EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015010934 (Gene tree)
Gene ID: 108926122
Gene Symbol: tnpo2
Alias: FLJ12155|IPO3|KPNB2B|TRN2
Full Name: transportin-2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14953 bases
Position: chrKV410851.1:142238-157190
Accession: 108926122
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015017024	IBN_N	PF03810.19	5e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015017216	-	5676	XM_018738624	ENSSFOP00015017024	889 (aa)	XP_018594140	A0A1W4Z0F3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015010934	tnpo2	99	86.712	ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	86.712
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.726	ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	95.726

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.901	ENSG00000105576	TNPO2	100	91.582	Homo_sapiens
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.376	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	94.376	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	82	94.345	ENSAPOG00000013185	-	96	94.345	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	89.321	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	89.012	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015010934	tnpo2	87	94.171	ENSACIG00000009586	-	100	94.171	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	87	95.590	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	95.590	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.376	ENSAOCG00000010152	-	100	94.376	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.838	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	95.838	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.376	ENSAPEG00000013268	-	100	94.376	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.838	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	95.838	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.376	ENSATEG00000019171	-	100	94.376	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.388	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	95.388	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.576	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	92.040	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.789	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	91.470	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	88.301	ENSACLG00000020672	-	100	88.301	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.613	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	95.613	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.124	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	94.124	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.901	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	91.582	Bos_taurus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	90.879	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	90.566	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	91.695	Canis_familiaris
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	91.695	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	87.319	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	87.347	Capra_hircus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.901	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	91.582	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015010934	tnpo2	93	89.536	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	89.205	Cavia_aperea
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.126	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	91.807	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.901	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	91.582	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	90.879	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	90.566	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.126	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	91.807	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.901	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	91.582	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.688	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	92.688	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015010934	tnpo2	96	92.065	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	91.735	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	90.990	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	90.677	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	91.695	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015010934	tnpo2	87	92.248	ENSCSEG00000011477	-	100	92.248	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.114	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	91.114	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	93.034	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	93.034	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.376	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	94.376	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	92.013	Danio_rerio
ENSSFOG00015010934	tnpo2	88	82.398	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	82.443	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	85.556	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	88.321	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	73.266	FBgn0024921	Tnpo	100	73.602	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015010934	tnpo2	91	84.171	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	84.171	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.901	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	92.126	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.901	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	91.582	Equus_caballus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	80	91.433	ENSELUG00000016542	-	99	84.062	Esox_lucius
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.784	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	94.784	Esox_lucius
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	90.879	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	90.566	Felis_catus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.126	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	91.807	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	93.371	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	93.371	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	97	93.953	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	93.953	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	86.465	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	86.465	Gadus_morhua
ENSSFOG00015010934	tnpo2	80	92.822	ENSGMOG00000014237	-	90	92.822	Gadus_morhua
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.263	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	94.263	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	93.933	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	93.933	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.688	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	92.688	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.613	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	95.613	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.376	ENSHBUG00000018317	-	100	94.376	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	91.695	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	90.434	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	90.122	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.151	ENSHCOG00000020440	-	100	94.151	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	93.701	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	93.701	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.263	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	94.263	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.163	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	95.163	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	91.695	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	90.879	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	90.566	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.263	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	94.263	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.226	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	91.226	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.501	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	95.501	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.601	ENSLBEG00000005301	-	100	94.601	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	90.101	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	90.101	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.726	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.726	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	90.879	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.566	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	90.879	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	90.566	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.901	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	91.582	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.901	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	91.582	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015010934	tnpo2	96	91.003	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	90.679	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.376	ENSMAMG00000011862	-	100	94.376	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	93.230	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	93.230	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.461	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	91.461	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.376	ENSMZEG00005007408	-	100	94.376	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.613	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	95.613	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	91.901	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	91.582	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	91.695	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015010934	tnpo2	87	90.310	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	90.310	Mola_mola
ENSSFOG00015010934	tnpo2	88	93.598	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	94.308	Mola_mola
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.102	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	92.102	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.263	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	94.263	Monopterus_albus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.376	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	94.376	Monopterus_albus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	92.238	Mus_caroli
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	92.238	Mus_musculus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	92.238	Mus_pahari
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	92.238	Mus_spretus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	91.695	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015010934	tnpo2	96	92.065	ENSMLUG00000012669	TNPO2	100	91.735	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.013	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	91.695	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	90.326	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	90.326	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	94.376	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	94.376	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	81.758	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	81.465	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	86.207	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	86.207	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.126	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	91.807	Octodon_degus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	93.430	ENSONIG00000017706	-	100	93.430	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.726	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	95.726	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	92.351	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	92.351	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	91	92.151	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	92.151	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.388	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	95.388	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015010934	tnpo2	56	93.200	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	93.200	Oryzias_latipes
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