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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015015448 (Gene tree)
Gene ID: 108925031
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 34681 bases
Position: chrKV410839.1:1228038-1262718
Accession: 108925031
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015024154	IBN_N	PF03810.19	7e-16	1	1
ENSSFOP00015024102	IBN_N	PF03810.19	7.3e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015024415	-	6970	XM_018736736	ENSSFOP00015024154	891 (aa)	XP_018592252	A0A1W4YL12
ENSSFOT00015024363	-	7021	XM_018736735	ENSSFOP00015024102	908 (aa)	XP_018592251	A0A1W4YVD0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	86.712	ENSSFOG00015018955	TNPO2	99	86.712
ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	86.712	ENSSFOG00015010934	tnpo2	99	86.712

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSG00000083312	TNPO1	100	96.891	Homo_sapiens
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	96.745	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	96.745	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	93.548	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	93.660	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015015448	tnpo1	87	95.097	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	94.839	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	96.857	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	96.857	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	96.857	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	96.857	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	96.296	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	96.296	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	90.417	ENSAPLG00000009619	-	97	91.514	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.276	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.276	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	59.801	ENSANAG00000027118	-	99	61.794	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.052	ENSANAG00000022453	-	99	94.052	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	84.400	ENSANAG00000025351	-	99	84.400	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	93.827	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	93.603	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.067	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.619	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.388	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	94.388	Bos_taurus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.164	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	94.164	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	96	94.522	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	94.522	Canis_familiaris
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	92.031	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	92.031	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.276	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	94.276	Capra_hircus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	90.632	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	93.341	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.052	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	94.052	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	94.501	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.276	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	94.276	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	94.501	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	94	81.905	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.905	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.725	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.949	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	76.121	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.121	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	94.501	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	94.501	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015015448	tnpo1	96	94.743	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	94.743	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.062	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.062	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.960	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	95.960	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.062	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	95.062	Danio_rerio
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	88.367	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	88.367	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	93	94.458	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.458	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	58.446	FBgn0035693	CG8219	99	57.995	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015015448	tnpo1	86	95.880	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.880	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015015448	tnpo1	94	85.256	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.256	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	94.501	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.725	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	94.725	Equus_caballus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	89.434	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.829	Esox_lucius
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	94.501	Felis_catus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.613	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.613	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.164	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	94.164	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	96.184	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.184	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	92.945	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.945	Gadus_morhua
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	93.603	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.939	Gallus_gallus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.852	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	95.852	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.398	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.398	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.174	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	95.174	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	94.501	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	79.148	ENSGGOG00000022535	-	98	79.148	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.847	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	95.847	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.052	ENSHGLG00000000970	-	99	94.052	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015015448	tnpo1	96	94.166	ENSHGLG00100017090	-	99	94.166	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015015448	tnpo1	97	74.100	ENSHGLG00100000963	-	99	73.635	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.613	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	94.613	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.960	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	95.960	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	91	93.342	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.342	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015015448	tnpo1	96	88.850	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.850	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	96.970	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	96.970	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	97	93.887	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	93.887	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	94.501	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.388	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	94.476	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	94.501	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	94.501	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	96.409	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	96.409	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.511	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	95.511	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	90.685	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	90.685	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	94.501	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015015448	tnpo1	87	95.361	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	95.361	Mola_mola
ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	95.532	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	95.532	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.062	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	95.062	Monopterus_albus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	94.501	Mus_caroli
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	94.501	Mus_musculus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.388	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	94.183	Mus_pahari
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.276	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	94.059	Mus_spretus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	94.501	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015015448	tnpo1	96	94.070	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	94.070	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.613	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	94.613	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015015448	tnpo1	87	95.613	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	95.613	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	94.501	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015015448	tnpo1	90	88.957	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.934	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.052	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	94.052	Octodon_degus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.095	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	95.095	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	92	94.884	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.884	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	96	88.331	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	88.331	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	87	94.819	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	94.560	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	95.045	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	94.932	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	95.721	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	95.721	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015015448	tnpo1	99	94.932	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	95.383	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	94.501	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.052	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	94.388	Ovis_aries
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	94.501	Pan_paniscus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	94.501	Panthera_pardus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	94.501	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	94.501	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015015448	tnpo1	94	82.735	ENSPTRG00000047731	-	100	82.735	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	94.501	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	94.501	Papio_anubis
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	92.705	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	93.154	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.062	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	95.062	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	93.161	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	92.825	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015015448	tnpo1	96	94.743	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	94.743	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.286	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	95.286	Phascolarctos_cinereus
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