EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015014110 (Gene tree)
Gene ID: 108928528
Gene Symbol: ehd3
Alias: si:ch211-147c1.2
Full Name: EH domain-containing protein 3
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 25002 bases
Position: chrKV410888.1:174485-199486
Accession: 108928528
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015021916	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-08	1	1
ENSSFOP00015021905	MMR_HSR1	PF01926.23	2.5e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015022151	-	4681	XM_018742493	ENSSFOP00015021905	535 (aa)	XP_018598009	A0A1W4Z2I5
ENSSFOT00015022162	-	3879	XM_018742494	ENSSFOP00015021916	526 (aa)	XP_018598010	A0A1W4ZBA2

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015014110's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm04144	Endocytosis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015014110's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	87.524	ENSSFOG00015006481	-	99	86.817
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	70.076	ENSSFOG00015023056	ehd2	99	69.316
ENSSFOG00015014110	ehd3	70	33.247	ENSSFOG00015009773	srl	79	32.976
ENSSFOG00015014110	ehd3	93	88.912	ENSSFOG00015019587	EHD1	99	88.912
ENSSFOG00015014110	ehd3	90	64.859	ENSSFOG00015006753	ehd2a	97	73.889

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.589	ENSG00000013016	EHD3	100	91.589	Homo_sapiens
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSAMEG00000004282	EHD3	100	91.402	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	95.327	ENSACIG00000015462	ehd3	100	95.327	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	81.308	ENSAOCG00000001953	-	100	82.243	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	95.140	ENSAPEG00000018380	ehd3	100	95.140	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.579	ENSATEG00000002224	ehd3	100	94.579	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	92.150	ENSAPLG00000010467	EHD3	100	92.150	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	87.664	ENSACAG00000007103	EHD3	100	87.664	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.215	ENSANAG00000020422	EHD3	100	91.215	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	95.140	ENSACLG00000007581	ehd3	100	95.140	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	90.778	ENSAMXG00000042972	ehd3	100	90.778	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSBTAG00000001662	EHD3	100	91.402	Bos_taurus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSCJAG00000003137	EHD3	100	91.402	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSCAFG00000005348	EHD3	100	91.776	Canis_familiaris
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	89.143	ENSCAFG00020023684	EHD3	98	89.098	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSCHIG00000017794	EHD3	100	91.402	Capra_hircus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.215	ENSTSYG00000036583	EHD3	100	91.215	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSCPOG00000034108	EHD3	100	91.776	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSCCAG00000029860	EHD3	100	91.402	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSCATG00000044604	EHD3	100	91.776	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSCLAG00000010983	EHD3	100	91.776	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSCSAG00000011254	EHD3	100	91.776	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.215	ENSCPBG00000011884	EHD3	100	91.215	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSCANG00000024283	EHD3	100	91.776	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSCGRG00001020979	Ehd3	100	91.402	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSCGRG00000013157	Ehd3	100	91.402	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.019	ENSCSEG00000019195	ehd3	100	94.019	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	95.140	ENSCVAG00000016197	ehd3	100	95.140	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	96.262	ENSDARG00000007869	ehd3	100	96.262	Danio_rerio
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSDNOG00000039339	EHD3	100	91.402	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSDORG00000024162	Ehd3	100	91.402	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	88.302	ENSETEG00000013323	EHD3	98	88.302	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.963	ENSEASG00005008635	EHD3	100	91.963	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.963	ENSECAG00000015195	EHD3	100	91.963	Equus_caballus
ENSSFOG00015014110	ehd3	87	92.641	ENSEEUG00000010447	EHD3	86	92.116	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	95.992	ENSELUG00000023984	ehd3	99	95.880	Esox_lucius
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.963	ENSFCAG00000029627	EHD3	100	91.963	Felis_catus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	92.150	ENSFALG00000011448	EHD3	100	92.150	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSFDAG00000017946	EHD3	100	91.776	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	94.444	ENSFHEG00000018572	ehd3	99	94.361	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	92.720	ENSGMOG00000006447	ehd3	99	92.669	Gadus_morhua
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	92.336	ENSGALG00000009086	EHD3	100	92.336	Gallus_gallus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.393	ENSGAFG00000005665	ehd3	100	94.393	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	95.019	ENSGACG00000013160	ehd3	95	94.925	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.215	ENSGAGG00000024938	EHD3	100	91.215	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSGGOG00000003031	EHD3	100	91.776	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	95.140	ENSHBUG00000023210	ehd3	100	95.140	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.589	ENSHGLG00000014803	EHD3	100	91.589	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.589	ENSHGLG00100011636	EHD3	100	91.589	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	94.636	ENSHCOG00000018418	ehd3	99	94.549	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	95.327	ENSIPUG00000004603	Ehd3	100	95.327	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	90.654	ENSSTOG00000028279	EHD3	100	90.654	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSJJAG00000013415	Ehd3	100	91.776	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.393	ENSKMAG00000018498	ehd3	100	94.393	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.206	ENSLBEG00000009464	ehd3	100	94.206	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	95.140	ENSLOCG00000016786	ehd3	100	95.140	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	90.613	ENSLAFG00000016215	EHD3	96	90.602	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSMFAG00000033132	EHD3	100	91.402	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSMMUG00000003476	EHD3	100	91.402	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSMNEG00000041202	EHD3	100	91.402	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSMLEG00000023912	EHD3	100	91.776	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.766	ENSMAMG00000014744	ehd3	100	94.766	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	95.140	ENSMZEG00005012558	ehd3	100	95.140	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.963	ENSMAUG00000013239	Ehd3	100	91.963	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	90.280	ENSMICG00000043744	EHD3	100	90.280	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSMOCG00000012572	Ehd3	100	91.776	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	80.374	ENSMMOG00000015157	ehd3	100	81.308	Mola_mola
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	92.150	ENSMODG00000015505	EHD3	100	92.150	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.206	ENSMALG00000015586	ehd3	100	94.206	Monopterus_albus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	92.150	MGP_CAROLIEiJ_G0021870	Ehd3	100	92.150	Mus_caroli
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	92.150	ENSMUSG00000024065	Ehd3	100	92.150	Mus_musculus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.963	MGP_PahariEiJ_G0020857	Ehd3	100	91.963	Mus_pahari
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.963	MGP_SPRETEiJ_G0022782	Ehd3	100	91.963	Mus_spretus
ENSSFOG00015014110	ehd3	90	92.437	ENSMPUG00000005148	EHD3	100	92.437	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	87.850	ENSMLUG00000008050	EHD3	100	87.850	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	92.481	ENSNGAG00000014439	Ehd3	99	92.481	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	95.594	ENSNBRG00000022653	ehd3	99	95.489	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015014110	ehd3	89	91.880	ENSNLEG00000015546	EHD3	100	91.841	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	91.667	ENSOPRG00000012242	EHD3	97	91.667	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	92.336	ENSODEG00000008117	EHD3	100	92.336	Octodon_degus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	95.327	ENSONIG00000000693	ehd3	100	95.327	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	92.161	ENSOCUG00000001228	EHD3	99	92.120	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	94.253	ENSORLG00000017118	ehd3	99	94.173	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	94.253	ENSORLG00020002121	ehd3	99	94.173	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	94.253	ENSORLG00015020550	ehd3	99	94.173	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	95.402	ENSOMEG00000000506	ehd3	99	95.301	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	90.841	ENSOGAG00000000397	EHD3	100	90.841	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	88.598	ENSOARG00000019698	EHD3	100	90.093	Ovis_aries
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSPPAG00000035288	EHD3	100	91.776	Pan_paniscus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSPPRG00000002225	EHD3	100	91.776	Panthera_pardus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.963	ENSPTIG00000013343	EHD3	100	91.963	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSPTRG00000011805	EHD3	100	91.776	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSPANG00000023120	EHD3	100	91.776	Papio_anubis
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	97.383	ENSPKIG00000001422	ehd3	100	97.383	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.215	ENSPSIG00000017757	EHD3	100	91.215	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	94.636	ENSPMGG00000007882	ehd3	99	94.549	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	92.150	ENSPCIG00000008811	EHD3	100	92.150	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.766	ENSPFOG00000010935	ehd3	100	94.766	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.579	ENSPLAG00000001005	ehd3	100	94.579	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.766	ENSPMEG00000006514	ehd3	100	94.766	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.953	ENSPREG00000012884	ehd3	100	94.953	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSPPYG00000012514	EHD3	100	91.776	Pongo_abelii
ENSSFOG00015014110	ehd3	91	90.167	ENSPCAG00000008166	EHD3	100	90.167	Procavia_capensis
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	90.841	ENSPCOG00000013548	EHD3	100	90.841	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	91.571	ENSPVAG00000002680	EHD3	100	91.571	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	95.140	ENSPNYG00000003812	ehd3	100	95.140	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	96.449	ENSPNAG00000028984	ehd3	100	96.449	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	92.150	ENSRNOG00000007744	Ehd3	100	92.150	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	92.131	ENSRBIG00000033877	EHD3	100	86.985	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSRROG00000045782	EHD3	100	91.776	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.402	ENSSBOG00000030935	EHD3	100	91.402	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.589	ENSSHAG00000013011	EHD3	100	91.589	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.206	ENSSMAG00000008537	ehd3	100	94.206	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	95.211	ENSSDUG00000010820	ehd3	99	95.113	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	93.487	ENSSLDG00000025510	ehd3	99	93.421	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	92.337	ENSSPUG00000014730	EHD3	99	92.105	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.766	ENSSPAG00000013275	ehd3	100	94.766	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.215	ENSSSCG00000035987	EHD3	100	91.215	Sus_scrofa
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	90.485	ENSTGUG00000004572	EHD3	100	90.485	Taeniopygia_guttata
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.393	ENSTRUG00000014338	ehd3	100	94.393	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	94.847	ENSTNIG00000010948	ehd3	99	94.757	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	90.019	ENSTBEG00000010371	EHD3	97	90.019	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	87.664	ENSTTRG00000000167	EHD3	100	87.664	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.963	ENSUAMG00000022243	EHD3	100	91.963	Ursus_americanus
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	91.082	ENSUMAG00000019931	EHD3	100	91.004	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	91.776	ENSVVUG00000007563	EHD3	98	91.776	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015014110	ehd3	99	92.529	ENSXETG00000022070	ehd3	99	92.481	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015014110	ehd3	100	94.953	ENSXMAG00000025261	ehd3	100	94.953	Xiphophorus_maculatus