EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015016930 (Gene tree)
Gene ID: 108935683
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15673 bases
Position: chrKV411104.1:1114565-1130237
Accession: 108935683
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015026378	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.5e-31	1	1
ENSSFOP00015026483	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3.9e-28	1	1
ENSSFOP00015026483	DEAD	PF00270.29	1.1e-16	1	1
ENSSFOP00015026378	DEAD	PF00270.29	1.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015026780	-	3576	-	ENSSFOP00015026483	1191 (aa)	-	-
ENSSFOT00015026672	-	5064	XM_018754487	ENSSFOP00015026378	1253 (aa)	XP_018610003	A0A1W5A9J2

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015016930's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015016930's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015016930	skiv2l	79	36.788	ENSSFOG00015014355	skiv2l2	90	36.552

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.133	ENSG00000204351	SKIV2L	99	60.787	Homo_sapiens
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.325	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	81.325	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.293	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.945	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	80.016	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	80.258	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.963	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	81.963	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	82.043	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	82.043	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.484	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	81.484	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	95	68.782	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	63.121	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.791	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	61.435	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.405	ENSACLG00000006886	skiv2l	100	81.579	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	80.926	ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.245	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.005	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	61.037	Bos_taurus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	89	42.023	WBGene00008502	skih-2	92	42.725	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.643	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.290	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.182	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	60.993	Canis_familiaris
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.182	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	60.993	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.195	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	61.085	Capra_hircus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.164	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	60.976	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.680	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	61.247	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.434	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	61.085	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.231	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	61.120	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.342	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.133	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.673	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	61.321	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	87	63.743	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	97	63.743	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015016930	skiv2l	93	50.467	ENSCING00000005576	-	99	50.467	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.182	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	60.585	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.563	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	61.133	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	79.936	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	79.936	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	82.043	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	83.531	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.529	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	81.529	Danio_rerio
ENSSFOG00015016930	skiv2l	92	65.134	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	99	58.097	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	95	44.735	FBgn0039117	tst	97	45.401	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015016930	skiv2l	71	75.342	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	79.167	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015016930	skiv2l	91	55.993	ENSEBUG00000013680	-	98	55.729	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015016930	skiv2l	94	61.326	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	62.107	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	93	61.435	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	60.830	Equus_caballus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	54	74.308	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	74.308	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.419	ENSELUG00000000181	skiv2l	97	84.919	Esox_lucius
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.661	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	61.290	Felis_catus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	96	66.321	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.937	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	82.283	ENSFHEG00000008853	skiv2l	97	85.772	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	77.582	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	77.582	Gadus_morhua
ENSSFOG00015016930	skiv2l	80	57.856	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	57.775	Gallus_gallus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.883	ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	82.203	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	80.366	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	80.366	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.729	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	61.374	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.484	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	81.659	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.231	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	61.041	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	59.552	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	59.385	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015016930	skiv2l	98	79.454	ENSHCOG00000007191	skiv2l	98	79.692	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	80.573	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	80.906	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	60.787	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.024	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	56	62.585	ENSLACG00000002986	-	60	62.585	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.182	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.006	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.311	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	61.199	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.311	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	61.199	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.355	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.242	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.151	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	61.041	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.165	ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	81.165	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.405	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	81.579	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015016930	skiv2l	62	71.967	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	95	51.198	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.280	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.849	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.373	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	61.339	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	59.936	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.685	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015016930	skiv2l	98	79.760	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	78.125	Mola_mola
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.405	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	62.077	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	77.760	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	77.760	Monopterus_albus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.342	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	60.993	Mus_caroli
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.182	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	61.072	Mus_musculus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.502	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	61.308	Mus_pahari
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.022	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	60.914	Mus_spretus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.022	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	60.787	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.067	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	60.723	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	79.200	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	79.376	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	60.995	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.763	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015016930	skiv2l	72	68.881	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	62.500	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	60.797	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.726	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.569	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	61.356	Octodon_degus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.963	ENSONIG00000013500	skiv2l	100	81.963	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.373	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	61.339	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.006	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	81.006	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	80.846	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	80.846	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	80.766	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	80.766	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.085	ENSOMEG00000008531	skiv2l	100	81.085	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.360	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	61.010	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	57.714	ENSOARG00000002411	-	99	57.636	Ovis_aries
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.239	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	61.085	Pan_paniscus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.532	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	61.164	Panthera_pardus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.133	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.770	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.661	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	61.308	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	60.223	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	60.315	Papio_anubis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	84.022	ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	84.022	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	78.446	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	78.446	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	60.991	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	60.804	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.024	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	61.841	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.644	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	81.963	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.963	ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	81.963	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.804	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	82.123	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015016930	skiv2l	98	79.777	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	78.365	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.262	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.914	Pongo_abelii
ENSSFOG00015016930	skiv2l	77	77.922	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	74	77.922	Procavia_capensis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.182	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	61.072	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.391	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	61.120	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	96	82.609	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	82.609	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.644	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	81.804	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.871	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	61.435	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	60.445	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	60.535	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.311	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	61.199	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015016930	skiv2l	90	40.000	YLR398C	-	89	40.136	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.791	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.435	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.326	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	61.102	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.006	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	81.006	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	82.231	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	82.231	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015016930	skiv2l	98	78.731	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	77.484	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	58.864	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	59.063	Sphenodon_punctatus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	95	81.129	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	81.129	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.290	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.605	Sus_scrofa
ENSSFOG00015016930	skiv2l	70	82.353	ENSTRUG00000000966	skiv2l	83	82.353	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	77.027	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	77.345	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	93	62.822	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.699	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	57.610	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.469	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.532	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.181	Ursus_americanus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	94	61.777	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	62.415	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.213	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	61.137	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	58.392	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.517	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	81.010	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	81.330	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.564	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	81.883	Xiphophorus_maculatus