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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015013765 (Gene tree)
Gene ID: 108940002
Gene Symbol: phf5a
Alias: chunp6910|un-named hi1373|unm hi1373
Full Name: PHD finger protein 5A
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1941 bases
Position: chrKV411197.1:11306155-11308095
Accession: 108940002
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015021378	PHF5	PF03660.14	2e-49	1	1
ENSSFOP00015021372	PHF5	PF03660.14	7.1e-36	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015021617	-	753	XM_018761735	ENSSFOP00015021378	110 (aa)	XP_018617251	A0A1W5AWF2
ENSSFOT00015021612	-	872	-	ENSSFOP00015021372	128 (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03040	Spliceosome	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSG00000100410	PHF5A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSAPOG00000017805	phf5a	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015013765	phf5a	74	100.000	ENSAMEG00000015687	PHF5A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	91.818	ENSACIG00000021628	phf5a	100	91.818	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSAOCG00000020917	phf5a	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSAPEG00000020260	phf5a	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSATEG00000007455	phf5a	100	100.000	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSATEG00000006506	phf5a	100	100.000	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSACAG00000004775	PHF5A	100	100.000	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	82.727	ENSANAG00000036831	-	100	82.727	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	81.818	ENSANAG00000022538	-	100	81.818	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015013765	phf5a	99	87.156	ENSANAG00000020141	-	92	87.156	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSANAG00000028988	-	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSACLG00000019161	phf5a	100	91.818	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSAMXG00000035422	phf5a	100	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSBTAG00000006423	PHF5A	100	100.000	Bos_taurus
ENSSFOG00015013765	phf5a	99	90.826	WBGene00004016	phf-5	99	90.826	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCJAG00000004999	PHF5A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCAFG00000001090	PHF5A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCAFG00020001984	PHF5A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	92.727	ENSCHIG00000015826	PHF5A	100	92.727	Capra_hircus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSTSYG00000001082	PHF5A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015013765	phf5a	77	100.000	ENSCAPG00000007769	PHF5A	87	100.000	Cavia_aperea
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCPOG00000033309	PHF5A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	67.273	ENSCCAG00000009204	-	100	67.273	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	83.636	ENSCCAG00000037275	-	100	83.636	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCCAG00000037141	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCATG00000012251	PHF5A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCLAG00000016714	-	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	69.369	ENSCLAG00000014324	-	100	69.369	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCSAG00000005811	PHF5A	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	90.909	ENSCHOG00000003545	PHF5A	100	90.909	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCPBG00000020547	PHF5A	100	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	97.273	ENSCSAVG00000007539	-	100	97.273	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCANG00000032125	PHF5A	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCGRG00001017936	Phf5a	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCGRG00000012081	Phf5a	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	91.818	ENSCSEG00000020499	phf5a	100	91.818	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSCVAG00000006090	phf5a	100	100.000	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSDARG00000045155	phf5a	100	100.000	Danio_rerio
ENSSFOG00015013765	phf5a	74	100.000	ENSDNOG00000034362	PHF5A	96	77.477	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSDORG00000002205	Phf5a	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015013765	phf5a	99	96.330	FBgn0031822	Phf5a	98	96.330	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSETEG00000010741	PHF5A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	92.727	ENSEBUG00000009125	-	100	92.727	Eptatretus_burgeri
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ENSSFOG00015013765	phf5a	74	87.654	ENSMMUG00000019698	-	100	87.654	Macaca_mulatta
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ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSMNEG00000045104	PHF5A	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015013765	phf5a	88	91.753	ENSMLEG00000038352	-	84	91.753	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSMLEG00000037662	PHF5A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSMAMG00000003744	phf5a	100	100.000	Mastacembelus_armatus
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ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSMALG00000008655	phf5a	100	100.000	Monopterus_albus
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ENSSFOG00015013765	phf5a	100	100.000	ENSNGAG00000001430	Phf5a	100	100.000	Nannospalax_galili
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