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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015014556 (Gene tree)
Gene ID: 108937907
Gene Symbol: pop4
Alias: zgc:110597
Full Name: POP4 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3945 bases
Position: chrKV411151.1:2496991-2500935
Accession: 108937907
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015022651	UPF0086	PF01868.16	9e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015022900	-	2624	XM_018758124	ENSSFOP00015022651	223 (aa)	XP_018613640	A0A1W5AKS8

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
sfm03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015014556	pop4	90	66.337	ENSG00000105171	POP4	100	78.125	Homo_sapiens
ENSSFOG00015014556	pop4	87	66.327	ENSAMEG00000018329	-	89	66.837	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015014556	pop4	91	60.096	ENSAMEG00000003172	-	93	60.096	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015014556	pop4	98	64.574	ENSACIG00000008358	pop4	100	64.574	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015014556	pop4	89	63.682	ENSAOCG00000010116	pop4	98	63.682	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015014556	pop4	99	59.641	ENSAPEG00000002829	pop4	94	59.641	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015014556	pop4	97	62.613	ENSATEG00000013028	pop4	99	62.613	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015014556	pop4	90	62.376	ENSAPLG00000014051	POP4	98	62.376	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015014556	pop4	90	67.327	ENSANAG00000020295	POP4	92	67.822	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015014556	pop4	98	61.818	ENSACLG00000000526	pop4	98	62.673	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015014556	pop4	95	69.302	ENSAMXG00000002899	pop4	96	69.302	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015014556	pop4	97	64.516	ENSBTAG00000002223	POP4	99	65.138	Bos_taurus
ENSSFOG00015014556	pop4	52	31.356	WBGene00007603	C15C6.4	58	31.356	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015014556	pop4	90	66.995	ENSCJAG00000046750	POP4	97	72.571	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015014556	pop4	81	67.033	ENSCAFG00000007630	POP4	100	69.231	Canis_familiaris
ENSSFOG00015014556	pop4	91	67.647	ENSCHIG00000016743	POP4	93	68.293	Capra_hircus
ENSSFOG00015014556	pop4	91	68.137	ENSTSYG00000003488	POP4	93	68.137	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015014556	pop4	87	50.000	ENSCAPG00000011105	POP4	88	50.510	Cavia_aperea
ENSSFOG00015014556	pop4	90	66.832	ENSCPOG00000002992	POP4	92	67.327	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015014556	pop4	84	63.298	ENSCCAG00000034244	-	86	63.298	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015014556	pop4	95	63.679	ENSCCAG00000020285	-	96	64.623	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015014556	pop4	90	67.822	ENSCATG00000036022	POP4	100	79.167	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015014556	pop4	90	65.347	ENSCLAG00000013162	POP4	92	66.832	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015014556	pop4	90	67.822	ENSCSAG00000004868	POP4	93	68.137	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015014556	pop4	91	47.059	ENSCHOG00000002071	POP4	98	46.479	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015014556	pop4	98	62.557	ENSCPBG00000016132	POP4	99	63.134	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015014556	pop4	84	32.984	ENSCING00000023871	-	95	33.505	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015014556	pop4	90	67.822	ENSCANG00000005924	POP4	100	68.137	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015014556	pop4	90	65.174	ENSCGRG00001017185	Pop4	92	65.174	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015014556	pop4	90	65.174	ENSCGRG00000008155	Pop4	92	65.174	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015014556	pop4	97	57.798	ENSCSEG00000002946	pop4	99	58.257	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015014556	pop4	95	47.465	ENSCVAG00000018602	POP4	92	47.465	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015014556	pop4	98	68.349	ENSDARG00000101472	pop4	99	68.349	Danio_rerio
ENSSFOG00015014556	pop4	98	62.557	ENSDNOG00000047663	POP4	88	63.014	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015014556	pop4	74	59.281	ENSDORG00000008577	Pop4	97	59.281	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015014556	pop4	65	34.641	FBgn0035831	CG8038	74	34.641	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015014556	pop4	95	52.830	ENSETEG00000003607	POP4	98	53.774	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015014556	pop4	94	45.778	ENSEBUG00000010447	pop4	88	45.778	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015014556	pop4	88	42.180	ENSEBUG00000004305	pop4	92	42.180	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015014556	pop4	95	42.925	ENSEBUG00000008575	pop4	96	42.925	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015014556	pop4	98	73.077	ENSECAG00000020206	POP4	81	73.077	Equus_caballus
ENSSFOG00015014556	pop4	87	49.490	ENSEEUG00000013109	POP4	98	50.000	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015014556	pop4	97	70.370	ENSELUG00000019812	pop4	99	70.370	Esox_lucius
ENSSFOG00015014556	pop4	87	67.857	ENSFCAG00000001619	POP4	89	68.367	Felis_catus
ENSSFOG00015014556	pop4	95	61.972	ENSFALG00000000206	POP4	95	61.972	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015014556	pop4	90	65.842	ENSFDAG00000017859	POP4	89	68.367	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015014556	pop4	98	54.018	ENSFHEG00000012745	pop4	99	54.018	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015014556	pop4	89	63.184	ENSGMOG00000000335	pop4	99	63.184	Gadus_morhua
ENSSFOG00015014556	pop4	95	60.377	ENSGALG00000041972	POP4	89	60.563	Gallus_gallus
ENSSFOG00015014556	pop4	75	57.310	ENSGAFG00000003571	pop4	94	57.310	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015014556	pop4	97	64.384	ENSGACG00000014510	pop4	93	72.093	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015014556	pop4	98	63.470	ENSGAGG00000024544	POP4	79	63.470	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015014556	pop4	90	66.832	ENSGGOG00000038346	POP4	92	67.157	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015014556	pop4	97	62.212	ENSHBUG00000021821	pop4	98	62.212	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015014556	pop4	90	65.347	ENSHGLG00000015798	POP4	92	66.337	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015014556	pop4	97	61.009	ENSHGLG00100009737	POP4	99	61.927	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015014556	pop4	97	60.455	ENSHCOG00000020937	pop4	98	60.455	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015014556	pop4	98	66.210	ENSIPUG00000013652	pop4	99	66.210	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015014556	pop4	90	68.317	ENSSTOG00000011016	POP4	92	68.812	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015014556	pop4	90	65.347	ENSJJAG00000013376	Pop4	92	65.842	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015014556	pop4	96	63.303	ENSKMAG00000012250	pop4	98	63.303	Kryptolebias_marmoratus
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ENSSFOG00015014556	pop4	97	58.904	ENSLBEG00000018846	-	98	58.904	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015014556	pop4	97	61.290	ENSLACG00000008581	POP4	98	62.673	Latimeria_chalumnae
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ENSSFOG00015014556	pop4	90	67.488	ENSMMUG00000017424	POP4	92	68.137	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015014556	pop4	90	67.980	ENSMNEG00000031374	POP4	92	68.627	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015014556	pop4	90	66.337	ENSMLEG00000043454	POP4	92	67.822	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015014556	pop4	98	65.778	ENSMAMG00000011716	pop4	99	65.778	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015014556	pop4	97	62.673	ENSMZEG00005002360	pop4	98	62.673	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015014556	pop4	95	60.377	ENSMGAG00000005337	POP4	95	61.972	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015014556	pop4	90	64.851	ENSMAUG00000020110	Pop4	92	64.851	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015014556	pop4	97	61.290	ENSMICG00000035730	POP4	97	63.014	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015014556	pop4	98	62.557	ENSMMOG00000015321	pop4	99	62.557	Mola_mola
ENSSFOG00015014556	pop4	98	62.273	ENSMODG00000029406	POP4	95	63.636	Monodelphis_domestica
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ENSSFOG00015014556	pop4	90	64.532	MGP_CAROLIEiJ_G0029600	Pop4	92	65.025	Mus_caroli
ENSSFOG00015014556	pop4	90	64.532	ENSMUSG00000030423	Pop4	92	64.532	Mus_musculus
ENSSFOG00015014556	pop4	90	64.677	MGP_SPRETEiJ_G0030699	Pop4	92	64.677	Mus_spretus
ENSSFOG00015014556	pop4	92	57.488	ENSMPUG00000008063	-	91	58.173	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015014556	pop4	92	64.563	ENSMPUG00000008041	-	91	66.019	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015014556	pop4	97	50.459	ENSMLUG00000010774	POP4	99	50.459	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015014556	pop4	56	72.800	ENSMEUG00000003636	-	100	72.800	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015014556	pop4	87	69.388	ENSOPRG00000004736	POP4	98	69.388	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015014556	pop4	90	65.842	ENSODEG00000013025	POP4	95	67.327	Octodon_degus
ENSSFOG00015014556	pop4	98	62.273	ENSONIG00000003458	pop4	98	62.273	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015014556	pop4	87	69.388	ENSOCUG00000015974	POP4	89	70.408	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015014556	pop4	98	60.444	ENSORLG00000020317	pop4	99	60.444	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015014556	pop4	97	61.261	ENSORLG00015011624	pop4	98	61.261	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015014556	pop4	98	59.729	ENSOMEG00000002538	pop4	99	59.729	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015014556	pop4	91	65.686	ENSOGAG00000011168	POP4	93	66.990	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015014556	pop4	87	69.898	ENSOARG00000004041	POP4	89	70.558	Ovis_aries
ENSSFOG00015014556	pop4	90	66.832	ENSPPAG00000040372	POP4	92	67.327	Pan_paniscus
ENSSFOG00015014556	pop4	87	67.857	ENSPPRG00000010502	POP4	89	68.367	Panthera_pardus
ENSSFOG00015014556	pop4	87	67.857	ENSPTIG00000016598	POP4	89	68.367	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015014556	pop4	90	66.832	ENSPTRG00000010779	POP4	92	67.327	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015014556	pop4	90	67.822	ENSPANG00000008546	POP4	92	68.137	Papio_anubis
ENSSFOG00015014556	pop4	90	75.980	ENSPKIG00000004468	pop4	89	75.980	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015014556	pop4	97	63.134	ENSPSIG00000015690	POP4	100	65.347	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015014556	pop4	89	60.784	ENSPMGG00000008608	pop4	98	62.255	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015014556	pop4	90	54.950	ENSPEMG00000019982	-	92	55.941	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015014556	pop4	96	63.084	ENSPEMG00000014034	-	96	63.551	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015014556	pop4	67	66.443	ENSPMAG00000006265	pop4	74	66.443	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015014556	pop4	98	63.470	ENSPCIG00000024738	POP4	95	63.470	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015014556	pop4	96	61.290	ENSPFOG00000000925	pop4	98	61.290	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015014556	pop4	96	61.290	ENSPLAG00000003161	pop4	98	61.290	Poecilia_latipinna
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ENSSFOG00015014556	pop4	100	59.556	ENSPREG00000022403	pop4	94	59.556	Poecilia_reticulata
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ENSSFOG00015014556	pop4	91	66.667	ENSPCOG00000018055	POP4	99	63.594	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015014556	pop4	95	66.509	ENSPVAG00000006069	POP4	96	66.509	Pteropus_vampyrus
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