EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015011794 (Gene tree)
Gene ID: 108919351
Gene Symbol: nrde2
Alias: c14orf102
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12194 bases
Position: chrKV411272.1:3541472-3553665
Accession: 108919351
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015018371	NRDE-2	PF08424.10	7.2e-104	1	1
ENSSFOP00015018350	NRDE-2	PF08424.10	8.3e-104	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015018583	-	5165	XM_018727279	ENSSFOP00015018371	1113 (aa)	XP_018582795	A0A1W4Y313
ENSSFOT00015018562	-	5255	XM_018727278	ENSSFOP00015018350	1143 (aa)	XP_018582794	A0A1W4XTC2

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015011794's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015011794's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.066	ENSG00000119720	NRDE2	100	69.756	Homo_sapiens
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.455	ENSAPOG00000009202	nrde2	99	52.846	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.659	ENSAMEG00000001807	NRDE2	100	50.127	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015011794	nrde2	94	55.585	ENSACIG00000014783	nrde2	98	56.498	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.428	ENSAOCG00000015576	nrde2	99	52.739	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.645	ENSAPEG00000001711	nrde2	99	53.207	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.601	ENSATEG00000010247	nrde2	99	52.766	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015011794	nrde2	98	51.125	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	51.125	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	47.793	ENSACAG00000014571	NRDE2	98	48.021	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	47.595	ENSANAG00000025313	NRDE2	100	47.950	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.405	ENSACLG00000025154	nrde2	100	52.488	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015011794	nrde2	85	63.636	ENSAMXG00000034642	nrde2	87	52.497	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.701	ENSBTAG00000005427	NRDE2	100	49.747	Bos_taurus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.662	ENSCJAG00000017711	NRDE2	100	50.210	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	46.380	ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	46.611	Canis_familiaris
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.605	ENSCAFG00020016346	NRDE2	100	49.074	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.947	ENSCHIG00000005876	NRDE2	100	50.168	Capra_hircus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.025	ENSTSYG00000000161	NRDE2	100	49.581	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015011794	nrde2	97	48.833	ENSCAPG00000012039	NRDE2	100	48.845	Cavia_aperea
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.063	ENSCPOG00000002428	NRDE2	100	49.281	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.873	ENSCCAG00000024917	NRDE2	100	50.084	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.681	ENSCLAG00000015185	NRDE2	100	49.198	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.766	ENSCSAG00000011451	NRDE2	100	49.410	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015011794	nrde2	73	49.128	ENSCHOG00000006165	NRDE2	75	49.354	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015011794	nrde2	89	52.712	ENSCPBG00000008537	NRDE2	95	51.282	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.981	ENSCANG00000029067	NRDE2	100	49.244	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.095	ENSCGRG00001015658	Nrde2	100	49.034	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.132	ENSCGRG00000005062	Nrde2	100	49.158	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015011794	nrde2	97	51.894	ENSCSEG00000000089	nrde2	100	52.336	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.794	ENSCVAG00000023105	nrde2	100	52.314	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	58.262	ENSDARG00000074726	nrde2	100	58.518	Danio_rerio
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.346	ENSDNOG00000024057	NRDE2	100	48.567	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015011794	nrde2	79	51.616	ENSDORG00000003197	Nrde2	98	51.974	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015011794	nrde2	63	48.613	ENSETEG00000000198	NRDE2	64	49.067	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	40.512	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	41.070	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.532	ENSEASG00005020675	NRDE2	100	49.454	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.660	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	49.538	Equus_caballus
ENSSFOG00015011794	nrde2	68	62.406	ENSEEUG00000004026	-	74	62.406	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	61.551	ENSELUG00000005973	nrde2	100	61.088	Esox_lucius
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	49.367	ENSFCAG00000011312	NRDE2	100	49.451	Felis_catus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.622	ENSFALG00000012260	NRDE2	98	51.121	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.167	ENSFDAG00000021350	NRDE2	100	49.071	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.527	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	52.527	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015011794	nrde2	65	58.943	ENSGMOG00000015815	nrde2	91	59.109	Gadus_morhua
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	51.533	ENSGALG00000010677	NRDE2	98	51.784	Gallus_gallus
ENSSFOG00015011794	nrde2	92	53.426	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	57.080	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	51.917	ENSGACG00000012619	nrde2	100	51.667	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	50.169	ENSGAGG00000003252	NRDE2	98	51.073	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.642	ENSGGOG00000008835	NRDE2	100	48.826	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.109	ENSHBUG00000016736	nrde2	100	52.570	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.508	ENSHGLG00000006731	NRDE2	100	49.154	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015011794	nrde2	97	48.611	ENSHGLG00100017736	NRDE2	99	49.268	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015011794	nrde2	91	48.455	ENSHCOG00000009559	nrde2	98	49.137	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	53.093	ENSIPUG00000016129	nrde2	100	52.835	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.232	ENSSTOG00000001678	NRDE2	100	49.493	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.321	ENSJJAG00000000907	Nrde2	100	49.664	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.381	ENSKMAG00000008647	nrde2	100	52.627	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015011794	nrde2	92	54.015	ENSLBEG00000021428	nrde2	97	54.071	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015011794	nrde2	69	57.875	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	57.875	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	58.919	ENSLOCG00000009037	nrde2	100	58.151	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015011794	nrde2	97	49.303	ENSLAFG00000004966	NRDE2	99	49.097	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015011794	nrde2	79	51.832	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	69.268	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.467	ENSMAMG00000013452	nrde2	99	52.549	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.405	ENSMZEG00005008319	nrde2	100	52.736	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015011794	nrde2	85	53.059	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	53.059	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	47.922	ENSMAUG00000018578	Nrde2	100	48.950	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.934	ENSMICG00000016741	NRDE2	100	48.816	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	46.459	ENSMOCG00000014472	Nrde2	100	46.633	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015011794	nrde2	72	53.085	ENSMMOG00000004703	nrde2	91	53.201	Mola_mola
ENSSFOG00015011794	nrde2	94	48.077	ENSMODG00000002711	NRDE2	100	48.333	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015011794	nrde2	91	53.803	ENSMALG00000021869	nrde2	94	54.155	Monopterus_albus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.688	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	48.336	Mus_caroli
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.692	ENSMUSG00000021179	Nrde2	100	48.259	Mus_musculus
ENSSFOG00015011794	nrde2	87	51.462	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	48.213	Mus_pahari
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.816	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	98	65.027	Mus_spretus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.021	ENSMPUG00000008135	NRDE2	100	48.985	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.208	ENSMLUG00000007484	NRDE2	100	48.564	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	47.959	ENSNGAG00000002993	Nrde2	100	47.408	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015011794	nrde2	92	54.098	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	55.493	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015011794	nrde2	97	48.579	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	49.001	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015011794	nrde2	72	52.569	ENSMEUG00000011097	NRDE2	74	52.569	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015011794	nrde2	62	64.211	ENSOPRG00000001375	-	60	64.151	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015011794	nrde2	97	48.225	ENSODEG00000012422	NRDE2	100	48.540	Octodon_degus
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	54.344	ENSONIG00000019512	nrde2	100	53.879	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.974	ENSOCUG00000010083	NRDE2	99	49.408	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015011794	nrde2	91	53.277	ENSORLG00000017730	nrde2	96	53.247	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	51.393	ENSORLG00020015965	nrde2	100	51.232	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	51.764	ENSORLG00015012437	nrde2	100	51.518	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	51.024	ENSOMEG00000010890	nrde2	100	51.015	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.066	ENSOGAG00000006624	NRDE2	100	48.995	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015011794	nrde2	97	47.441	ENSOARG00000003475	NRDE2	100	48.306	Ovis_aries
ENSSFOG00015011794	nrde2	97	50.000	ENSPPAG00000034133	NRDE2	99	52.326	Pan_paniscus
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	49.367	ENSPPRG00000006422	NRDE2	100	49.535	Panthera_pardus
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	49.451	ENSPTIG00000009989	NRDE2	100	49.662	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.151	ENSPTRG00000023399	NRDE2	100	49.329	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	69.626	ENSPKIG00000009331	nrde2	100	69.626	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.746	ENSPSIG00000005588	NRDE2	98	50.343	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015011794	nrde2	92	50.138	ENSPMGG00000024089	nrde2	94	50.368	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	47.775	ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	48.219	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015011794	nrde2	56	42.687	ENSPMAG00000003270	-	99	43.284	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	50.341	ENSPCIG00000018567	NRDE2	100	50.253	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	51.336	ENSPFOG00000013217	nrde2	99	50.867	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.023	ENSPLAG00000022350	nrde2	99	51.471	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.023	ENSPMEG00000000778	nrde2	99	51.552	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.059	ENSPREG00000009066	nrde2	99	51.349	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015011794	nrde2	84	50.970	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	51.261	Pongo_abelii
ENSSFOG00015011794	nrde2	73	69.355	ENSPCAG00000016399	NRDE2	72	69.355	Procavia_capensis
ENSSFOG00015011794	nrde2	94	47.195	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	46.892	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015011794	nrde2	96	46.731	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	47.208	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015011794	nrde2	98	52.421	ENSPNYG00000022833	nrde2	94	57.549	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015011794	nrde2	91	57.790	ENSPNAG00000015807	nrde2	96	57.790	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015011794	nrde2	90	47.481	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	47.575	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	49.364	ENSSBOG00000024346	NRDE2	100	49.747	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.814	ENSSHAG00000016736	NRDE2	97	49.284	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	50.526	ENSSMAG00000011671	nrde2	99	50.404	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	53.181	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	53.263	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015011794	nrde2	91	55.315	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	56.848	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015011794	nrde2	91	53.102	ENSSPUG00000006348	NRDE2	97	54.616	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015011794	nrde2	92	55.679	ENSSPAG00000000539	nrde2	100	54.965	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.729	ENSSSCG00000002434	NRDE2	100	49.831	Sus_scrofa
ENSSFOG00015011794	nrde2	98	50.129	ENSTGUG00000012462	-	99	50.432	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015011794	nrde2	77	55.776	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	55.776	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015011794	nrde2	82	54.869	ENSTBEG00000011834	NRDE2	86	51.613	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	47.793	ENSTTRG00000013583	NRDE2	100	48.692	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015011794	nrde2	89	50.762	ENSUAMG00000004159	NRDE2	95	50.605	Ursus_americanus
ENSSFOG00015011794	nrde2	91	49.859	ENSUMAG00000006393	NRDE2	97	48.370	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.092	ENSVVUG00000018202	NRDE2	100	48.414	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.999	ENSXETG00000015708	nrde2	92	50.993	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015011794	nrde2	92	53.340	ENSXCOG00000013298	nrde2	97	53.674	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015011794	nrde2	100	51.815	ENSXMAG00000009320	nrde2	100	51.898	Xiphophorus_maculatus