EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015017293 (Gene tree)
Gene ID: 108920358
Gene Symbol: srrt
Alias: CHUNP6881|ars2|zgc:92060
Full Name: serrate%2C RNA effector molecule
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13788 bases
Position: chrKV411287.1:155315-169102
Accession: 108920358
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015026904	ARS2	PF04959.13	1.1e-94	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015027212	-	3104	XM_018729064	ENSSFOP00015026904	892 (aa)	XP_018584580	A0A1W4Y7Y8

Gene Model

Click here to download ENSSFOG00015017293's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSFOG00015017293's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015017293	srrt	96	67.610	ENSG00000087087	SRRT	97	88.525	Homo_sapiens
ENSSFOG00015017293	srrt	95	75.524	ENSAPOG00000002304	srrt	94	77.924	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	70.468	ENSAMEG00000014506	SRRT	93	69.168	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015017293	srrt	82	86.123	ENSACIG00000015795	srrt	88	85.683	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015017293	srrt	92	58.886	ENSAOCG00000009189	-	94	57.407	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015017293	srrt	95	77.635	ENSAOCG00000009693	srrt	87	85.903	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015017293	srrt	95	77.400	ENSAPEG00000003646	srrt	93	85.683	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015017293	srrt	92	58.886	ENSAPEG00000020016	-	94	57.407	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015017293	srrt	95	76.968	ENSATEG00000014425	srrt	86	85.430	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015017293	srrt	53	67.149	ENSATEG00000003652	-	85	65.336	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	68.384	ENSACAG00000001014	SRRT	94	68.521	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015017293	srrt	51	79.487	ENSANAG00000031718	SRRT	94	69.778	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015017293	srrt	52	67.505	ENSACLG00000009423	-	94	57.751	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015017293	srrt	95	77.032	ENSACLG00000013156	srrt	90	77.180	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015017293	srrt	50	86.384	ENSAMXG00000016671	srrt	91	77.857	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015017293	srrt	51	79.274	ENSBTAG00000001134	SRRT	94	69.006	Bos_taurus
ENSSFOG00015017293	srrt	62	46.561	WBGene00017085	E01A2.2	85	42.236	Caenorhabditis_elegans
ENSSFOG00015017293	srrt	51	79.060	ENSCJAG00000014917	SRRT	94	69.545	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.750	ENSCAFG00000023538	SRRT	94	69.123	Canis_familiaris
ENSSFOG00015017293	srrt	98	68.284	ENSCAFG00020013358	SRRT	99	66.393	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015017293	srrt	84	79.785	ENSCHIG00000010495	SRRT	94	69.366	Capra_hircus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	68.245	ENSTSYG00000036426	SRRT	97	67.840	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015017293	srrt	95	68.801	ENSCAPG00000013586	SRRT	98	69.467	Cavia_aperea
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.535	ENSCPOG00000001739	SRRT	94	69.042	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015017293	srrt	51	79.487	ENSCCAG00000015877	SRRT	94	69.778	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.930	ENSCATG00000036306	SRRT	96	68.482	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015017293	srrt	51	79.274	ENSCLAG00000007568	SRRT	90	74.468	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.650	ENSCSAG00000017996	SRRT	94	69.123	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015017293	srrt	54	72.930	ENSCHOG00000007815	SRRT	68	72.930	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015017293	srrt	72	72.015	ENSCPBG00000011553	SRRT	83	67.905	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015017293	srrt	100	40.644	ENSCING00000003506	-	54	52.211	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015017293	srrt	100	42.716	ENSCSAVG00000008394	-	81	57.225	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015017293	srrt	96	67.610	ENSCANG00000034556	SRRT	94	69.366	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.679	ENSCGRG00001001594	Srrt	94	69.213	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015017293	srrt	96	63.864	ENSCGRG00000007292	Srrt	90	74.894	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015017293	srrt	98	69.841	ENSCSEG00000017878	srrt	94	68.602	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015017293	srrt	52	65.966	ENSCSEG00000005233	-	54	64.968	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015017293	srrt	90	56.089	ENSCVAG00000017344	-	94	55.067	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	77.385	ENSCVAG00000019848	srrt	94	76.225	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	80.578	ENSDARG00000017762	srrt	95	80.301	Danio_rerio
ENSSFOG00015017293	srrt	51	79.487	ENSDNOG00000003851	SRRT	94	69.240	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.729	ENSDORG00000005584	Srrt	90	75.536	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015017293	srrt	91	52.361	FBgn0033062	Ars2	69	51.702	Drosophila_melanogaster
ENSSFOG00015017293	srrt	73	76.681	ENSETEG00000016175	SRRT	70	75.840	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015017293	srrt	61	62.658	ENSEBUG00000008517	-	76	61.571	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.704	ENSEASG00005016956	SRRT	94	69.930	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.704	ENSECAG00000012292	SRRT	94	69.930	Equus_caballus
ENSSFOG00015017293	srrt	80	78.723	ENSEEUG00000009117	SRRT	79	77.508	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	76.993	ENSELUG00000006651	srrt	95	76.196	Esox_lucius
ENSSFOG00015017293	srrt	92	61.827	ENSELUG00000021216	-	53	70.940	Esox_lucius
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.170	ENSFCAG00000006855	SRRT	94	69.240	Felis_catus
ENSSFOG00015017293	srrt	51	76.264	ENSFDAG00000021347	SRRT	89	72.967	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015017293	srrt	53	59.016	ENSFHEG00000004105	-	93	59.787	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015017293	srrt	74	84.367	ENSFHEG00000002756	srrt	87	84.367	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015017293	srrt	64	68.027	ENSGMOG00000018694	-	70	66.187	Gadus_morhua
ENSSFOG00015017293	srrt	95	71.915	ENSGMOG00000018619	srrt	93	70.384	Gadus_morhua
ENSSFOG00015017293	srrt	95	76.678	ENSGAFG00000005423	srrt	94	75.833	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015017293	srrt	51	64.565	ENSGAFG00000020383	-	54	65.435	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015017293	srrt	92	56.991	ENSGACG00000001100	-	94	55.800	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	75.607	ENSGACG00000020387	srrt	94	75.685	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	67.381	ENSGGOG00000001508	SRRT	94	69.601	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015017293	srrt	51	85.683	ENSHBUG00000002942	srrt	90	77.419	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015017293	srrt	96	67.804	ENSHGLG00000008344	Srrt	90	74.468	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.078	ENSHGLG00100018857	Srrt	90	75.699	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015017293	srrt	92	54.041	ENSHCOG00000008904	-	88	65.044	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015017293	srrt	98	73.570	ENSHCOG00000005403	srrt	94	72.575	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015017293	srrt	92	80.120	ENSIPUG00000021150	srrt	94	79.053	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	67.927	ENSSTOG00000013776	SRRT	94	69.836	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	70.070	ENSJJAG00000010446	Srrt	90	75.269	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	73.852	ENSKMAG00000013599	srrt	94	75.743	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015017293	srrt	52	65.102	ENSKMAG00000008468	-	53	65.962	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015017293	srrt	85	84.532	ENSLBEG00000016308	srrt	85	83.660	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015017293	srrt	95	58.858	ENSLACG00000001089	SRRT	94	59.176	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015017293	srrt	81	89.274	ENSLOCG00000013658	srrt	100	65.995	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.109	ENSLAFG00000007725	SRRT	94	68.889	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015017293	srrt	96	67.610	ENSMFAG00000033745	SRRT	98	68.482	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.650	ENSMMUG00000021255	SRRT	94	69.123	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.650	ENSMNEG00000041864	SRRT	96	68.482	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015017293	srrt	96	67.610	ENSMLEG00000029479	SRRT	97	68.482	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015017293	srrt	92	59.330	ENSMAMG00000010681	-	94	59.364	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015017293	srrt	51	84.327	ENSMAMG00000014311	srrt	94	77.273	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015017293	srrt	51	85.463	ENSMZEG00005016135	srrt	90	77.300	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015017293	srrt	52	67.715	ENSMZEG00005028002	-	94	57.870	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015017293	srrt	95	68.707	ENSMAUG00000011386	Srrt	90	74.786	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015017293	srrt	51	79.487	ENSMICG00000009471	SRRT	96	68.830	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.836	ENSMOCG00000001971	Srrt	90	75.214	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015017293	srrt	95	73.522	ENSMMOG00000016399	srrt	94	72.608	Mola_mola
ENSSFOG00015017293	srrt	83	57.483	ENSMMOG00000011137	-	55	67.164	Mola_mola
ENSSFOG00015017293	srrt	51	76.008	ENSMODG00000004862	SRRT	89	76.496	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015017293	srrt	58	49.807	ENSMALG00000005567	-	84	52.288	Monopterus_albus
ENSSFOG00015017293	srrt	87	71.795	ENSMALG00000018604	srrt	99	70.309	Monopterus_albus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.931	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	100	79.926	Mus_caroli
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.931	ENSMUSG00000037364	Srrt	99	79.926	Mus_musculus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	70.023	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	100	79.926	Mus_pahari
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.931	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	100	79.926	Mus_spretus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.476	ENSMPUG00000015839	SRRT	94	69.240	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015017293	srrt	51	79.060	ENSMLUG00000009975	SRRT	94	69.123	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.714	ENSNGAG00000023715	Srrt	100	69.444	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015017293	srrt	95	61.287	ENSNLEG00000011987	SRRT	99	62.073	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015017293	srrt	96	56.128	ENSMEUG00000011941	SRRT	94	56.858	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015017293	srrt	60	75.556	ENSOPRG00000002502	-	67	77.778	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.816	ENSODEG00000016856	SRRT	90	75.269	Octodon_degus
ENSSFOG00015017293	srrt	51	85.463	ENSONIG00000004242	srrt	94	73.684	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015017293	srrt	92	57.447	ENSONIG00000016080	-	94	56.813	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015017293	srrt	98	74.371	ENSORLG00000008120	srrt	94	72.608	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015017293	srrt	98	74.315	ENSORLG00020003058	srrt	94	72.488	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015017293	srrt	98	74.543	ENSORLG00015008062	srrt	94	72.608	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015017293	srrt	98	73.973	ENSOMEG00000003155	srrt	88	84.547	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015017293	srrt	92	58.873	ENSOMEG00000006963	-	94	58.747	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015017293	srrt	51	79.487	ENSOGAG00000017242	SRRT	94	69.591	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015017293	srrt	51	79.570	ENSOARG00000015645	SRRT	94	69.249	Ovis_aries
ENSSFOG00015017293	srrt	96	67.837	ENSPPAG00000041090	SRRT	94	70.070	Pan_paniscus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.178	ENSPPRG00000009557	SRRT	94	69.249	Panthera_pardus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	67.421	ENSPTIG00000014355	SRRT	94	69.240	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015017293	srrt	96	67.837	ENSPTRG00000019511	SRRT	99	67.940	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015017293	srrt	95	66.855	ENSPANG00000020763	SRRT	95	68.482	Papio_anubis
ENSSFOG00015017293	srrt	93	76.512	ENSPKIG00000022212	-	94	75.948	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015017293	srrt	98	85.650	ENSPKIG00000005434	srrt	95	84.687	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015017293	srrt	50	79.470	ENSPSIG00000016311	SRRT	94	69.121	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015017293	srrt	98	72.336	ENSPMGG00000002841	srrt	94	82.174	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.838	ENSPEMG00000010834	Srrt	89	75.541	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSFOG00015017293	srrt	96	53.733	ENSPMAG00000009614	-	55	62.370	Petromyzon_marinus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	66.667	ENSPCIG00000000816	SRRT	94	68.182	Phascolarctos_cinereus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	76.706	ENSPFOG00000005704	srrt	94	76.576	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015017293	srrt	51	65.217	ENSPFOG00000016554	-	54	65.510	Poecilia_formosa
ENSSFOG00015017293	srrt	51	64.859	ENSPLAG00000004526	-	55	65.152	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015017293	srrt	95	76.202	ENSPLAG00000021992	srrt	94	76.100	Poecilia_latipinna
ENSSFOG00015017293	srrt	95	76.471	ENSPMEG00000001182	srrt	94	76.219	Poecilia_mexicana
ENSSFOG00015017293	srrt	95	76.588	ENSPREG00000022308	srrt	94	75.505	Poecilia_reticulata
ENSSFOG00015017293	srrt	96	56.772	ENSPPYG00000017432	SRRT	93	58.126	Pongo_abelii
ENSSFOG00015017293	srrt	96	67.614	ENSPCAG00000001621	SRRT	94	67.404	Procavia_capensis
ENSSFOG00015017293	srrt	51	80.000	ENSPCOG00000025751	SRRT	94	69.357	Propithecus_coquereli
ENSSFOG00015017293	srrt	65	70.940	ENSPVAG00000000834	SRRT	100	61.495	Pteropus_vampyrus
ENSSFOG00015017293	srrt	51	85.463	ENSPNYG00000018710	srrt	94	77.300	Pundamilia_nyererei
ENSSFOG00015017293	srrt	90	88.415	ENSPNAG00000010629	srrt	95	63.488	Pygocentrus_nattereri
ENSSFOG00015017293	srrt	51	69.631	ENSRNOG00000048277	AABR07035787.1	93	68.980	Rattus_norvegicus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.650	ENSRBIG00000035718	SRRT	96	68.482	Rhinopithecus_bieti
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.650	ENSRROG00000030622	SRRT	96	68.482	Rhinopithecus_roxellana
ENSSFOG00015017293	srrt	51	80.000	ENSSBOG00000033570	SRRT	95	70.023	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSFOG00015017293	srrt	71	64.804	ENSSHAG00000007349	-	100	65.356	Sarcophilus_harrisii
ENSSFOG00015017293	srrt	50	66.811	ENSSMAG00000018195	-	94	53.256	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	77.594	ENSSMAG00000015342	srrt	86	85.872	Scophthalmus_maximus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	77.712	ENSSDUG00000012049	srrt	94	77.354	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015017293	srrt	52	56.842	ENSSDUG00000002051	-	93	57.298	Seriola_dumerili
ENSSFOG00015017293	srrt	81	86.696	ENSSLDG00000017477	srrt	85	86.696	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSFOG00015017293	srrt	50	59.041	ENSSPAG00000018943	-	93	59.130	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	77.465	ENSSPAG00000005665	srrt	92	77.381	Stegastes_partitus
ENSSFOG00015017293	srrt	90	55.638	ENSTRUG00000000023	-	92	54.523	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015017293	srrt	98	74.066	ENSTRUG00000016075	srrt	94	73.846	Takifugu_rubripes
ENSSFOG00015017293	srrt	74	70.134	ENSTNIG00000011779	srrt	100	69.231	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015017293	srrt	92	54.697	ENSTNIG00000003111	-	53	66.161	Tetraodon_nigroviridis
ENSSFOG00015017293	srrt	59	80.851	ENSTBEG00000005212	SRRT	56	81.356	Tupaia_belangeri
ENSSFOG00015017293	srrt	51	79.487	ENSTTRG00000011104	SRRT	94	69.357	Tursiops_truncatus
ENSSFOG00015017293	srrt	95	69.920	ENSUAMG00000027997	SRRT	97	69.357	Ursus_americanus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.590	ENSUMAG00000011295	SRRT	94	69.357	Ursus_maritimus
ENSSFOG00015017293	srrt	96	68.750	ENSVVUG00000023572	SRRT	94	69.123	Vulpes_vulpes
ENSSFOG00015017293	srrt	71	73.118	ENSXETG00000025124	srrt	70	74.324	Xenopus_tropicalis
ENSSFOG00015017293	srrt	53	52.818	ENSXCOG00000013105	-	91	51.948	Xiphophorus_couchianus
ENSSFOG00015017293	srrt	98	76.773	ENSXMAG00000007627	srrt	88	82.675	Xiphophorus_maculatus
ENSSFOG00015017293	srrt	51	65.502	ENSXMAG00000002090	-	54	66.013	Xiphophorus_maculatus