EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015010874 (Gene tree)
Gene ID: 108939008
Gene Symbol: celf4
Alias: zgc:92761
Full Name: CUGBP Elav-like family member 4
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 57704 bases
Position: chrKV411184.1:1090422-1148125
Accession: 108939008
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015016903	RRM_1	PF00076.22	3.7e-51	1	3
ENSSFOP00015016903	RRM_1	PF00076.22	3.7e-51	2	3
ENSSFOP00015016903	RRM_1	PF00076.22	3.7e-51	3	3
ENSSFOP00015016892	RRM_1	PF00076.22	5e-51	1	3
ENSSFOP00015016892	RRM_1	PF00076.22	5e-51	2	3
ENSSFOP00015016892	RRM_1	PF00076.22	5e-51	3	3
ENSSFOP00015016887	RRM_1	PF00076.22	1.9e-39	1	2
ENSSFOP00015016887	RRM_1	PF00076.22	1.9e-39	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015017077	-	1338	-	ENSSFOP00015016887	445 (aa)	-	-
ENSSFOT00015017082	-	5921	XM_018760077	ENSSFOP00015016892	522 (aa)	XP_018615593	-
ENSSFOT00015017093	-	5813	XM_018760073	ENSSFOP00015016903	486 (aa)	XP_018615589	A0A1W5AR76

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015010874's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015010874's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015010874	celf4	94	67.373	ENSSFOG00015010315	celf5b	100	66.454
ENSSFOG00015010874	celf4	96	44.701	ENSSFOG00015019353	celf1	93	46.000
ENSSFOG00015010874	celf4	97	45.491	ENSSFOG00015023817	-	100	45.996
ENSSFOG00015010874	celf4	96	44.639	ENSSFOG00015023981	-	98	45.984
ENSSFOG00015010874	celf4	92	71.903	ENSSFOG00015004376	celf5a	94	71.460
ENSSFOG00015010874	celf4	60	38.356	ENSSFOG00015006617	-	60	38.356
ENSSFOG00015010874	celf4	61	30.000	ENSSFOG00015018496	-	67	30.000
ENSSFOG00015010874	celf4	92	71.058	ENSSFOG00015022130	celf3a	87	71.058
ENSSFOG00015010874	celf4	57	46.914	ENSSFOG00015017503	-	83	46.914
ENSSFOG00015010874	celf4	51	33.750	ENSSFOG00015006642	-	63	33.750
ENSSFOG00015010874	celf4	59	41.975	ENSSFOG00015018252	elavl2	72	41.975
ENSSFOG00015010874	celf4	60	41.667	ENSSFOG00015001257	ELAVL2	81	41.667
ENSSFOG00015010874	celf4	57	46.914	ENSSFOG00015021786	ELAVL1	77	46.914
ENSSFOG00015010874	celf4	64	44.615	ENSSFOG00015023630	elavl3	96	44.615
ENSSFOG00015010874	celf4	66	37.500	ENSSFOG00015008578	rbms3	57	37.500
ENSSFOG00015010874	celf4	100	75.813	ENSSFOG00015002593	-	100	76.016
ENSSFOG00015010874	celf4	51	31.111	ENSSFOG00015008776	tia1	63	31.111
ENSSFOG00015010874	celf4	71	37.349	ENSSFOG00015002752	-	62	37.349
ENSSFOG00015010874	celf4	69	37.349	ENSSFOG00015006662	pabpc1a	61	37.349
ENSSFOG00015010874	celf4	92	82.522	ENSSFOG00015016756	-	93	80.931
ENSSFOG00015010874	celf4	60	40.741	ENSSFOG00015015838	elavl4	75	40.741
ENSSFOG00015010874	celf4	64	38.158	ENSSFOG00015014493	rbms1a	52	38.158

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSG00000101489	CELF4	100	92.537	Homo_sapiens
ENSSFOG00015010874	celf4	100	84.280	ENSAPOG00000002964	celf4	100	83.712	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015010874	celf4	92	75.688	ENSAMEG00000017059	CELF4	99	77.925	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015010874	celf4	98	81.982	ENSACIG00000018097	celf4	100	81.757	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	84.280	ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.811	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015010874	celf4	58	68.182	ENSAOCG00000019919	-	88	63.448	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015010874	celf4	98	85.811	ENSAPEG00000002940	celf4	99	85.811	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015010874	celf4	98	85.586	ENSATEG00000023731	celf4	100	85.586	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015010874	celf4	72	71.357	ENSAPLG00000007830	-	100	71.357	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015010874	celf4	52	71.119	ENSACAG00000012428	CELF4	91	82.609	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSANAG00000029499	CELF4	100	80.911	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015010874	celf4	100	86.382	ENSACLG00000011828	celf4	100	85.772	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015010874	celf4	100	86.067	ENSAMXG00000007935	celf4	100	85.843	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.783	ENSBTAG00000004940	CELF4	98	87.805	Bos_taurus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	78.085	ENSCJAG00000021135	CELF4	100	79.149	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	77.645	ENSCHIG00000007169	CELF4	98	87.805	Capra_hircus
ENSSFOG00015010874	celf4	95	83.486	ENSTSYG00000000816	CELF4	90	85.015	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015010874	celf4	100	75.542	ENSCPOG00000035956	CELF4	99	75.345	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSCCAG00000028373	CELF4	100	80.911	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSCATG00000045293	CELF4	100	80.911	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015010874	celf4	100	80.079	ENSCLAG00000008344	CELF4	99	79.882	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015010874	celf4	90	85.112	ENSCSAG00000017933	CELF4	99	85.674	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015010874	celf4	90	79.552	ENSCPBG00000005237	CELF4	93	80.952	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSCANG00000036735	CELF4	100	80.911	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015010874	celf4	77	74.536	ENSCGRG00001018085	Celf4	89	75.066	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015010874	celf4	100	84.280	ENSCSEG00000007074	celf4	99	90.476	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015010874	celf4	99	84.116	ENSCVAG00000017617	celf4	99	84.910	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	85.878	ENSDARG00000070045	celf4	100	85.468	Danio_rerio
ENSSFOG00015010874	celf4	90	81.572	ENSDNOG00000032492	CELF4	99	82.656	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	80.079	ENSDORG00000007169	Celf4	99	79.882	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015010874	celf4	92	72.000	ENSETEG00000007432	-	71	73.427	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSEASG00005016534	CELF4	100	80.911	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	76.125	ENSECAG00000008810	CELF4	99	77.104	Equus_caballus
ENSSFOG00015010874	celf4	87	63.387	ENSEEUG00000003763	CELF4	96	64.531	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	80.000	ENSFCAG00000045234	CELF4	100	81.087	Felis_catus
ENSSFOG00015010874	celf4	90	86.236	ENSFALG00000009188	CELF4	98	86.798	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015010874	celf4	100	74.951	ENSFDAG00000010287	CELF4	99	74.753	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015010874	celf4	100	73.631	ENSFHEG00000003431	celf4	99	74.286	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	68.550	ENSGMOG00000008703	celf4	100	68.362	Gadus_morhua
ENSSFOG00015010874	celf4	66	85.366	ENSGMOG00000011747	-	79	85.366	Gadus_morhua
ENSSFOG00015010874	celf4	100	83.969	ENSGAFG00000021515	celf4	94	84.318	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015010874	celf4	100	77.778	ENSGACG00000008752	celf4	100	77.589	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015010874	celf4	90	62.344	ENSGAGG00000017672	-	90	79.630	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015010874	celf4	64	78.025	ENSGAGG00000023014	-	98	79.618	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSGGOG00000013920	CELF4	100	80.911	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015010874	celf4	100	86.179	ENSHBUG00000021618	celf4	100	85.772	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015010874	celf4	100	76.726	ENSHGLG00000003130	CELF4	99	77.318	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.487	ENSHGLG00100006394	CELF4	99	79.290	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015010874	celf4	98	84.163	ENSHCOG00000012195	celf4	99	83.258	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015010874	celf4	100	78.882	ENSIPUG00000010810	celf4	95	79.535	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.290	ENSJJAG00000016892	Celf4	99	79.093	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	83.902	ENSKMAG00000019602	celf4	100	83.333	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	85.144	ENSLBEG00000000940	celf4	100	85.301	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015010874	celf4	92	76.733	ENSLOCG00000004792	celf4	98	76.733	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	80.198	ENSLAFG00000021352	CELF4	99	80.000	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSMFAG00000042983	CELF4	100	80.911	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015010874	celf4	100	76.667	ENSMMUG00000006866	CELF4	99	77.059	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSMNEG00000033449	CELF4	100	80.911	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015010874	celf4	92	75.817	ENSMLEG00000028543	CELF4	99	76.471	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	85.144	ENSMAMG00000018573	celf4	100	85.301	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	81.778	ENSMZEG00005026879	celf4	100	81.556	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015010874	celf4	64	64.127	ENSMGAG00000017029	CELF4	99	64.127	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015010874	celf4	100	78.298	ENSMICG00000006984	CELF4	100	79.362	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.804	ENSMOCG00000011985	Celf4	99	80.000	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015010874	celf4	98	84.685	ENSMMOG00000012281	celf4	100	84.685	Mola_mola
ENSSFOG00015010874	celf4	77	76.657	ENSMODG00000000306	CELF4	91	76.657	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015010874	celf4	100	86.382	ENSMALG00000001696	celf4	100	85.772	Monopterus_albus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.608	MGP_CAROLIEiJ_G0022058	Celf4	100	79.375	Mus_caroli
ENSSFOG00015010874	celf4	100	81.437	ENSMUSG00000024268	Celf4	99	82.435	Mus_musculus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.608	MGP_PahariEiJ_G0018792	Celf4	100	79.375	Mus_pahari
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.608	MGP_SPRETEiJ_G0022969	Celf4	100	79.332	Mus_spretus
ENSSFOG00015010874	celf4	91	66.509	ENSMPUG00000001027	CELF4	100	69.740	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015010874	celf4	90	83.646	ENSMLUG00000001755	CELF4	100	84.182	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.804	ENSNGAG00000000761	Celf4	99	79.608	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015010874	celf4	100	81.778	ENSNBRG00000018194	celf4	100	81.556	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015010874	celf4	77	74.571	ENSMEUG00000007202	-	100	76.000	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015010874	celf4	89	77.287	ENSOPRG00000014415	CELF4	89	78.233	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.804	ENSODEG00000018464	CELF4	99	79.608	Octodon_degus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	84.091	ENSONIG00000019463	celf4	100	83.333	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015010874	celf4	91	79.567	ENSOCUG00000024790	CELF4	81	81.922	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	84.091	ENSORLG00000008913	celf4	100	83.333	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015010874	celf4	100	84.091	ENSORLG00020008454	celf4	100	83.333	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015010874	celf4	100	84.091	ENSORLG00015004115	celf4	100	83.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015010874	celf4	100	84.280	ENSOMEG00000002391	celf4	100	85.327	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015010874	celf4	91	78.118	ENSOGAG00000010018	CELF4	100	78.588	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015010874	celf4	64	80.952	ENSOARG00000005276	CELF4	100	82.222	Ovis_aries
ENSSFOG00015010874	celf4	92	79.303	ENSPPAG00000020644	CELF4	99	79.956	Pan_paniscus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSPPRG00000007683	CELF4	100	80.911	Panthera_pardus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSPTRG00000009982	CELF4	100	80.911	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSPANG00000006365	CELF4	100	80.911	Papio_anubis
ENSSFOG00015010874	celf4	100	86.031	ENSPKIG00000017421	celf4	100	85.588	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015010874	celf4	90	86.236	ENSPSIG00000015538	CELF4	98	86.798	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.608	ENSPEMG00000019299	Celf4	99	79.412	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015010874	celf4	78	83.146	ENSPLAG00000012151	celf4	88	83.616	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015010874	celf4	84	90.476	ENSPMEG00000015313	celf4	97	90.476	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015010874	celf4	100	86.475	ENSPREG00000021231	celf4	100	85.861	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015010874	celf4	83	76.159	ENSPCAG00000000126	CELF4	80	79.290	Procavia_capensis
ENSSFOG00015010874	celf4	100	76.172	ENSPVAG00000009204	CELF4	99	77.148	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	81.778	ENSPNYG00000004131	celf4	100	81.556	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015010874	celf4	100	87.269	ENSPNAG00000006426	celf4	100	86.653	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015010874	celf4	87	77.208	ENSRNOG00000014503	Celf4	100	78.632	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	80.000	ENSRBIG00000035924	CELF4	100	81.087	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015010874	celf4	100	79.826	ENSRROG00000014839	CELF4	100	80.911	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015010874	celf4	100	78.959	ENSSBOG00000030001	CELF4	100	80.043	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015010874	celf4	84	81.040	ENSSHAG00000009193	CELF4	96	82.569	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015010874	celf4	100	85.259	ENSSMAG00000009331	celf4	99	90.476	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	72.561	ENSSLDG00000018548	celf4	100	72.561	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015010874	celf4	100	75.000	ENSSPAG00000018307	celf4	100	75.000	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	77.872	ENSSSCG00000003748	CELF4	99	88.095	Sus_scrofa
ENSSFOG00015010874	celf4	90	86.236	ENSTGUG00000001649	CELF4	98	86.798	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015010874	celf4	98	82.432	ENSTRUG00000015481	celf4	100	82.658	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015010874	celf4	97	76.749	ENSTNIG00000010679	celf4	99	74.081	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015010874	celf4	90	82.759	ENSTBEG00000010647	CELF4	87	82.759	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015010874	celf4	100	75.977	ENSTTRG00000016826	CELF4	99	76.953	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015010874	celf4	86	77.989	ENSUAMG00000005506	CELF4	83	82.948	Ursus_americanus
ENSSFOG00015010874	celf4	55	78.000	ENSVPAG00000009042	-	88	58.303	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015010874	celf4	100	78.112	ENSVVUG00000027721	CELF4	99	79.116	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015010874	celf4	93	82.973	ENSXETG00000020486	celf4	98	82.703	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015010874	celf4	90	83.127	ENSXCOG00000017592	celf4	97	79.717	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015010874	celf4	100	86.531	ENSXMAG00000018178	celf4	100	85.918	Xiphophorus_maculatus