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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015013399 (Gene tree)
Gene ID: 108919382
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11888 bases
Position: chrKV410803.1:1775518-1787405
Accession: 108919382
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015020848	eRF1_2	PF03464.15	1.7e-32	1	1
ENSSFOP00015020884	eRF1_2	PF03464.15	5.7e-30	1	1
ENSSFOP00015020848	eRF1_3	PF03465.15	1e-25	1	1
ENSSFOP00015020884	eRF1_3	PF03465.15	2e-16	1	1
ENSSFOP00015020848	eRF1_1	PF03463.15	1.8e-52	1	1
ENSSFOP00015020884	eRF1_1	PF03463.15	1.9e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015021082	-	4871	XM_018727345	ENSSFOP00015020848	385 (aa)	XP_018582861	A0A1W4Y3N7
ENSSFOT00015021118	-	1116	-	ENSSFOP00015020884	371 (aa)	-	-

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSG00000152684	PELO	98	83.289	Homo_sapiens
ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.390	ENSAPOG00000023072	pelo	98	90.451	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015013399	pelo	67	91.498	ENSAPOG00000023700	-	90	91.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015013399	pelo	67	91.498	ENSAPOG00000000616	pelo	90	91.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSAMEG00000007734	PELO	98	83.024	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015013399	pelo	97	85.255	ENSACIG00000014386	pelo	97	90.828	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.649	ENSAOCG00000023717	pelo	98	90.716	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.649	ENSAPEG00000011235	pelo	98	90.716	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.649	ENSATEG00000019550	pelo	98	90.981	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015013399	pelo	77	73.490	ENSAPLG00000013265	PELO	97	73.793	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015013399	pelo	97	82.133	ENSACAG00000004352	PELO	98	81.963	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSANAG00000014096	PELO	98	83.024	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	ENSACLG00000010305	pelo	98	89.390	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015013399	pelo	97	93.566	ENSAMXG00000020299	pelo	98	93.369	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	ENSBTAG00000003268	PELO	98	83.554	Bos_taurus
ENSSFOG00015013399	pelo	99	59.318	WBGene00011280	pelo-1	99	59.682	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	ENSCJAG00000035190	PELO	98	83.289	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	ENSCAFG00020023234	PELO	98	83.289	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSCHIG00000016410	PELO	98	83.289	Capra_hircus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.377	ENSTSYG00000005203	PELO	98	83.554	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.636	ENSCPOG00000027406	PELO	98	83.820	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	ENSCCAG00000035600	PELO	98	83.289	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSCATG00000011829	PELO	98	83.024	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	ENSCLAG00000005043	PELO	98	83.289	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSCSAG00000016692	PELO	98	83.024	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSCHOG00000000523	PELO	98	83.024	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015013399	pelo	97	82.667	ENSCPBG00000007544	PELO	98	82.493	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015013399	pelo	97	66.220	ENSCING00000001979	-	98	66.048	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015013399	pelo	99	67.448	ENSCSAVG00000006158	-	98	68.170	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSCANG00000023382	PELO	98	83.024	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015013399	pelo	97	83.646	ENSCGRG00001024665	Pelo	98	83.289	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015013399	pelo	97	84.182	ENSCGRG00000004570	Pelo	98	83.820	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.610	ENSCSEG00000008807	pelo	98	90.186	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	ENSCVAG00000016082	pelo	98	89.390	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	91.948	ENSDARG00000055477	pelo	98	92.573	Danio_rerio
ENSSFOG00015013399	pelo	100	79.793	ENSDNOG00000036721	PELO	98	79.894	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSDORG00000016689	Pelo	98	83.024	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015013399	pelo	96	67.027	FBgn0011207	pelo	95	65.782	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015013399	pelo	74	75.269	ENSEBUG00000004955	pelo	95	75.269	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSEASG00005013348	PELO	98	83.024	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	91.948	ENSELUG00000023229	pelo	98	92.042	Esox_lucius
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.636	ENSFCAG00000032341	PELO	98	83.820	Felis_catus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSFALG00000004559	PELO	98	83.289	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015013399	pelo	74	83.451	ENSFDAG00000002076	PELO	88	83.451	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015013399	pelo	100	88.312	ENSFHEG00000009769	pelo	98	88.594	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015013399	pelo	98	91.247	ENSGMOG00000005849	pelo	98	91.247	Gadus_morhua
ENSSFOG00015013399	pelo	100	88.312	ENSGAFG00000019350	pelo	98	88.859	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.390	ENSGACG00000007245	pelo	97	91.758	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015013399	pelo	97	82.933	ENSGAGG00000004018	PELO	98	82.759	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSGGOG00000012635	PELO	98	83.024	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	ENSHBUG00000005866	pelo	98	89.390	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.636	ENSHGLG00000005932	PELO	98	83.820	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015013399	pelo	100	81.299	ENSHGLG00100017627	PELO	98	81.432	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015013399	pelo	100	88.052	ENSHCOG00000016782	pelo	98	88.064	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.649	ENSIPUG00000020627	pelo	98	91.247	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.636	ENSSTOG00000027378	PELO	98	83.820	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	80.519	ENSJJAG00000015032	Pelo	98	80.637	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.130	ENSKMAG00000021305	pelo	98	90.451	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015013399	pelo	99	90.365	ENSLBEG00000022399	pelo	98	90.981	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSLAFG00000020551	PELO	98	83.024	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSMFAG00000000651	PELO	98	83.024	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSMMUG00000039101	PELO	98	83.024	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSMNEG00000035538	PELO	98	83.024	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSMLEG00000039113	PELO	98	83.024	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015013399	pelo	97	92.761	ENSMAMG00000013260	pelo	98	92.573	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	ENSMZEG00005014258	pelo	98	89.390	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	ENSMAUG00000009770	Pelo	98	83.289	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	ENSMICG00000044040	PELO	98	83.289	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSMOCG00000017554	Pelo	98	83.024	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.130	ENSMMOG00000001324	pelo	98	90.451	Mola_mola
ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.390	ENSMALG00000008194	pelo	98	90.716	Monopterus_albus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.597	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	98	82.759	Mus_caroli
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.597	ENSMUSG00000042275	Pelo	98	82.759	Mus_musculus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	98	83.024	Mus_pahari
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.597	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	98	82.759	Mus_spretus
ENSSFOG00015013399	pelo	99	82.031	ENSMLUG00000024132	PELO	98	82.493	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.377	ENSNGAG00000019331	Pelo	98	83.820	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	ENSNBRG00000011799	pelo	98	89.390	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSNLEG00000035970	PELO	98	83.024	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015013399	pelo	100	81.039	ENSMEUG00000005468	PELO	98	81.698	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015013399	pelo	98	82.322	ENSOPRG00000018793	PELO	98	83.019	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	ENSODEG00000017579	PELO	98	83.289	Octodon_degus
ENSSFOG00015013399	pelo	96	89.488	ENSONIG00000011511	pelo	98	88.859	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.377	ENSOCUG00000023902	PELO	98	83.820	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.610	ENSORLG00000005827	pelo	98	89.655	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.870	ENSORLG00020016456	pelo	98	89.920	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.870	ENSORLG00015014447	pelo	98	89.920	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015013399	pelo	100	90.909	ENSOMEG00000021567	pelo	98	91.247	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	ENSOGAG00000027940	PELO	98	83.289	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	ENSOARG00000008324	PELO	98	83.554	Ovis_aries
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSPPAG00000038951	PELO	98	83.024	Pan_paniscus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.636	ENSPPRG00000018800	PELO	98	83.820	Panthera_pardus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.636	ENSPTIG00000019988	PELO	98	83.820	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.597	ENSPTRG00000034409	PELO	98	83.024	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSPANG00000010902	PELO	98	83.024	Papio_anubis
ENSSFOG00015013399	pelo	100	95.325	ENSPKIG00000015190	pelo	98	95.756	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015013399	pelo	97	82.400	ENSPSIG00000004971	PELO	98	82.228	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015013399	pelo	72	85.978	ENSPMGG00000014561	pelo	100	85.978	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.377	ENSPEMG00000015584	Pelo	98	83.554	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.078	ENSPCIG00000004880	PELO	98	82.759	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	88.831	ENSPFOG00000007277	pelo	98	89.125	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	ENSPLAG00000020787	pelo	98	89.390	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015013399	pelo	100	88.831	ENSPMEG00000016964	pelo	98	89.125	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	ENSPREG00000023071	pelo	98	89.390	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015013399	pelo	97	83.378	ENSPPYG00000015451	PELO	94	83.024	Pongo_abelii
ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.117	ENSPCOG00000021178	PELO	98	83.289	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015013399	pelo	100	89.091	ENSPNYG00000017325	pelo	98	89.390	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015013399	pelo	97	94.370	ENSPNAG00000012458	pelo	98	94.164	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.597	ENSRNOG00000061128	Pelo	98	82.759	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSRBIG00000007299	PELO	98	83.024	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015013399	pelo	100	82.857	ENSRROG00000035507	PELO	98	83.024	Rhinopithecus_roxellana
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