EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015015432 (Gene tree)
Gene ID: 108932867
Gene Symbol: urb2
Alias: fc13e02|si:dkey-162b3.2|wu:fc13e02
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19049 bases
Position: chrKV411003.1:8170398-8189446
Accession: 108932867
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015024000	Urb2	PF10441.9	1.4e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSSFOT00015024273	-	4707	XM_018749545	ENSSFOP00015024013	1444 (aa)	XP_018605061	A0A1W4ZX28

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.723	ENSG00000135763	URB2	99	63.953	Homo_sapiens
ENSSFOG00015015432	urb2	90	44.575	ENSAPOG00000000608	urb2	95	44.575	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.274	ENSAMEG00000009206	URB2	97	39.165	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015015432	urb2	98	54.918	ENSAOCG00000019961	urb2	94	54.918	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015015432	urb2	98	54.918	ENSAPEG00000005263	urb2	94	54.918	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015015432	urb2	98	42.737	ENSATEG00000020930	urb2	98	42.617	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	41.963	ENSAPLG00000002998	URB2	99	41.831	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015015432	urb2	98	40.690	ENSACAG00000001285	URB2	98	40.690	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015015432	urb2	98	40.132	ENSANAG00000033963	URB2	98	39.828	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015015432	urb2	90	43.271	ENSACLG00000009254	urb2	95	43.133	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015015432	urb2	99	48.385	ENSAMXG00000003474	urb2	98	48.385	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.812	ENSBTAG00000010180	URB2	97	38.518	Bos_taurus
ENSSFOG00015015432	urb2	93	62.937	ENSCJAG00000010968	URB2	98	62.937	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.889	ENSCAFG00000012118	URB2	97	38.852	Canis_familiaris
ENSSFOG00015015432	urb2	94	38.583	ENSCAFG00020027217	URB2	99	38.546	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.720	ENSCHIG00000014513	URB2	97	38.385	Capra_hircus
ENSSFOG00015015432	urb2	99	39.688	ENSTSYG00000006924	URB2	98	39.790	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015015432	urb2	63	44.518	ENSCPOG00000020777	-	96	44.518	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.881	ENSCCAG00000023932	URB2	98	39.789	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.260	ENSCATG00000043366	URB2	98	39.246	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.974	ENSCLAG00000006268	URB2	98	39.960	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.378	ENSCSAG00000010599	URB2	98	39.364	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015015432	urb2	63	53.604	ENSCHOG00000010163	URB2	64	53.604	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015015432	urb2	98	43.470	ENSCPBG00000006191	URB2	98	43.264	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.458	ENSCANG00000023711	URB2	98	39.552	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.689	ENSCGRG00001009591	Urb2	98	38.587	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.689	ENSCGRG00000011259	Urb2	98	38.587	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015015432	urb2	98	40.245	ENSCSEG00000000299	urb2	97	40.319	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015015432	urb2	98	42.211	ENSCVAG00000011011	urb2	97	42.254	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	50.635	ENSDARG00000003217	urb2	87	70.968	Danio_rerio
ENSSFOG00015015432	urb2	98	36.653	ENSDNOG00000043064	URB2	99	37.475	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.026	ENSDORG00000014975	Urb2	98	38.026	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015015432	urb2	94	38.889	ENSETEG00000002869	URB2	93	38.889	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015015432	urb2	99	39.619	ENSEASG00005012060	URB2	98	39.564	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015015432	urb2	90	62.069	ENSECAG00000012338	URB2	97	62.069	Equus_caballus
ENSSFOG00015015432	urb2	90	58.042	ENSEEUG00000002669	URB2	89	58.042	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	55.979	ENSELUG00000014647	urb2	99	55.285	Esox_lucius
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.394	ENSFCAG00000007662	URB2	97	39.601	Felis_catus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	41.535	ENSFALG00000003385	URB2	97	41.601	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.974	ENSFDAG00000021079	URB2	98	40.026	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015015432	urb2	98	42.050	ENSFHEG00000010357	urb2	97	42.303	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	43.222	ENSGMOG00000012459	urb2	97	43.071	Gadus_morhua
ENSSFOG00015015432	urb2	98	42.345	ENSGALG00000011101	URB2	98	42.215	Gallus_gallus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	45.419	ENSGACG00000016179	urb2	97	45.062	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	43.329	ENSGAGG00000021879	URB2	98	43.154	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.987	ENSGGOG00000025643	URB2	98	39.683	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015015432	urb2	98	41.544	ENSHBUG00000018469	urb2	98	41.295	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015015432	urb2	98	40.146	ENSHGLG00000016561	URB2	99	40.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.830	ENSHGLG00100001838	URB2	98	38.830	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015015432	urb2	98	49.130	ENSIPUG00000020315	urb2	97	48.996	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.448	ENSSTOG00000025323	URB2	98	39.396	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.815	ENSJJAG00000011998	Urb2	98	39.643	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	41.534	ENSKMAG00000020129	urb2	98	41.595	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	44.581	ENSLACG00000002038	URB2	98	44.938	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015015432	urb2	98	53.938	ENSLOCG00000015462	urb2	98	53.714	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.208	ENSLAFG00000012484	URB2	98	37.831	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.194	ENSMFAG00000039905	URB2	98	39.179	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.326	ENSMMUG00000009509	URB2	98	39.312	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.432	ENSMNEG00000038762	URB2	98	39.246	Macaca_nemestrina
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ENSSFOG00015015432	urb2	98	41.722	ENSMAMG00000020365	urb2	98	41.922	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	41.993	ENSMZEG00005011027	urb2	98	42.054	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015015432	urb2	95	40.257	ENSMGAG00000012073	URB2	99	40.027	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015015432	urb2	93	58.042	ENSMAUG00000017980	Urb2	98	58.042	Mesocricetus_auratus
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ENSSFOG00015015432	urb2	98	42.495	ENSMALG00000006529	urb2	98	42.391	Monopterus_albus
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ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.757	ENSMPUG00000012438	URB2	97	38.785	Mustela_putorius_furo
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ENSSFOG00015015432	urb2	92	45.249	ENSMEUG00000016434	URB2	94	45.249	Notamacropus_eugenii
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ENSSFOG00015015432	urb2	99	39.593	ENSOCUG00000010700	URB2	98	39.446	Oryctolagus_cuniculus
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ENSSFOG00015015432	urb2	98	44.072	ENSORLG00020003361	urb2	97	44.479	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015015432	urb2	98	44.099	ENSORLG00015001534	urb2	97	44.196	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015015432	urb2	98	42.458	ENSOMEG00000010076	urb2	97	42.653	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015015432	urb2	99	39.304	ENSOGAG00000003021	URB2	98	39.567	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.776	ENSOARG00000003102	URB2	97	38.375	Ovis_aries
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.960	ENSPPAG00000040629	URB2	98	39.683	Pan_paniscus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	39.631	ENSPPRG00000012767	URB2	97	39.708	Panthera_pardus
ENSSFOG00015015432	urb2	93	57.812	ENSPTIG00000012577	URB2	97	57.812	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015015432	urb2	98	40.026	ENSPTRG00000002092	URB2	98	39.749	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.334	ENSPANG00000002245	URB2	98	38.319	Papio_anubis
ENSSFOG00015015432	urb2	98	63.278	ENSPKIG00000005787	urb2	97	63.211	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015015432	urb2	98	42.383	ENSPSIG00000002690	URB2	98	42.188	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015015432	urb2	94	37.722	ENSPEMG00000019551	Urb2	98	37.560	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015015432	urb2	98	40.646	ENSPCIG00000030071	URB2	98	40.753	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015015432	urb2	98	42.689	ENSPFOG00000014330	urb2	97	42.503	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015015432	urb2	98	41.911	ENSPLAG00000014654	urb2	97	41.667	Poecilia_latipinna
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ENSSFOG00015015432	urb2	90	42.956	ENSPNYG00000016840	urb2	95	42.818	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015015432	urb2	99	50.000	ENSPNAG00000013684	urb2	99	49.802	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.052	ENSRNOG00000026853	Urb2	95	38.139	Rattus_norvegicus
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ENSSFOG00015015432	urb2	98	38.538	ENSVVUG00000006747	URB2	99	38.477	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015015432	urb2	98	37.194	ENSXETG00000023331	urb2	97	37.020	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015015432	urb2	98	41.508	ENSXMAG00000015059	urb2	97	41.270	Xiphophorus_maculatus