC3H12B	99	70.883	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	74.438	ENSMALG00000021153	zc3h12b	99	74.259	Monopterus_albus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.278	ENSMUSG00000035045	Zc3h12b	91	72.423	Mus_musculus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.160	MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	91	72.423	Mus_pahari
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.278	MGP_SPRETEiJ_G0034413	Zc3h12b	91	72.423	Mus_spretus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.080	ENSMPUG00000001162	ZC3H12B	99	67.491	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	70.446	ENSMLUG00000013635	ZC3H12B	93	73.265	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.751	ENSNBRG00000014889	zc3h12b	99	77.870	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.611	ENSNLEG00000000383	ZC3H12B	99	69.258	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	89	74.633	ENSMEUG00000014075	ZC3H12B	89	74.633	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	78.204	ENSONIG00000012867	zc3h12b	99	78.204	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	70.318	ENSOCUG00000006130	ZC3H12B	91	73.724	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	76.422	ENSORLG00000009556	zc3h12b	99	76.422	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	59	66.857	ENSORLG00000009188	-	60	70.213	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	61	70.717	ENSORLG00020019033	-	82	69.231	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	76.422	ENSORLG00020021793	zc3h12b	99	76.422	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	64	67.055	ENSORLG00015020619	-	87	68.803	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	76.540	ENSORLG00015004818	zc3h12b	99	76.540	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	76.960	ENSOMEG00000005768	zc3h12b	99	76.960	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	55	70.997	ENSOMEG00000018642	-	53	70.448	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.376	ENSOGAG00000029439	ZC3H12B	99	69.140	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.376	ENSOARG00000004959	ZC3H12B	91	73.522	Ovis_aries
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.611	ENSPPAG00000039530	ZC3H12B	99	69.140	Pan_paniscus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	76	74.411	ENSPPRG00000004966	-	94	74.411	Panthera_pardus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	75	74.960	ENSPTIG00000005571	ZC3H12B	99	74.960	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.611	ENSPTRG00000021969	ZC3H12B	99	69.140	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.847	ENSPANG00000007944	ZC3H12B	99	69.376	Papio_anubis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	78.571	ENSPKIG00000019893	ZC3H12B	99	77.408	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	78.511	ENSPKIG00000012946	zc3h12b	94	80.025	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	65	69.767	ENSPKIG00000012595	-	62	69.653	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	75.268	ENSPSIG00000016853	ZC3H12B	99	74.286	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	75.000	ENSPMGG00000006009	zc3h12b	99	75.118	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	70.130	ENSPCIG00000020264	ZC3H12B	99	70.130	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	76.815	ENSPFOG00000019365	zc3h12b	99	76.436	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	94	79.772	ENSPLAG00000011981	zc3h12b	99	73.302	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	73.653	ENSPMEG00000002552	zc3h12b	99	73.271	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.103	ENSPREG00000020794	zc3h12b	99	76.257	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	89	75.407	ENSPPYG00000020416	ZC3H12B	87	75.407	Pongo_abelii
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	90	70.667	ENSPCAG00000016422	ZC3H12B	87	70.667	Procavia_capensis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.591	ENSPCOG00000020467	ZC3H12B	91	73.840	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	81	68.148	ENSPVAG00000017352	ZC3H12B	87	68.148	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.633	ENSPNYG00000018012	zc3h12b	99	77.751	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	95	47.555	ENSPNAG00000017483	-	87	49.550	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	93	75.622	ENSPNAG00000002567	zc3h12b	92	75.589	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.347	ENSRNOG00000011508	Zc3h12b	91	72.423	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.729	ENSRBIG00000036402	ZC3H12B	99	69.258	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.729	ENSRROG00000036004	ZC3H12B	99	69.258	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.847	ENSSBOG00000004095	ZC3H12B	99	69.376	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.882	ENSSHAG00000006530	ZC3H12B	99	69.882	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.660	ENSSMAG00000018309	zc3h12b	99	77.778	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	78.665	ENSSDUG00000014078	zc3h12b	99	77.804	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.936	ENSSLDG00000018895	zc3h12b	99	78.055	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	81	60.593	ENSSARG00000002292	ZC3H12B	87	60.593	Sorex_araneus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	93	73.650	ENSSPUG00000014175	ZC3H12B	95	73.650	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	78.462	ENSSPAG00000022460	zc3h12b	99	78.698	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	69.847	ENSSSCG00000012367	ZC3H12B	91	74.422	Sus_scrofa
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	74.941	ENSTGUG00000002846	ZC3H12B	99	75.149	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	94	77.680	ENSTRUG00000012186	zc3h12b	98	77.680	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	85	81.805	ENSTNIG00000011828	zc3h12b	93	81.805	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	75	72.512	ENSTBEG00000011540	ZC3H12B	86	72.512	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	79	80.682	ENSTTRG00000007468	ZC3H12B	76	80.682	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.551	ENSUAMG00000005098	ZC3H12B	99	67.962	Ursus_americanus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.551	ENSUMAG00000017054	ZC3H12B	99	67.962	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	89	72.741	ENSVPAG00000009070	ZC3H12B	87	72.741	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.433	ENSVVUG00000022686	ZC3H12B	99	67.845	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	68.128	ENSXETG00000017794	zc3h12b	99	67.139	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.294	ENSXCOG00000006151	zc3h12b	99	76.325	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015008769	zc3h12b	99	77.453	ENSXMAG00000018548	zc3h12b	99	76.491	Xiphophorus_maculatus