EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015011874 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma-like
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7027 bases
Position: chrKV410863.1:4274425-4281451
Accession: 108927115
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015018541	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015018753	-	2088	XM_018740184	ENSSFOP00015018541	695 (aa)	XP_018595700	-

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015011874's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015011874's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015011874	papolg	98	55.798	ENSSFOG00015004431	papola	96	67.403
ENSSFOG00015011874	papolg	100	68.873	ENSSFOG00015002383	papolg	100	68.873

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.005	ENSG00000115421	PAPOLG	100	77.119	Homo_sapiens
ENSSFOG00015011874	papolg	100	68.829	ENSAPOG00000004798	papolg	99	68.829	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015011874	papolg	99	62.973	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	63.378	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015011874	papolg	100	68.245	ENSACIG00000010546	papolg	99	68.567	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	66.443	ENSAOCG00000010254	papolg	89	66.218	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015011874	papolg	100	66.443	ENSAPEG00000006944	papolg	89	66.218	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015011874	papolg	100	66.355	ENSATEG00000009007	papolg	98	67.488	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015011874	papolg	98	59.489	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	59.489	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015011874	papolg	80	57.023	ENSACAG00000015048	-	99	57.023	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.649	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	64.649	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015011874	papolg	80	78.873	ENSACLG00000015592	papolg	89	65.744	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.223	ENSAMXG00000004611	papolg	100	65.223	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.113	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	64.113	Bos_taurus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.276	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	64.276	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	62.348	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	62.753	Canis_familiaris
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.549	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	63.961	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.113	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	64.113	Capra_hircus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.844	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	63.844	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015011874	papolg	53	73.087	ENSCAPG00000014901	-	99	73.087	Cavia_aperea
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.661	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	63.661	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.787	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	64.787	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015011874	papolg	90	71.245	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	71.245	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.575	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	63.575	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.276	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	64.276	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015011874	papolg	88	61.422	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	61.422	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015011874	papolg	69	60.041	ENSCING00000024664	-	92	60.041	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015011874	papolg	68	61.237	ENSCSAVG00000009085	-	97	61.237	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.512	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	64.512	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015011874	papolg	98	64.138	ENSCGRG00001014951	Papolg	99	63.661	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015011874	papolg	98	64.138	ENSCGRG00000005552	-	99	63.661	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015011874	papolg	100	69.553	ENSCSEG00000000771	papolg	99	69.274	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015011874	papolg	82	75.690	ENSCVAG00000016602	papolg	97	75.862	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.344	ENSDARG00000012141	papolg	100	65.344	Danio_rerio
ENSSFOG00015011874	papolg	100	62.046	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	62.046	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015011874	papolg	60	77.986	ENSDORG00000016228	Papolg	99	77.986	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015011874	papolg	99	52.901	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	53.036	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015011874	papolg	65	58.150	ENSEBUG00000005042	-	81	57.143	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015011874	papolg	63	67.684	ENSEBUG00000004020	papolg	93	66.019	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.575	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	63.978	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.575	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	63.957	Equus_caballus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	57.104	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	57.104	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015011874	papolg	91	70.282	ENSELUG00000014497	papolg	80	70.282	Esox_lucius
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.844	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	63.844	Felis_catus
ENSSFOG00015011874	papolg	98	55.738	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	55.738	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.306	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	63.306	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015011874	papolg	65	60.080	ENSFHEG00000019080	papolg	90	61.647	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015011874	papolg	90	78.175	ENSGMOG00000018772	papolg	83	78.175	Gadus_morhua
ENSSFOG00015011874	papolg	100	57.995	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	57.995	Gallus_gallus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.136	ENSGAFG00000003263	papolg	89	64.744	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.688	ENSGACG00000002718	papolg	100	66.222	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.787	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	64.787	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015011874	papolg	80	78.873	ENSHBUG00000004882	papolg	89	66.222	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015011874	papolg	99	63.859	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	63.859	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.881	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	63.881	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015011874	papolg	100	67.843	ENSHCOG00000006782	papolg	89	67.843	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015011874	papolg	100	68.524	ENSIPUG00000021642	papolg	100	68.524	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.710	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	63.710	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015011874	papolg	60	78.220	ENSJJAG00000015601	Papolg	99	78.220	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	66.759	ENSKMAG00000016439	papolg	97	66.759	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.433	ENSLBEG00000023218	papolg	89	64.691	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015011874	papolg	99	58.768	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	58.768	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015011874	papolg	100	67.457	ENSLOCG00000016130	papolg	100	67.457	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.503	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	77.283	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.735	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	64.141	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.735	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	64.141	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015011874	papolg	100	57.086	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	57.487	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.099	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	64.512	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	69.394	ENSMAMG00000010667	papolg	99	69.394	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015011874	papolg	99	68.028	ENSMZEG00005018140	papolg	99	69.688	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015011874	papolg	98	58.219	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	98	58.219	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015011874	papolg	98	64.414	ENSMAUG00000009088	Papolg	98	64.414	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.986	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	65.082	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.372	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	64.372	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015011874	papolg	100	66.265	ENSMMOG00000008020	papolg	99	66.622	Mola_mola
ENSSFOG00015011874	papolg	98	62.807	ENSMODG00000002160	PAPOLG	98	62.807	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.646	ENSMALG00000007012	papolg	89	65.646	Monopterus_albus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.209	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	78.220	Mus_caroli
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.881	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	78.220	Mus_musculus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.690	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	64.690	Mus_pahari
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.420	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	78.220	Mus_spretus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	62.869	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	63.271	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015011874	papolg	99	63.847	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	63.847	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.747	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	63.747	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015011874	papolg	78	69.355	ENSNBRG00000011943	papolg	99	58.808	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015011874	papolg	60	77.986	ENSNLEG00000009507	-	99	77.986	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015011874	papolg	54	85.507	ENSMEUG00000013605	-	55	85.507	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.710	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	63.710	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015011874	papolg	59	76.259	ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	76.259	Octodon_degus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	60.734	ENSONIG00000002985	papolg	100	61.005	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015011874	papolg	98	62.668	ENSOANG00000012403	PAPOLG	98	62.668	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.844	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	63.844	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.287	ENSORLG00000001577	papolg	89	65.952	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.067	ENSORLG00020002482	papolg	89	66.129	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.020	ENSORLG00015008836	papolg	89	65.684	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.779	ENSOMEG00000001406	papolg	89	66.178	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015011874	papolg	56	55.609	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	55.609	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.978	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	63.978	Ovis_aries
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.512	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	64.512	Pan_paniscus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.844	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	63.844	Panthera_pardus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.844	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	63.844	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.512	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	64.512	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015011874	papolg	100	60.459	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	60.864	Papio_anubis
ENSSFOG00015011874	papolg	100	69.553	ENSPKIG00000003313	papolg	100	69.553	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015011874	papolg	91	69.394	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	69.394	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015011874	papolg	98	62.585	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	62.585	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015011874	papolg	98	64.011	ENSPEMG00000008960	-	99	64.011	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015011874	papolg	75	58.595	ENSPMAG00000002961	papolg	98	49.185	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015011874	papolg	70	61.122	ENSPMAG00000004864	-	98	61.122	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	62.384	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	62.384	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.815	ENSPFOG00000012909	papolg	98	65.333	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.683	ENSPLAG00000018445	papolg	89	65.000	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.729	ENSPMEG00000003961	papolg	89	64.961	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015011874	papolg	80	78.169	ENSPREG00000010358	papolg	89	64.267	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.276	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	64.276	Pongo_abelii
ENSSFOG00015011874	papolg	99	57.104	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	57.104	Procavia_capensis
ENSSFOG00015011874	papolg	100	59.418	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	59.418	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015011874	papolg	90	73.214	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	73.214	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	69.068	ENSPNYG00000006729	papolg	99	69.068	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015011874	papolg	100	66.711	ENSPNAG00000015521	papolg	100	66.711	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.747	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	63.747	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	59.485	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	59.485	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.463	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	64.463	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.022	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	64.432	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015011874	papolg	94	62.958	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	62.958	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015011874	papolg	91	79.891	ENSSMAG00000015598	papolg	95	64.204	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	68.855	ENSSDUG00000000912	papolg	99	68.864	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015011874	papolg	100	67.480	ENSSLDG00000001217	papolg	99	66.066	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.324	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	64.324	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	68.583	ENSSPAG00000009004	papolg	99	68.354	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.130	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	64.130	Sus_scrofa
ENSSFOG00015011874	papolg	75	67.293	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	67.293	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015011874	papolg	100	66.898	ENSTRUG00000006410	papolg	99	66.898	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015011874	papolg	100	60.829	ENSTNIG00000017106	papolg	100	60.829	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015011874	papolg	99	59.023	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	59.023	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015011874	papolg	100	59.463	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	59.866	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.488	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	63.896	Ursus_americanus
ENSSFOG00015011874	papolg	99	63.094	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	63.501	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015011874	papolg	99	60.734	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	61.141	Vicugna_pacos
ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.699	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	63.023	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015011874	papolg	100	60.265	ENSXETG00000002208	papolg	100	60.265	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015011874	papolg	70	81.363	ENSXCOG00000006611	papolg	73	81.363	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015011874	papolg	70	79.000	ENSXMAG00000007383	papolg	82	79.000	Xiphophorus_maculatus