EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015008837 (Gene tree)
Gene ID: 108932409
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9135 bases
Position: chrKV410993.1:2599912-2609046
Accession: 108932409
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015013741	SRP54	PF00448.22	1.8e-48	1	1
ENSSFOP00015013741	SRP54_N	PF02881.19	1.9e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015013912	-	1758	XM_018748787	ENSSFOP00015013741	585 (aa)	XP_018604303	-

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015008837's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015008837's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.303	ENSG00000182934	SRPRA	100	65.109	Homo_sapiens
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.742	ENSAPOG00000017588	srpra	100	73.425	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.835	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	65.732	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.291	ENSACIG00000021588	srpra	100	71.894	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	80.776	ENSAOCG00000018884	srpra	100	80.944	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015008837	srpra	100	80.607	ENSAPEG00000022286	srpra	100	80.776	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015008837	srpra	100	74.959	ENSATEG00000023578	srpra	100	72.699	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015008837	srpra	93	67.828	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	65.728	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015008837	srpra	100	67.543	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	65.895	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.303	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	65.109	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.965	ENSACLG00000000518	srpra	100	73.148	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015008837	srpra	100	74.917	ENSAMXG00000009975	srpra	100	74.669	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.630	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	65.008	Bos_taurus
ENSSFOG00015008837	srpra	99	48.819	WBGene00009521	F38A1.8	99	48.499	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.938	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	64.743	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.431	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	63.281	Canis_familiaris
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.147	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	65.000	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.357	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	64.852	Capra_hircus
ENSSFOG00015008837	srpra	82	85.015	ENSTSYG00000005187	SRPRA	100	66.218	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015008837	srpra	94	67.009	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	87.218	Cavia_aperea
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.355	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	87.218	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.303	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	65.109	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.147	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	65.055	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.199	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	65.421	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.303	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	65.109	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.745	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	66.359	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015008837	srpra	99	55.901	ENSCING00000008954	-	100	55.901	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015008837	srpra	99	59.295	ENSCSAVG00000005602	-	100	58.710	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.991	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	65.109	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.109	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	66.719	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.109	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	87.407	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015008837	srpra	100	77.138	ENSCSEG00000002374	srpra	100	75.822	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.923	ENSCVAG00000019881	srpra	100	72.000	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.308	ENSDARG00000061124	srpra	100	72.308	Danio_rerio
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.407	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	63.790	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.008	ENSDORG00000016719	Srpr	100	65.576	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015008837	srpra	99	51.108	FBgn0010391	Gtp-bp	100	51.278	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.163	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	63.297	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015008837	srpra	63	71.169	ENSEBUG00000002602	srpra	97	67.824	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.459	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	65.888	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.459	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	65.888	Equus_caballus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	60.530	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	60.436	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.741	ENSELUG00000017643	srpra	100	72.672	Esox_lucius
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.888	ENSFCAG00000011274	-	100	65.630	Felis_catus
ENSSFOG00015008837	srpra	78	59.728	ENSFCAG00000030894	-	99	59.417	Felis_catus
ENSSFOG00015008837	srpra	94	63.651	ENSFALG00000005048	SRPRA	96	65.082	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.044	ENSFDAG00000016229	SRPRA	85	87.879	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.699	ENSFHEG00000016959	srpra	100	71.779	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	73.428	ENSGMOG00000013244	srpra	100	73.482	Gadus_morhua
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.275	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	66.357	Gallus_gallus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	78.808	ENSGAFG00000000453	srpra	100	77.152	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015008837	srpra	100	73.053	ENSGACG00000006550	srpra	100	71.851	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.516	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	66.667	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.303	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	65.109	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.811	ENSHBUG00000000119	srpra	100	72.994	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.230	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	87.879	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.230	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	87.879	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015008837	srpra	100	78.053	ENSHCOG00000010749	srpra	100	77.888	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015008837	srpra	93	71.100	ENSIPUG00000000867	srpra	99	71.757	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.785	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	64.798	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.511	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	66.615	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	74.154	ENSKMAG00000002280	srpra	100	72.769	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.504	ENSLBEG00000009608	srpra	100	72.657	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015008837	srpra	91	76.238	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	67.035	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015008837	srpra	100	71.407	ENSLOCG00000002733	srpra	100	71.275	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.441	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	65.163	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.459	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	65.265	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.459	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	65.265	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.459	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	65.265	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.147	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	65.055	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	73.118	ENSMAMG00000000473	srpra	100	71.846	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.965	ENSMZEG00005013432	srpra	100	73.148	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015008837	srpra	93	64.570	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	66.003	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.459	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	66.406	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.835	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	64.953	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.781	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	65.938	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015008837	srpra	100	76.575	ENSMMOG00000005019	srpra	100	74.798	Mola_mola
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.798	ENSMODG00000004576	-	100	63.265	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.546	ENSMALG00000011343	srpra	100	72.350	Monopterus_albus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.679	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	88.636	Mus_caroli
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.822	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	87.879	Mus_musculus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.798	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	87.879	Mus_pahari
ENSSFOG00015008837	srpra	91	79.310	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	89	79.310	Mus_spretus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.991	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	65.888	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.752	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	64.632	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.199	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	64.743	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015008837	srpra	100	73.118	ENSNBRG00000017311	srpra	100	73.457	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015008837	srpra	99	63.265	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	64.754	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015008837	srpra	93	63.907	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	62.791	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015008837	srpra	100	61.912	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	61.189	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.798	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	65.523	Octodon_degus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.504	ENSONIG00000005324	srpra	100	72.840	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.938	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	64.743	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015008837	srpra	82	92.453	ENSORLG00000014676	srpra	81	92.453	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015008837	srpra	100	71.783	ENSORLG00020009240	srpra	100	71.695	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015008837	srpra	100	74.682	ENSORLG00015015405	srpra	100	73.726	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015008837	srpra	100	75.974	ENSOMEG00000005872	srpra	100	75.689	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.719	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	65.421	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.230	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	63.411	Ovis_aries
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.303	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	65.109	Pan_paniscus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.888	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	65.630	Panthera_pardus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.732	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	65.474	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.303	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	65.109	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.459	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	65.265	Papio_anubis
ENSSFOG00015008837	srpra	100	76.518	ENSPKIG00000016106	srpra	100	76.518	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015008837	srpra	93	66.722	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	66.557	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015008837	srpra	100	73.742	ENSPMGG00000001393	srpra	100	73.899	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.953	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	66.562	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015008837	srpra	99	59.937	ENSPMAG00000009559	srpra	99	59.937	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.174	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	64.798	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.086	ENSPFOG00000003114	srpra	100	71.538	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015008837	srpra	100	80.537	ENSPLAG00000007323	srpra	100	79.530	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015008837	srpra	100	80.976	ENSPMEG00000015658	srpra	100	80.471	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015008837	srpra	100	79.766	ENSPREG00000004937	srpra	100	78.859	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015008837	srpra	88	84.211	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	84.211	Pongo_abelii
ENSSFOG00015008837	srpra	64	89.147	ENSPCAG00000003801	-	63	89.147	Procavia_capensis
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.147	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	64.953	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.728	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	65.728	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.965	ENSPNYG00000012371	srpra	100	73.148	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015008837	srpra	100	70.833	ENSPNAG00000013476	srpra	100	71.759	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015008837	srpra	100	64.798	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	66.406	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.822	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	65.265	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.303	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	65.109	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015008837	srpra	56	43.023	YDR292C	-	52	43.161	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.147	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	64.953	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015008837	srpra	93	64.628	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	62.852	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015008837	srpra	100	77.011	ENSSMAG00000002783	srpra	100	77.668	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	80.268	ENSSDUG00000013920	srpra	100	80.268	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015008837	srpra	100	73.201	ENSSLDG00000008601	srpra	93	73.313	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015008837	srpra	79	78.049	ENSSARG00000012434	SRPRA	85	78.049	Sorex_araneus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.581	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	65.581	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	75.039	ENSSPAG00000005103	srpra	100	73.561	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.835	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	64.486	Sus_scrofa
ENSSFOG00015008837	srpra	93	63.682	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	63.682	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015008837	srpra	100	75.941	ENSTRUG00000006856	srpra	100	75.772	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015008837	srpra	100	67.939	ENSTNIG00000010316	srpra	100	67.228	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.732	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	64.852	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.835	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	65.732	Ursus_americanus
ENSSFOG00015008837	srpra	87	70.050	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	61.228	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015008837	srpra	66	89.147	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	89.147	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.303	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	65.312	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015008837	srpra	100	57.863	ENSXETG00000003920	srpra	100	57.317	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015008837	srpra	100	71.235	ENSXCOG00000001286	srpra	86	93.333	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015008837	srpra	100	73.457	ENSXMAG00000028401	srpra	100	72.952	Xiphophorus_maculatus