EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015014870 (Gene tree)
Gene ID: 108938580
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: probable global transcription activator SNF2L2
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26132 bases
Position: chrKV411167.1:9241205-9267336
Accession: 108938580
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015023171	BRK	PF07533.16	1.7e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015023426	SMARCA2-201	4224	XM_018759235	ENSSFOP00015023171	1407 (aa)	XP_018614751	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	50	47.000	ENSSFOG00015017895	hells	59	47.000
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	93	77.541	ENSSFOG00015013823	smarca4	89	75.781
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	72.068	ENSSFOG00015009921	-	89	71.310

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.510	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.311	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	86.960	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	81.781	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	81.824	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.542	ENSACIG00000015607	SMARCA2	91	84.540	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.125	ENSAOCG00000009647	-	92	84.919	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.455	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	99	86.744	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.373	ENSATEG00000006916	SMARCA2	91	84.876	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	99	81.212	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	97	81.756	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.520	ENSACAG00000002423	SMARCA2	91	84.048	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.408	ENSANAG00000026498	SMARCA2	99	84.151	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	87.545	ENSACLG00000004248	SMARCA2	91	86.803	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	88.889	ENSAMXG00000012404	smarca2	92	87.509	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.508	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	91	85.188	Bos_taurus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.256	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	85.328	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.354	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	91	84.986	Canis_familiaris
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	76	88.744	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	87	88.651	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.633	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	91	85.188	Capra_hircus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	83.176	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	94	83.608	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	80.671	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	91	80.729	Cavia_aperea
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	84.245	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	91	83.812	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.561	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	99	84.506	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.591	ENSCATG00000031470	SMARCA2	99	84.731	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.539	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	91	83.450	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.765	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	96	84.469	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	84	85.097	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	79	85.097	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.296	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	91	84.362	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.191	ENSCANG00000039597	SMARCA2	98	85.745	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	78.235	ENSCGRG00001002323	Smarca2	91	78.101	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	81.799	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	91	80.266	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	92	82.834	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	83.808	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	88.738	ENSDARG00000008904	smarca2	89	88.810	Danio_rerio
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.263	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	91	83.531	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	85.063	ENSDORG00000014832	Smarca2	91	83.485	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	78	61.812	FBgn0000212	brm	80	55.917	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	96	73.256	ENSEBUG00000011442	-	93	72.636	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	87	61.792	ENSEBUG00000002449	-	88	62.736	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.373	ENSEASG00005010312	SMARCA2	91	85.127	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	65	87.500	ENSEEUG00000015540	-	60	87.500	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	83.659	ENSELUG00000010318	smarca2	98	80.190	Esox_lucius
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.993	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	91	84.773	Felis_catus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.797	ENSFALG00000010416	SMARCA2	91	83.765	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	85.111	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	90	82.349	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.355	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	91	83.622	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	99	81.136	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	92	80.729	Gadus_morhua
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.082	ENSGALG00000010164	SMARCA2	91	83.835	Gallus_gallus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	92	81.669	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	86	82.322	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	83.181	ENSGACG00000014488	SMARCA2	92	81.617	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.225	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	91	84.222	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	75	92.008	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	90	82.581	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	87.356	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	90	86.620	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	84.161	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	88	84.807	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	87.321	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	91	84.950	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	80.087	ENSHCOG00000015348	-	100	79.942	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	99	87.303	ENSIPUG00000011060	smarca2	99	87.187	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	85.463	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	91	83.799	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	85.283	ENSJJAG00000010867	Smarca2	91	83.695	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.599	ENSKMAG00000015844	-	89	85.087	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	52	70.544	ENSLACG00000000270	SMARCA2	99	72.323	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	95	90.044	ENSLOCG00000011499	smarca2	89	90.113	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	83.601	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	91	82.951	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	98	84.758	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	98	84.687	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	99	85.126	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	96	85.196	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	99	84.130	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	99	85.336	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.588	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	85.911	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.185	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	85.541	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	87.545	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	90	86.803	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	83	71.049	ENSMGAG00000005160	-	100	71.049	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.981	ENSMICG00000005162	SMARCA2	99	85.126	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	84.886	ENSMOCG00000001611	Smarca2	91	83.322	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.506	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	93	83.415	Mola_mola
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.670	ENSMODG00000003578	SMARCA2	91	83.871	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.413	ENSMALG00000009611	SMARCA2	91	85.282	Monopterus_albus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	82.505	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	97	82.389	Mus_caroli
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	82.563	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	82.746	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	97	82.877	Mus_pahari
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	82.365	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	82.253	Mus_spretus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	77	91.720	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	80	91.720	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	80.224	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	91	78.955	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	85.081	ENSNGAG00000000108	Smarca2	88	84.892	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	92	76.048	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	99	83.275	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	98	85.735	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	81.732	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	88	82.357	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	79.787	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	91	78.343	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	84.660	ENSODEG00000005452	SMARCA2	90	82.905	Octodon_degus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.456	ENSONIG00000014163	SMARCA2	91	83.959	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	54	89.460	ENSOANG00000008299	-	95	91.105	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.386	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	91	82.951	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.415	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	82.986	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.615	ENSORLG00015006289	SMARCA2	99	83.321	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.643	ENSOMEG00000009736	-	94	84.996	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	82.135	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	91	81.543	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	85.663	ENSOARG00000013265	SMARCA2	91	84.040	Ovis_aries
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	77	91.582	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	98	83.666	Pan_paniscus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.065	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	91	84.844	Panthera_pardus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.073	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	98	86.001	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	79.702	ENSPANG00000025121	SMARCA2	91	78.601	Papio_anubis
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	92.753	ENSPKIG00000018469	-	91	90.961	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	84.319	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	91	83.625	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	82.771	ENSPMGG00000013696	-	93	81.748	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	94	84.288	ENSPEMG00000019821	Smarca2	91	82.402	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	71.126	ENSPMAG00000005337	-	91	70.904	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	50	81.206	ENSPMAG00000001030	-	100	81.346	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	86.846	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	91	85.817	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	83.450	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	91	82.692	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	83.125	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	90	82.085	Poecilia_latipinna
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