EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015012323 (Gene tree)
Gene ID: 108934697
Gene Symbol: CAPRIN1 (1 of many)
Alias: GPIAP1|M11S1|RNG105|caprin-1
Full Name: caprin-1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12404 bases
Position: chrKV411072.1:3465851-3478254
Accession: 108934697
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015019160	Caprin-1_C	PF12287.8	5.7e-122	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015019379	CAPRIN1 (1 of many)-201	2852	XM_018752737	ENSSFOP00015019160	668 (aa)	XP_018608253	A0A1W5A4P3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	65.093	ENSSFOG00015015517	CAPRIN1	100	64.235

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	44.364	ENSG00000110888	CAPRIN2	96	49.612	Homo_sapiens
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	95	59.879	ENSG00000135387	CAPRIN1	97	59.265	Homo_sapiens
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	63.165	ENSAPOG00000010508	caprin1b	100	63.309	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	61.045	ENSAPOG00000004726	caprin1a	100	61.045	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	91	45.247	ENSAMEG00000009118	CAPRIN2	54	45.247	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.337	ENSAMEG00000008137	CAPRIN1	93	59.098	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	62.040	ENSACIG00000017913	caprin1b	100	61.318	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	59.287	ENSACIG00000005383	caprin1a	100	59.733	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	60.896	ENSAOCG00000003017	caprin1a	100	61.045	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	64.173	ENSAOCG00000004574	caprin1b	100	64.317	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	60.896	ENSAPEG00000008548	caprin1a	100	61.045	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	63.885	ENSAPEG00000001227	caprin1b	100	64.029	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	60.831	ENSATEG00000007707	caprin1a	100	61.037	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	65.368	ENSATEG00000015675	caprin1b	100	65.512	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	91	44.689	ENSAPLG00000006703	CAPRIN2	57	44.689	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	90	60.703	ENSAPLG00000006975	CAPRIN1	97	60.630	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	95	38.870	ENSACAG00000012953	CAPRIN2	61	38.870	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	93	59.784	ENSACAG00000013621	CAPRIN1	97	56.877	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	95	44.838	ENSANAG00000034464	-	89	44.376	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	92	44.000	ENSANAG00000035460	CAPRIN2	67	44.000	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.184	ENSANAG00000032811	-	97	59.200	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	62.393	ENSACLG00000007463	caprin1b	100	63.675	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	59.821	ENSACLG00000026749	caprin1a	100	60.119	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	59.317	ENSAMXG00000005142	caprin1b	100	59.317	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	99	59.944	ENSAMXG00000006601	caprin1a	100	58.606	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.092	ENSBTAG00000016744	CAPRIN1	93	58.866	Bos_taurus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	87	44.487	ENSBTAG00000019373	CAPRIN2	56	44.487	Bos_taurus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	44.000	ENSCJAG00000001080	CAPRIN2	69	44.000	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.184	ENSCJAG00000010542	CAPRIN1	93	58.576	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.490	ENSCAFG00000007104	CAPRIN1	92	59.302	Canis_familiaris
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	90	45.247	ENSCAFG00000010713	CAPRIN2	57	45.247	Canis_familiaris
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	91	42.222	ENSCAFG00020018961	-	59	42.222	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	92	60.620	ENSCAFG00020004525	CAPRIN1	97	60.550	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.122	ENSCHIG00000017561	CAPRIN1	93	59.012	Capra_hircus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	91	44.487	ENSCHIG00000026352	CAPRIN2	60	44.487	Capra_hircus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	88	58.699	ENSTSYG00000033857	-	97	58.720	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	53.191	ENSTSYG00000028754	-	96	53.293	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	41.781	ENSTSYG00000008590	CAPRIN2	68	41.781	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	89	51.656	ENSCAPG00000000035	CAPRIN1	92	52.508	Cavia_aperea
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.031	ENSCPOG00000015734	CAPRIN1	97	71.186	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	89	41.328	ENSCPOG00000006625	CAPRIN2	72	35.981	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.031	ENSCCAG00000020172	-	97	59.040	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	98	46.324	ENSCCAG00000036089	-	97	46.029	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	95	53.707	ENSCCAG00000022482	-	94	52.757	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	91	45.560	ENSCCAG00000027709	CAPRIN2	66	44.364	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	92	44.364	ENSCATG00000031463	CAPRIN2	69	44.364	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	59.877	ENSCATG00000038427	CAPRIN1	93	58.636	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	91	43.411	ENSCLAG00000001513	CAPRIN2	72	35.780	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.031	ENSCLAG00000015468	-	94	59.211	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	95	44.564	ENSCLAG00000007513	-	91	44.410	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	91	45.247	ENSCSAG00000007446	CAPRIN2	57	45.247	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	74	59.846	ENSCSAG00000005378	CAPRIN1	90	73.684	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	66	72.973	ENSCHOG00000001622	CAPRIN1	69	64.706	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	89	40.310	ENSCHOG00000008931	CAPRIN2	54	40.310	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	89	43.066	ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	43.066	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	98	59.137	ENSCPBG00000012511	CAPRIN1	97	59.375	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	92	45.560	ENSCANG00000035343	CAPRIN2	66	44.364	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.031	ENSCANG00000032583	CAPRIN1	97	59.425	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.890	ENSCGRG00001006383	Caprin1	93	59.621	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	88	42.697	ENSCGRG00001002901	Caprin2	71	35.988	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	35.692	ENSCGRG00000001249	Caprin2	74	35.538	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	93	61.077	ENSCGRG00000012551	Caprin1	97	61.002	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	57.058	ENSCSEG00000001898	caprin1a	100	57.652	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	63.181	ENSCSEG00000013073	caprin1b	100	63.037	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	62.108	ENSCVAG00000021994	caprin1b	100	62.251	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	57.500	ENSCVAG00000005129	caprin1a	100	57.353	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	61.192	ENSDARG00000009346	caprin1a	100	61.304	Danio_rerio
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	61.484	ENSDARG00000054272	caprin1b	100	61.748	Danio_rerio
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.061	ENSDNOG00000031223	-	93	58.841	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	88	59.740	ENSDNOG00000037711	-	97	59.680	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	67	42.085	ENSDNOG00000009793	CAPRIN2	60	42.085	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	56.581	ENSDORG00000006566	Caprin1	93	55.540	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	91	35.469	ENSDORG00000012639	Caprin2	75	35.387	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	75	42.157	ENSETEG00000011498	-	51	42.105	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	89	60.350	ENSETEG00000009308	CAPRIN1	97	60.658	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	93	38.032	ENSEBUG00000005422	CAPRIN1	92	37.537	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	92	43.448	ENSEASG00005005997	CAPRIN2	59	43.448	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.092	ENSEASG00005020196	CAPRIN1	97	59.685	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	93	43.448	ENSECAG00000000608	CAPRIN2	59	43.448	Equus_caballus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.092	ENSECAG00000007147	CAPRIN1	97	59.685	Equus_caballus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	89	59.395	ENSEEUG00000006638	CAPRIN1	97	59.341	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	99	59.770	ENSELUG00000009443	caprin1a	98	59.943	Esox_lucius
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	62.166	ENSELUG00000006003	caprin1b	100	61.885	Esox_lucius
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	91	45.247	ENSFCAG00000007004	CAPRIN2	68	45.247	Felis_catus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	88	59.968	ENSFCAG00000030411	CAPRIN1	97	59.904	Felis_catus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	91	44.689	ENSFALG00000009038	CAPRIN2	54	44.689	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	98	58.009	ENSFALG00000001291	CAPRIN1	97	58.689	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.490	ENSFDAG00000015466	CAPRIN1	97	58.790	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	93	44.615	ENSFDAG00000020134	CAPRIN2	61	44.615	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	58.346	ENSFHEG00000020227	caprin1a	100	58.493	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	60.684	ENSFHEG00000009076	caprin1b	100	60.969	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	59.406	ENSGMOG00000002853	caprin1b	100	59.803	Gadus_morhua
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	57.226	ENSGMOG00000008955	caprin1a	100	57.226	Gadus_morhua
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	98	59.510	ENSGALG00000013532	CAPRIN1	97	59.602	Gallus_gallus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	91	44.485	ENSGALG00000012947	CAPRIN2	56	44.485	Gallus_gallus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	57.692	ENSGAFG00000013909	caprin1a	100	57.692	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	60.198	ENSGACG00000009867	caprin1b	100	60.482	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	57.522	ENSGACG00000015620	caprin1a	100	57.522	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	61.656	ENSGAGG00000002048	CAPRIN1	97	59.659	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	93	42.857	ENSGAGG00000015057	CAPRIN2	53	42.857	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	56.202	ENSGGOG00000010997	CAPRIN1	97	54.731	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	44.000	ENSGGOG00000006182	CAPRIN2	67	44.000	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	60.119	ENSHBUG00000013605	caprin1a	100	60.417	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	100	62.411	ENSHBUG00000003821	caprin1b	100	63.688	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	95	55.878	ENSHGLG00000008140	-	93	55.224	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	95	50.376	ENSHGLG00000002732	-	90	50.376	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	57.953	ENSHGLG00000016118	-	99	56.632	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015012323	CAPRIN1	94	60.366	ENSHGLG00000018658	CAPRIN1	95	58.696	Heterocephalus_glaber_female
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