EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015012788 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4968 bases
Position: chrKV411026.1:2314882-2319849
Accession: ZDB-GENE-041007-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015019898	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	8.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015020127	-	945	-	ENSSFOP00015019898	314 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	51.163	ENSG00000105849	TWISTNB	52	57.542	Homo_sapiens
ENSSFOG00015012788	twistnb	59	57.447	ENSACIG00000020400	twistnb	50	57.447	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	66.258	ENSATEG00000017956	twistnb	84	47.289	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015012788	twistnb	53	60.355	ENSANAG00000026418	TWISTNB	57	55.670	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015012788	twistnb	55	60.000	ENSAMXG00000035868	twistnb	55	58.470	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015012788	twistnb	76	50.204	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	89	46.129	Bos_taurus
ENSSFOG00015012788	twistnb	58	57.377	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	53	57.377	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015012788	twistnb	61	54.404	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	55	54.688	Capra_hircus
ENSSFOG00015012788	twistnb	56	57.297	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	55	56.085	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015012788	twistnb	58	56.757	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	88	43.865	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015012788	twistnb	58	57.377	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	53	57.377	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	51.163	ENSCATG00000035621	TWISTNB	54	56.284	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.000	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	88	43.887	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	50.698	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	54	55.738	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015012788	twistnb	57	59.890	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	55	59.890	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015012788	twistnb	58	56.284	ENSCANG00000038759	TWISTNB	54	56.284	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015012788	twistnb	53	61.446	ENSCGRG00001000499	Twistnb	50	61.446	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015012788	twistnb	58	56.452	ENSDNOG00000006438	-	54	56.452	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015012788	twistnb	60	58.115	ENSDORG00000007795	Twistnb	57	58.115	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015012788	twistnb	65	56.039	ENSEASG00005021702	TWISTNB	85	46.372	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.606	ENSECAG00000014563	TWISTNB	85	47.231	Equus_caballus
ENSSFOG00015012788	twistnb	97	47.785	ENSELUG00000000098	TWISTNB	85	47.785	Esox_lucius
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.000	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	88	45.631	Felis_catus
ENSSFOG00015012788	twistnb	94	40.391	ENSFALG00000009761	TWISTNB	50	63.158	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.606	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	88	45.714	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015012788	twistnb	56	63.277	ENSGAFG00000018309	twistnb	52	60.638	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015012788	twistnb	76	49.167	ENSGACG00000006425	twistnb	67	58.523	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015012788	twistnb	59	55.914	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	54	55.914	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015012788	twistnb	59	57.527	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	88	46.349	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015012788	twistnb	59	57.527	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	88	46.349	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015012788	twistnb	62	55.612	ENSIPUG00000004117	twistnb	51	56.989	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.606	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	81	43.168	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	61.212	ENSJJAG00000015887	Twistnb	88	45.277	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015012788	twistnb	77	48.148	ENSLBEG00000024225	twistnb	52	58.974	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015012788	twistnb	97	45.048	ENSLACG00000010508	TWISTNB	82	45.545	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015012788	twistnb	53	66.272	ENSLOCG00000011399	twistnb	51	66.272	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.000	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	88	45.277	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	50.698	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	54	55.738	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	50.698	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	53	55.738	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	51.643	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	54	55.738	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	51.163	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	54	56.284	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015012788	twistnb	66	50.000	ENSMICG00000036489	TWISTNB	88	42.724	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015012788	twistnb	56	58.659	ENSMOCG00000003458	Twistnb	55	58.659	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015012788	twistnb	59	54.359	ENSMMOG00000020085	twistnb	50	54.359	Mola_mola
ENSSFOG00015012788	twistnb	78	47.368	ENSMODG00000001402	-	63	43.878	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	61.932	ENSMALG00000016407	twistnb	50	60.000	Monopterus_albus
ENSSFOG00015012788	twistnb	56	58.101	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	50	60.843	Mus_caroli
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	59.394	ENSMUSG00000020561	Twistnb	50	60.241	Mus_musculus
ENSSFOG00015012788	twistnb	53	59.639	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	50	59.639	Mus_pahari
ENSSFOG00015012788	twistnb	56	57.542	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	50	60.241	Mus_spretus
ENSSFOG00015012788	twistnb	56	57.542	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	83	44.268	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015012788	twistnb	50	63.125	ENSNGAG00000022455	Twistnb	80	63.125	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015012788	twistnb	59	57.672	ENSNBRG00000008652	twistnb	52	55.897	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	51.628	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	53	58.101	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015012788	twistnb	58	55.978	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	85	46.667	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015012788	twistnb	66	50.679	ENSODEG00000007222	TWISTNB	53	57.778	Octodon_degus
ENSSFOG00015012788	twistnb	58	64.324	ENSORLG00000004005	twistnb	64	46.465	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015012788	twistnb	58	64.865	ENSORLG00020002579	twistnb	72	47.138	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015012788	twistnb	58	64.865	ENSORLG00015013403	twistnb	64	46.801	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015012788	twistnb	56	58.101	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	52	58.101	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015012788	twistnb	61	54.404	ENSOARG00000009803	TWISTNB	54	54.688	Ovis_aries
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	51.163	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	53	57.542	Pan_paniscus
ENSSFOG00015012788	twistnb	56	57.542	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	88	44.660	Panthera_pardus
ENSSFOG00015012788	twistnb	96	45.307	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	45.307	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	51.163	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	52	57.542	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	51.163	ENSPANG00000015736	TWISTNB	54	56.284	Papio_anubis
ENSSFOG00015012788	twistnb	76	58.635	ENSPKIG00000025635	twistnb	83	55.082	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015012788	twistnb	63	50.935	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	52	56.983	Pongo_abelii
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	61.212	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	53	58.659	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015012788	twistnb	59	57.672	ENSPNYG00000002674	twistnb	52	55.897	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	61.212	ENSRNOG00000010750	Twistnb	55	58.659	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015012788	twistnb	56	57.542	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	52	57.542	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015012788	twistnb	56	57.542	ENSRROG00000040155	TWISTNB	52	57.542	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015012788	twistnb	59	56.150	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	54	57.377	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015012788	twistnb	59	62.234	ENSSMAG00000012792	twistnb	50	62.234	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015012788	twistnb	61	62.500	ENSSDUG00000007038	twistnb	73	48.173	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015012788	twistnb	59	60.638	ENSSPAG00000005871	twistnb	51	60.638	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015012788	twistnb	57	56.831	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	55	56.831	Sus_scrofa
ENSSFOG00015012788	twistnb	96	42.405	ENSTNIG00000017778	twistnb	51	61.677	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015012788	twistnb	57	58.333	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	87	46.815	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.000	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	88	45.513	Ursus_americanus
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	59.394	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	88	45.192	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.000	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	54	56.284	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015012788	twistnb	56	64.407	ENSXCOG00000020199	twistnb	50	64.407	Xiphophorus_couchianus