EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015012267 (Gene tree)
Gene ID: 108927561
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin-4-like
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14328 bases
Position: chrKV410874.1:5461654-5475981
Accession: 108927561
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015019188	IBN_N	PF03810.19	1.9e-14	1	1
ENSSFOP00015019144	IBN_N	PF03810.19	2.8e-14	1	1
ENSSFOP00015019091	IBN_N	PF03810.19	3e-14	1	1
ENSSFOP00015019048	IBN_N	PF03810.19	3.5e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015019408	-	4455	-	ENSSFOP00015019188	1021 (aa)	-	-
ENSSFOT00015019310	-	4677	XM_018740960	ENSSFOP00015019091	1095 (aa)	XP_018596476	A0A1W4Z7F9
ENSSFOT00015019363	-	4623	-	ENSSFOP00015019144	1077 (aa)	-	-
ENSSFOT00015019266	-	4758	-	ENSSFOP00015019048	1122 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015012267	ipo4	100	66.515	ENSSFOG00015014437	IPO4	99	66.332

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.747	ENSG00000196497	IPO4	99	48.942	Homo_sapiens
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.982	ENSAPOG00000019018	ipo4	99	68.440	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.702	ENSAMEG00000016271	IPO4	84	47.518	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.949	ENSACIG00000004246	ipo4	99	67.857	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	69.835	ENSAOCG00000004773	ipo4	99	69.744	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	69.744	ENSAPEG00000002112	ipo4	99	69.780	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015012267	ipo4	92	71.429	ENSATEG00000017082	ipo4	99	71.230	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015012267	ipo4	92	45.886	ENSACAG00000003973	-	96	47.666	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.282	ENSANAG00000037973	IPO4	99	48.390	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.186	ENSACLG00000019742	ipo4	99	66.758	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.642	ENSAMXG00000037878	ipo4	99	68.099	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	48.346	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	48.897	Bos_taurus
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.282	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	48.390	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	49.489	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	49.402	Canis_familiaris
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	49.351	ENSCAFG00020002873	IPO4	98	48.423	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.423	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	48.298	Capra_hircus
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.189	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	48.574	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	48.022	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	48.114	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.561	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	48.666	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.654	ENSCATG00000040395	IPO4	99	48.850	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	48.666	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	48.942	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015012267	ipo4	91	47.305	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	44.995	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015012267	ipo4	93	34.742	ENSCING00000008639	-	99	35.583	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015012267	ipo4	91	36.631	ENSCSAVG00000011482	-	99	35.535	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.468	ENSCANG00000029513	IPO4	99	48.666	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.934	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	48.118	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.934	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	48.118	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	64.221	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	65.424	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	64.121	ENSCVAG00000002281	ipo4	99	64.033	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	73.309	ENSDARG00000041493	ipo4	99	73.309	Danio_rerio
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	48.206	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	48.574	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.375	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	48.574	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	31.416	FBgn0042178	CG32165	99	31.085	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	31.034	FBgn0042177	CG32164	99	30.741	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.567	ENSETEG00000018381	IPO4	99	47.475	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015012267	ipo4	93	48.634	ENSEASG00005011954	IPO4	96	49.950	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	48.850	ENSECAG00000009909	IPO4	99	49.034	Equus_caballus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	71.886	ENSELUG00000020628	ipo4	99	72.278	Esox_lucius
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	49.310	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	49.310	Felis_catus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	45.055	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	45.463	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015012267	ipo4	88	71.042	ENSFHEG00000009351	ipo4	96	70.907	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	70.685	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	70.265	Gadus_morhua
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	66.728	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	67.093	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	66.514	ENSGACG00000002276	ipo4	99	66.881	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015012267	ipo4	52	40.187	ENSGAGG00000003383	-	99	41.815	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.468	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	48.666	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.580	ENSHBUG00000023269	ipo4	99	67.153	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.838	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	48.298	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.470	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	47.930	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	63.751	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	63.702	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	72.212	ENSIPUG00000001185	ipo4	99	72.761	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	48.850	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	49.034	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.375	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	48.758	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	68.199	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	68.566	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.675	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	67.156	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	52.236	ENSLACG00000001428	IPO4	99	52.057	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015012267	ipo4	78	67.342	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	66.835	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.606	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	47.698	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.839	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	49.034	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.839	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	49.034	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.654	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	48.850	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.932	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	48.942	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.779	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	67.706	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.580	ENSMZEG00005017273	ipo4	99	67.153	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	48.165	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	47.934	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.654	ENSMICG00000001719	IPO4	99	48.666	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	47.495	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	47.842	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	66.972	ENSMMOG00000005264	ipo4	99	67.155	Mola_mola
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	46.196	ENSMODG00000003337	IPO4	96	46.465	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	66.736	ENSMALG00000001587	ipo4	99	65.963	Monopterus_albus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.518	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	49.325	Mus_caroli
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.151	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	48.834	Mus_musculus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.286	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	49.197	Mus_pahari
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.426	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	49.202	Mus_spretus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	49.540	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	49.448	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.746	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	48.022	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.930	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	48.022	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	69.936	ENSNBRG00000005870	ipo4	99	69.625	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	48.485	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	48.669	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	48.114	ENSODEG00000002609	IPO4	99	48.206	Octodon_degus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	69.760	ENSONIG00000014574	ipo4	99	69.048	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	47.750	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	48.118	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	65.619	ENSORLG00000006457	ipo4	99	67.079	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	66.055	ENSORLG00020004286	ipo4	99	66.239	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	66.239	ENSORLG00015021856	ipo4	99	66.422	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	64.810	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	65.046	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	47.354	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	47.562	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	47.579	ENSOARG00000019188	IPO4	98	47.810	Ovis_aries
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.561	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	48.574	Pan_paniscus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	49.494	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	49.494	Panthera_pardus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	49.402	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	49.402	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.561	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	48.758	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.932	ENSPANG00000026278	IPO4	99	48.942	Papio_anubis
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	68.435	ENSPKIG00000007683	-	99	67.887	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	72.993	ENSPKIG00000007830	ipo4	99	73.266	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	62.249	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	62.865	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	46.232	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	46.514	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	45.898	ENSPCIG00000010718	IPO4	98	48.755	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.152	ENSPFOG00000009255	ipo4	99	66.880	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.152	ENSPLAG00000020556	ipo4	99	66.880	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	67.048	ENSPMEG00000013102	ipo4	99	66.789	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	66.423	ENSPREG00000017605	ipo4	99	66.423	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.839	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	48.942	Pongo_abelii
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	49.535	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	49.724	Procavia_capensis
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.145	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	48.114	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.318	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	48.432	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	68.286	ENSPNYG00000021414	ipo4	99	68.253	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015012267	ipo4	99	69.653	ENSPNAG00000027964	ipo4	99	71.298	Pygocentrus_nattereri
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