EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015008923 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tomm20a
Alias: arid4b|ch1073-321c8.1|wu:fk47b11
Full Name: translocase of outer mitochondrial membrane 20
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12546 bases
Position: chrKV410863.1:2192008-2204553
Accession: ZDB-GENE-040426-1976
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015013808	Tudor-knot	PF11717.8	1.9e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015013978	-	6132	-	ENSSFOP00015013808	924 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	48.335	ENSSFOG00015000132	arid4b	75	49.696

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015008923	tomm20a	86	45.975	ENSG00000054267	ARID4B	98	33.923	Homo_sapiens
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	52.546	ENSAPOG00000010823	tomm20a	76	50.994	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	77	42.225	ENSAMEG00000008801	ARID4B	76	41.683	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015008923	tomm20a	86	85.870	ENSACIG00000006313	tomm20a	71	85.870	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	52.696	ENSAOCG00000003330	tomm20a	76	50.795	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	52.696	ENSAPEG00000024018	tomm20a	76	50.795	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	52.064	ENSATEG00000014930	tomm20a	76	50.544	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	42.587	ENSAPLG00000004422	ARID4B	76	41.816	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015008923	tomm20a	83	49.784	ENSACAG00000001289	ARID4B	76	43.230	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	87.500	ENSACLG00000023521	tomm20a	74	84.783	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015008923	tomm20a	78	85.859	ENSAMXG00000003657	tomm20a	60	85.859	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	77	42.099	ENSBTAG00000000222	ARID4B	76	41.843	Bos_taurus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	45.894	ENSCJAG00000018055	ARID4B	76	41.205	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	41.477	ENSCPOG00000034766	ARID4B	76	40.132	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	84	46.137	ENSCCAG00000021520	ARID4B	76	40.691	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	41.524	ENSCATG00000042166	ARID4B	76	41.182	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	41.746	ENSCLAG00000003255	ARID4B	76	41.667	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	46.170	ENSCSAG00000010069	ARID4B	76	41.340	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	46.209	ENSCANG00000027498	ARID4B	79	41.555	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	41.929	ENSCGRG00001014397	Arid4b	76	41.595	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	41.929	ENSCGRG00000004910	Arid4b	76	41.595	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015008923	tomm20a	94	49.680	ENSCVAG00000003244	tomm20a	75	50.449	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	49.643	ENSDARG00000090656	tomm20a	74	49.641	Danio_rerio
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	41.771	ENSDORG00000006422	Arid4b	76	41.346	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015008923	tomm20a	88	84.375	ENSETEG00000005596	ARID4B	67	86.022	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015008923	tomm20a	76	50.000	ENSELUG00000018441	tomm20a	55	45.985	Esox_lucius
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	51.475	ENSFHEG00000003798	tomm20a	75	50.398	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	49.445	ENSGACG00000004298	tomm20a	75	50.350	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	45.957	ENSGGOG00000022080	ARID4B	76	41.114	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	52.328	ENSHBUG00000020369	tomm20a	75	50.842	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015008923	tomm20a	77	41.814	ENSHGLG00000012546	ARID4B	76	41.889	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015008923	tomm20a	77	41.814	ENSHGLG00100015436	ARID4B	76	41.889	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	50.149	ENSHCOG00000010376	tomm20a	88	49.161	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	49.089	ENSIPUG00000014234	arid4b	75	47.866	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	90	73.913	ENSSTOG00000002810	ARID4B	76	42.297	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	86	89.130	ENSKMAG00000010987	tomm20a	76	89.130	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	51.212	ENSLOCG00000015899	tomm20a	75	52.477	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	41.524	ENSMFAG00000044016	ARID4B	76	41.182	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	41.524	ENSMMUG00000007141	ARID4B	76	41.182	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015008923	tomm20a	88	84.375	ENSMNEG00000014840	ARID4B	76	41.221	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	41.619	ENSMLEG00000033583	ARID4B	76	41.182	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	91	49.622	ENSMAMG00000017134	tomm20a	73	49.559	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	52.314	ENSMZEG00005009879	tomm20a	75	50.942	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015008923	tomm20a	86	87.097	ENSMMOG00000000561	tomm20a	77	49.294	Mola_mola
ENSSFOG00015008923	tomm20a	94	50.790	ENSMALG00000005205	tomm20a	75	51.988	Monopterus_albus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	88	84.375	MGP_CAROLIEiJ_G0018236	Arid4b	76	41.563	Mus_caroli
ENSSFOG00015008923	tomm20a	56	84.375	ENSMUSG00000039219	Arid4b	76	41.578	Mus_musculus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	83	46.467	MGP_PahariEiJ_G0019286	Arid4b	76	41.097	Mus_pahari
ENSSFOG00015008923	tomm20a	88	84.375	MGP_SPRETEiJ_G0019094	Arid4b	76	41.373	Mus_spretus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	57	73.913	ENSMPUG00000002906	ARID4B	76	40.900	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015008923	tomm20a	77	41.310	ENSMLUG00000016232	ARID4B	76	40.553	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	43.197	ENSNGAG00000014629	Arid4b	76	42.150	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015008923	tomm20a	86	87.097	ENSNBRG00000019684	tomm20a	71	87.097	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	45.957	ENSNLEG00000002665	ARID4B	76	41.131	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015008923	tomm20a	90	73.913	ENSODEG00000005373	ARID4B	76	41.522	Octodon_degus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	51.693	ENSORLG00000012510	tomm20a	75	48.713	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015008923	tomm20a	87	86.957	ENSORLG00020013988	tomm20a	71	86.957	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015008923	tomm20a	87	86.957	ENSORLG00015022835	tomm20a	71	86.957	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	53.869	ENSOMEG00000000521	tomm20a	75	52.069	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	46.596	ENSPPAG00000031651	ARID4B	76	40.979	Pan_paniscus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	45.957	ENSPTRG00000048786	-	85	40.979	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	45.957	ENSPTRG00000002129	ARID4B	76	40.979	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	41.619	ENSPANG00000013611	ARID4B	76	41.182	Papio_anubis
ENSSFOG00015008923	tomm20a	69	51.553	ENSPMGG00000001596	tomm20a	88	56.204	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	45.229	ENSPCIG00000029756	ARID4B	76	43.160	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	48.975	ENSPFOG00000019430	tomm20a	75	48.761	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	49.078	ENSPLAG00000010554	tomm20a	75	48.617	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	49.287	ENSPMEG00000003093	tomm20a	74	48.713	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	48.279	ENSPREG00000007996	tomm20a	75	49.701	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	46.467	ENSPPYG00000000098	ARID4B	76	40.883	Pongo_abelii
ENSSFOG00015008923	tomm20a	58	73.913	ENSPCOG00000024328	ARID4B	76	41.785	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015008923	tomm20a	77	65.000	ENSPVAG00000015159	ARID4B	68	50.189	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	51.917	ENSPNYG00000013988	tomm20a	76	51.382	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	52.348	ENSPNAG00000000523	tomm20a	70	51.830	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	46.681	ENSRNOG00000016391	LOC100912163	74	44.557	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	56	84.375	ENSRBIG00000042029	ARID4B	72	38.090	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	46.170	ENSRROG00000045203	ARID4B	76	40.957	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015008923	tomm20a	56	84.375	ENSSBOG00000020196	ARID4B	91	40.787	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015008923	tomm20a	76	53.026	ENSSMAG00000010430	tomm20a	76	50.146	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	53.252	ENSSDUG00000003019	tomm20a	76	51.597	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015008923	tomm20a	88	83.333	ENSSPUG00000015466	ARID4B	74	42.326	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	52.893	ENSSPAG00000007358	tomm20a	76	51.290	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	76	50.792	ENSTRUG00000002893	tomm20a	86	48.219	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	42.075	ENSTTRG00000002228	ARID4B	76	41.021	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	42.404	ENSUMAG00000006905	ARID4B	77	41.691	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015008923	tomm20a	85	46.868	ENSVVUG00000008154	ARID4B	85	40.266	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015008923	tomm20a	100	40.157	ENSXETG00000024651	arid4b	59	50.809	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015008923	tomm20a	98	49.128	ENSXMAG00000006538	tomm20a	75	50.853	Xiphophorus_maculatus