EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015012510 (Gene tree)
Gene ID: 108939580
Gene Symbol: rpp30
Alias: fk66h08|rpp1|wu:fk66h08|zgc:110189
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p30
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4940 bases
Position: chrKV411190.1:4026449-4031388
Accession: 108939580
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015019430	RNase_P_p30	PF01876.16	4.1e-66	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015019656	-	1782	XM_018761016	ENSSFOP00015019430	266 (aa)	XP_018616532	A0A1W5ALK4

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
sfm03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.684	ENSG00000148688	RPP30	100	64.684	Homo_sapiens
ENSSFOG00015012510	rpp30	87	63.948	ENSAPOG00000023156	rpp30	97	55.906	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.428	ENSAMEG00000016776	RPP30	100	65.428	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	54.511	ENSACIG00000022810	rpp30	99	54.511	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	62.406	ENSAOCG00000016438	rpp30	90	62.406	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	62.030	ENSAPEG00000008697	rpp30	90	62.030	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015012510	rpp30	96	65.504	ENSATEG00000015263	rpp30	93	65.504	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015012510	rpp30	89	64.050	ENSAPLG00000009959	RPP30	100	64.050	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	59.774	ENSACAG00000007996	RPP30	99	59.774	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	54.307	ENSANAG00000009439	RPP30	84	54.307	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	61.887	ENSACLG00000015389	-	99	61.887	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	67.045	ENSAMXG00000040653	rpp30	98	67.045	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.312	ENSBTAG00000002973	RPP30	100	64.312	Bos_taurus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.045	ENSCJAG00000011045	RPP30	100	63.569	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.056	ENSCAFG00000031801	RPP30	100	65.056	Canis_familiaris
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.056	ENSCAFG00020000258	RPP30	100	65.056	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	62.082	ENSCHIG00000012901	RPP30	100	62.082	Capra_hircus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	63.670	ENSTSYG00000013903	RPP30	100	63.569	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015012510	rpp30	89	49.378	ENSCAPG00000001326	RPP30	100	49.378	Cavia_aperea
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.312	ENSCPOG00000033174	RPP30	100	64.312	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.684	ENSCCAG00000029514	RPP30	100	64.684	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	65.414	ENSCATG00000042072	RPP30	99	65.414	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.799	ENSCLAG00000008595	RPP30	100	65.799	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.056	ENSCSAG00000006694	RPP30	100	65.056	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015012510	rpp30	62	92.308	ENSCHOG00000007023	-	75	92.308	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.045	ENSCPBG00000026518	RPP30	99	64.045	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015012510	rpp30	79	41.176	ENSCING00000019714	-	86	39.496	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015012510	rpp30	94	35.714	ENSCSAVG00000011282	-	93	35.714	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.056	ENSCANG00000041084	RPP30	100	65.056	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015012510	rpp30	86	63.793	ENSCGRG00001017068	-	97	63.793	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	56.877	ENSCGRG00001000834	-	100	56.877	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	57.249	ENSCGRG00000006196	-	100	57.249	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	62.825	ENSCGRG00000002508	-	100	62.825	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	59.124	ENSCSEG00000001779	rpp30	94	59.124	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	62.921	ENSCVAG00000003139	rpp30	99	62.921	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	69.318	ENSDARG00000027428	rpp30	99	69.318	Danio_rerio
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	63.197	ENSDNOG00000010186	RPP30	92	63.197	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	63.197	ENSDORG00000015333	Rpp30	100	63.197	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015012510	rpp30	95	31.679	FBgn0283652	Rpp30	87	31.679	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	62.082	ENSETEG00000018823	RPP30	100	62.082	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015012510	rpp30	61	38.509	ENSEBUG00000003989	-	92	38.509	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	65.414	ENSEASG00005011050	RPP30	99	65.414	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	65.414	ENSECAG00000021917	RPP30	99	65.414	Equus_caballus
ENSSFOG00015012510	rpp30	95	46.304	ENSEEUG00000009986	-	97	46.304	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	73.585	ENSELUG00000003731	rpp30	95	73.585	Esox_lucius
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.428	ENSFCAG00000029073	RPP30	93	65.428	Felis_catus
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	65.038	ENSFALG00000007711	RPP30	99	65.038	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.684	ENSFDAG00000019241	RPP30	100	64.684	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015012510	rpp30	92	62.195	ENSFHEG00000014739	rpp30	97	60.417	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015012510	rpp30	91	58.635	ENSGMOG00000005379	rpp30	100	58.635	Gadus_morhua
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	62.825	ENSGALG00000006486	RPP30	99	69.600	Gallus_gallus
ENSSFOG00015012510	rpp30	92	63.158	ENSGAFG00000001445	rpp30	92	63.158	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	60.727	ENSGACG00000010285	rpp30	99	60.727	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	63.296	ENSGAGG00000000980	RPP30	69	63.296	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.428	ENSGGOG00000026917	RPP30	100	65.428	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	61.887	ENSHBUG00000019332	rpp30	99	61.887	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.056	ENSHGLG00000013072	RPP30	100	65.056	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.056	ENSHGLG00100017798	RPP30	100	65.056	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	56.107	ENSHCOG00000004763	-	92	56.107	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015012510	rpp30	100	67.658	ENSIPUG00000003863	rpp30	100	67.658	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.312	ENSSTOG00000027002	RPP30	100	64.312	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.312	ENSJJAG00000020041	Rpp30	100	64.312	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	61.509	ENSKMAG00000015355	rpp30	99	61.509	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	63.433	ENSLBEG00000019989	rpp30	99	63.433	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015012510	rpp30	71	55.455	ENSLACG00000002534	RPP30	96	55.455	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	75.573	ENSLOCG00000000031	rpp30	98	75.573	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	62.825	ENSLAFG00000015931	RPP30	100	62.825	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.056	ENSMFAG00000031109	RPP30	100	65.056	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.056	ENSMMUG00000006628	RPP30	100	65.056	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.684	ENSMNEG00000033838	RPP30	99	73.600	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.056	ENSMLEG00000037578	RPP30	100	65.056	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	64.179	ENSMAMG00000010934	rpp30	99	64.179	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	61.887	ENSMZEG00005018508	-	99	61.887	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	58.364	ENSMGAG00000008452	RPP30	100	58.736	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	63.941	ENSMAUG00000008797	Rpp30	100	63.941	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.312	ENSMICG00000012019	RPP30	100	64.312	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.312	ENSMOCG00000016872	Rpp30	100	64.312	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015012510	rpp30	97	59.615	ENSMMOG00000009266	rpp30	96	59.615	Mola_mola
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	66.541	ENSMODG00000006863	-	99	66.541	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	58.271	ENSMODG00000009342	-	99	58.271	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	61.940	ENSMALG00000011718	rpp30	99	61.940	Monopterus_albus
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	63.534	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	63.534	Mus_caroli
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	63.197	ENSMUSG00000024800	Rpp30	100	63.197	Mus_musculus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	62.454	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	62.454	Mus_pahari
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	63.197	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	63.197	Mus_spretus
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	66.165	ENSMPUG00000017258	RPP30	93	66.165	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	66.541	ENSMLUG00000017169	RPP30	99	66.541	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015012510	rpp30	80	61.574	ENSNGAG00000014392	-	91	61.574	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	62.825	ENSNGAG00000012018	-	100	62.825	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015012510	rpp30	93	55.645	ENSNBRG00000024170	-	93	55.645	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.428	ENSNLEG00000012383	RPP30	100	65.428	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	59.191	ENSMEUG00000015587	-	100	59.191	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015012510	rpp30	51	71.111	ENSOPRG00000007367	-	95	71.111	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	49.627	ENSODEG00000004560	-	100	49.442	Octodon_degus
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	64.394	ENSODEG00000004530	-	100	64.394	Octodon_degus
ENSSFOG00015012510	rpp30	76	61.275	ENSONIG00000019140	rpp30	100	59.420	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	64.045	ENSOANG00000003415	RPP30	99	64.045	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	62.454	ENSOCUG00000006896	RPP30	92	62.454	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015012510	rpp30	95	63.281	ENSORLG00000020420	rpp30	89	63.281	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	62.782	ENSORLG00020009037	-	99	62.782	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015012510	rpp30	98	62.782	ENSORLG00015008300	rpp30	93	62.782	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015012510	rpp30	67	60.773	ENSOMEG00000012640	-	98	60.773	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.312	ENSOGAG00000013963	RPP30	100	64.312	Otolemur_garnettii
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ENSSFOG00015012510	rpp30	99	64.684	ENSPPAG00000043779	RPP30	100	64.684	Pan_paniscus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.428	ENSPPRG00000000115	RPP30	100	65.428	Panthera_pardus
ENSSFOG00015012510	rpp30	99	65.428	ENSPTIG00000014949	RPP30	100	65.428	Panthera_tigris_altaica
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