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Description

Ensembl ID: ENSSFOG00015018941 (Gene tree)
Gene ID: 108938759
Gene Symbol: aco1
Alias: IRP1|wu:fo75b03
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Scleropages_formosus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15231 bases
Position: chrKV411175.1:2183400-2198630
Accession: 108938759
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSFOP00015029542	Aconitase	PF00330.20	1.2e-178	1	1
ENSSFOP00015029563	Aconitase	PF00330.20	1.2e-178	1	1
ENSSFOP00015029633	Aconitase	PF00330.20	6.6e-170	1	1
ENSSFOP00015029633	Aconitase_C	PF00694.19	4.6e-45	1	1
ENSSFOP00015029542	Aconitase_C	PF00694.19	4.6e-45	1	1
ENSSFOP00015029563	Aconitase_C	PF00694.19	4.6e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSFOT00015029877	-	5701	XM_018759631	ENSSFOP00015029542	890 (aa)	XP_018615147	A0A1W5AQM1
ENSSFOT00015029900	-	5579	XM_018759630	ENSSFOP00015029563	890 (aa)	XP_018615146	A0A1W5AQM1
ENSSFOT00015029970	-	2658	-	ENSSFOP00015029633	885 (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
sfm00020	Citrate cycle (TCA cycle)	KEGG
sfm00630	Glyoxylate and dicarboxylate metabolism	KEGG
sfm01100	Metabolic pathways	KEGG
sfm01200	Carbon metabolism	KEGG
sfm01210	2-Oxocarboxylic acid metabolism	KEGG
sfm01230	Biosynthesis of amino acids	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSFOG00015018941	aco1	99	60.963	ENSSFOG00015022085	ireb2	88	60.963

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.864	ENSG00000122729	ACO1	99	82.864	Homo_sapiens
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.089	ENSAPOG00000008670	aco1	99	83.089	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.545	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	82.545	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.315	ENSACIG00000014377	aco1	99	83.315	Amphilophus_citrinellus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.616	ENSAOCG00000007699	aco1	99	83.616	Amphiprion_ocellaris
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.503	ENSAPEG00000014370	aco1	99	83.503	Amphiprion_percula
ENSSFOG00015018941	aco1	99	84.893	ENSATEG00000000560	aco1	99	84.893	Anabas_testudineus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	81.962	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.962	Anas_platyrhynchos
ENSSFOG00015018941	aco1	97	81.512	ENSACAG00000001541	ACO1	99	81.512	Anolis_carolinensis
ENSSFOG00015018941	aco1	99	81.623	ENSANAG00000003359	ACO1	99	81.623	Aotus_nancymaae
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.202	ENSACLG00000007755	aco1	99	83.390	Astatotilapia_calliptera
ENSSFOG00015018941	aco1	99	84.329	ENSAMXG00000002499	aco1	99	84.329	Astyanax_mexicanus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.677	ENSBTAG00000000555	ACO1	100	82.677	Bos_taurus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.074	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	82.074	Callithrix_jacchus
ENSSFOG00015018941	aco1	100	82.379	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	82.379	Canis_familiaris
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.751	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	82.751	Canis_lupus_dingo
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.677	ENSCHIG00000007667	ACO1	100	82.677	Capra_hircus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.976	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	82.976	Carlito_syrichta
ENSSFOG00015018941	aco1	99	66.291	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	66.178	Cavia_aperea
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.074	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	82.074	Cavia_porcellus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.074	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	82.074	Cebus_capucinus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.187	ENSCATG00000045333	ACO1	99	82.187	Cercocebus_atys
ENSSFOG00015018941	aco1	99	81.440	ENSCLAG00000002487	ACO1	100	81.440	Chinchilla_lanigera
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.638	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	82.638	Chlorocebus_sabaeus
ENSSFOG00015018941	aco1	91	64.873	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	64.715	Choloepus_hoffmanni
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.187	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	82.187	Chrysemys_picta_bellii
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.280	ENSCANG00000014847	ACO1	99	82.280	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.902	ENSCGRG00001024337	Aco1	100	82.902	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.002	ENSCGRG00000004877	-	100	82.002	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSFOG00015018941	aco1	99	81.130	ENSCSEG00000018262	aco1	99	81.130	Cynoglossus_semilaevis
ENSSFOG00015018941	aco1	99	77.815	ENSCVAG00000020264	aco1	99	77.815	Cyprinodon_variegatus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	84.667	ENSDARG00000026376	aco1	99	84.667	Danio_rerio
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.300	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	82.300	Dasypus_novemcinctus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.976	ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.976	Dipodomys_ordii
ENSSFOG00015018941	aco1	86	63.684	ENSETEG00000012415	-	85	63.684	Echinops_telfairi
ENSSFOG00015018941	aco1	99	58.817	ENSEBUG00000015441	aco1	97	59.029	Eptatretus_burgeri
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.202	ENSEASG00005004602	ACO1	99	83.202	Equus_asinus_asinus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.202	ENSECAG00000014846	ACO1	99	83.202	Equus_caballus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	72.266	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	72.266	Erinaceus_europaeus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.089	ENSELUG00000016812	aco1	97	83.089	Esox_lucius
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.413	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	82.413	Felis_catus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.300	ENSFALG00000001167	ACO1	99	82.300	Ficedula_albicollis
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.074	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	82.074	Fukomys_damarensis
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.070	ENSFHEG00000005619	aco1	99	83.070	Fundulus_heteroclitus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	81.038	ENSGMOG00000005514	aco1	99	81.038	Gadus_morhua
ENSSFOG00015018941	aco1	99	81.849	ENSGALG00000002162	ACO1	99	81.849	Gallus_gallus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.616	ENSGACG00000001637	aco1	99	83.616	Gasterosteus_aculeatus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	81.736	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.736	Gopherus_agassizii
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.751	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	82.751	Gorilla_gorilla
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.202	ENSHBUG00000008952	aco1	99	83.390	Haplochromis_burtoni
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.300	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	82.300	Heterocephalus_glaber_female
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.300	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	82.300	Heterocephalus_glaber_male
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.373	ENSHCOG00000015881	aco1	99	82.373	Hippocampus_comes
ENSSFOG00015018941	aco1	100	83.146	ENSIPUG00000020088	ACO1	100	83.146	Ictalurus_punctatus
ENSSFOG00015018941	aco1	100	82.809	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	82.809	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.677	ENSJJAG00000013824	Aco1	100	82.677	Jaculus_jaculus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.995	ENSKMAG00000015759	aco1	99	82.995	Kryptolebias_marmoratus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	80.023	ENSLBEG00000013866	aco1	99	80.023	Labrus_bergylta
ENSSFOG00015018941	aco1	75	70.772	ENSLACG00000000936	ACO1	99	70.746	Latimeria_chalumnae
ENSSFOG00015018941	aco1	100	83.371	ENSLOCG00000011082	aco1	100	83.371	Lepisosteus_oculatus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	80.722	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	80.722	Loxodonta_africana
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.300	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	82.300	Macaca_fascicularis
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.413	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	82.413	Macaca_mulatta
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.300	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	82.300	Macaca_nemestrina
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.413	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	82.413	Mandrillus_leucophaeus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	84.520	ENSMAMG00000002915	aco1	99	84.520	Mastacembelus_armatus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	79.821	ENSMZEG00005012733	aco1	99	79.484	Maylandia_zebra
ENSSFOG00015018941	aco1	99	67.667	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	67.667	Meleagris_gallopavo
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.790	ENSMAUG00000021408	Aco1	100	82.790	Mesocricetus_auratus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.187	ENSMICG00000006540	ACO1	99	82.187	Microcebus_murinus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.465	ENSMOCG00000015393	Aco1	100	83.465	Microtus_ochrogaster
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.658	ENSMMOG00000020282	aco1	99	82.658	Mola_mola
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.300	ENSMODG00000004463	ACO1	99	82.300	Monodelphis_domestica
ENSSFOG00015018941	aco1	99	84.407	ENSMALG00000019764	aco1	99	84.407	Monopterus_albus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.677	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	100	82.677	Mus_caroli
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.677	ENSMUSG00000028405	Aco1	100	82.677	Mus_musculus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.790	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	82.790	Mus_pahari
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.902	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	82.902	Mus_spretus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.864	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	82.864	Mustela_putorius_furo
ENSSFOG00015018941	aco1	99	81.172	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	81.172	Myotis_lucifugus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.015	ENSNGAG00000005703	Aco1	100	83.015	Nannospalax_galili
ENSSFOG00015018941	aco1	99	65.583	ENSNBRG00000008973	aco1	99	65.510	Neolamprologus_brichardi
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.751	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	82.751	Nomascus_leucogenys
ENSSFOG00015018941	aco1	89	74.260	ENSMEUG00000014756	ACO1	90	74.260	Notamacropus_eugenii
ENSSFOG00015018941	aco1	99	78.354	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	78.354	Ochotona_princeps
ENSSFOG00015018941	aco1	99	76.888	ENSODEG00000015432	-	99	76.663	Octodon_degus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	79.820	ENSODEG00000001240	-	99	79.820	Octodon_degus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.089	ENSONIG00000019869	aco1	99	83.089	Oreochromis_niloticus
ENSSFOG00015018941	aco1	81	83.079	ENSOANG00000012132	ACO1	99	83.079	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	81.271	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	80.491	Oryctolagus_cuniculus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.202	ENSORLG00000020656	aco1	99	83.202	Oryzias_latipes
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.976	ENSORLG00020010991	aco1	99	82.976	Oryzias_latipes_hni
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.202	ENSORLG00015011785	aco1	99	83.202	Oryzias_latipes_hsok
ENSSFOG00015018941	aco1	99	81.716	ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.716	Oryzias_melastigma
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.413	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	82.413	Otolemur_garnettii
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.677	ENSOARG00000014707	ACO1	98	82.677	Ovis_aries
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.864	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	82.864	Pan_paniscus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.413	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	82.413	Panthera_pardus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.300	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	82.300	Panthera_tigris_altaica
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.864	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	82.864	Pan_troglodytes
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.413	ENSPANG00000025270	ACO1	99	82.413	Papio_anubis
ENSSFOG00015018941	aco1	99	84.685	ENSPKIG00000023168	aco1	99	84.685	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.638	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	82.638	Pelodiscus_sinensis
ENSSFOG00015018941	aco1	99	83.108	ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.108	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.790	ENSPEMG00000018464	Aco1	100	82.790	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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