EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015017965 (Gene tree)
Gene ID: 108927306
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC108927306
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33801 bases
Position: chrKV410868.1:673710-707510
Accession: 108927306
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015028015	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015028328	-	1350	XM_018740531	ENSSFOP00015028015	449 (aa)	XP_018596047	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.758	ENSSFOG00015000985	si:ch211-11k18.4	94	58.758

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	76.615	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	76.615	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	77.060	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	77.060	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	56.637	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	56.637	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	76.392	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	76.392	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.720	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	58.720	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.499	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	58.499	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	76.392	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	76.392	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	76.169	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	76.169	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	59.202	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	59.202	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.057	ENSACAG00000028632	-	99	58.057	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	57.871	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	57.871	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	76.169	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	76.169	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.940	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	58.940	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	73.719	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	73.719	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	69	61.783	ENSCING00000020807	-	83	61.783	Ciona_intestinalis
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	99	51.236	ENSCSAVG00000009987	-	99	52.573	Ciona_savignyi
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	99	72.646	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	71.226	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	57.556	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	57.616	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	57.965	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	58.720	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	75.056	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	75.056	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	98	74.773	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	74.773	Danio_rerio
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	72.449	Danio_rerio
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	80	52.925	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	52.925	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	75.056	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	75.056	Esox_lucius
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.407	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	58.407	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	75.056	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	75.056	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	90	52.826	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	100	53.676	Gadus_morhua
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	74.610	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	74.610	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.444	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.202	Gambusia_affinis
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	58	83.012	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	83.012	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	85	61.358	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	100	59.804	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	76.392	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	76.392	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	57.395	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	57.616	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	99	70.270	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	70.270	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	89	54.887	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	88	54.887	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	70.379	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	70.379	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	96	58.065	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	58.065	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	75.947	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	75.947	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.278	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	59.031	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	74.833	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	74.833	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	99	59.775	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	60.449	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	58.315	ENSLACG00000004899	-	99	58.315	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	99	63.858	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	63.858	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	99	69.575	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	69.575	Lepisosteus_oculatus
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ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	100	56.388	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	56.388	Mola_mola
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ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	98	74.545	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	74.545	Monopterus_albus
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