EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015012002 (Gene tree)
Gene ID: 108928886
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10571 bases
Position: chrKV410894.1:852451-863021
Accession: 108928886
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015018686	RRM_1	PF00076.22	9.5e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015018899	-	2130	XM_018743082	ENSSFOP00015018686	458 (aa)	XP_018598598	A0A1W4ZCZ0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.421	ENSG00000102241	HTATSF1	99	57.143	Homo_sapiens
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.661	ENSAPOG00000009823	htatsf1	99	61.803	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.447	ENSACIG00000020459	htatsf1	99	61.392	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	61.489	ENSAOCG00000020994	htatsf1	99	61.702	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	61.996	ENSAPEG00000016432	htatsf1	99	61.064	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015012002	htatsf1	90	67.056	ENSATEG00000008903	htatsf1	90	69.059	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	92	59.535	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	59.535	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015012002	htatsf1	75	64.946	ENSACAG00000009346	HTATSF1	93	64.946	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.025	ENSACLG00000008096	htatsf1	99	61.814	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	66.320	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	66.385	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	85	60.298	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	54	60.298	Bos_taurus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	72	39.535	WBGene00022025	Y65B4A.1	75	38.953	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015012002	htatsf1	80	63.733	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	50	63.733	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	82	63.446	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	51	63.446	Canis_familiaris
ENSSFOG00015012002	htatsf1	82	62.663	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	50	63.802	Capra_hircus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	76	64.607	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	50	64.474	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	64.211	ENSCCAG00000022701	-	50	64.211	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	62.402	ENSCCAG00000025329	-	56	62.435	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.896	ENSCATG00000029963	HTATSF1	50	63.896	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.780	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	50	63.780	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.896	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	50	63.896	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	61.064	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	61.538	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015012002	htatsf1	83	47.709	ENSCING00000005914	-	89	47.439	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015012002	htatsf1	83	47.486	ENSCSAVG00000000371	-	93	46.927	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.896	ENSCANG00000028495	HTATSF1	50	63.896	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.340	ENSCVAG00000014070	htatsf1	98	61.653	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	63.362	ENSDARG00000056649	htatsf1	99	62.716	Danio_rerio
ENSSFOG00015012002	htatsf1	74	43.678	FBgn0037081	barc	62	43.678	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015012002	htatsf1	80	40.489	ENSETEG00000006377	-	50	39.402	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015012002	htatsf1	91	51.577	ENSEBUG00000001534	htatsf1	79	55.076	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015012002	htatsf1	100	62.553	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	62.994	Esox_lucius
ENSSFOG00015012002	htatsf1	82	63.021	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	51	63.021	Felis_catus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	80	67.810	ENSFALG00000003728	HTATSF1	87	65.915	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	61.842	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	50	61.842	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.447	ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	61.229	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	76	69.972	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	69.972	Gadus_morhua
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	59.657	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	59.698	Gallus_gallus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	61.915	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	61.489	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	61.373	ENSGACG00000020459	htatsf1	99	60.730	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.421	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	50	63.421	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.236	ENSHBUG00000004392	htatsf1	99	62.025	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015012002	htatsf1	80	69.291	ENSHCOG00000009056	htatsf1	88	70.079	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015012002	htatsf1	87	70.781	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	64.871	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	82	63.802	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	52	63.802	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	61.006	ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	61.064	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.766	ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	61.064	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	58.458	ENSLACG00000015989	HTATSF1	85	66.844	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	50.108	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	49.680	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	64.474	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.421	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.896	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	50	63.896	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.896	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	50	63.896	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.896	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	55	63.896	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.896	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	50	63.896	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	71.392	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	61.795	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.025	ENSMZEG00005000485	htatsf1	99	61.814	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015012002	htatsf1	93	61.098	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	97	60.690	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015012002	htatsf1	77	63.510	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	63.446	Mesocricetus_auratus
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ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	60.842	ENSMMOG00000011013	htatsf1	89	66.998	Mola_mola
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ENSSFOG00015012002	htatsf1	52	62.249	ENSMODG00000000199	-	92	61.207	Monodelphis_domestica
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ENSSFOG00015012002	htatsf1	82	63.802	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	51	63.802	Mus_caroli
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ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.158	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	50	63.158	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015012002	htatsf1	84	66.076	ENSMEUG00000004133	-	94	66.076	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.236	ENSONIG00000008638	htatsf1	99	62.236	Oreochromis_niloticus
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ENSSFOG00015012002	htatsf1	82	62.663	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	50	62.663	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.979	ENSORLG00000002356	htatsf1	99	62.340	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.979	ENSORLG00020017818	htatsf1	96	62.156	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.368	ENSORLG00015002268	htatsf1	99	62.368	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.766	ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	61.603	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.421	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	50	63.421	Pan_paniscus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	82	63.281	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	51	63.281	Panthera_pardus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.421	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	50	63.421	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015012002	htatsf1	100	67.965	ENSPKIG00000024852	htatsf1	100	67.965	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015012002	htatsf1	80	65.676	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	99	64.721	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	60.549	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	60.338	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	76	64.045	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	63.947	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015012002	htatsf1	91	63.488	ENSPCIG00000030173	-	91	66.834	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	90	59.954	ENSPCIG00000018896	-	84	65.775	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	61.915	ENSPFOG00000007871	htatsf1	96	61.915	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.340	ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	61.702	Poecilia_latipinna
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ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.553	ENSPREG00000007811	htatsf1	99	61.915	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.421	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	52	61.616	Pongo_abelii
ENSSFOG00015012002	htatsf1	85	55.668	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	55	55.668	Procavia_capensis
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.947	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	50	63.947	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015012002	htatsf1	82	63.351	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	55	63.351	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.025	ENSPNYG00000016693	htatsf1	99	61.814	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	67.391	ENSPNAG00000006166	htatsf1	99	67.615	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.636	ENSRROG00000021939	HTATSF1	50	63.636	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015012002	htatsf1	85	61.404	ENSSBOG00000027186	-	53	61.404	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	63.881	ENSSBOG00000017914	-	50	63.881	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015012002	htatsf1	88	65.375	ENSSHAG00000018908	-	88	66.332	Sarcophilus_harrisii
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ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	59.197	ENSSDUG00000020002	htatsf1	87	68.207	Seriola_dumerili
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ENSSFOG00015012002	htatsf1	80	60.000	ENSSARG00000005193	HTATSF1	52	60.000	Sorex_araneus
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ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	61.915	ENSSPAG00000000732	htatsf1	99	60.722	Stegastes_partitus
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ENSSFOG00015012002	htatsf1	91	65.493	ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	70.712	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.232	ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	62.232	Xiphophorus_maculatus